Cartografia no InVesalius
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Nevair Gallani
25 de Agosto de 2015 às 01:55Ola,
Ha alguns anos eu ja postei algo sobre o assunto na lista.
Ocorre o seguinte: o InVesalius é um excelente software para tratamento de imagens cerebrais. Fora as aplicaçoes para prototipagem, ele pode ser usado para estudo de imagens cerebrais.
A utilizacao de um mapa de coordenadas cartesianas 3D (um cubo cartesiano) é extremamente util para estudos medicos. O espaco cartesiano precisa ser feito em escala metrica real (correspondente a escala metrica das imagens, nos arquivos DICOM). Isto é, 1mm no espaço cartesiano, precisa corresponder a 1mm na imagem DICOM. A origem deste espaço precisa ser configuravel manualmente, assim como sua posicao (rotacao) em relacao ao objeto (ao crânio). Uma vez posicionado e 'fixo' (registrado), o usuario precisa ser capaz de obter as coordenadas x y z em qualquer ponto do objeto, em corte axial, coronal e sagital.
Eu posso colaborar em algumas etapas matematicas de calculo vetorial.
Aguardo comentario dos desenvolvedores sobre isso.
Obrigado
Nevair -
25 de Agosto de 2015 às 11:24Antes de qualquer coisa, sou um grande fã do INVESALIUS e só tenho a
agradecer e parabenizar os desenvolvedores.
Seria interessante saber mais sobre a relação do equipamento tomográfico e
suas configurações na obtenção de uma reconstrução 3D fidedigna no
INVESALIUS.
Esse conhecimento ajudaria a orientar melhor os radiologistas com relação a
uma aquisição de imagens com o objetivo de reconstrução 3D em CAD.
Tenho muito interesse em saber melhor o funcionamento do software com
relação ao dicom e a forma como ele transfere os cortes tomográficos para
uma malha de poligonos no arquivo CAD.
Atenciosamente
Rafael Vidal
Em 24/08/2015 22:55, "Nevair Gallani" -
2 de Setembro de 2015 às 10:36(Esta lista estah ativa ? O desenvolvimento do InVesalius estah ativo ?)-----Message reçu-----
De: "Nevair Gallani"
À: invesalius@listas.softwarepublico.gov.br
Date: 24/08/2015 22:55
Objet: Cartografia no InVesalius -
12 de Janeiro de 2016 às 16:22Olá Rafael,
Nós recomendamos espaçamento de pelo menos 1mm entre as fatias. Pode ser mais, porém a reconstrução 3D será prejudicada, você perceberá em locais de grande curvatura o efeito de escada.
Então, o InVesalius utiliza o algoritmo de Marching Cubes para a geração da malha triangular, e é gerada respeitando a segmentação realizada pelo usuário. -
12 de Janeiro de 2016 às 16:23
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12 de Janeiro de 2016 às 16:24
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12 de Janeiro de 2016 às 16:30Olá Nevair,
Sim, o desenvolvimento está ativo.
O software é desenvolvido principalmente em Python, em alguns lugares foi usado o Cython e C++. O desenvolvimento é realizado no Github https://github.com/invesalius/invesalius3/
Você poderia dar detalhes sobre a cartografia, usos, e etc? Pode ser uma ferramenta interessante no InVesalius. -
8 de Março de 2016 às 02:21Ola Thiago,
Sei que a concepcao do InVesalius foi focada na saida para impressao 3D, mas com as ferramentas da versao atual por exemplo, ele é bastante util e poderoso para estudo de imagens em neurologia neurocirurgia, atraves das mascaras multiplas e imagens 3D por exmplo. Nesses casos a 'saida' é a propria imagem e o que ela revela em termos anatomicos, com suas manipulacoes, zoom, 3D, anaglifo, etc.
Sao muito raros os softwares na rede com essas capacidades, com arquitetura aberta, gratuitos para uso, e com plataforma Windows.
Mais raros ainda - na verdade nao existe nenhum no mundo com permissao de uso gratuita - sao softwares que contem possibilidade de uso de um espaco cartesiano sobreposto sobre o objeto estudado (uma cabeça / encefalo). Existem dois mapas anatomicos (schaltenbrand e talairach) onde voce pode identificar uma estrutura anatomica a partir das suas coordenadas, ou possuindo uma determinada coordenada, ela vai indicar a localizacao especifica no encefalo.
O usuario marca pontos de referencia no encefalo nas imagens a serem estudadas, o software projeta um cubo cartesiano ortogonal com origem no local marcado pelo usuario, e nao imposta onde o usuario posicionar outra marca de interesse, o software lë a posicao do cursor ou do local de interesse informando o valor de coordenadas x y z.
O sistema DICOM ja possui algo deste tipo, mas a origem normalmente seria num dos cantos do 'cubo' da serie de fatias do exame, nao num ponto anatomico determinado pelo usuario.
Em suma, esta propriedade é extremamente util e importante em neurologia neurocirurgia para localizacao de lesoes e nucleos, e é cada vez mais utilizado para estudo.-----Mensagem Original-----
Rafael Peres
Thiago Franco de Moraes