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  640 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/eye.jpg -text
  641 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/ferramentas_avancadas.bb -text
  642 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/ferramentas_avancadas.jpg -text
  643 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/generate_surface.bb -text
  644 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/generate_surface.png -text
  645 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_barra.bb -text
  646 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_barra.png -text
  647 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_janela.bb -text
  648 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_janela.png -text
  649 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_presets.bb -text
  650 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_presets.png -text
  651 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_principal.bb -text
  652 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_principal.png -text
  653 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mac2.bb -text
  654 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mac2.png -text
  655 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mac4.bb -text
  656 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mac4.png -text
  657 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/manager_mensuares.bb -text
  658 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/manager_mensuares.jpg -text
  659 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mask_manager.bb -text
  660 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mask_manager.jpg -text
  661 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/medida_volumetrica.bb -text
  662 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/medida_volumetrica.jpg -text
  663 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_save_image_window.PNG -text
  664 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_save_image_window.bb -text
  665 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/new_data.bb -text
  666 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/new_data.jpg -text
  667 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/noise_amalgam.bb -text
  668 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/noise_amalgam.jpg -text
  669 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/only_2d_planes.bb -text
  670 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/only_2d_planes.jpg -text
  671 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/pseudo_menu.bb -text
  672 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/pseudo_menu.png -text
  673 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_1.PNG -text
  674 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_1.bb -text
  675 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_2.PNG -text
  676 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_2.bb -text
  677 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_3.PNG -text
  678 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_3.bb -text
  679 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_image_window.PNG -text
  680 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_image_window.bb -text
  681 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_preset.bb -text
  682 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_preset.png -text
  683 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_window_preset.bb -text
  684 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_window_preset.jpg -text
  685 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/screen_hunter1.bb -text
  686 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/screen_hunter1.jpg -text
  687 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/selec_operacao.bb -text
  688 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/selec_operacao.png -text
  689 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/select_brush_operation.bb -text
  690 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/select_brush_operation.jpg -text
  691 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/select_surface.bb -text
  692 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/select_surface.jpg -text
  693 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/selected_mask.bb -text
  694 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/selected_mask.jpg -text
  695 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/sem_sombreamento_II.bb -text
  696 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/sem_sombreamento_II.jpg -text
  697 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/surface_manager.bb -text
  698 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/surface_manager.jpg -text
  699 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/text_off.bb -text
  700 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/text_off.png -text
  701 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/text_on.bb -text
  702 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/text_on.png -text
  703 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/transparency.bb -text
  704 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/transparency.jpg -text
  705 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/transparency_2.bb -text
  706 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/transparency_2.png -text
  707 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/vias_aereas_II.bb -text
  708 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/vias_aereas_II.jpg -text
  709 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/view_2d_3d_1.bb -text
  710 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/view_2d_3d_1.png -text
  711 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/view_2d_3d_2.bb -text
  712 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/view_2d_3d_2.png -text
  713 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/logo_cti.bb -text
  714 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/logo_cti.jpg -text
  715 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/rm_ge.bb -text
  716 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/rm_ge.jpg -text
  717 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/splash_pt.bb -text
  718 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/splash_pt.png -text
  719 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/tomografo.bb -text
  720 +docs/user_guide_pt_BR_source/img/tomografo.jpg -text
  721 +docs/user_guide_pt_BR_source/intro.tex -text
  722 +docs/user_guide_pt_BR_source/manual_pt_BR.tex -text
  723 +docs/user_guide_pt_BR_source/resumo.tex -text
19 724 icons/3D_glasses.png -text
20 725 icons/3D_glasses_original.png -text
21 726 icons/Floppy.png -text
... ...
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No preview for this file type
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... ... @@ -0,0 +1,29 @@
  1 +\scalebox{2.0}{\sffamily Autores do Manual}
  2 +\\
  3 +
  4 +Fábio de Souza Azevedo
  5 +
  6 +
  7 +\href{mailto:fabio.azevedo@cti.gov.br}{fabio.azevedo@cti.gov.br}
  8 +\\
  9 +
  10 +
  11 +Jorge Vicente Lopes da Silva
  12 +
  13 +
  14 +\href{mailto:jorge.silva@cti.gov.br}{jorge.silva@cti.gov.br}
  15 +\\
  16 +
  17 +
  18 +Paulo Henrique Junqueira Amorim
  19 +
  20 +
  21 +\href{mailto:paulo.amorim@cti.gov.br}{paulo.amorim@cti.gov.br}
  22 +\\
  23 +
  24 +
  25 +Thiago Franco de Moraes
  26 +
  27 +
  28 +\href{mailto:thiago.moraes@cti.gov.br}{thiago.moraes@cti.gov.br}
  29 +\\
0 30 \ No newline at end of file
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_cust.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,105 @@
  1 +\chapter{Customização}
  2 +
  3 +Algumas opções de customização estão disponíveis para o usuário do InVesalius. Elas
  4 +são apresentadas a seguir.
  5 +
  6 +\section{Menu de ferramentas}
  7 +
  8 +Para ocultar/exibir o menu lateral de ferramentas, clique sobre o botão que a figura
  9 +\ref{fig:layout_full_original} ilustra.
  10 +
  11 +\begin{figure}[!htb]
  12 +\centering
  13 +\includegraphics[scale=0.5]{layout_full_original}
  14 +\caption{Atalho para ocultar/exibir menu lateral de ferramentas}
  15 +\label{fig:layout_full_original}
  16 +\end{figure}
  17 +
  18 +Com o menu ocultado, amplia-se a área da janela do InVesalius disponível para a
  19 +visualização das imagens, conforme mostra a figura \ref{fig:closed_tool_menu}.
  20 +
  21 +\begin{figure}[!htb]
  22 +\centering
  23 +\includegraphics[scale=0.4]{closed_tool_menu}
  24 +\caption{Menu lateral ocultado}
  25 +\label{fig:closed_tool_menu}
  26 +\end{figure}
  27 +
  28 +\newpage
  29 +
  30 +\section{Posicionamento automático de volume/superfície}
  31 +
  32 +Para acertar automaticamente a posição de visualização de um volume ou superfície,
  33 +pode-se clicar sobre o ícone apresentado na figura \ref{fig:3d_automatic_position}
  34 +(localizado no canto inferior direito da tela do InVesalius) e escolher uma das
  35 +opções de visualização disponíveis.
  36 +
  37 +\begin{figure}[!htb]
  38 +\centering
  39 +\includegraphics[scale=0.45]{3d_automatic_position}
  40 +\caption{Opções de posição para visualização}
  41 +\label{fig:3d_automatic_position}
  42 +\end{figure}
  43 +
  44 +\section{Cor de fundo da janela de volume/superfície}
  45 +
  46 +Para alterar a cor de fundo da janela de volume/superfície, clique no atalho que a figura
  47 +\ref{fig:button_select_color_2} mostra. O atalho também está localizado no canto inferior
  48 +direito da tela do InVesalius.
  49 +
  50 +\begin{figure}[!htb]
  51 +\centering
  52 +\includegraphics[scale=0.8]{color_button}
  53 +\caption{Atalho para cor de fundo da janela de volume/superfície}
  54 +\label{fig:button_select_color_2}
  55 +\end{figure}
  56 +
  57 +Uma janela para seleção de cor se abre, como aparece na figura \ref{fig:color_window_background}.
  58 +Após isso, basta clicar sobre a cor desejada e, em seguida, clicar em \textbf{OK}.
  59 +
  60 +\begin{figure}[!htb]
  61 +\centering
  62 +\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142}
  63 +\caption{Seleção de cor de fundo}
  64 +\label{fig:color_window_background}
  65 +\end{figure}
  66 +
  67 +A figura \ref{fig:background_color} mostra um exemplo dessa janela com a cor de fundo alterada.
  68 +
  69 +\begin{figure}[!htb]
  70 +\centering
  71 +\includegraphics[scale=0.6]{3d_background}
  72 +\caption{Cor de fundo alterada}
  73 +\label{fig:background_color}
  74 +\end{figure}
  75 +
  76 +\newpage
  77 +
  78 +\section{Exibir/ocultar textos em janela 2D}
  79 +
  80 +Para exibir ou ocultar os textos que aparecem nas janelas de imagens 2D, clique no atalho
  81 +exibido na figura \ref{fig:text}, localizado na barra de ferramentas.
  82 +
  83 +\begin{figure}[!htb]
  84 +\centering
  85 +\includegraphics[scale=0.7]{text}
  86 +\caption{Atalho para exibir ou ocultar texto}
  87 +\label{fig:text}
  88 +\end{figure}
  89 +
  90 +As figuras \ref{fig:text_on} e \ref{fig:text_off} ilustram, respectivamente, a exibição
  91 +dos textos habilitada e desabilitada.
  92 +
  93 +\begin{figure}[!htb]
  94 +\centering
  95 +\includegraphics[scale=0.5]{text_on}
  96 +\caption{Exibição de texto habilitada}
  97 +\label{fig:text_on}
  98 +\end{figure}
  99 +
  100 +\begin{figure}[!htb]
  101 +\centering
  102 +\includegraphics[scale=0.5]{text_off}
  103 +\caption{Exibição de texto desabilitada}
  104 +\label{fig:text_off}
  105 +\end{figure}
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_export.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,99 @@
  1 +\chapter{Exportando dados}
  2 +
  3 +Com o InVesalius, é possível exportar dados para outros softwares, em formatos de arquivo
  4 +como OBJ, STL, entre outros.
  5 +
  6 +O menu que contém as opções para exportação localiza-se no painel esquerdo do InVesalius,
  7 +dentro do item \textbf{4. Exporte os dados}. Caso o menu não esteja visível, dê um clique
  8 +duplo com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre o item para expandi-lo. A figura
  9 +\ref{fig:data_export} mostra esse menu.
  10 +
  11 +\begin{figure}[!htb]
  12 +\centering
  13 +\includegraphics[scale=0.6]{data_export}
  14 +\caption{Menu para exportação de dados}
  15 +\label{fig:data_export}
  16 +\end{figure}
  17 +
  18 +\section{Superfície}
  19 +
  20 +Para exportar uma superfície, é necessário selecioná-la no menu de dados, conforme mostra a
  21 +figura \ref{fig:data_export_selection}.
  22 +
  23 +\newpage
  24 +
  25 +\begin{figure}[!htb]
  26 +\centering
  27 +\includegraphics[scale=0.6]{data_export_selection}
  28 +\caption{Seleção de superfície a exportar}
  29 +\label{fig:data_export_selection}
  30 +\end{figure}
  31 +
  32 +Em seguida, clique sobre o ícone que a figura \ref{fig:surface_export_original} ilustra.
  33 +
  34 +\begin{figure}[!htb]
  35 +\centering
  36 +\includegraphics[scale=0.2]{surface_export_original}
  37 +\caption{Atalho para exportar superfície}
  38 +\label{fig:surface_export_original}
  39 +\end{figure}
  40 +
  41 +Na janela exibida (figura \ref{fig:export_data_window}), insira o nome do arquivo e
  42 +selecione o formato desejado para a exportação. Em seguida, clique em \textbf{Save (Salvar)}.
  43 +
  44 +
  45 +\begin{figure}[!htb]
  46 +\centering
  47 +\includegraphics[scale=0.4]{export_data_window}
  48 +\caption{Janela para exportar superfície}
  49 +\label{fig:export_data_window}
  50 +\end{figure}
  51 +
  52 +Os tipos de arquivo que podem ser exportados estão listados na tabela
  53 +\ref{tab:files_export_list}:
  54 +
  55 +\begin{table}[h]
  56 +\centering
  57 +\caption{Formatos de arquivo que o InVesalius exporta}
  58 +\begin{tabular}{lcc}\\
  59 +\hline % este comando coloca uma linha na tabela
  60 +Formato & Extensão\\
  61 +\hline
  62 +\hline
  63 +Inventor & .iv\\
  64 +Polygon File Format & .ply\\
  65 +Renderman & .rib\\
  66 +Stereolithography (formato binário)& .stl\\
  67 +Stereolithography (formato ASCII) & .stl\\
  68 +VRML & .vrml\\
  69 +VTK PolyData & .vtp\\
  70 +Wavefront & .obj\\
  71 +\hline
  72 +\end{tabular}
  73 +\label{tab:files_export_list}
  74 +\end{table}
  75 +
  76 +
  77 +\section{Imagem}
  78 +
  79 +É possível exportar imagens de qualquer das orientações de exibição (axial, coronal,
  80 +sagital e 3D). Para isso, clique com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre o atalho
  81 +exibido na figura \ref{fig:menu_save_image_window} e selecione a sub-janela correspondente
  82 +à imagem que deseja exportar.
  83 +
  84 +\begin{figure}[!htb]
  85 +\centering
  86 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_save_image_window}
  87 +\caption{Menu para exportar imagem}
  88 +\label{fig:menu_save_image_window}
  89 +\end{figure}
  90 +
  91 +Na janela exibida (figura \ref{fig:save_image_window}), selecione o formato do arquivo e
  92 +clique no botão \textbf{Save (Salvar)}.
  93 +
  94 +\begin{figure}[!htb]
  95 +\centering
  96 +\includegraphics[scale=0.4]{save_image_window}
  97 +\caption{Janela para exportar imagem}
  98 +\label{fig:save_image_window}
  99 +\end{figure}
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_geren_dados.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,119 @@
  1 +\chapter{Gerenciamento de dados}
  2 +
  3 +Nos capítulos anteriores, mostrou-se como manipular superfícies, máscaras para segmentação
  4 +e medições. É possível exibir ou ocultar e criar ou remover esses elementos pelo painel de
  5 +gerenciamento de \textbf{Dados}, localizado no canto inferior esquerdo da tela do InVesalius.
  6 +O painel é dividido em 3 abas: \textbf{Máscaras}, \textbf{Superfícies 3D} e \textbf{Medições},
  7 +conforme mostra a figura \ref{fig:volumetric_data}. Cada uma das abas agrupa dados
  8 +correspondentes aos elementos a que se referem.
  9 +
  10 +%\begin{figure}[!htb]
  11 +%\centering
  12 +%\includegraphics[scale=0.5]{medida_volumetrica}
  13 +%\caption{Gerenciamento de dados}
  14 +%\label{fig:volumetric_data}
  15 +%\end{figure}
  16 +
  17 +\begin{figure}[!htb]
  18 +\centering
  19 +\includegraphics[scale=0.5]{mask_manager}
  20 +\caption{Gerenciamento de dados}
  21 +\label{fig:volumetric_data}
  22 +\end{figure}
  23 +
  24 +Dentro de cada aba, aparece um painel dividido em linhas e colunas. Em cada linha, a primeira
  25 +coluna determina a visualização do elemento listado naquela linha. Isto é, o ícone que
  26 +representa um "olho" ativa ou desativa a exibição das máscaras, superfícies ou medições. Caso
  27 +um desses elementos esteja em exibição, o ícone da figura \ref{fig:disable_mask} correspondente
  28 +a ele também estará visível.
  29 +
  30 +\newpage
  31 +
  32 +\begin{figure}[!htb]
  33 +\centering
  34 +\includegraphics[scale=0.9]{eye}
  35 +\caption{Ícone indicativo da visibilidade de elementos}
  36 +\label{fig:disable_mask}
  37 +\end{figure}
  38 +
  39 +Algumas operações são possíveis sobre os dados. Por exemplo, para excluir um dado, é necessário
  40 +primeiro selecionar seu nome, como mostra a figura \ref{fig:selected_mask} e, em seguida, clicar
  41 +no atalho que a figura \ref{fig:delete_data} ilustra.
  42 +
  43 +\begin{figure}[!htb]
  44 +\centering
  45 +\includegraphics[scale=0.5]{selected_mask}
  46 +\caption{Dado selecionado}
  47 +\label{fig:selected_mask}
  48 +\end{figure}
  49 +
  50 +
  51 +\begin{figure}[!htb]
  52 +\centering
  53 +\includegraphics[scale=0.8]{delete_data}
  54 +\caption{Excluir dado}
  55 +\label{fig:delete_data}
  56 +\end{figure}
  57 +
  58 +Para criar uma nova máscara, superfície ou medição, basta clicar no atalho ilustrado na figura
  59 +\ref{fig:new_data}, desde que a respectiva aba esteja aberta.
  60 +
  61 +\begin{figure}[!htb]
  62 +\centering
  63 +\includegraphics[scale=0.8]{new_data}
  64 +\caption{Novo dado}
  65 +\label{fig:new_data}
  66 +\end{figure}
  67 +
  68 +Para copiar um dado, basta selecioná-lo e clicar no atalho que a figura \ref{fig:duplicate_data}
  69 +ilustra.
  70 +
  71 +\begin{figure}[!htb]
  72 +\centering
  73 +\includegraphics[scale=0.8]{duplicate_data}
  74 +\caption{Copiar dado}
  75 +\label{fig:duplicate_data}
  76 +\end{figure}
  77 +
  78 +
  79 +\newpage
  80 +
  81 +
  82 +\section{Máscaras}
  83 +
  84 +Na coluna \textbf{Nome}, são exibidos a cor e o nome atribuídos à máscara. Já a coluna
  85 +\textbf{Limiar} exibe o intervalo de valores utilizado para criar a máscara. A figura
  86 +\ref{fig:volumetric_data} mostra um exemplo.
  87 +
  88 +\section{Superfícies 3D}
  89 +
  90 +Na coluna \textbf{Nome}, são exibidos a cor e o nome atribuídos à superfície. A coluna
  91 +\textbf{Volume} mostra o volume total da superfície. Por fim, a coluna \textbf{Transparência}
  92 +indica o nível de transparência em uso para exibir a superfície. A figura \ref{fig:surface_manager}
  93 +traz um exemplo.
  94 +
  95 +\begin{figure}[!htb]
  96 +\centering
  97 +\includegraphics[scale=0.5]{surface_manager}
  98 +\caption{Gerenciamento de superfícies}
  99 +\label{fig:surface_manager}
  100 +\end{figure}
  101 +
  102 +
  103 +\newpage
  104 +
  105 +
  106 +\section{Medições}
  107 +
  108 +A aba \textbf{Medições} traz as seguintes informações. A coluna \textbf{Nome} exibe a cor e o
  109 +nome atribuídos à medição. A coluna \textbf{Local} exibe onde a medição foi feita (imagem axial,
  110 +coronal, sagital ou 3D), e \textbf{Tipo} indica o tipo da medida (linear ou angular). Por último,
  111 +a coluna \textbf{Valor} informa a medida propriamente dita. Veja a figura \ref{fig:manager_mensuares}.
  112 +
  113 +\begin{figure}[!htb]
  114 +\centering
  115 +\includegraphics[scale=0.5]{manager_mensuares}
  116 +\caption{Gerenciamento de medições}
  117 +\label{fig:manager_mensuares}
  118 +\end{figure}
  119 +
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_import.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,104 @@
  1 +\chapter{Importação}
  2 +
  3 +O InVesalius importa arquivos no formato DICOM, incluindo arquivos compactados (JPEG sem perdas e
  4 +com perdas) e arquivos no formato Analyze (Mayo Clinic)$^\copyright$.
  5 +
  6 +\section{DICOM}
  7 +
  8 +No menu \textbf{Arquivo}, clique na opção \textbf{Importar DICOM...}. Se preferir, use o atalho
  9 +do teclado \textbf{Ctrl + I}. A importação também pode ser acionada pelo ícone da barra de ferramentas
  10 +descrito na figura \ref{fig:import}.
  11 +
  12 +\begin{figure}[!htb]
  13 +\centering
  14 +\includegraphics[scale=0.2]{file_import_original.png}
  15 +\caption{Atalho para Importar DICOM}
  16 +\label{fig:import}
  17 +\end{figure}
  18 +
  19 +\hspace{.2cm}
  20 +
  21 +Em seguida, selecione o diretório que contenha os arquivos DICOM, como na figura \ref{fig:win_folder}.
  22 +O InVesalius irá procurar por arquivos também em subdiretórios do diretório escolhido, caso existam.
  23 +
  24 +\newpage
  25 +
  26 +Clique em \textbf{OK}.
  27 +
  28 +\begin{figure}[!htb]
  29 +\centering
  30 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec311139.jpg}
  31 +\caption{Seleção de diretório}
  32 +\label{fig:win_folder}
  33 +\end{figure}
  34 +
  35 +\hspace{.2cm}
  36 +
  37 +Enquanto o InVesalius procura por arquivos DICOM no diretório, é exibido o progresso
  38 +do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:ver_file}.
  39 +
  40 +\begin{figure}[!htb]
  41 +\centering
  42 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_03Dec311131.jpg}
  43 +\caption{Status de verificação e carregamento de arquivos}
  44 +\label{fig:ver_file}
  45 +\end{figure}
  46 +
  47 +\newpage
  48 +
  49 +Se arquivos DICOM forem encontrados, é aberta uma janela (figura \ref{fig:win_import})
  50 +para selecionar o paciente e a respectiva série que se deseja abrir. Também é possível
  51 +pular imagens para reconstrução.
  52 +
  53 +\begin{figure}[!htb]
  54 +\centering
  55 +\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_06Dec311139.jpg}
  56 +\caption{Tela de importação}
  57 +\label{fig:win_import}
  58 +\end{figure}
  59 +
  60 +\newpage
  61 +
  62 +Caso deseje importar uma série com todas as imagens presentes, clique em "\textbf{+}" ao
  63 +lado do nome do paciente para expandir as séries a ele pertencentes. Dê um \textbf{clique duplo}
  64 +com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre a descrição da série. Veja a figura
  65 +\ref{fig:import_serie}.
  66 +
  67 +\begin{figure}[!htb]
  68 +\centering
  69 +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_08Dec311139_.jpg}
  70 +\caption{Seleção de série}
  71 +\label{fig:import_serie}
  72 +\end{figure}
  73 +
  74 +%\hspace{.2cm}
  75 +
  76 +Em alguns casos, em particular quando não se dispõe de um computador com memória e/ou
  77 +processamento satisfatórios para trabalhar com muitas imagens em uma série, pode ser
  78 +recomendável pular (ignorar) algumas delas. Para isso, clique \textbf{uma vez} com o botão
  79 +\textbf{esquerdo} do mouse sobre a descrição da série (figura \ref{fig:import_serie}) e selecione
  80 +quantas imagens serão puladas (figura \ref{fig:skip_image}). Clique em \textbf{OK}.
  81 +
  82 +\begin{figure}[!htb]
  83 +\centering
  84 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_13Dec311140_.jpg}
  85 +\caption{Pular imagens}
  86 +\label{fig:skip_image}
  87 +\end{figure}
  88 +
  89 +%\hspace{.2cm}
  90 +
  91 +Em ambos os procedimentos, será apresentada uma janela (figura \ref{fig:prog_recons}) com o progresso
  92 +da reconstrução (quando as imagens são empilhadas e interpoladas).
  93 +
  94 +\begin{figure}[!htb]
  95 +\centering
  96 +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_14Dec311140.jpg}
  97 +\caption{Progresso da reconstrução}
  98 +\label{fig:prog_recons}
  99 +\end{figure}
  100 +
  101 +\newpage
  102 +
  103 +\section{Analyze}
  104 +Para importar arquivos no formato Analyze, basta ...
0 105 \ No newline at end of file
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_instal.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,145 @@
  1 +\chapter{Instalação}
  2 +
  3 +\section{MS-Windows}
  4 +
  5 +Para instalar o InVesalius no MS-Windows, basta executar o programa instalador.
  6 +Quando aparecer uma janela pedindo para confirmar a execução do arquivo, clique
  7 +em \textbf{Executar}.
  8 +
  9 +\begin{figure}[!htb]
  10 +\centering
  11 +\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_02Dec311523.jpg}
  12 +\end{figure}
  13 +
  14 +\newpage
  15 +Uma nova janela pedirá para selecionar o idioma do instalador. Selecione
  16 +o idioma e clique em \textbf{OK}.
  17 +
  18 +\begin{figure}[!htb]
  19 +\centering
  20 +\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_03Dec311523.jpg}
  21 +\end{figure}
  22 +
  23 +\hspace{.2cm}
  24 +
  25 +Em seguida, será exibida a janela do instalador. Clique em \textbf{Avançar}.
  26 +
  27 +\begin{figure}[!htb]
  28 +\centering
  29 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_02Dec310024.jpg}
  30 +\end{figure}
  31 +
  32 +\newpage
  33 +
  34 +Selecione \textbf{Eu aceito os termos do Contrato} e clique em \textbf{Avançar}.
  35 +
  36 +\begin{figure}[!htb]
  37 +\centering
  38 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec310024.jpg}
  39 +\end{figure}
  40 +
  41 +\hspace{.2cm}
  42 +
  43 +Clique em \textbf{Avançar} novamente.
  44 +
  45 +\begin{figure}[!htb]
  46 +\centering
  47 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_05Dec310024.jpg}
  48 +\end{figure}
  49 +
  50 +\newpage
  51 +
  52 +Clique em \textbf{Avançar}.
  53 +
  54 +\begin{figure}[!htb]
  55 +\centering
  56 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_06Dec310024.jpg}
  57 +\end{figure}
  58 +
  59 +\hspace{.2cm}
  60 +
  61 +Selecione \textbf{Criar um ícone na Área de Trabalho} e \textbf{Criar um ícone
  62 +na Barra de Inicialização Rápida} e clique em \textbf{Avançar}.
  63 +
  64 +\begin{figure}[!htb]
  65 +\centering
  66 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_08Dec310024.jpg}
  67 +\end{figure}
  68 +
  69 +\newpage
  70 +
  71 +Clique em \textbf{Instalar}.
  72 +
  73 +\begin{figure}[!htb]
  74 +\centering
  75 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_09Dec310024.jpg}
  76 +\end{figure}
  77 +
  78 +\hspace{.2cm}
  79 +
  80 +Enquanto o software é instalado, será exibida uma janela com o progresso
  81 +da instalação.
  82 +
  83 +\begin{figure}[!htb]
  84 +\centering
  85 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_11Dec310025.jpg}
  86 +\end{figure}
  87 +
  88 +\newpage
  89 +
  90 +Para executar o InVesalius após a instalação, clique em \textbf{Concluir}.
  91 +
  92 +\begin{figure}[!htb]
  93 +\centering
  94 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_14Dec310025.jpg}
  95 +\end{figure}
  96 +
  97 +\hspace{.2cm}
  98 +
  99 +Caso seja a primeira vez em que o software é instalado, será exibida uma janela
  100 +para selecionar o idioma do InVesalius. Selecione o idioma desejado e clique em
  101 +\textbf{OK}.
  102 +
  103 +\begin{figure}[!htb]
  104 +\centering
  105 +\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_15Dec310025.jpg}
  106 +\end{figure}
  107 +
  108 +\newpage
  109 +
  110 +Enquanto o InVesalius é carregado, é exibida uma janela de abertura como a da figura
  111 +seguinte.
  112 +
  113 +\begin{figure}[!htb]
  114 +\centering
  115 +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_17Dec310026.jpg}
  116 +\end{figure}
  117 +
  118 +\hspace{.2cm}
  119 +
  120 +Em seguida, a janela principal do programa é aberta.
  121 +
  122 +\begin{figure}[!htb]
  123 +\centering
  124 +\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_18Dec310026.jpg}
  125 +\end{figure}
  126 +
  127 +\section{Mac Os X}
  128 +
  129 +Para iniciar a instalação no Mac Os X, clique 2 vezes com o botão esquerdo do mouse sobre o instalador.
  130 +Em seguida o instalador será inicializado.
  131 +
  132 +\begin{figure}[!htb]
  133 +\centering
  134 +\includegraphics[scale=0.3]{mac2.png}
  135 +\end{figure}
  136 +
  137 +Mantenha o botão esquerdo pressionado sobre o ícone do software InVesalius e arraste-o para o ícone \textit{Applications}
  138 +ambos contidos no instalador.
  139 +
  140 +\begin{figure}[!htb]
  141 +\centering
  142 +\includegraphics[scale=0.4]{mac4.png}
  143 +\end{figure}
  144 +
  145 +O software já encontra-se instalado, bastando acessar pelo menu
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_manip.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,388 @@
  1 +\chapter{Manipulação de Imagens (2D)}
  2 +
  3 +\section{Reconstrução Multiplanar}
  4 +
  5 +Ao importar as imagens DICOM, o InVesalius mostra, automaticamente, a sua reconstrução
  6 +multiplanar nas orientações Axial, Sagital e Coronal, bem como uma janela para manipulação 3D.
  7 +Veja a figura \ref{fig:mpr}.
  8 +
  9 +\begin{figure}[!htb]
  10 +\centering
  11 +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_18Dec311140_1.jpg}
  12 +\caption{Reconstrução multiplanar}
  13 +\label{fig:mpr}
  14 +\end{figure}
  15 +
  16 +\newpage
  17 +
  18 +Além de criar a reconstrução multiplanar, o InVesalius segmenta a imagem, destacando, por exemplo, os
  19 +ossos dos tecidos moles. O destaque é representado por meio da aplicação de cores sobre a estrutura
  20 +segmentada, isto é, as cores formam uma máscara sobre a imagem destacando a estrutura (figura
  21 +\ref{fig:mpr}). Isso será discutido em mais detalhes nos próximos capítulos.
  22 +
  23 +Para esconder a máscara, usa-se o gerenciador de dados, localizado no canto inferior esquerdo
  24 +da tela. Basta escolher a aba \textbf{Máscaras} e clicar \textbf{uma} vez com o botão
  25 +\textbf{esquerdo} do mouse sobre o ícone do olho ao lado de \textbf{"Máscara 1"}. Veja a figura
  26 +\ref{fig:ger_masc}.
  27 +
  28 +\begin{figure}[!htb]
  29 +\centering
  30 +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_29Dec311141_.jpg}
  31 +\caption{Gerenciador de máscaras}
  32 +\label{fig:ger_masc}
  33 +\end{figure}
  34 +
  35 +O ícone do olho desaparece, e as cores da máscara de segmentação são escondidas (figura
  36 +\ref{fig:mpr_sem_mask}).
  37 +
  38 +\begin{figure}[!htb]
  39 +\centering
  40 +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_28Dec311141_.jpg}
  41 +\caption{Reconstrução multiplanar sem máscara de segmentação}
  42 +\label{fig:mpr_sem_mask}
  43 +\end{figure}
  44 +
  45 +\subsection{Orientação axial}
  46 +
  47 +A orientação axial é composta de cortes transversais da região
  48 +de interesse, ou seja, cortes paralelos ao plano axial do corpo humano.
  49 +Na figura \ref{fig:axial_corte}, é exibida uma imagem em orientação axial da
  50 +região do crânio.
  51 +
  52 +\begin{figure}[!htb]
  53 +\centering
  54 +\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_24Dec310029_.jpg}
  55 +\caption{Corte axial}
  56 +\label{fig:axial_corte}
  57 +\end{figure}
  58 +
  59 +\subsection{Orientação sagital}
  60 +
  61 +A orientação sagital é composta de cortes realizados lateralmente
  62 +em relação à região de interesse, ou seja, cortes paralelos ao plano sagital do corpo humano,
  63 +que o divide nas porções esquerda e direita.
  64 +A figura \ref{fig:sagital_slice} mostra uma imagem do crânio em orientação sagital.
  65 +
  66 +\begin{figure}[!htb]
  67 +\centering
  68 +\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_25Dec310029_.jpg}
  69 +\caption{Corte sagital}
  70 +\label{fig:sagital_slice}
  71 +\end{figure}
  72 +
  73 +\newpage
  74 +
  75 +\subsection{Orientação coronal}
  76 +
  77 +A orientação coronal é composta de cortes paralelos ao plano coronal,
  78 +que divide o corpo humano em metades ventral e dorsal.
  79 +A figura \ref{fig:coronal_slice} mostra uma imagem do crânio em orientação
  80 +coronal.
  81 +
  82 +\begin{figure}[!htb]
  83 +\centering
  84 +\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_24Dec311141_.jpg}
  85 +\caption{Corte coronal}
  86 +\label{fig:coronal_slice}
  87 +\end{figure}
  88 +
  89 +
  90 +\section{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal}
  91 +
  92 +Para saber qual o ponto comum das imagens nas diferentes orientações, basta acionar o
  93 +recurso "Cruz de interseção de fatias" pelo ícone de atalho localizado na barra de ferramentas.
  94 +Veja a figura \ref{fig:cross_icon}.
  95 +
  96 +\begin{figure}[!htb]
  97 +\centering
  98 +\includegraphics[scale=1]{cross.png}
  99 +\caption{Atalho para mostrar ponto comum entre diferentes orientações}
  100 +\label{fig:cross_icon}
  101 +\end{figure}
  102 +
  103 +Quando o recurso é acionado, dois segmentos de reta que se cruzam perpendicularmente são exibidos
  104 +sobre cada imagem (figura \ref{fig:cross_all}). O ponto de interseção de cada par de segmentos
  105 +representa o ponto comum entre as diferentes orientações.
  106 +
  107 +\newpage
  108 +
  109 +Para modificar o ponto, mantenha \textbf{pressionado} o botão \textbf{esquerdo} do mouse e o
  110 +\textbf{arraste}. Automaticamente, os pontos correspondentes serão atualizados em cada imagem.
  111 +
  112 +\begin{figure}[!htb]
  113 +\centering
  114 +\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_01Jan021941.jpg}
  115 +\caption{Ponto comum entre orientações diferentes}
  116 +\label{fig:cross_all}
  117 +\end{figure}
  118 +
  119 +Para desativar a funcionalidade, basta clicar novamente sobre o atalho (figura \ref{fig:cross_icon}).
  120 +Esse recurso pode ser utilizado em conjunto com o editor de fatias (que será comentado mais à frente).
  121 +
  122 +\newpage
  123 +
  124 +\section{Mover}
  125 +
  126 +Para mover uma imagem na tela, pode-se utilizar o ícone do atalho "Mover" da barra de ferramentas (figura
  127 +\ref{fig:move_icon}). Clique sobre o ícone para ativar o recurso e, em seguida, com o botão
  128 +\textbf{esquerdo} do mouse pressionado sobre a imagem, \textbf{arraste-a} para a direção desejada.
  129 +A figura \ref{fig:move_img} mostra uma imagem deslocada (movida).
  130 +
  131 +\begin{figure}[!htb]
  132 +\centering
  133 +\includegraphics[scale=0.25]{tool_translate_original.png}
  134 +\caption{Atalho para mover imagens}
  135 +\label{fig:move_icon}
  136 +\end{figure}
  137 +
  138 +\begin{figure}[!htb]
  139 +\centering
  140 +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_84Dec311201.jpg}
  141 +\caption{Imagem deslocada}
  142 +\label{fig:move_img}
  143 +\end{figure}
  144 +
  145 +\section{Rotacionar}
  146 +
  147 +A rotação de imagens pode ser ativada pelo ícone do atalho "Rotacionar" da barra de ferramentas (figura
  148 +\ref{fig:rot_icon}). Para rotacionar uma imagem, clique sobre o ícone e, em seguida, com o botão
  149 +\textbf{esquerdo} do mouse pressionado sobre a imagem, \textbf{arraste-a} no sentido horário ou
  150 +anti-horário, dependendo do sentido de rotação desejado.
  151 +
  152 +\begin{figure}[!htb]
  153 +\centering
  154 +\includegraphics[scale=0.25]{tool_rotate_original.png}
  155 +\caption{Atalho para rotacionar imagens}
  156 +\label{fig:rot_icon}
  157 +\end{figure}
  158 +
  159 +\begin{figure}[!htb]
  160 +\centering
  161 +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_83Dec311201_.jpg}
  162 +\caption{Imagem rotacionada}
  163 +\label{fig:rotate_all}
  164 +\end{figure}
  165 +
  166 +\section{Ampliar (\textit{Zoom})}
  167 +
  168 +No InVesalius, existem diferentes formas de ampliar uma imagem. Pode-se maximizar a janela da
  169 +orientação desejada, aplicar o \textit{zoom} diretamente na imagem, ou selecionar a região da imagem
  170 +que será ampliada.
  171 +
  172 +
  173 +\subsection{Maximizando as janelas de orientação}
  174 +
  175 +Como já sabemos, a janela principal do InVesalius é dividida em 4 subjanelas: axial, sagital, coronal
  176 +e 3D. Cada uma delas pode ser maximizada de modo a ocupar toda a área da janela principal. Para isso,
  177 +basta clicar com o botão \textbf{esquerdo} do mouse no ícone existente no \textbf{canto superior direito}
  178 +da subjanela (figura \ref{fig:maximize_window}). Para restaurar uma janela maximizada a seu tamanho
  179 +anterior, basta clicar novamente no ícone.
  180 +
  181 +\begin{figure}[!htb]
  182 +\centering
  183 +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_27Dec311141__.jpg}
  184 +\caption{Detalhe de uma subjanela (Observe o ícone de maximizar no canto superior direito)}
  185 +\label{fig:maximize_window}
  186 +\end{figure}
  187 +
  188 +\subsection{Ampliando ou reduzindo uma imagem}
  189 +
  190 +Para ampliar ou reduzir uma imagem, clique sobre o ícone do atalho "\textit{Zoom}" na barra de
  191 +ferramentas (figura \ref{fig:zoom_icon}). Mantenha o botão \textbf{esquerdo} pressionado sobre
  192 +a imagem e \textbf{arraste} o mouse para \textbf{cima}, caso deseje ampliá-la, ou para \textbf{baixo},
  193 +caso deseje reduzi-la.
  194 +
  195 +\begin{figure}[!htb]
  196 +\centering
  197 +\includegraphics[scale=0.25]{tool_zoom_original.png}
  198 +\caption{Atalho de \textit{Zoom}}
  199 +\label{fig:zoom_icon}
  200 +\end{figure}
  201 +
  202 +%\begin{figure}[!htb]
  203 +%\centering
  204 +%\includegraphics[scale=0.2]{ScreenHunter_76Dec311201_.jpg}
  205 +%\caption{Imagem com \textit{Zoom} aplicado}
  206 +%\label{fig:zoom_}
  207 +%\end{figure}
  208 +
  209 +\subsection{Ampliando uma área da imagem}
  210 +
  211 +Para ampliar uma área determinada da imagem, clique sobre o ícone do atalho "Zoom baseado na seleção"
  212 +na barra de ferramentas (figura \ref{fig:zoom_icon_loc}). Posicione o ponteiro do mouse na posição
  213 +inicial da seleção, clique e mantenha o botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado e \textbf{arraste-o}
  214 +até a posição final da seleção, formando um retângulo (figura \ref{fig:zoom_select}). Assim que o
  215 +botão esquerdo do mouse for liberado, a operação de \textit{zoom} será aplicada à região selecionada
  216 +(figura \ref{fig:zoom_applied}).
  217 +
  218 +\begin{figure}[!htb]
  219 +\centering
  220 +\includegraphics[scale=0.25]{tool_zoom_select_original.png}
  221 +\caption{Atalho de \textit{Zoom} baseado na seleção}
  222 +\label{fig:zoom_icon_loc}
  223 +\end{figure}
  224 +
  225 +\begin{figure}[!htb]
  226 +\centering
  227 +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_06Jan062046.jpg}
  228 +\caption{Área selecionada para \textit{zoom}}
  229 +\label{fig:zoom_select}
  230 +\end{figure}
  231 +
  232 +\begin{figure}[!htb]
  233 +\centering
  234 +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_08Jan062046.jpg}
  235 +\caption{Imagem ampliada}
  236 +\label{fig:zoom_applied}
  237 +\end{figure}
  238 +
  239 +
  240 +\section{Brilho e contraste (Janelas)}
  241 +\label{sec:ww_wl}
  242 +
  243 +Para melhorar a visualização das imagens, podemos utilizar o recurso de \textit{window width} e
  244 +\textit{window level}, popularmente conhecido por "brilho e contraste" ou "janela" (para radiologistas).
  245 +Com esse recurso, é possível definir a faixa da escala de cinza (\textit{window level}) e a
  246 +largura dessa faixa (\textit{window width}) que serão usadas para exibir as imagens.
  247 +
  248 +O recurso pode ser acionado pelo ícone do atalho "Contraste" na barra de ferramentas. Veja a figura \ref{fig:window_level_shortcut}.
  249 +
  250 +\begin{figure}[!htb]
  251 +\centering
  252 +\includegraphics[scale=0.70]{tool_contrast_original.png}
  253 +\caption{Atalho de brilho e contraste}
  254 +\label{fig:window_level_shortcut}
  255 +\end{figure}
  256 +
  257 +Para aumentar o brilho, mantenha o botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado e o \textbf{arraste} na
  258 +horizontal para a direita. Para diminuir o brilho, basta arrastar o mouse para a esquerda. O contraste
  259 +pode ser alterado arrastando o mouse (com o botão \textbf{esquerdo} pressionado) na vertical: para cima
  260 +para aumentar, ou para baixo para diminuir o contraste.
  261 +
  262 +Para desabilitar o recurso, clique novamente sobre o ícone do atalho (figura \ref{fig:window_level_shortcut}).
  263 +
  264 +É possível utilizar padrões pré-definidos de brilho e contraste. A tabela \ref{tab:window_level} relaciona
  265 +alguns tipos de tecido com os respectivos valores de brilho e contraste da imagem. Para usar um padrão
  266 +pré-definido, posicione o cursor do mouse sobre a imagem e clique com o botão \textbf{direito} para abrir um
  267 +menu de contexto sobre ela. Quando o menu se abrir, selecione a entrada \textbf{Brilho e Contraste} e, em
  268 +seguida, clique sobre a opção pré-definida, de acordo com o tipo de tecido, como mostra a figura
  269 +\ref{fig:window_level}.
  270 +
  271 +
  272 +\begin{figure}[!htb]
  273 +\centering
  274 +\includegraphics[scale=0.40]{ScreenHunter_12Jan021943_0.png}
  275 +\caption{Menu de contexto para seleção de brilho e contraste}
  276 +\label{fig:window_level}
  277 +\end{figure}
  278 +
  279 +\begin{table}[h]
  280 +\centering
  281 +\caption{Valores de brilho e contraste para alguns tecidos}
  282 +\begin{tabular}{lcc}\\
  283 +\hline % este comando coloca uma linha na tabela
  284 +Tecido & Brilho & Contraste\\
  285 +\hline
  286 +\hline
  287 +Padrão & Exame & Exame\\
  288 +Manual & Alterado & Alterado\\
  289 +Abdômen & 350 & 50 \\
  290 +Cérebro & 80 & 40\\
  291 +Enfisema & 500 & -850\\
  292 +Fossa Posterior Nasal & 120 & 40\\
  293 +Fígado & 2000 & -500\\
  294 +Isquemia - Contraste Tecidos Duros & 15 & 32\\
  295 +Isquemia - Contraste Tecidos Moles & 80 & 20\\
  296 +Laringe & 180 & 80\\
  297 +Mediastino & 350 & 25\\
  298 +Osso & 2000 & 300\\
  299 +Pélvis & 450 & 50\\
  300 +Pulmão Duro & 1000 & -600\\
  301 +Pulmão Mole & 1600 & -600\\
  302 +Seio & 4000 & 400\\
  303 +Vascular - Duro & 240 & 80\\
  304 +Vascular - Mole & 680 & 160\\
  305 +\hline
  306 +\end{tabular}
  307 +\label{tab:window_level}
  308 +\end{table}
  309 +
  310 +\begin{figure}
  311 + \centering
  312 + \subfloat[Osso]{\label{fig:contrast_bone}\includegraphics[width=0.4\textwidth]{contraste_osso}}
  313 + \subfloat[Pulmão]{\label{fig:contrast_isq}\includegraphics[width=0.4\textwidth]{contraste_pulmao}}
  314 + \caption{Diferentes tipos de brilho e constraste}
  315 + \label{fig:two_window_level}
  316 +\end{figure}
  317 +
  318 +
  319 +\section{Pseudocor}
  320 +
  321 +Outro recurso para melhorar a visualização das imagens são as pseudocores. Elas substituem os níveis
  322 +de cinza por cores, ou pelos níveis de cinza invertidos. Nesse último caso, regiões da imagem que
  323 +antes eram mais claras se tornam mais escuras e vice-versa.
  324 +
  325 +Para alterar a visualização usando uma pseudocor, posicione o cursor do mouse sobre a imagem e clique
  326 +com o botão \textbf{direito} para abrir um menu de contexto sobre ela. Quando o menu se abrir,
  327 +selecione a entrada \textbf{Pseudocor} e, em seguida, clique sobre a opção de pseudocor desejada, como
  328 +mostra a figura \ref{fig:pseudo_color}.
  329 +
  330 +\begin{figure}[!htb]
  331 +\centering
  332 +\includegraphics[scale=0.40]{pseudo_menu.png}
  333 +\caption{Pseudo Cor}
  334 +\label{fig:pseudo_color}
  335 +\end{figure}
  336 +
  337 +As figuras de \ref{fig:image_default} a \ref{fig:image_saturation} exemplificam as diversas opções de
  338 +pseudocor disponíveis.\\
  339 +
  340 +\begin{figure}[!htb]
  341 +\centering
  342 +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_24Dec310029.jpg}
  343 +\caption{Padrão}
  344 +\label{fig:image_default}
  345 +\end{figure}
  346 +
  347 +\begin{figure}[!htb]
  348 +\centering
  349 +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_21Jan021944.jpg}
  350 +\caption{Imagem Cinza Invertido}
  351 +\label{fig:image_inverted}
  352 +\end{figure}
  353 +
  354 +\begin{figure}[!htb]
  355 +\centering
  356 +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_20Jan021944}
  357 +\caption{Arco-íris}
  358 +\label{fig:image_arc}
  359 +\end{figure}
  360 +
  361 +\begin{figure}[!htb]
  362 +\centering
  363 +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_22Jan021944}
  364 +\caption{Deserto}
  365 +\label{fig:image_desert}
  366 +\end{figure}
  367 +
  368 +\begin{figure}[!htb]
  369 +\centering
  370 +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_23Jan021944}
  371 +\caption{Matiz}
  372 +\label{fig:image_matiz}
  373 +\end{figure}
  374 +
  375 +\begin{figure}[!htb]
  376 +\centering
  377 +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_24Jan021944}
  378 +\caption{Oceano}
  379 +\label{fig:image_ocean}
  380 +\end{figure}
  381 +
  382 +\begin{figure}[!htb]
  383 +\centering
  384 +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_25Jan021944}
  385 +\caption{Saturação}
  386 +\label{fig:image_saturation}
  387 +\end{figure}
  388 +
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_med.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,99 @@
  1 +\chapter{Medições}
  2 +
  3 +O InVesalius permite realizar medições lineares e angulares em 2D (planos axial,
  4 +coronal e sagital) e em 3D (superfícies). Também é possível fazer medições
  5 +volumétricas em superfícies.
  6 +
  7 +\section{Medição linear}
  8 +
  9 +Para realizar medições lineares, é necessário ativar o recurso clicando no atalho
  10 +correspondente localizado na barra de ferramentas (figura \ref{fig:measure_line_original}).
  11 +
  12 +\begin{figure}[!htb]
  13 +\centering
  14 +\includegraphics[scale=0.2]{measure_line_original}
  15 +\caption{Atalho para ativar medição linear}
  16 +\label{fig:measure_line_original}
  17 +\end{figure}
  18 +
  19 +Uma medição linear é definida entre dois pontos. Com o recurso ativado, clique
  20 +\textbf{uma} vez sobre a imagem para estabelecer o ponto inicial. Em seguida,
  21 +posicione o ponteiro do mouse no ponto final e clique \textbf{uma} vez novamente.
  22 +A medição é executada e o resultado é exibido automaticamente sobre a imagem ou
  23 +superfície.
  24 +
  25 +A figura \ref{fig:axial_linear} mostra uma medida linear em 2D na orientação axial,
  26 +e a figura \ref{fig:3d_linear} mostra outra medida linear em 3D (superfície).
  27 +
  28 +\begin{figure}[!htb]
  29 +\centering
  30 +\includegraphics[scale=0.4]{axial_linear}
  31 +\caption{Medida linear sobre imagem plana}
  32 +\label{fig:axial_linear}
  33 +\end{figure}
  34 +
  35 +\begin{figure}[!htb]
  36 +\centering
  37 +\includegraphics[scale=0.3]{3d_linear}
  38 +\caption{Medida linear sobre superfície}
  39 +\label{fig:3d_linear}
  40 +\end{figure}
  41 +
  42 +\newpage
  43 +
  44 +\textbf{Nota: A medida linear é dada em milímetros (mm).}
  45 +
  46 +\section{Medição angular}
  47 +
  48 +Uma medição angular em 2D ou sobre uma superfície (3D) pode ser realizada clicando-se
  49 +no atalho ilustrado na figura \ref{fig:atalho_angular}.
  50 +
  51 +\begin{figure}[!htb]
  52 +\centering
  53 +\includegraphics[scale=0.2]{measure_angle_original}
  54 +\caption{Atalho para medição angular}
  55 +\label{fig:atalho_angular}
  56 +\end{figure}
  57 +
  58 +Para efetuar a medição angular, é necessário fornecer os três pontos que descreverão o
  59 +ângulo a ser medido, A\^{B}C. Posicione o ponteiro do mouse e clique \textbf{uma} vez
  60 +com o botão esquerdo para determinar o primeiro ponto, A. Para inserir o segundo ponto,
  61 +B (o vértice do ângulo ou o "centro do transferidor"), posicione o ponteiro do mouse e
  62 +clique \textbf{uma} vez novamente. Repita as mesmas ações para determinar o terceiro
  63 +ponto, C. A medição é executada e, automaticamente, a medida resultante é exibida sobre
  64 +a imagem ou superfície.
  65 +
  66 +A figura \ref{fig:axial_angular} ilustra uma medida angular em uma imagem plana, e a
  67 +figura \ref{fig:axial_superficie} ilustra uma medida angular sobre uma superfície.
  68 +
  69 +\begin{figure}[!htb]
  70 +\centering
  71 +\includegraphics[scale=0.38]{axial_angular}
  72 +\caption{Medida angular sobre imagem plana}
  73 +\label{fig:axial_angular}
  74 +\end{figure}
  75 +
  76 +\begin{figure}[!htb]
  77 +\centering
  78 +\includegraphics[scale=0.33]{angular_superficie}
  79 +\caption{Medida angular sobre superfície}
  80 +\label{fig:axial_superficie}
  81 +\end{figure}
  82 +
  83 +\textbf{Nota: A medida angular é dada em graus ($^{\circ}$)}
  84 +
  85 +
  86 +\section{Medição volumétrica}
  87 +
  88 +As medições volumétricas são feitas automaticamente ao se criar uma nova superfície.
  89 +Elas são exibidas na aba \textbf{Superfícies 3D}, no painel de gerenciamento de \textbf{Dados}, localizado no canto
  90 +inferior esquerdo da tela, como ilustra a figura \ref{fig:volumetric_mensure}.
  91 +
  92 +\begin{figure}[!htb]
  93 +\centering
  94 +\includegraphics[scale=0.5]{medida_volumetrica}
  95 +\caption{Medidas volumétricas}
  96 +\label{fig:volumetric_mensure}
  97 +\end{figure}
  98 +
  99 +\textbf{Nota: A medida volumétrica é dada em milímetros cúbicos ($mm^3$)}
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_segmen.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,264 @@
  1 +\chapter{Segmentação}
  2 +
  3 +Para selecionar um determinado tipo de tecido da imagem, é utilizado o recurso de
  4 +segmentação, disponível no InVesalius.
  5 +
  6 +\section{Limiar (\textit{Threshold})}
  7 +
  8 +Limiar é uma técnica de segmentação de imagens que permite selecionar da imagem somente
  9 +os \textit{pixels} cuja intensidade está dentro de um limiar definido pelo usuário.
  10 +O limiar é definido por dois números, limiares inicial e final, também conhecidos como
  11 +\textit{thresholds} mínimo e máximo. Como referência para a definição, é utilizada a
  12 +escala de Hounsfield (tabela \ref{tab:escala_hounsfield}).
  13 +
  14 +A segmentação é acionada no painel situado no lado esquerdo da interface do InVesalius,
  15 +no item \textbf{2. Selecione a região de interesse} (figura \ref{fig:region_selection}).
  16 +
  17 +\begin{figure}[!htb]
  18 +\centering
  19 +\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter01Jan201144.jpg}
  20 +\caption{Seleção de região de interesse}
  21 +\label{fig:region_selection}
  22 +\end{figure}
  23 +
  24 +Antes de iniciar a segmentação, é necessário configurar uma máscara. A máscara é uma
  25 +imagem com a região selecionada colorida e sobreposta à imagem original. Veja a figura
  26 +(\ref{fig:region_selection_masc})
  27 +
  28 +\begin{figure}[!htb]
  29 +\centering
  30 +\includegraphics[scale=0.4]{limiar_principal}
  31 +\caption{Máscara (regiões em amarelo)}
  32 +\label{fig:region_selection_masc}
  33 +\end{figure}
  34 +
  35 +Para alterar o limiar, pode-se utilizar a barra que representa os níveis de cinza na imagem (figura
  36 +\ref{fig:region_selection_bar}). É possível alterar o limiar inicial usando o controle deslizante
  37 +\textit{esquerdo} da barra. De forma semelhante, o limiar final pode ser alterado por meio do controle
  38 +\textit{direito}. É possível, ainda, digitar diretamente os valores desejados nas respectivas caixas
  39 +de texto nas extremidades da barra. Com a alteração dos valores, automaticamente a máscara será atualizada,
  40 +pintando somente os \textit{pixels} com intensidade dentro da faixa determinada.
  41 +
  42 +\begin{figure}[!htb]
  43 +\centering
  44 +\includegraphics[scale=0.7]{limiar_barra}
  45 +\caption{Seleção dos \textit{pixels} com intensidade entre 226 e 3021 (Osso)}
  46 +\label{fig:region_selection_bar}
  47 +\end{figure}
  48 +
  49 +Também existem valores pré-definidos de limiar de acordo com alguns tipos de tecido, como mostra a
  50 +figura \ref{fig:limiar_presets}. Basta selecionar o tecido desejado e a máscara será atualizada
  51 +automaticamente.
  52 +
  53 +\begin{figure}[!htb]
  54 +\centering
  55 +\includegraphics[scale=0.6]{limiar_presets}
  56 +\caption{Caixa de seleção de valores pré-definidos de limiar}
  57 +\label{fig:limiar_presets}
  58 +\end{figure}
  59 +
  60 +A tabela \ref{tab:limiar} mostra a faixa de níveis de cinza de acordo com o tipo de tecido ou material.
  61 +
  62 +\begin{table}[h]
  63 +\centering
  64 +\caption{Limiares pré-definidos para alguns materiais}
  65 +\begin{tabular}{lcc}\\
  66 +\hline % este comando coloca uma linha na tabela
  67 +Material & Limiar inicial & Limiar final\\
  68 +\hline
  69 +\hline
  70 +Esmalte (Adulto) & 1553 & 2850\\
  71 +Esmalte (Criança) & 2042 & 3021\\
  72 +Osso & 226 & 3021\\
  73 +Osso Compacto (Adulto) & 662 & 1988\\
  74 +Osso Compacto (Criança) & 586 & 2198\\
  75 +Osso Esponjoso (Adulto) & 148 & 661\\
  76 +Osso Esponjoso (Criança) & 156 & 585\\
  77 +Personalizado & Def. Usuário & Def. Usuário\\
  78 +Tecido Epitelial (Adulto) & -718 & -177\\
  79 +Tecido Epitelial (Criança) & -766 & -202\\
  80 +Tecido Gorduroso (Adulto) & -205 & -51\\
  81 +Tecido Gorduroso (Criança) & -212 & -72\\
  82 +Tecido Muscular (Adulto) & -5 & 135\\
  83 +Tecido Muscular (Criança) & -25 & 139\\
  84 +Tecidos Moles & -700 & 225\\
  85 +\hline
  86 +\end{tabular}
  87 +\label{tab:limiar}
  88 +\end{table}
  89 +\newpage
  90 +
  91 +A tabela \ref{tab:limiar} é mais indicada para tomógrafos médicos. Nos tomógrafos odontológicos,
  92 +comumente as faixas de níveis de cinza são maiores e não regulares. Assim, é necessário utilizar
  93 +a barra de limiar (figura \ref{fig:region_selection_bar}) para ajustá-las.
  94 +
  95 +Caso se deseje criar uma nova máscara, basta clicar no ícone do atalho presente no painel, dentro
  96 +do item \textbf{2. Selecione a região de interesse}. Veja a figura \ref{fig:shortcut_new_mask}.
  97 +
  98 +\begin{figure}[!htb]
  99 +\centering
  100 +\includegraphics[scale=0.2]{object_add_original}
  101 +\caption{Atalho para criar nova máscara}
  102 +\label{fig:shortcut_new_mask}
  103 +\end{figure}
  104 +
  105 +Clicando-se nesse atalho, uma nova janela será apresentada (figura \ref{fig:create_new_mask}).
  106 +Selecione a faixa de limiar desejada e clique em \textbf{OK}.
  107 +
  108 +\begin{figure}[!htb]
  109 +\centering
  110 +\includegraphics[scale=0.5]{limiar_janela}
  111 +\caption{Criar uma nova máscara}
  112 +\label{fig:create_new_mask}
  113 +\end{figure}
  114 +
  115 +\newpage
  116 +
  117 +Com uma máscara de segmentação configurada, é possível gerar a superfície 3D correspondente
  118 +às imagens em estudo. A superfície será composta por uma malha de triângulos. O próximo capítulo
  119 +trará maiores detalhes sobre esse tipo de superfície.
  120 +
  121 +Para iniciar a geração, clique no botão \textbf{Gerar superfície} (figura \ref{fig:generate_surface}).
  122 +Caso já exista uma superfície gerada previamente, pode-se substituí-la pela nova. Para isso, basta
  123 +selecionar, \textbf{antes} da geração, a opção \textbf{Sobrescrever anterior}.
  124 +
  125 +\begin{figure}[!htb]
  126 +\centering
  127 +\includegraphics[scale=0.5]{generate_surface}
  128 +\caption{Botão Gerar superfície}
  129 +\label{fig:generate_surface}
  130 +\end{figure}
  131 +
  132 +Após alguns instantes, a superfície será exibida na janela de visualização 3D do InVesalius
  133 +(figura \ref{fig:surface}).
  134 +
  135 +\begin{figure}[!htb]
  136 +\centering
  137 +\includegraphics[scale=0.5]{3d_model}
  138 +\caption{Superfície 3D}
  139 +\label{fig:surface}
  140 +\end{figure}
  141 +
  142 +
  143 +
  144 +\section{Segmentação manual (Edição de imagens)}
  145 +
  146 +Há situações em que a segmentação por limiar não é eficiente, pois ela é aplicada ao conjunto
  147 +todo das imagens. Para aplicar a segmentação a imagens isoladas, pode-se usar a segmentação
  148 +manual. Com ela, é possível adicionar ou apagar uma determinada região da imagem que foi
  149 +segmentada por limiar. No entanto, a segmentação manual requer maior conhecimento de anatomia
  150 +por parte do usuário. Para utilizá-la, é necessário clicar em \textbf{Ferramentas avançadas
  151 +de edição} (figura \ref{fig:advanced_edition}) para abrir o painel de edição.
  152 +
  153 +\begin{figure}[!htb]
  154 +\centering
  155 +\includegraphics[scale=0.6]{edicao_avancada}
  156 +\caption{Ferramentas avançadas de edição}
  157 +\label{fig:advanced_edition}
  158 +\end{figure}
  159 +
  160 +O painel de edição aparece como mostra a figura \ref{fig:edition_slices_ref}.
  161 +
  162 +\begin{figure}[!htb]
  163 +\centering
  164 +\includegraphics[scale=0.5]{edition_slices}
  165 +\caption{Painel de edição}
  166 +\label{fig:edition_slices_ref}
  167 +\end{figure}
  168 +
  169 +Há dois tipos de pincel disponíveis para desenho: um em forma de círculo e outro em forma
  170 +de quadrado. Para escolher um pincel, clique no triângulo da lista de seleção para abri-la
  171 +e, a seguir, clique sobre o tipo escolhido. O pincel selecionado aparece no painel como
  172 +mostra a figura \ref{fig:brush_type}.
  173 +
  174 +\begin{figure}[!htb]
  175 +\centering
  176 +\includegraphics[scale=0.5]{edit_pencil}
  177 +\caption{Tipo de pincel}
  178 +\label{fig:brush_type}
  179 +\end{figure}
  180 +
  181 +\newpage
  182 +
  183 +Também é possível alterar o diâmetro do pincel, conforme mostra a figura \ref{fig:select_diameter}.
  184 +
  185 +\begin{figure}[!htb]
  186 +\centering
  187 +\includegraphics[scale=0.5]{diametro_pincel}
  188 +\caption{Seleção do diâmetro do pincel}
  189 +\label{fig:select_diameter}
  190 +\end{figure}
  191 +
  192 +É necessário selecionar o tipo de operação que será realizada pelo pincel. As opções são as
  193 +seguintes:\\
  194 +\\
  195 +\textbf{Desenhar}, para pintar uma região que não foi selecionada;\\
  196 +\textbf{Apagar}, para remover uma região que foi selecionada;\\
  197 +\textbf{Limiar}, para remover uma região que está fora do limiar e foi selecionada, ou pintar
  198 +uma região que está dentro do limiar e não foi selecionada.\\
  199 +
  200 +A figura \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operações do pincel:
  201 +
  202 +\begin{figure}[!htb]
  203 +\centering
  204 +\includegraphics[scale=0.6]{select_brush_operation}
  205 +\caption{Seleção do tipo de operação do pincel}
  206 +\label{fig:select_brush_operations}
  207 +\end{figure}
  208 +
  209 +A figura \ref{fig:noise_amalgaman} mostra um caso em que algumas imagens contêm ruídos
  210 +causados pela presença de prótese dentária de amálgama no paciente. Observe os "raios"
  211 +saindo da região da arcada dentária. Isso ocorre porque a máscara de segmentação também
  212 +seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar para osso.
  213 +
  214 +\begin{figure}[!htb]
  215 +\centering
  216 +\includegraphics[scale=0.3]{noise_amalgam}
  217 +\caption{Imagem com ruído segmentada com limiar}
  218 +\label{fig:noise_amalgaman}
  219 +\end{figure}
  220 +
  221 +A figura \ref{fig:surface_amagaman} ilustra como é uma superfície gerada a partir dessa
  222 +segmentação.
  223 +
  224 +\begin{figure}[!htb]
  225 +\centering
  226 +\includegraphics[scale=0.3]{case_almagam}
  227 +\caption{Superfície gerada a partir de imagem com ruído}
  228 +\label{fig:surface_amagaman}
  229 +\end{figure}
  230 +
  231 +\begin{figure}[!htb]
  232 +\centering
  233 +\includegraphics[scale=0.3]{case_almagam_zoom}
  234 +\caption{Zoom da região com ruído}
  235 +\label{fig:surface_amagaman_zoom}
  236 +\end{figure}
  237 +
  238 +\newpage
  239 +
  240 +Em casos como este, utilizando o editor, com o pincel na opção \textbf{Apagar}, mantenha o
  241 +botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado enquanto o \textbf{arrasta} sobre a região que
  242 +deseja remover (na máscara).
  243 +
  244 +A figura \ref{fig:editor_amalgaman} mostra a imagem da figura \ref{fig:noise_amalgaman} após
  245 +edição.
  246 +
  247 +\begin{figure}[!htb]
  248 +\centering
  249 +\includegraphics[scale=0.3]{editor_amagam}
  250 +\caption{Imagem com ruído removido}
  251 +\label{fig:editor_amalgaman}
  252 +\end{figure}
  253 +
  254 +\begin{figure}[!htb]
  255 +\centering
  256 +\includegraphics[scale=0.3]{edited_amalgam}
  257 +\caption{Superfície criada a partir da imagem com ruído removido}
  258 +\label{fig:surface_edited_amalgaman}
  259 +\end{figure}
  260 +
  261 +\newpage
  262 +Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figura
  263 +\ref{fig:surface_edited_amalgaman}).
  264 +%\ref{fig:generate_surface}).
0 265 \ No newline at end of file
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_superf.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,246 @@
  1 +\chapter{Superfície (Malha de Triângulos)}
  2 +
  3 +No InVesalius, a superfície 3D é gerada com base em um modelo segmentado (obtido a partir
  4 +da segmentação das imagens). O método utilizado para gerar a superfície é o algoritmo
  5 +\textit{marching cubes}. Resumidamente, o algoritmo transforma os \textit{voxels} das
  6 +imagens que foram "empilhadas" e segmentadas em uma malha de polígonos simples - no caso,
  7 +triângulos.
  8 +
  9 +Os controles disponíveis para a configuração de superfícies 3D no InVesalius encontram-se
  10 +no painel esquerdo do software, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}, opção
  11 +\textbf{Propriedades da superfície}.
  12 +
  13 +\begin{figure}[!htb]
  14 +\centering
  15 +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_23_Jan_23_23_10}
  16 +\caption{Configuração de uma superfície 3D}
  17 +\label{fig:3d_surface_managment}
  18 +\end{figure}
  19 +
  20 +
  21 +\section{Criando superfícies}
  22 +
  23 +É possível criar uma nova superfície com base em uma máscara de segmentação já existente.
  24 +Para isso, no painel esquerdo, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}, clique
  25 +no atalho ilustrado na figura \ref{fig:shortcut_new_surface}.
  26 +
  27 +\begin{figure}[!htb]
  28 +\centering
  29 +\includegraphics[scale=0.18]{object_add_original}
  30 +\caption{Atalho para criar uma superfície}
  31 +\label{fig:shortcut_new_surface}
  32 +\end{figure}
  33 +
  34 +Ao se clicar nesse atalho, uma janela se abre para permitir a configuração da superfície a
  35 +ser criada (figura \ref{fig:create_surface_1}). Além de ser possível determinar a qualidade
  36 +da superfície a gerar, há opções também para o preenchimento de buracos existentes e para a
  37 +seleção da maior região da superfície.
  38 +
  39 +\begin{figure}[!htb]
  40 +\centering
  41 +\includegraphics[scale=0.5]{screen_hunter1}
  42 +\caption{Janela para criação de superfície}
  43 +\label{fig:create_surface_1}
  44 +\end{figure}
  45 +
  46 +%Existe 2 opções para fechar os buracos existentes e para selecionar a maior região da superfície aonde em muitos
  47 +%casos é útil para remover o suporte ou a mesa do tomografo.
  48 +
  49 +A seleção da maior região pode ser usada, por exemplo, para remover do modelo o suporte ou a
  50 +mesa do tomógrafo. A figura \ref{fig:surface_ex1} ilustra um caso com as duas opções
  51 +selecionadas: "Preencher buracos" e "Manter maior região".
  52 +
  53 +\newpage
  54 +
  55 +\begin{figure}
  56 + \centering
  57 + \subfloat[Frente]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.338\textwidth]{ScreenHunter_48_Jan_23_23_34}}
  58 + \subfloat[Baixo]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{ScreenHunter_50Jan232334}}
  59 + \caption{Superfície com região maior selecionada e com buracos preenchidos}
  60 + \label{fig:surface_ex1}
  61 +\end{figure}
  62 +
  63 +
  64 +Já a figura \ref{fig:surface_ex2} mostra o mesmo caso sem essas opções selecionadas. Observa-se o
  65 +suporte do tomógrafo e a superfície aberta.
  66 +
  67 +
  68 +\begin{figure}
  69 + \centering
  70 + \subfloat[Frente]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.371\textwidth]{ScreenHunter_52Jan232335}}
  71 + \subfloat[Baixo]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{ScreenHunter_53Jan232336}}
  72 + \caption{Superfície sem a seleção da maior região e com buracos abertos}
  73 + \label{fig:surface_ex2}
  74 +\end{figure}
  75 +
  76 +\newpage
  77 +
  78 +\section{Transparência}
  79 +
  80 +É possível visualizar uma superfície com transparência. Para isso, primeiro selecione a
  81 +superfície por meio da lista de seleção, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}, opção
  82 +\textbf{Propriedades da superfície} (figura \ref{fig:select_surface}).
  83 +
  84 +\begin{figure}[!htb]
  85 +\centering
  86 +\includegraphics[scale=0.6]{select_surface}
  87 +\caption{Seleção de superfície}
  88 +\label{fig:select_surface}
  89 +\end{figure}
  90 +
  91 +Em seguida, para determinar o nível de transparência que a superfície selecionada receberá, arraste
  92 +o controle deslizante ilustrado na figura \ref{fig:select_transparency}. Quanto mais para a direita
  93 +o controle, maior será a transparência aplicada.
  94 +
  95 +\begin{figure}[!htb]
  96 +\centering
  97 +\includegraphics[scale=0.5]{transparency}
  98 +\caption{Seleção de nível de transparência}
  99 +\label{fig:select_transparency}
  100 +\end{figure}
  101 +
  102 +A figura \ref{fig:model_transparency} ilustra a visualização de duas superfícies: uma mais externa
  103 +(esverdeada) e outra mais interna (amarelada). A superfície mais externa aparece com a transparência
  104 +aumentada.
  105 +
  106 +\begin{figure}[!htb]
  107 +\centering
  108 +\includegraphics[scale=0.3]{transparency_2}
  109 +\caption{Superfícies com nível alterado de transparência}
  110 +\label{fig:model_transparency}
  111 +\end{figure}
  112 +
  113 +\newpage
  114 +
  115 +\section{Cor}
  116 +
  117 +A cor de uma superfície também pode ser alterada. Selecione a superfície (reveja a figura
  118 +\ref{fig:select_surface}) e, em seguida, clique no botão ao lado da superfície selecionada. A figura
  119 +\ref{fig:change_surface_color} ilustra o botão, também localizado no item \textbf{3. Configure a
  120 +superfície 3D}, opção \textbf{Propriedades da superfície}.
  121 +
  122 +\begin{figure}[!htb]
  123 +\centering
  124 +\includegraphics[scale=0.6]{button_select_color}
  125 +\caption{Botão para alteração de cor}
  126 +\label{fig:change_surface_color}
  127 +\end{figure}
  128 +
  129 +Uma janela de seleção de cores se abre (figura \ref{fig:button_select_color}). Selecione a cor
  130 +desejada e clique no botão \textbf{OK}.
  131 +
  132 +\begin{figure}[!htb]
  133 +\centering
  134 +\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142}
  135 +\caption{Opções de cor}
  136 +\label{fig:button_select_color}
  137 +\end{figure}
  138 +
  139 +\section{Separando regiões desconexas}
  140 +
  141 +Para separar regiões da superfície que se encontram desconexas, é necessário clicar na opção
  142 +\textbf{Ferramentas avançadas}, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}. Veja a
  143 +figura \ref{fig:advanced_tools}.
  144 +
  145 +\begin{figure}[!htb]
  146 +\centering
  147 +\includegraphics[scale=0.4]{ferramentas_avancadas}
  148 +\caption{Atalho para ferramentas avançadas}
  149 +\label{fig:advanced_tools}
  150 +\end{figure}
  151 +
  152 +\newpage
  153 +
  154 +Um menu com as opções disponíveis será exibido, como ilustra a figura
  155 +\ref{fig:advanced_tools_expanded}.
  156 +
  157 +\begin{figure}[!htb]
  158 +\centering
  159 +\includegraphics[scale=0.5]{exract_region}
  160 +\caption{Ferramentas avançadas}
  161 +\label{fig:advanced_tools_expanded}
  162 +\end{figure}
  163 +
  164 +\subsection{Separar maior superfície}
  165 +
  166 +A opção \textbf{Separar maior superfície} seleciona, automaticamente, somente a região
  167 +desconexa que contém maior volume. Para realizar a operação, basta clicar no atalho
  168 +que a figura \ref{fig:short_connectivity_largest} ilustra. É criada uma nova superfície
  169 +resultante da operação.
  170 +
  171 +\begin{figure}[!htb]
  172 +\centering
  173 +\includegraphics[scale=0.2]{connectivity_largest}
  174 +\caption{Atalho para separação da maior região desconexa}
  175 +\label{fig:short_connectivity_largest}
  176 +\end{figure}
  177 +
  178 +Como exemplo, a figura \ref{fig:extract_most_region_1} mostra um caso antes da separação
  179 +da maior região.
  180 +
  181 +\begin{figure}[!htb]
  182 +\centering
  183 +\includegraphics[scale=0.3]{extract_most_region_1}
  184 +\caption{Superfícies desconexas}
  185 +\label{fig:extract_most_region_1}
  186 +\end{figure}
  187 +
  188 +Na figura \ref{fig:extract_most_region2}, observa-se a superfície com a maior região
  189 +desconexa separada.
  190 +
  191 +\begin{figure}[!htb]
  192 +\centering
  193 +\includegraphics[scale=0.3]{extract_most_region2}
  194 +\caption{Maior região separada}
  195 +\label{fig:extract_most_region2}
  196 +\end{figure}
  197 +
  198 +\newpage
  199 +
  200 +\subsection{Selecionar as regiões de interesse}
  201 +
  202 +Outra modalidade de seleção se dá pela opção \textbf{Selecionar as regiões de interesse...}.
  203 +Para ativá-la, o usuário deve clicar sobre o botão ilustrado na figura
  204 +\ref{fig:short_connectivity_manual}. Em seguida, basta clicar sobre as regiões desconexas
  205 +da superfície que se pretende selecionar.
  206 +
  207 +\begin{figure}[!htb]
  208 +\centering
  209 +\includegraphics[scale=0.2]{connectivity_manual}
  210 +\caption{Atalho para seleção de regiões de interesse}
  211 +\label{fig:short_connectivity_manual}
  212 +\end{figure}
  213 +
  214 +No exemplo da figura \ref{fig:extract_most_region3}, foram selecionados o crânio e a parte
  215 +direita do suporte do tomógrafo.
  216 +
  217 +\begin{figure}[!htb]
  218 +\centering
  219 +\includegraphics[scale=0.35]{extract_most_region3}
  220 +\caption{Exemplo de regiões de interesse selecionadas}
  221 +\label{fig:extract_most_region3}
  222 +\end{figure}
  223 +
  224 +
  225 +\subsection{Separar todas regiões desconexas}
  226 +
  227 +É possível, também, separar automaticamente \textit{todas} as regiões desconexas. Para
  228 +isso, basta clicar no botão ilustrado pela figura \ref{fig:connectivity_split_all}, que
  229 +representa a opção \textbf{Separar todas regiões desconexas}.
  230 +
  231 +\begin{figure}[!htb]
  232 +\centering
  233 +\includegraphics[scale=0.2]{connectivity_split_all}
  234 +\caption{Atalho para separação de todas as regiões desconexas}
  235 +\label{fig:connectivity_split_all}
  236 +\end{figure}
  237 +
  238 +A figura \ref{fig:extrac_most_region_4} mostra um exemplo.
  239 +
  240 +\begin{figure}[!htb]
  241 +\centering
  242 +\includegraphics[scale=0.3]{extrac_most_region_4}
  243 +\caption{Exemplo de separação de todas as regiões desconexas}
  244 +\label{fig:extrac_most_region_4}
  245 +\end{figure}
  246 +
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_visual_simult.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,60 @@
  1 +\chapter{Visualização simultânea de imagens e superfície}
  2 +
  3 +A visualização simultânea de imagens e superfície pode ser acionada clicando com o botão
  4 +\textbf{esquerdo} do mouse sobre o atalho localizado no canto inferior direito da tela do
  5 +InVesalius. Veja a figura \ref{fig:slice_plane_original}.
  6 +
  7 +\begin{figure}[!htb]
  8 +\centering
  9 +\includegraphics[scale=0.6]{slice_plane_original}
  10 +\caption{Atalho para visualização simultânea}
  11 +\label{fig:slice_plane_original}
  12 +\end{figure}
  13 +
  14 +Este recurso permite habilitar ou desabilitar a exibição das imagens nas diferentes
  15 +orientações (ou planos) na mesma janela de visualização da superfície 3D. Para isso, basta
  16 +marcar ou desmarcar a opção correspondente no menu indicado na figura \ref{fig:view_2d_3d_1}.
  17 +
  18 +\begin{figure}[!htb]
  19 +\centering
  20 +\includegraphics[scale=0.6]{view_2d_3d_1}
  21 +\caption{Seleção das orientações (planos) a exibir}
  22 +\label{fig:view_2d_3d_1}
  23 +\end{figure}
  24 +
  25 +Vale notar que uma orientação, quando selecionada, apresenta uma marca na opção correspondente.
  26 +Isso é ilustrado na figura \ref{fig:view_2d_3d_2}.
  27 +
  28 +\begin{figure}[!htb]
  29 +\centering
  30 +\includegraphics[scale=0.6]{view_2d_3d_2}
  31 +\caption{Orientações selecionados para exibição}
  32 +\label{fig:view_2d_3d_2}
  33 +\end{figure}
  34 +
  35 +
  36 +\newpage
  37 +
  38 +
  39 +Se a superfície já estiver sendo exibida, os planos das orientações serão apresentados como mostra
  40 +a figura \ref{fig:3d_planes}. Caso contrário, somente os planos serão exibidos
  41 +(figura \ref{fig:only_2d_planes}).
  42 +
  43 +\begin{figure}[!htb]
  44 +\centering
  45 +\includegraphics[scale=0.5]{3d_planes}
  46 +\caption{Superfície e planos exibidos simultaneamente}
  47 +\label{fig:3d_planes}
  48 +\end{figure}
  49 +
  50 +\begin{figure}[!htb]
  51 +\centering
  52 +\includegraphics[scale=0.55]{only_2d_planes}
  53 +\caption{Exibição de planos (sem superfície)}
  54 +\label{fig:only_2d_planes}
  55 +\end{figure}
  56 +
  57 +\newpage
  58 +
  59 +Para desativar a exibição de um plano, basta desmarcar a opção correspondente no menu
  60 +(figura \ref{fig:view_2d_3d_2}).
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_visual_vol.tex 0 → 100644
... ... @@ -0,0 +1,197 @@
  1 +\chapter{Visualização volumétrica}
  2 +
  3 +Para a visualização volumétrica dos modelos, o InVesalius dispõe de uma técnica
  4 +conhecida como \textit{Raycasting}. Trata-se de uma técnica que,
  5 +resumidamente, consiste em simular, para cada pixel da tela, o traçado de um raio de luz em
  6 +direção ao objeto. A cor do pixel será baseada na cor e na transparência de cada voxel
  7 +interceptado pelo raio de luz.
  8 +
  9 +No InVesalius, existem diversos padrões pré-definidos (\textit{presets}) para visualizar
  10 +determinados tipos de tecidos ou diferentes tipos de exames (tomografia com contraste, por
  11 +exemplo).
  12 +
  13 +Para acessar esse recurso, basta clicar no atalho ilustrado pela figura
  14 +\ref{fig:volume_raycasting_origina}, localizado no canto inferior direito da tela (ao lado da
  15 +janela de exibição de superfícies) e selecionar um dos padrões disponíveis.
  16 +
  17 +Para desativar a visualização volumétrica, clique novamente no atalho indicado pela figura
  18 +\ref{fig:volume_raycasting_origina} e escolha a opção \textbf{Desabilitado}.
  19 +
  20 +\begin{figure}[!htb]
  21 +\centering
  22 +\includegraphics[scale=0.4]{volume_raycasting_origina}
  23 +\caption{Atalho para visualização volumétrica}
  24 +\label{fig:volume_raycasting_origina}
  25 +\end{figure}
  26 +
  27 +\section{Padrões de visualização}
  28 +
  29 +São diversos os padrões de visualização pré-definidos. Alguns exemplos são ilustrados nas
  30 +figuras seguintes.
  31 +
  32 +\begin{figure}[!htb]
  33 +\centering
  34 +\includegraphics[scale=0.68]{brilhante_I}
  35 +\caption{Brilhante}
  36 +\label{fig:brilhante_I}
  37 +\end{figure}
  38 +
  39 +\begin{figure}[!htb]
  40 +\centering
  41 +\includegraphics[scale=0.65]{vias_aereas_II}
  42 +\caption{Vias Aéreas II}
  43 +\label{fig:vias_aereas_II}
  44 +\end{figure}
  45 +
  46 +\begin{figure}[!htb]
  47 +\centering
  48 +\includegraphics[scale=0.42]{contraste_medio}
  49 +\caption{Contraste Médio}
  50 +\label{fig:contraste_medio}
  51 +\end{figure}
  52 +
  53 +\begin{figure}[!htb]
  54 +\centering
  55 +\includegraphics[scale=0.55]{MIP}
  56 +\caption{MIP}
  57 +\label{fig:MIP}
  58 +\end{figure}
  59 +
  60 +
  61 +\newpage
  62 +
  63 +
  64 +\section{Personalização de padrão}
  65 +
  66 +Alguns padrões podem ser personalizados (ou customizados). Veja a figura
  67 +\ref{fig:customize_1}, que exibe um padrão e alguns controles gráficos de ajuste.
  68 +Com eles, é possível alterar a cor de uma dada estrutura e sua opacidade, determinando
  69 +como e se ela será exibida.
  70 +
  71 +\begin{figure}[!htb]
  72 +\centering
  73 +\includegraphics[scale=0.6]{customize_1}
  74 +\caption{Ajustes para o padrão de visualização Mole + Pele II}
  75 +\label{fig:customize_1}
  76 +\end{figure}
  77 +
  78 +
  79 +\newpage
  80 +
  81 +
  82 +Caso se deseje ocultar uma estrutura, é necessário utilizar o controle gráfico de ajuste mantendo
  83 +baixa a opacidade da região correspondente. No exemplo da figura \ref{fig:customize_1},
  84 +suponha que se pretende esconder a parte muscular, que aparece em vermelho. Para isso, basta
  85 +posicionar o ponteiro do mouse sobre o ponto em vermelho e, com o botão esquerdo pressionado,
  86 +\textbf{arrastar} o ponto para baixo, a fim de diminuir a opacidade (o que equivale a aumentar
  87 +a transparência). A figura \ref{fig:customize_2} ilustra o resultado.
  88 +
  89 +Nota: O valor \textit{Alpha} indica a opacidade da cor, e o valor \textit{Value}, a
  90 +intensidade da cor no pixel.
  91 +
  92 +\begin{figure}[!htb]
  93 +\centering
  94 +\includegraphics[scale=0.6]{customize_2}
  95 +\caption{Padrão de visualização Mole + Pele II alterado}
  96 +\label{fig:customize_2}
  97 +\end{figure}
  98 +
  99 +
  100 +\newpage
  101 +
  102 +
  103 +É possível remover ou adicionar pontos no controle gráfico de ajuste. Para a remoção, basta clicar
  104 +com o botão \textbf{direito} do mouse sobre o ponto. Para adicionar um novo ponto, clique com
  105 +o botão \textbf{esquerdo} sobre a linha do gráfico. Pode-se também salvar o padrão resultante,
  106 +clicando no atalho que a figura \ref{fig:save_preset} ilustra.
  107 +
  108 +\begin{figure}[!htb]
  109 +\centering
  110 +\includegraphics[scale=0.6]{save_preset}
  111 +\caption{Atalho para salvar padrão}
  112 +\label{fig:save_preset}
  113 +\end{figure}
  114 +
  115 +Ao salvar o padrão, o InVesalius exibe uma janela como a da figura \ref{fig:save_window_preset}.
  116 +Digite um nome para o padrão personalizado e clique em \textbf{OK}. O padrão salvo estará
  117 +disponível com os demais na próxima vez em que o software for aberto.
  118 +
  119 +\begin{figure}[!htb]
  120 +\centering
  121 +\includegraphics[scale=0.6]{save_window_preset}
  122 +\caption{Janela para nomear e salvar um padrão}
  123 +\label{fig:save_window_preset}
  124 +\end{figure}
  125 +
  126 +\section{Personalização de padrão com Brilho e Contraste}
  127 +
  128 +É possível personalizar um padrão sem utilizar o controle gráfico de ajuste, apresentado na seção
  129 +anterior. Isso é feito por meio do controle de brilho e \textbf{Contraste} presente na barra de
  130 +ferramentas. Para ativar o controle, clique no atalho ilustrado pela figura
  131 +\ref{fig:tool_contrast_original_vol}.
  132 +
  133 +\begin{figure}[!htb]
  134 +\centering
  135 +\includegraphics[scale=0.6]{tool_contrast_original}
  136 +\caption{Atalho para brilho e contraste}
  137 +\label{fig:tool_contrast_original_vol}
  138 +\end{figure}
  139 +
  140 +Com o controle ativado, arrastando o mouse com o botão esquerdo pressionado
  141 +sobre a janela do volume, é possível alterar os valores de \textit{window width} e
  142 +\textit{window level}. O procedimento é o mesmo aplicado para as fatias 2D, visto
  143 +na seção \ref{sec:ww_wl}. Arrastando o mouse na direção horizontal, altera-se o valor de
  144 +\textit{window level}. Para a esquerda, diminui-se seu valor e, para a direita,
  145 +aumenta-se seu valor. Arrastando o mouse na direção vertical, altera-se o valor de
  146 +\textit{window width}. Para baixo, diminui-se seu valor e, para cima, aumenta-se seu
  147 +valor.
  148 +
  149 +Com a manipulação desses valores, conseguem-se diferentes resultados de
  150 +visualização. Por exemplo, para adicionar tecido à visualização, \textbf{arraste} o
  151 +mouse diagonalmente, do canto inferior direito para o canto superior esquerdo da janela
  152 +de visualização. Para remover tecido da visualização, faça o contrário, ou seja,
  153 +\textbf{arraste} o mouse diagonalmente, do canto superior esquerdo para o canto inferior
  154 +direito. Veja a figura \ref{fig:raycasting_add}.
  155 +
  156 +\begin{figure}[!htb]
  157 + \centering
  158 + \subfloat[Osso]{\label{fig:raycasting_add_1}\includegraphics[width=0.33\textwidth]{raycasting_add_1}}
  159 + \hfill
  160 + \subfloat[Músculo]{\label{fig:raycasting_add_2}\includegraphics[width=0.333\textwidth]{raycasting_add_2}}
  161 + \hfill
  162 + \subfloat[Pele]{\label{fig:raycasting_add_3}\includegraphics[width=0.332\textwidth]{raycasting_add_3}}
  163 + \caption{Adição de tecido}
  164 + \label{fig:raycasting_add}
  165 +\end{figure}
  166 +
  167 +\newpage
  168 +
  169 +
  170 +\section{Corte}
  171 +
  172 +Em visualização volumétrica, o corte é utilizado para visualizar uma região interna do volume.
  173 +O InVesalius dispõe de uma ferramenta para corte com base em um plano de referência. Com
  174 +um padrão de visualização selecionado, clique em \textbf{Ferramentas} e, em seguida, em
  175 +\textbf{Plano para corte} (figura \ref{fig:activate_cut_plane}).
  176 +
  177 +\begin{figure}[!htb]
  178 +\centering
  179 +\includegraphics[scale=0.6]{activate_cut_plane}
  180 +\caption{Ativando plano para corte}
  181 +\label{fig:activate_cut_plane}
  182 +\end{figure}
  183 +
  184 +Uma representação do plano para corte é exibida junto ao volume. Para realizar o corte,
  185 +mantenha o botão \textbf{esquerdo} pressionado sobre o plano e \textbf{arraste} o mouse.
  186 +Para rotacionar o plano, mantenha o botão \textbf{esquerdo} pressionado sobre a sua borda
  187 +e movimente o mouse na direção desejada. Veja um exemplo na figura \ref{fig:cutted_image}.
  188 +
  189 +\begin{figure}[!htb]
  190 +\centering
  191 +\includegraphics[scale=0.6]{cutted_image}
  192 +\caption{Imagem com plano de corte}
  193 +\label{fig:cutted_image}
  194 +\end{figure}
  195 +
  196 +Para desativar o recurso de corte, clique novamente em \textbf{Ferramentas} e em
  197 +\textbf{Plano para corte} (figura \ref{fig:activate_cut_plane}).
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  11 +\begin{figure}[h!]
  12 +\flushright
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