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606 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/customize_2.png -text | |
607 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/cutted_image.bb -text | |
608 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/cutted_image.png -text | |
609 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/data_export.PNG -text | |
610 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/data_export.bb -text | |
611 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/data_export_selection.PNG -text | |
612 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/data_export_selection.bb -text | |
613 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/delete_data.bb -text | |
614 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/delete_data.jpg -text | |
615 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/diametro_pincel.bb -text | |
616 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/diametro_pincel.png -text | |
617 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/duplicate_data.bb -text | |
618 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/duplicate_data.jpg -text | |
619 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/edicao_avancada.bb -text | |
620 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/edicao_avancada.png -text | |
621 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/edit_pencil.bb -text | |
622 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/edit_pencil.png -text | |
623 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/edited_amalgam.jpg -text | |
624 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/edition_slices.bb -text | |
625 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/edition_slices.png -text | |
626 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/editor_amagam.bb -text | |
627 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/editor_amagam.jpg -text | |
628 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/export_data_window.PNG -text | |
629 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/export_data_window.bb -text | |
630 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/exract_region.bb -text | |
631 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/exract_region.jpg -text | |
632 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/extrac_most_region_4.jpg -text | |
633 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/extract_most_region2.bb -text | |
634 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/extract_most_region2.jpg -text | |
635 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/extract_most_region3.bb -text | |
636 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/extract_most_region3.jpg -text | |
637 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/extract_most_region_1.bb -text | |
638 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/extract_most_region_1.jpg -text | |
639 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/eye.bb -text | |
640 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/eye.jpg -text | |
641 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/ferramentas_avancadas.bb -text | |
642 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/ferramentas_avancadas.jpg -text | |
643 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/generate_surface.bb -text | |
644 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/generate_surface.png -text | |
645 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_barra.bb -text | |
646 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_barra.png -text | |
647 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_janela.bb -text | |
648 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_janela.png -text | |
649 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_presets.bb -text | |
650 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_presets.png -text | |
651 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_principal.bb -text | |
652 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/limiar_principal.png -text | |
653 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mac2.bb -text | |
654 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mac2.png -text | |
655 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mac4.bb -text | |
656 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mac4.png -text | |
657 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/manager_mensuares.bb -text | |
658 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/manager_mensuares.jpg -text | |
659 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mask_manager.bb -text | |
660 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mask_manager.jpg -text | |
661 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/medida_volumetrica.bb -text | |
662 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/medida_volumetrica.jpg -text | |
663 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_save_image_window.PNG -text | |
664 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_save_image_window.bb -text | |
665 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/new_data.bb -text | |
666 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/new_data.jpg -text | |
667 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/noise_amalgam.bb -text | |
668 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/noise_amalgam.jpg -text | |
669 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/only_2d_planes.bb -text | |
670 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/only_2d_planes.jpg -text | |
671 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/pseudo_menu.bb -text | |
672 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/pseudo_menu.png -text | |
673 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_1.PNG -text | |
674 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_1.bb -text | |
675 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_2.PNG -text | |
676 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_2.bb -text | |
677 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_3.PNG -text | |
678 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/raycasting_add_3.bb -text | |
679 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_image_window.PNG -text | |
680 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_image_window.bb -text | |
681 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_preset.bb -text | |
682 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_preset.png -text | |
683 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_window_preset.bb -text | |
684 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/save_window_preset.jpg -text | |
685 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/screen_hunter1.bb -text | |
686 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/screen_hunter1.jpg -text | |
687 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/selec_operacao.bb -text | |
688 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/selec_operacao.png -text | |
689 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/select_brush_operation.bb -text | |
690 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/select_brush_operation.jpg -text | |
691 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/select_surface.bb -text | |
692 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/select_surface.jpg -text | |
693 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/selected_mask.bb -text | |
694 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/selected_mask.jpg -text | |
695 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/sem_sombreamento_II.bb -text | |
696 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/sem_sombreamento_II.jpg -text | |
697 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/surface_manager.bb -text | |
698 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/surface_manager.jpg -text | |
699 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/text_off.bb -text | |
700 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/text_off.png -text | |
701 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/text_on.bb -text | |
702 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/text_on.png -text | |
703 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/transparency.bb -text | |
704 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/transparency.jpg -text | |
705 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/transparency_2.bb -text | |
706 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/transparency_2.png -text | |
707 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/vias_aereas_II.bb -text | |
708 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/vias_aereas_II.jpg -text | |
709 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/view_2d_3d_1.bb -text | |
710 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/view_2d_3d_1.png -text | |
711 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/view_2d_3d_2.bb -text | |
712 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/view_2d_3d_2.png -text | |
713 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/logo_cti.bb -text | |
714 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/logo_cti.jpg -text | |
715 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/rm_ge.bb -text | |
716 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/rm_ge.jpg -text | |
717 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/splash_pt.bb -text | |
718 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/splash_pt.png -text | |
719 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/tomografo.bb -text | |
720 | +docs/user_guide_pt_BR_source/img/tomografo.jpg -text | |
721 | +docs/user_guide_pt_BR_source/intro.tex -text | |
722 | +docs/user_guide_pt_BR_source/manual_pt_BR.tex -text | |
723 | +docs/user_guide_pt_BR_source/resumo.tex -text | |
19 | 724 | icons/3D_glasses.png -text |
20 | 725 | icons/3D_glasses_original.png -text |
21 | 726 | icons/Floppy.png -text | ... | ... |
No preview for this file type
... | ... | @@ -0,0 +1,29 @@ |
1 | +\scalebox{2.0}{\sffamily Autores do Manual} | |
2 | +\\ | |
3 | + | |
4 | +Fábio de Souza Azevedo | |
5 | + | |
6 | + | |
7 | +\href{mailto:fabio.azevedo@cti.gov.br}{fabio.azevedo@cti.gov.br} | |
8 | +\\ | |
9 | + | |
10 | + | |
11 | +Jorge Vicente Lopes da Silva | |
12 | + | |
13 | + | |
14 | +\href{mailto:jorge.silva@cti.gov.br}{jorge.silva@cti.gov.br} | |
15 | +\\ | |
16 | + | |
17 | + | |
18 | +Paulo Henrique Junqueira Amorim | |
19 | + | |
20 | + | |
21 | +\href{mailto:paulo.amorim@cti.gov.br}{paulo.amorim@cti.gov.br} | |
22 | +\\ | |
23 | + | |
24 | + | |
25 | +Thiago Franco de Moraes | |
26 | + | |
27 | + | |
28 | +\href{mailto:thiago.moraes@cti.gov.br}{thiago.moraes@cti.gov.br} | |
29 | +\\ | |
0 | 30 | \ No newline at end of file | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,105 @@ |
1 | +\chapter{Customização} | |
2 | + | |
3 | +Algumas opções de customização estão disponíveis para o usuário do InVesalius. Elas | |
4 | +são apresentadas a seguir. | |
5 | + | |
6 | +\section{Menu de ferramentas} | |
7 | + | |
8 | +Para ocultar/exibir o menu lateral de ferramentas, clique sobre o botão que a figura | |
9 | +\ref{fig:layout_full_original} ilustra. | |
10 | + | |
11 | +\begin{figure}[!htb] | |
12 | +\centering | |
13 | +\includegraphics[scale=0.5]{layout_full_original} | |
14 | +\caption{Atalho para ocultar/exibir menu lateral de ferramentas} | |
15 | +\label{fig:layout_full_original} | |
16 | +\end{figure} | |
17 | + | |
18 | +Com o menu ocultado, amplia-se a área da janela do InVesalius disponível para a | |
19 | +visualização das imagens, conforme mostra a figura \ref{fig:closed_tool_menu}. | |
20 | + | |
21 | +\begin{figure}[!htb] | |
22 | +\centering | |
23 | +\includegraphics[scale=0.4]{closed_tool_menu} | |
24 | +\caption{Menu lateral ocultado} | |
25 | +\label{fig:closed_tool_menu} | |
26 | +\end{figure} | |
27 | + | |
28 | +\newpage | |
29 | + | |
30 | +\section{Posicionamento automático de volume/superfície} | |
31 | + | |
32 | +Para acertar automaticamente a posição de visualização de um volume ou superfície, | |
33 | +pode-se clicar sobre o ícone apresentado na figura \ref{fig:3d_automatic_position} | |
34 | +(localizado no canto inferior direito da tela do InVesalius) e escolher uma das | |
35 | +opções de visualização disponíveis. | |
36 | + | |
37 | +\begin{figure}[!htb] | |
38 | +\centering | |
39 | +\includegraphics[scale=0.45]{3d_automatic_position} | |
40 | +\caption{Opções de posição para visualização} | |
41 | +\label{fig:3d_automatic_position} | |
42 | +\end{figure} | |
43 | + | |
44 | +\section{Cor de fundo da janela de volume/superfície} | |
45 | + | |
46 | +Para alterar a cor de fundo da janela de volume/superfície, clique no atalho que a figura | |
47 | +\ref{fig:button_select_color_2} mostra. O atalho também está localizado no canto inferior | |
48 | +direito da tela do InVesalius. | |
49 | + | |
50 | +\begin{figure}[!htb] | |
51 | +\centering | |
52 | +\includegraphics[scale=0.8]{color_button} | |
53 | +\caption{Atalho para cor de fundo da janela de volume/superfície} | |
54 | +\label{fig:button_select_color_2} | |
55 | +\end{figure} | |
56 | + | |
57 | +Uma janela para seleção de cor se abre, como aparece na figura \ref{fig:color_window_background}. | |
58 | +Após isso, basta clicar sobre a cor desejada e, em seguida, clicar em \textbf{OK}. | |
59 | + | |
60 | +\begin{figure}[!htb] | |
61 | +\centering | |
62 | +\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142} | |
63 | +\caption{Seleção de cor de fundo} | |
64 | +\label{fig:color_window_background} | |
65 | +\end{figure} | |
66 | + | |
67 | +A figura \ref{fig:background_color} mostra um exemplo dessa janela com a cor de fundo alterada. | |
68 | + | |
69 | +\begin{figure}[!htb] | |
70 | +\centering | |
71 | +\includegraphics[scale=0.6]{3d_background} | |
72 | +\caption{Cor de fundo alterada} | |
73 | +\label{fig:background_color} | |
74 | +\end{figure} | |
75 | + | |
76 | +\newpage | |
77 | + | |
78 | +\section{Exibir/ocultar textos em janela 2D} | |
79 | + | |
80 | +Para exibir ou ocultar os textos que aparecem nas janelas de imagens 2D, clique no atalho | |
81 | +exibido na figura \ref{fig:text}, localizado na barra de ferramentas. | |
82 | + | |
83 | +\begin{figure}[!htb] | |
84 | +\centering | |
85 | +\includegraphics[scale=0.7]{text} | |
86 | +\caption{Atalho para exibir ou ocultar texto} | |
87 | +\label{fig:text} | |
88 | +\end{figure} | |
89 | + | |
90 | +As figuras \ref{fig:text_on} e \ref{fig:text_off} ilustram, respectivamente, a exibição | |
91 | +dos textos habilitada e desabilitada. | |
92 | + | |
93 | +\begin{figure}[!htb] | |
94 | +\centering | |
95 | +\includegraphics[scale=0.5]{text_on} | |
96 | +\caption{Exibição de texto habilitada} | |
97 | +\label{fig:text_on} | |
98 | +\end{figure} | |
99 | + | |
100 | +\begin{figure}[!htb] | |
101 | +\centering | |
102 | +\includegraphics[scale=0.5]{text_off} | |
103 | +\caption{Exibição de texto desabilitada} | |
104 | +\label{fig:text_off} | |
105 | +\end{figure} | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,99 @@ |
1 | +\chapter{Exportando dados} | |
2 | + | |
3 | +Com o InVesalius, é possível exportar dados para outros softwares, em formatos de arquivo | |
4 | +como OBJ, STL, entre outros. | |
5 | + | |
6 | +O menu que contém as opções para exportação localiza-se no painel esquerdo do InVesalius, | |
7 | +dentro do item \textbf{4. Exporte os dados}. Caso o menu não esteja visível, dê um clique | |
8 | +duplo com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre o item para expandi-lo. A figura | |
9 | +\ref{fig:data_export} mostra esse menu. | |
10 | + | |
11 | +\begin{figure}[!htb] | |
12 | +\centering | |
13 | +\includegraphics[scale=0.6]{data_export} | |
14 | +\caption{Menu para exportação de dados} | |
15 | +\label{fig:data_export} | |
16 | +\end{figure} | |
17 | + | |
18 | +\section{Superfície} | |
19 | + | |
20 | +Para exportar uma superfície, é necessário selecioná-la no menu de dados, conforme mostra a | |
21 | +figura \ref{fig:data_export_selection}. | |
22 | + | |
23 | +\newpage | |
24 | + | |
25 | +\begin{figure}[!htb] | |
26 | +\centering | |
27 | +\includegraphics[scale=0.6]{data_export_selection} | |
28 | +\caption{Seleção de superfície a exportar} | |
29 | +\label{fig:data_export_selection} | |
30 | +\end{figure} | |
31 | + | |
32 | +Em seguida, clique sobre o ícone que a figura \ref{fig:surface_export_original} ilustra. | |
33 | + | |
34 | +\begin{figure}[!htb] | |
35 | +\centering | |
36 | +\includegraphics[scale=0.2]{surface_export_original} | |
37 | +\caption{Atalho para exportar superfície} | |
38 | +\label{fig:surface_export_original} | |
39 | +\end{figure} | |
40 | + | |
41 | +Na janela exibida (figura \ref{fig:export_data_window}), insira o nome do arquivo e | |
42 | +selecione o formato desejado para a exportação. Em seguida, clique em \textbf{Save (Salvar)}. | |
43 | + | |
44 | + | |
45 | +\begin{figure}[!htb] | |
46 | +\centering | |
47 | +\includegraphics[scale=0.4]{export_data_window} | |
48 | +\caption{Janela para exportar superfície} | |
49 | +\label{fig:export_data_window} | |
50 | +\end{figure} | |
51 | + | |
52 | +Os tipos de arquivo que podem ser exportados estão listados na tabela | |
53 | +\ref{tab:files_export_list}: | |
54 | + | |
55 | +\begin{table}[h] | |
56 | +\centering | |
57 | +\caption{Formatos de arquivo que o InVesalius exporta} | |
58 | +\begin{tabular}{lcc}\\ | |
59 | +\hline % este comando coloca uma linha na tabela | |
60 | +Formato & Extensão\\ | |
61 | +\hline | |
62 | +\hline | |
63 | +Inventor & .iv\\ | |
64 | +Polygon File Format & .ply\\ | |
65 | +Renderman & .rib\\ | |
66 | +Stereolithography (formato binário)& .stl\\ | |
67 | +Stereolithography (formato ASCII) & .stl\\ | |
68 | +VRML & .vrml\\ | |
69 | +VTK PolyData & .vtp\\ | |
70 | +Wavefront & .obj\\ | |
71 | +\hline | |
72 | +\end{tabular} | |
73 | +\label{tab:files_export_list} | |
74 | +\end{table} | |
75 | + | |
76 | + | |
77 | +\section{Imagem} | |
78 | + | |
79 | +É possível exportar imagens de qualquer das orientações de exibição (axial, coronal, | |
80 | +sagital e 3D). Para isso, clique com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre o atalho | |
81 | +exibido na figura \ref{fig:menu_save_image_window} e selecione a sub-janela correspondente | |
82 | +à imagem que deseja exportar. | |
83 | + | |
84 | +\begin{figure}[!htb] | |
85 | +\centering | |
86 | +\includegraphics[scale=0.4]{menu_save_image_window} | |
87 | +\caption{Menu para exportar imagem} | |
88 | +\label{fig:menu_save_image_window} | |
89 | +\end{figure} | |
90 | + | |
91 | +Na janela exibida (figura \ref{fig:save_image_window}), selecione o formato do arquivo e | |
92 | +clique no botão \textbf{Save (Salvar)}. | |
93 | + | |
94 | +\begin{figure}[!htb] | |
95 | +\centering | |
96 | +\includegraphics[scale=0.4]{save_image_window} | |
97 | +\caption{Janela para exportar imagem} | |
98 | +\label{fig:save_image_window} | |
99 | +\end{figure} | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,119 @@ |
1 | +\chapter{Gerenciamento de dados} | |
2 | + | |
3 | +Nos capítulos anteriores, mostrou-se como manipular superfícies, máscaras para segmentação | |
4 | +e medições. É possível exibir ou ocultar e criar ou remover esses elementos pelo painel de | |
5 | +gerenciamento de \textbf{Dados}, localizado no canto inferior esquerdo da tela do InVesalius. | |
6 | +O painel é dividido em 3 abas: \textbf{Máscaras}, \textbf{Superfícies 3D} e \textbf{Medições}, | |
7 | +conforme mostra a figura \ref{fig:volumetric_data}. Cada uma das abas agrupa dados | |
8 | +correspondentes aos elementos a que se referem. | |
9 | + | |
10 | +%\begin{figure}[!htb] | |
11 | +%\centering | |
12 | +%\includegraphics[scale=0.5]{medida_volumetrica} | |
13 | +%\caption{Gerenciamento de dados} | |
14 | +%\label{fig:volumetric_data} | |
15 | +%\end{figure} | |
16 | + | |
17 | +\begin{figure}[!htb] | |
18 | +\centering | |
19 | +\includegraphics[scale=0.5]{mask_manager} | |
20 | +\caption{Gerenciamento de dados} | |
21 | +\label{fig:volumetric_data} | |
22 | +\end{figure} | |
23 | + | |
24 | +Dentro de cada aba, aparece um painel dividido em linhas e colunas. Em cada linha, a primeira | |
25 | +coluna determina a visualização do elemento listado naquela linha. Isto é, o ícone que | |
26 | +representa um "olho" ativa ou desativa a exibição das máscaras, superfícies ou medições. Caso | |
27 | +um desses elementos esteja em exibição, o ícone da figura \ref{fig:disable_mask} correspondente | |
28 | +a ele também estará visível. | |
29 | + | |
30 | +\newpage | |
31 | + | |
32 | +\begin{figure}[!htb] | |
33 | +\centering | |
34 | +\includegraphics[scale=0.9]{eye} | |
35 | +\caption{Ícone indicativo da visibilidade de elementos} | |
36 | +\label{fig:disable_mask} | |
37 | +\end{figure} | |
38 | + | |
39 | +Algumas operações são possíveis sobre os dados. Por exemplo, para excluir um dado, é necessário | |
40 | +primeiro selecionar seu nome, como mostra a figura \ref{fig:selected_mask} e, em seguida, clicar | |
41 | +no atalho que a figura \ref{fig:delete_data} ilustra. | |
42 | + | |
43 | +\begin{figure}[!htb] | |
44 | +\centering | |
45 | +\includegraphics[scale=0.5]{selected_mask} | |
46 | +\caption{Dado selecionado} | |
47 | +\label{fig:selected_mask} | |
48 | +\end{figure} | |
49 | + | |
50 | + | |
51 | +\begin{figure}[!htb] | |
52 | +\centering | |
53 | +\includegraphics[scale=0.8]{delete_data} | |
54 | +\caption{Excluir dado} | |
55 | +\label{fig:delete_data} | |
56 | +\end{figure} | |
57 | + | |
58 | +Para criar uma nova máscara, superfície ou medição, basta clicar no atalho ilustrado na figura | |
59 | +\ref{fig:new_data}, desde que a respectiva aba esteja aberta. | |
60 | + | |
61 | +\begin{figure}[!htb] | |
62 | +\centering | |
63 | +\includegraphics[scale=0.8]{new_data} | |
64 | +\caption{Novo dado} | |
65 | +\label{fig:new_data} | |
66 | +\end{figure} | |
67 | + | |
68 | +Para copiar um dado, basta selecioná-lo e clicar no atalho que a figura \ref{fig:duplicate_data} | |
69 | +ilustra. | |
70 | + | |
71 | +\begin{figure}[!htb] | |
72 | +\centering | |
73 | +\includegraphics[scale=0.8]{duplicate_data} | |
74 | +\caption{Copiar dado} | |
75 | +\label{fig:duplicate_data} | |
76 | +\end{figure} | |
77 | + | |
78 | + | |
79 | +\newpage | |
80 | + | |
81 | + | |
82 | +\section{Máscaras} | |
83 | + | |
84 | +Na coluna \textbf{Nome}, são exibidos a cor e o nome atribuídos à máscara. Já a coluna | |
85 | +\textbf{Limiar} exibe o intervalo de valores utilizado para criar a máscara. A figura | |
86 | +\ref{fig:volumetric_data} mostra um exemplo. | |
87 | + | |
88 | +\section{Superfícies 3D} | |
89 | + | |
90 | +Na coluna \textbf{Nome}, são exibidos a cor e o nome atribuídos à superfície. A coluna | |
91 | +\textbf{Volume} mostra o volume total da superfície. Por fim, a coluna \textbf{Transparência} | |
92 | +indica o nível de transparência em uso para exibir a superfície. A figura \ref{fig:surface_manager} | |
93 | +traz um exemplo. | |
94 | + | |
95 | +\begin{figure}[!htb] | |
96 | +\centering | |
97 | +\includegraphics[scale=0.5]{surface_manager} | |
98 | +\caption{Gerenciamento de superfícies} | |
99 | +\label{fig:surface_manager} | |
100 | +\end{figure} | |
101 | + | |
102 | + | |
103 | +\newpage | |
104 | + | |
105 | + | |
106 | +\section{Medições} | |
107 | + | |
108 | +A aba \textbf{Medições} traz as seguintes informações. A coluna \textbf{Nome} exibe a cor e o | |
109 | +nome atribuídos à medição. A coluna \textbf{Local} exibe onde a medição foi feita (imagem axial, | |
110 | +coronal, sagital ou 3D), e \textbf{Tipo} indica o tipo da medida (linear ou angular). Por último, | |
111 | +a coluna \textbf{Valor} informa a medida propriamente dita. Veja a figura \ref{fig:manager_mensuares}. | |
112 | + | |
113 | +\begin{figure}[!htb] | |
114 | +\centering | |
115 | +\includegraphics[scale=0.5]{manager_mensuares} | |
116 | +\caption{Gerenciamento de medições} | |
117 | +\label{fig:manager_mensuares} | |
118 | +\end{figure} | |
119 | + | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,104 @@ |
1 | +\chapter{Importação} | |
2 | + | |
3 | +O InVesalius importa arquivos no formato DICOM, incluindo arquivos compactados (JPEG sem perdas e | |
4 | +com perdas) e arquivos no formato Analyze (Mayo Clinic)$^\copyright$. | |
5 | + | |
6 | +\section{DICOM} | |
7 | + | |
8 | +No menu \textbf{Arquivo}, clique na opção \textbf{Importar DICOM...}. Se preferir, use o atalho | |
9 | +do teclado \textbf{Ctrl + I}. A importação também pode ser acionada pelo ícone da barra de ferramentas | |
10 | +descrito na figura \ref{fig:import}. | |
11 | + | |
12 | +\begin{figure}[!htb] | |
13 | +\centering | |
14 | +\includegraphics[scale=0.2]{file_import_original.png} | |
15 | +\caption{Atalho para Importar DICOM} | |
16 | +\label{fig:import} | |
17 | +\end{figure} | |
18 | + | |
19 | +\hspace{.2cm} | |
20 | + | |
21 | +Em seguida, selecione o diretório que contenha os arquivos DICOM, como na figura \ref{fig:win_folder}. | |
22 | +O InVesalius irá procurar por arquivos também em subdiretórios do diretório escolhido, caso existam. | |
23 | + | |
24 | +\newpage | |
25 | + | |
26 | +Clique em \textbf{OK}. | |
27 | + | |
28 | +\begin{figure}[!htb] | |
29 | +\centering | |
30 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec311139.jpg} | |
31 | +\caption{Seleção de diretório} | |
32 | +\label{fig:win_folder} | |
33 | +\end{figure} | |
34 | + | |
35 | +\hspace{.2cm} | |
36 | + | |
37 | +Enquanto o InVesalius procura por arquivos DICOM no diretório, é exibido o progresso | |
38 | +do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:ver_file}. | |
39 | + | |
40 | +\begin{figure}[!htb] | |
41 | +\centering | |
42 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_03Dec311131.jpg} | |
43 | +\caption{Status de verificação e carregamento de arquivos} | |
44 | +\label{fig:ver_file} | |
45 | +\end{figure} | |
46 | + | |
47 | +\newpage | |
48 | + | |
49 | +Se arquivos DICOM forem encontrados, é aberta uma janela (figura \ref{fig:win_import}) | |
50 | +para selecionar o paciente e a respectiva série que se deseja abrir. Também é possível | |
51 | +pular imagens para reconstrução. | |
52 | + | |
53 | +\begin{figure}[!htb] | |
54 | +\centering | |
55 | +\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_06Dec311139.jpg} | |
56 | +\caption{Tela de importação} | |
57 | +\label{fig:win_import} | |
58 | +\end{figure} | |
59 | + | |
60 | +\newpage | |
61 | + | |
62 | +Caso deseje importar uma série com todas as imagens presentes, clique em "\textbf{+}" ao | |
63 | +lado do nome do paciente para expandir as séries a ele pertencentes. Dê um \textbf{clique duplo} | |
64 | +com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre a descrição da série. Veja a figura | |
65 | +\ref{fig:import_serie}. | |
66 | + | |
67 | +\begin{figure}[!htb] | |
68 | +\centering | |
69 | +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_08Dec311139_.jpg} | |
70 | +\caption{Seleção de série} | |
71 | +\label{fig:import_serie} | |
72 | +\end{figure} | |
73 | + | |
74 | +%\hspace{.2cm} | |
75 | + | |
76 | +Em alguns casos, em particular quando não se dispõe de um computador com memória e/ou | |
77 | +processamento satisfatórios para trabalhar com muitas imagens em uma série, pode ser | |
78 | +recomendável pular (ignorar) algumas delas. Para isso, clique \textbf{uma vez} com o botão | |
79 | +\textbf{esquerdo} do mouse sobre a descrição da série (figura \ref{fig:import_serie}) e selecione | |
80 | +quantas imagens serão puladas (figura \ref{fig:skip_image}). Clique em \textbf{OK}. | |
81 | + | |
82 | +\begin{figure}[!htb] | |
83 | +\centering | |
84 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_13Dec311140_.jpg} | |
85 | +\caption{Pular imagens} | |
86 | +\label{fig:skip_image} | |
87 | +\end{figure} | |
88 | + | |
89 | +%\hspace{.2cm} | |
90 | + | |
91 | +Em ambos os procedimentos, será apresentada uma janela (figura \ref{fig:prog_recons}) com o progresso | |
92 | +da reconstrução (quando as imagens são empilhadas e interpoladas). | |
93 | + | |
94 | +\begin{figure}[!htb] | |
95 | +\centering | |
96 | +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_14Dec311140.jpg} | |
97 | +\caption{Progresso da reconstrução} | |
98 | +\label{fig:prog_recons} | |
99 | +\end{figure} | |
100 | + | |
101 | +\newpage | |
102 | + | |
103 | +\section{Analyze} | |
104 | +Para importar arquivos no formato Analyze, basta ... | |
0 | 105 | \ No newline at end of file | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,145 @@ |
1 | +\chapter{Instalação} | |
2 | + | |
3 | +\section{MS-Windows} | |
4 | + | |
5 | +Para instalar o InVesalius no MS-Windows, basta executar o programa instalador. | |
6 | +Quando aparecer uma janela pedindo para confirmar a execução do arquivo, clique | |
7 | +em \textbf{Executar}. | |
8 | + | |
9 | +\begin{figure}[!htb] | |
10 | +\centering | |
11 | +\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_02Dec311523.jpg} | |
12 | +\end{figure} | |
13 | + | |
14 | +\newpage | |
15 | +Uma nova janela pedirá para selecionar o idioma do instalador. Selecione | |
16 | +o idioma e clique em \textbf{OK}. | |
17 | + | |
18 | +\begin{figure}[!htb] | |
19 | +\centering | |
20 | +\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_03Dec311523.jpg} | |
21 | +\end{figure} | |
22 | + | |
23 | +\hspace{.2cm} | |
24 | + | |
25 | +Em seguida, será exibida a janela do instalador. Clique em \textbf{Avançar}. | |
26 | + | |
27 | +\begin{figure}[!htb] | |
28 | +\centering | |
29 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_02Dec310024.jpg} | |
30 | +\end{figure} | |
31 | + | |
32 | +\newpage | |
33 | + | |
34 | +Selecione \textbf{Eu aceito os termos do Contrato} e clique em \textbf{Avançar}. | |
35 | + | |
36 | +\begin{figure}[!htb] | |
37 | +\centering | |
38 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec310024.jpg} | |
39 | +\end{figure} | |
40 | + | |
41 | +\hspace{.2cm} | |
42 | + | |
43 | +Clique em \textbf{Avançar} novamente. | |
44 | + | |
45 | +\begin{figure}[!htb] | |
46 | +\centering | |
47 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_05Dec310024.jpg} | |
48 | +\end{figure} | |
49 | + | |
50 | +\newpage | |
51 | + | |
52 | +Clique em \textbf{Avançar}. | |
53 | + | |
54 | +\begin{figure}[!htb] | |
55 | +\centering | |
56 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_06Dec310024.jpg} | |
57 | +\end{figure} | |
58 | + | |
59 | +\hspace{.2cm} | |
60 | + | |
61 | +Selecione \textbf{Criar um ícone na Área de Trabalho} e \textbf{Criar um ícone | |
62 | +na Barra de Inicialização Rápida} e clique em \textbf{Avançar}. | |
63 | + | |
64 | +\begin{figure}[!htb] | |
65 | +\centering | |
66 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_08Dec310024.jpg} | |
67 | +\end{figure} | |
68 | + | |
69 | +\newpage | |
70 | + | |
71 | +Clique em \textbf{Instalar}. | |
72 | + | |
73 | +\begin{figure}[!htb] | |
74 | +\centering | |
75 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_09Dec310024.jpg} | |
76 | +\end{figure} | |
77 | + | |
78 | +\hspace{.2cm} | |
79 | + | |
80 | +Enquanto o software é instalado, será exibida uma janela com o progresso | |
81 | +da instalação. | |
82 | + | |
83 | +\begin{figure}[!htb] | |
84 | +\centering | |
85 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_11Dec310025.jpg} | |
86 | +\end{figure} | |
87 | + | |
88 | +\newpage | |
89 | + | |
90 | +Para executar o InVesalius após a instalação, clique em \textbf{Concluir}. | |
91 | + | |
92 | +\begin{figure}[!htb] | |
93 | +\centering | |
94 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_14Dec310025.jpg} | |
95 | +\end{figure} | |
96 | + | |
97 | +\hspace{.2cm} | |
98 | + | |
99 | +Caso seja a primeira vez em que o software é instalado, será exibida uma janela | |
100 | +para selecionar o idioma do InVesalius. Selecione o idioma desejado e clique em | |
101 | +\textbf{OK}. | |
102 | + | |
103 | +\begin{figure}[!htb] | |
104 | +\centering | |
105 | +\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_15Dec310025.jpg} | |
106 | +\end{figure} | |
107 | + | |
108 | +\newpage | |
109 | + | |
110 | +Enquanto o InVesalius é carregado, é exibida uma janela de abertura como a da figura | |
111 | +seguinte. | |
112 | + | |
113 | +\begin{figure}[!htb] | |
114 | +\centering | |
115 | +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_17Dec310026.jpg} | |
116 | +\end{figure} | |
117 | + | |
118 | +\hspace{.2cm} | |
119 | + | |
120 | +Em seguida, a janela principal do programa é aberta. | |
121 | + | |
122 | +\begin{figure}[!htb] | |
123 | +\centering | |
124 | +\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_18Dec310026.jpg} | |
125 | +\end{figure} | |
126 | + | |
127 | +\section{Mac Os X} | |
128 | + | |
129 | +Para iniciar a instalação no Mac Os X, clique 2 vezes com o botão esquerdo do mouse sobre o instalador. | |
130 | +Em seguida o instalador será inicializado. | |
131 | + | |
132 | +\begin{figure}[!htb] | |
133 | +\centering | |
134 | +\includegraphics[scale=0.3]{mac2.png} | |
135 | +\end{figure} | |
136 | + | |
137 | +Mantenha o botão esquerdo pressionado sobre o ícone do software InVesalius e arraste-o para o ícone \textit{Applications} | |
138 | +ambos contidos no instalador. | |
139 | + | |
140 | +\begin{figure}[!htb] | |
141 | +\centering | |
142 | +\includegraphics[scale=0.4]{mac4.png} | |
143 | +\end{figure} | |
144 | + | |
145 | +O software já encontra-se instalado, bastando acessar pelo menu | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,388 @@ |
1 | +\chapter{Manipulação de Imagens (2D)} | |
2 | + | |
3 | +\section{Reconstrução Multiplanar} | |
4 | + | |
5 | +Ao importar as imagens DICOM, o InVesalius mostra, automaticamente, a sua reconstrução | |
6 | +multiplanar nas orientações Axial, Sagital e Coronal, bem como uma janela para manipulação 3D. | |
7 | +Veja a figura \ref{fig:mpr}. | |
8 | + | |
9 | +\begin{figure}[!htb] | |
10 | +\centering | |
11 | +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_18Dec311140_1.jpg} | |
12 | +\caption{Reconstrução multiplanar} | |
13 | +\label{fig:mpr} | |
14 | +\end{figure} | |
15 | + | |
16 | +\newpage | |
17 | + | |
18 | +Além de criar a reconstrução multiplanar, o InVesalius segmenta a imagem, destacando, por exemplo, os | |
19 | +ossos dos tecidos moles. O destaque é representado por meio da aplicação de cores sobre a estrutura | |
20 | +segmentada, isto é, as cores formam uma máscara sobre a imagem destacando a estrutura (figura | |
21 | +\ref{fig:mpr}). Isso será discutido em mais detalhes nos próximos capítulos. | |
22 | + | |
23 | +Para esconder a máscara, usa-se o gerenciador de dados, localizado no canto inferior esquerdo | |
24 | +da tela. Basta escolher a aba \textbf{Máscaras} e clicar \textbf{uma} vez com o botão | |
25 | +\textbf{esquerdo} do mouse sobre o ícone do olho ao lado de \textbf{"Máscara 1"}. Veja a figura | |
26 | +\ref{fig:ger_masc}. | |
27 | + | |
28 | +\begin{figure}[!htb] | |
29 | +\centering | |
30 | +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_29Dec311141_.jpg} | |
31 | +\caption{Gerenciador de máscaras} | |
32 | +\label{fig:ger_masc} | |
33 | +\end{figure} | |
34 | + | |
35 | +O ícone do olho desaparece, e as cores da máscara de segmentação são escondidas (figura | |
36 | +\ref{fig:mpr_sem_mask}). | |
37 | + | |
38 | +\begin{figure}[!htb] | |
39 | +\centering | |
40 | +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_28Dec311141_.jpg} | |
41 | +\caption{Reconstrução multiplanar sem máscara de segmentação} | |
42 | +\label{fig:mpr_sem_mask} | |
43 | +\end{figure} | |
44 | + | |
45 | +\subsection{Orientação axial} | |
46 | + | |
47 | +A orientação axial é composta de cortes transversais da região | |
48 | +de interesse, ou seja, cortes paralelos ao plano axial do corpo humano. | |
49 | +Na figura \ref{fig:axial_corte}, é exibida uma imagem em orientação axial da | |
50 | +região do crânio. | |
51 | + | |
52 | +\begin{figure}[!htb] | |
53 | +\centering | |
54 | +\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_24Dec310029_.jpg} | |
55 | +\caption{Corte axial} | |
56 | +\label{fig:axial_corte} | |
57 | +\end{figure} | |
58 | + | |
59 | +\subsection{Orientação sagital} | |
60 | + | |
61 | +A orientação sagital é composta de cortes realizados lateralmente | |
62 | +em relação à região de interesse, ou seja, cortes paralelos ao plano sagital do corpo humano, | |
63 | +que o divide nas porções esquerda e direita. | |
64 | +A figura \ref{fig:sagital_slice} mostra uma imagem do crânio em orientação sagital. | |
65 | + | |
66 | +\begin{figure}[!htb] | |
67 | +\centering | |
68 | +\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_25Dec310029_.jpg} | |
69 | +\caption{Corte sagital} | |
70 | +\label{fig:sagital_slice} | |
71 | +\end{figure} | |
72 | + | |
73 | +\newpage | |
74 | + | |
75 | +\subsection{Orientação coronal} | |
76 | + | |
77 | +A orientação coronal é composta de cortes paralelos ao plano coronal, | |
78 | +que divide o corpo humano em metades ventral e dorsal. | |
79 | +A figura \ref{fig:coronal_slice} mostra uma imagem do crânio em orientação | |
80 | +coronal. | |
81 | + | |
82 | +\begin{figure}[!htb] | |
83 | +\centering | |
84 | +\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_24Dec311141_.jpg} | |
85 | +\caption{Corte coronal} | |
86 | +\label{fig:coronal_slice} | |
87 | +\end{figure} | |
88 | + | |
89 | + | |
90 | +\section{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal} | |
91 | + | |
92 | +Para saber qual o ponto comum das imagens nas diferentes orientações, basta acionar o | |
93 | +recurso "Cruz de interseção de fatias" pelo ícone de atalho localizado na barra de ferramentas. | |
94 | +Veja a figura \ref{fig:cross_icon}. | |
95 | + | |
96 | +\begin{figure}[!htb] | |
97 | +\centering | |
98 | +\includegraphics[scale=1]{cross.png} | |
99 | +\caption{Atalho para mostrar ponto comum entre diferentes orientações} | |
100 | +\label{fig:cross_icon} | |
101 | +\end{figure} | |
102 | + | |
103 | +Quando o recurso é acionado, dois segmentos de reta que se cruzam perpendicularmente são exibidos | |
104 | +sobre cada imagem (figura \ref{fig:cross_all}). O ponto de interseção de cada par de segmentos | |
105 | +representa o ponto comum entre as diferentes orientações. | |
106 | + | |
107 | +\newpage | |
108 | + | |
109 | +Para modificar o ponto, mantenha \textbf{pressionado} o botão \textbf{esquerdo} do mouse e o | |
110 | +\textbf{arraste}. Automaticamente, os pontos correspondentes serão atualizados em cada imagem. | |
111 | + | |
112 | +\begin{figure}[!htb] | |
113 | +\centering | |
114 | +\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_01Jan021941.jpg} | |
115 | +\caption{Ponto comum entre orientações diferentes} | |
116 | +\label{fig:cross_all} | |
117 | +\end{figure} | |
118 | + | |
119 | +Para desativar a funcionalidade, basta clicar novamente sobre o atalho (figura \ref{fig:cross_icon}). | |
120 | +Esse recurso pode ser utilizado em conjunto com o editor de fatias (que será comentado mais à frente). | |
121 | + | |
122 | +\newpage | |
123 | + | |
124 | +\section{Mover} | |
125 | + | |
126 | +Para mover uma imagem na tela, pode-se utilizar o ícone do atalho "Mover" da barra de ferramentas (figura | |
127 | +\ref{fig:move_icon}). Clique sobre o ícone para ativar o recurso e, em seguida, com o botão | |
128 | +\textbf{esquerdo} do mouse pressionado sobre a imagem, \textbf{arraste-a} para a direção desejada. | |
129 | +A figura \ref{fig:move_img} mostra uma imagem deslocada (movida). | |
130 | + | |
131 | +\begin{figure}[!htb] | |
132 | +\centering | |
133 | +\includegraphics[scale=0.25]{tool_translate_original.png} | |
134 | +\caption{Atalho para mover imagens} | |
135 | +\label{fig:move_icon} | |
136 | +\end{figure} | |
137 | + | |
138 | +\begin{figure}[!htb] | |
139 | +\centering | |
140 | +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_84Dec311201.jpg} | |
141 | +\caption{Imagem deslocada} | |
142 | +\label{fig:move_img} | |
143 | +\end{figure} | |
144 | + | |
145 | +\section{Rotacionar} | |
146 | + | |
147 | +A rotação de imagens pode ser ativada pelo ícone do atalho "Rotacionar" da barra de ferramentas (figura | |
148 | +\ref{fig:rot_icon}). Para rotacionar uma imagem, clique sobre o ícone e, em seguida, com o botão | |
149 | +\textbf{esquerdo} do mouse pressionado sobre a imagem, \textbf{arraste-a} no sentido horário ou | |
150 | +anti-horário, dependendo do sentido de rotação desejado. | |
151 | + | |
152 | +\begin{figure}[!htb] | |
153 | +\centering | |
154 | +\includegraphics[scale=0.25]{tool_rotate_original.png} | |
155 | +\caption{Atalho para rotacionar imagens} | |
156 | +\label{fig:rot_icon} | |
157 | +\end{figure} | |
158 | + | |
159 | +\begin{figure}[!htb] | |
160 | +\centering | |
161 | +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_83Dec311201_.jpg} | |
162 | +\caption{Imagem rotacionada} | |
163 | +\label{fig:rotate_all} | |
164 | +\end{figure} | |
165 | + | |
166 | +\section{Ampliar (\textit{Zoom})} | |
167 | + | |
168 | +No InVesalius, existem diferentes formas de ampliar uma imagem. Pode-se maximizar a janela da | |
169 | +orientação desejada, aplicar o \textit{zoom} diretamente na imagem, ou selecionar a região da imagem | |
170 | +que será ampliada. | |
171 | + | |
172 | + | |
173 | +\subsection{Maximizando as janelas de orientação} | |
174 | + | |
175 | +Como já sabemos, a janela principal do InVesalius é dividida em 4 subjanelas: axial, sagital, coronal | |
176 | +e 3D. Cada uma delas pode ser maximizada de modo a ocupar toda a área da janela principal. Para isso, | |
177 | +basta clicar com o botão \textbf{esquerdo} do mouse no ícone existente no \textbf{canto superior direito} | |
178 | +da subjanela (figura \ref{fig:maximize_window}). Para restaurar uma janela maximizada a seu tamanho | |
179 | +anterior, basta clicar novamente no ícone. | |
180 | + | |
181 | +\begin{figure}[!htb] | |
182 | +\centering | |
183 | +\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_27Dec311141__.jpg} | |
184 | +\caption{Detalhe de uma subjanela (Observe o ícone de maximizar no canto superior direito)} | |
185 | +\label{fig:maximize_window} | |
186 | +\end{figure} | |
187 | + | |
188 | +\subsection{Ampliando ou reduzindo uma imagem} | |
189 | + | |
190 | +Para ampliar ou reduzir uma imagem, clique sobre o ícone do atalho "\textit{Zoom}" na barra de | |
191 | +ferramentas (figura \ref{fig:zoom_icon}). Mantenha o botão \textbf{esquerdo} pressionado sobre | |
192 | +a imagem e \textbf{arraste} o mouse para \textbf{cima}, caso deseje ampliá-la, ou para \textbf{baixo}, | |
193 | +caso deseje reduzi-la. | |
194 | + | |
195 | +\begin{figure}[!htb] | |
196 | +\centering | |
197 | +\includegraphics[scale=0.25]{tool_zoom_original.png} | |
198 | +\caption{Atalho de \textit{Zoom}} | |
199 | +\label{fig:zoom_icon} | |
200 | +\end{figure} | |
201 | + | |
202 | +%\begin{figure}[!htb] | |
203 | +%\centering | |
204 | +%\includegraphics[scale=0.2]{ScreenHunter_76Dec311201_.jpg} | |
205 | +%\caption{Imagem com \textit{Zoom} aplicado} | |
206 | +%\label{fig:zoom_} | |
207 | +%\end{figure} | |
208 | + | |
209 | +\subsection{Ampliando uma área da imagem} | |
210 | + | |
211 | +Para ampliar uma área determinada da imagem, clique sobre o ícone do atalho "Zoom baseado na seleção" | |
212 | +na barra de ferramentas (figura \ref{fig:zoom_icon_loc}). Posicione o ponteiro do mouse na posição | |
213 | +inicial da seleção, clique e mantenha o botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado e \textbf{arraste-o} | |
214 | +até a posição final da seleção, formando um retângulo (figura \ref{fig:zoom_select}). Assim que o | |
215 | +botão esquerdo do mouse for liberado, a operação de \textit{zoom} será aplicada à região selecionada | |
216 | +(figura \ref{fig:zoom_applied}). | |
217 | + | |
218 | +\begin{figure}[!htb] | |
219 | +\centering | |
220 | +\includegraphics[scale=0.25]{tool_zoom_select_original.png} | |
221 | +\caption{Atalho de \textit{Zoom} baseado na seleção} | |
222 | +\label{fig:zoom_icon_loc} | |
223 | +\end{figure} | |
224 | + | |
225 | +\begin{figure}[!htb] | |
226 | +\centering | |
227 | +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_06Jan062046.jpg} | |
228 | +\caption{Área selecionada para \textit{zoom}} | |
229 | +\label{fig:zoom_select} | |
230 | +\end{figure} | |
231 | + | |
232 | +\begin{figure}[!htb] | |
233 | +\centering | |
234 | +\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_08Jan062046.jpg} | |
235 | +\caption{Imagem ampliada} | |
236 | +\label{fig:zoom_applied} | |
237 | +\end{figure} | |
238 | + | |
239 | + | |
240 | +\section{Brilho e contraste (Janelas)} | |
241 | +\label{sec:ww_wl} | |
242 | + | |
243 | +Para melhorar a visualização das imagens, podemos utilizar o recurso de \textit{window width} e | |
244 | +\textit{window level}, popularmente conhecido por "brilho e contraste" ou "janela" (para radiologistas). | |
245 | +Com esse recurso, é possível definir a faixa da escala de cinza (\textit{window level}) e a | |
246 | +largura dessa faixa (\textit{window width}) que serão usadas para exibir as imagens. | |
247 | + | |
248 | +O recurso pode ser acionado pelo ícone do atalho "Contraste" na barra de ferramentas. Veja a figura \ref{fig:window_level_shortcut}. | |
249 | + | |
250 | +\begin{figure}[!htb] | |
251 | +\centering | |
252 | +\includegraphics[scale=0.70]{tool_contrast_original.png} | |
253 | +\caption{Atalho de brilho e contraste} | |
254 | +\label{fig:window_level_shortcut} | |
255 | +\end{figure} | |
256 | + | |
257 | +Para aumentar o brilho, mantenha o botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado e o \textbf{arraste} na | |
258 | +horizontal para a direita. Para diminuir o brilho, basta arrastar o mouse para a esquerda. O contraste | |
259 | +pode ser alterado arrastando o mouse (com o botão \textbf{esquerdo} pressionado) na vertical: para cima | |
260 | +para aumentar, ou para baixo para diminuir o contraste. | |
261 | + | |
262 | +Para desabilitar o recurso, clique novamente sobre o ícone do atalho (figura \ref{fig:window_level_shortcut}). | |
263 | + | |
264 | +É possível utilizar padrões pré-definidos de brilho e contraste. A tabela \ref{tab:window_level} relaciona | |
265 | +alguns tipos de tecido com os respectivos valores de brilho e contraste da imagem. Para usar um padrão | |
266 | +pré-definido, posicione o cursor do mouse sobre a imagem e clique com o botão \textbf{direito} para abrir um | |
267 | +menu de contexto sobre ela. Quando o menu se abrir, selecione a entrada \textbf{Brilho e Contraste} e, em | |
268 | +seguida, clique sobre a opção pré-definida, de acordo com o tipo de tecido, como mostra a figura | |
269 | +\ref{fig:window_level}. | |
270 | + | |
271 | + | |
272 | +\begin{figure}[!htb] | |
273 | +\centering | |
274 | +\includegraphics[scale=0.40]{ScreenHunter_12Jan021943_0.png} | |
275 | +\caption{Menu de contexto para seleção de brilho e contraste} | |
276 | +\label{fig:window_level} | |
277 | +\end{figure} | |
278 | + | |
279 | +\begin{table}[h] | |
280 | +\centering | |
281 | +\caption{Valores de brilho e contraste para alguns tecidos} | |
282 | +\begin{tabular}{lcc}\\ | |
283 | +\hline % este comando coloca uma linha na tabela | |
284 | +Tecido & Brilho & Contraste\\ | |
285 | +\hline | |
286 | +\hline | |
287 | +Padrão & Exame & Exame\\ | |
288 | +Manual & Alterado & Alterado\\ | |
289 | +Abdômen & 350 & 50 \\ | |
290 | +Cérebro & 80 & 40\\ | |
291 | +Enfisema & 500 & -850\\ | |
292 | +Fossa Posterior Nasal & 120 & 40\\ | |
293 | +Fígado & 2000 & -500\\ | |
294 | +Isquemia - Contraste Tecidos Duros & 15 & 32\\ | |
295 | +Isquemia - Contraste Tecidos Moles & 80 & 20\\ | |
296 | +Laringe & 180 & 80\\ | |
297 | +Mediastino & 350 & 25\\ | |
298 | +Osso & 2000 & 300\\ | |
299 | +Pélvis & 450 & 50\\ | |
300 | +Pulmão Duro & 1000 & -600\\ | |
301 | +Pulmão Mole & 1600 & -600\\ | |
302 | +Seio & 4000 & 400\\ | |
303 | +Vascular - Duro & 240 & 80\\ | |
304 | +Vascular - Mole & 680 & 160\\ | |
305 | +\hline | |
306 | +\end{tabular} | |
307 | +\label{tab:window_level} | |
308 | +\end{table} | |
309 | + | |
310 | +\begin{figure} | |
311 | + \centering | |
312 | + \subfloat[Osso]{\label{fig:contrast_bone}\includegraphics[width=0.4\textwidth]{contraste_osso}} | |
313 | + \subfloat[Pulmão]{\label{fig:contrast_isq}\includegraphics[width=0.4\textwidth]{contraste_pulmao}} | |
314 | + \caption{Diferentes tipos de brilho e constraste} | |
315 | + \label{fig:two_window_level} | |
316 | +\end{figure} | |
317 | + | |
318 | + | |
319 | +\section{Pseudocor} | |
320 | + | |
321 | +Outro recurso para melhorar a visualização das imagens são as pseudocores. Elas substituem os níveis | |
322 | +de cinza por cores, ou pelos níveis de cinza invertidos. Nesse último caso, regiões da imagem que | |
323 | +antes eram mais claras se tornam mais escuras e vice-versa. | |
324 | + | |
325 | +Para alterar a visualização usando uma pseudocor, posicione o cursor do mouse sobre a imagem e clique | |
326 | +com o botão \textbf{direito} para abrir um menu de contexto sobre ela. Quando o menu se abrir, | |
327 | +selecione a entrada \textbf{Pseudocor} e, em seguida, clique sobre a opção de pseudocor desejada, como | |
328 | +mostra a figura \ref{fig:pseudo_color}. | |
329 | + | |
330 | +\begin{figure}[!htb] | |
331 | +\centering | |
332 | +\includegraphics[scale=0.40]{pseudo_menu.png} | |
333 | +\caption{Pseudo Cor} | |
334 | +\label{fig:pseudo_color} | |
335 | +\end{figure} | |
336 | + | |
337 | +As figuras de \ref{fig:image_default} a \ref{fig:image_saturation} exemplificam as diversas opções de | |
338 | +pseudocor disponíveis.\\ | |
339 | + | |
340 | +\begin{figure}[!htb] | |
341 | +\centering | |
342 | +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_24Dec310029.jpg} | |
343 | +\caption{Padrão} | |
344 | +\label{fig:image_default} | |
345 | +\end{figure} | |
346 | + | |
347 | +\begin{figure}[!htb] | |
348 | +\centering | |
349 | +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_21Jan021944.jpg} | |
350 | +\caption{Imagem Cinza Invertido} | |
351 | +\label{fig:image_inverted} | |
352 | +\end{figure} | |
353 | + | |
354 | +\begin{figure}[!htb] | |
355 | +\centering | |
356 | +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_20Jan021944} | |
357 | +\caption{Arco-íris} | |
358 | +\label{fig:image_arc} | |
359 | +\end{figure} | |
360 | + | |
361 | +\begin{figure}[!htb] | |
362 | +\centering | |
363 | +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_22Jan021944} | |
364 | +\caption{Deserto} | |
365 | +\label{fig:image_desert} | |
366 | +\end{figure} | |
367 | + | |
368 | +\begin{figure}[!htb] | |
369 | +\centering | |
370 | +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_23Jan021944} | |
371 | +\caption{Matiz} | |
372 | +\label{fig:image_matiz} | |
373 | +\end{figure} | |
374 | + | |
375 | +\begin{figure}[!htb] | |
376 | +\centering | |
377 | +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_24Jan021944} | |
378 | +\caption{Oceano} | |
379 | +\label{fig:image_ocean} | |
380 | +\end{figure} | |
381 | + | |
382 | +\begin{figure}[!htb] | |
383 | +\centering | |
384 | +\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_25Jan021944} | |
385 | +\caption{Saturação} | |
386 | +\label{fig:image_saturation} | |
387 | +\end{figure} | |
388 | + | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,99 @@ |
1 | +\chapter{Medições} | |
2 | + | |
3 | +O InVesalius permite realizar medições lineares e angulares em 2D (planos axial, | |
4 | +coronal e sagital) e em 3D (superfícies). Também é possível fazer medições | |
5 | +volumétricas em superfícies. | |
6 | + | |
7 | +\section{Medição linear} | |
8 | + | |
9 | +Para realizar medições lineares, é necessário ativar o recurso clicando no atalho | |
10 | +correspondente localizado na barra de ferramentas (figura \ref{fig:measure_line_original}). | |
11 | + | |
12 | +\begin{figure}[!htb] | |
13 | +\centering | |
14 | +\includegraphics[scale=0.2]{measure_line_original} | |
15 | +\caption{Atalho para ativar medição linear} | |
16 | +\label{fig:measure_line_original} | |
17 | +\end{figure} | |
18 | + | |
19 | +Uma medição linear é definida entre dois pontos. Com o recurso ativado, clique | |
20 | +\textbf{uma} vez sobre a imagem para estabelecer o ponto inicial. Em seguida, | |
21 | +posicione o ponteiro do mouse no ponto final e clique \textbf{uma} vez novamente. | |
22 | +A medição é executada e o resultado é exibido automaticamente sobre a imagem ou | |
23 | +superfície. | |
24 | + | |
25 | +A figura \ref{fig:axial_linear} mostra uma medida linear em 2D na orientação axial, | |
26 | +e a figura \ref{fig:3d_linear} mostra outra medida linear em 3D (superfície). | |
27 | + | |
28 | +\begin{figure}[!htb] | |
29 | +\centering | |
30 | +\includegraphics[scale=0.4]{axial_linear} | |
31 | +\caption{Medida linear sobre imagem plana} | |
32 | +\label{fig:axial_linear} | |
33 | +\end{figure} | |
34 | + | |
35 | +\begin{figure}[!htb] | |
36 | +\centering | |
37 | +\includegraphics[scale=0.3]{3d_linear} | |
38 | +\caption{Medida linear sobre superfície} | |
39 | +\label{fig:3d_linear} | |
40 | +\end{figure} | |
41 | + | |
42 | +\newpage | |
43 | + | |
44 | +\textbf{Nota: A medida linear é dada em milímetros (mm).} | |
45 | + | |
46 | +\section{Medição angular} | |
47 | + | |
48 | +Uma medição angular em 2D ou sobre uma superfície (3D) pode ser realizada clicando-se | |
49 | +no atalho ilustrado na figura \ref{fig:atalho_angular}. | |
50 | + | |
51 | +\begin{figure}[!htb] | |
52 | +\centering | |
53 | +\includegraphics[scale=0.2]{measure_angle_original} | |
54 | +\caption{Atalho para medição angular} | |
55 | +\label{fig:atalho_angular} | |
56 | +\end{figure} | |
57 | + | |
58 | +Para efetuar a medição angular, é necessário fornecer os três pontos que descreverão o | |
59 | +ângulo a ser medido, A\^{B}C. Posicione o ponteiro do mouse e clique \textbf{uma} vez | |
60 | +com o botão esquerdo para determinar o primeiro ponto, A. Para inserir o segundo ponto, | |
61 | +B (o vértice do ângulo ou o "centro do transferidor"), posicione o ponteiro do mouse e | |
62 | +clique \textbf{uma} vez novamente. Repita as mesmas ações para determinar o terceiro | |
63 | +ponto, C. A medição é executada e, automaticamente, a medida resultante é exibida sobre | |
64 | +a imagem ou superfície. | |
65 | + | |
66 | +A figura \ref{fig:axial_angular} ilustra uma medida angular em uma imagem plana, e a | |
67 | +figura \ref{fig:axial_superficie} ilustra uma medida angular sobre uma superfície. | |
68 | + | |
69 | +\begin{figure}[!htb] | |
70 | +\centering | |
71 | +\includegraphics[scale=0.38]{axial_angular} | |
72 | +\caption{Medida angular sobre imagem plana} | |
73 | +\label{fig:axial_angular} | |
74 | +\end{figure} | |
75 | + | |
76 | +\begin{figure}[!htb] | |
77 | +\centering | |
78 | +\includegraphics[scale=0.33]{angular_superficie} | |
79 | +\caption{Medida angular sobre superfície} | |
80 | +\label{fig:axial_superficie} | |
81 | +\end{figure} | |
82 | + | |
83 | +\textbf{Nota: A medida angular é dada em graus ($^{\circ}$)} | |
84 | + | |
85 | + | |
86 | +\section{Medição volumétrica} | |
87 | + | |
88 | +As medições volumétricas são feitas automaticamente ao se criar uma nova superfície. | |
89 | +Elas são exibidas na aba \textbf{Superfícies 3D}, no painel de gerenciamento de \textbf{Dados}, localizado no canto | |
90 | +inferior esquerdo da tela, como ilustra a figura \ref{fig:volumetric_mensure}. | |
91 | + | |
92 | +\begin{figure}[!htb] | |
93 | +\centering | |
94 | +\includegraphics[scale=0.5]{medida_volumetrica} | |
95 | +\caption{Medidas volumétricas} | |
96 | +\label{fig:volumetric_mensure} | |
97 | +\end{figure} | |
98 | + | |
99 | +\textbf{Nota: A medida volumétrica é dada em milímetros cúbicos ($mm^3$)} | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,264 @@ |
1 | +\chapter{Segmentação} | |
2 | + | |
3 | +Para selecionar um determinado tipo de tecido da imagem, é utilizado o recurso de | |
4 | +segmentação, disponível no InVesalius. | |
5 | + | |
6 | +\section{Limiar (\textit{Threshold})} | |
7 | + | |
8 | +Limiar é uma técnica de segmentação de imagens que permite selecionar da imagem somente | |
9 | +os \textit{pixels} cuja intensidade está dentro de um limiar definido pelo usuário. | |
10 | +O limiar é definido por dois números, limiares inicial e final, também conhecidos como | |
11 | +\textit{thresholds} mínimo e máximo. Como referência para a definição, é utilizada a | |
12 | +escala de Hounsfield (tabela \ref{tab:escala_hounsfield}). | |
13 | + | |
14 | +A segmentação é acionada no painel situado no lado esquerdo da interface do InVesalius, | |
15 | +no item \textbf{2. Selecione a região de interesse} (figura \ref{fig:region_selection}). | |
16 | + | |
17 | +\begin{figure}[!htb] | |
18 | +\centering | |
19 | +\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter01Jan201144.jpg} | |
20 | +\caption{Seleção de região de interesse} | |
21 | +\label{fig:region_selection} | |
22 | +\end{figure} | |
23 | + | |
24 | +Antes de iniciar a segmentação, é necessário configurar uma máscara. A máscara é uma | |
25 | +imagem com a região selecionada colorida e sobreposta à imagem original. Veja a figura | |
26 | +(\ref{fig:region_selection_masc}) | |
27 | + | |
28 | +\begin{figure}[!htb] | |
29 | +\centering | |
30 | +\includegraphics[scale=0.4]{limiar_principal} | |
31 | +\caption{Máscara (regiões em amarelo)} | |
32 | +\label{fig:region_selection_masc} | |
33 | +\end{figure} | |
34 | + | |
35 | +Para alterar o limiar, pode-se utilizar a barra que representa os níveis de cinza na imagem (figura | |
36 | +\ref{fig:region_selection_bar}). É possível alterar o limiar inicial usando o controle deslizante | |
37 | +\textit{esquerdo} da barra. De forma semelhante, o limiar final pode ser alterado por meio do controle | |
38 | +\textit{direito}. É possível, ainda, digitar diretamente os valores desejados nas respectivas caixas | |
39 | +de texto nas extremidades da barra. Com a alteração dos valores, automaticamente a máscara será atualizada, | |
40 | +pintando somente os \textit{pixels} com intensidade dentro da faixa determinada. | |
41 | + | |
42 | +\begin{figure}[!htb] | |
43 | +\centering | |
44 | +\includegraphics[scale=0.7]{limiar_barra} | |
45 | +\caption{Seleção dos \textit{pixels} com intensidade entre 226 e 3021 (Osso)} | |
46 | +\label{fig:region_selection_bar} | |
47 | +\end{figure} | |
48 | + | |
49 | +Também existem valores pré-definidos de limiar de acordo com alguns tipos de tecido, como mostra a | |
50 | +figura \ref{fig:limiar_presets}. Basta selecionar o tecido desejado e a máscara será atualizada | |
51 | +automaticamente. | |
52 | + | |
53 | +\begin{figure}[!htb] | |
54 | +\centering | |
55 | +\includegraphics[scale=0.6]{limiar_presets} | |
56 | +\caption{Caixa de seleção de valores pré-definidos de limiar} | |
57 | +\label{fig:limiar_presets} | |
58 | +\end{figure} | |
59 | + | |
60 | +A tabela \ref{tab:limiar} mostra a faixa de níveis de cinza de acordo com o tipo de tecido ou material. | |
61 | + | |
62 | +\begin{table}[h] | |
63 | +\centering | |
64 | +\caption{Limiares pré-definidos para alguns materiais} | |
65 | +\begin{tabular}{lcc}\\ | |
66 | +\hline % este comando coloca uma linha na tabela | |
67 | +Material & Limiar inicial & Limiar final\\ | |
68 | +\hline | |
69 | +\hline | |
70 | +Esmalte (Adulto) & 1553 & 2850\\ | |
71 | +Esmalte (Criança) & 2042 & 3021\\ | |
72 | +Osso & 226 & 3021\\ | |
73 | +Osso Compacto (Adulto) & 662 & 1988\\ | |
74 | +Osso Compacto (Criança) & 586 & 2198\\ | |
75 | +Osso Esponjoso (Adulto) & 148 & 661\\ | |
76 | +Osso Esponjoso (Criança) & 156 & 585\\ | |
77 | +Personalizado & Def. Usuário & Def. Usuário\\ | |
78 | +Tecido Epitelial (Adulto) & -718 & -177\\ | |
79 | +Tecido Epitelial (Criança) & -766 & -202\\ | |
80 | +Tecido Gorduroso (Adulto) & -205 & -51\\ | |
81 | +Tecido Gorduroso (Criança) & -212 & -72\\ | |
82 | +Tecido Muscular (Adulto) & -5 & 135\\ | |
83 | +Tecido Muscular (Criança) & -25 & 139\\ | |
84 | +Tecidos Moles & -700 & 225\\ | |
85 | +\hline | |
86 | +\end{tabular} | |
87 | +\label{tab:limiar} | |
88 | +\end{table} | |
89 | +\newpage | |
90 | + | |
91 | +A tabela \ref{tab:limiar} é mais indicada para tomógrafos médicos. Nos tomógrafos odontológicos, | |
92 | +comumente as faixas de níveis de cinza são maiores e não regulares. Assim, é necessário utilizar | |
93 | +a barra de limiar (figura \ref{fig:region_selection_bar}) para ajustá-las. | |
94 | + | |
95 | +Caso se deseje criar uma nova máscara, basta clicar no ícone do atalho presente no painel, dentro | |
96 | +do item \textbf{2. Selecione a região de interesse}. Veja a figura \ref{fig:shortcut_new_mask}. | |
97 | + | |
98 | +\begin{figure}[!htb] | |
99 | +\centering | |
100 | +\includegraphics[scale=0.2]{object_add_original} | |
101 | +\caption{Atalho para criar nova máscara} | |
102 | +\label{fig:shortcut_new_mask} | |
103 | +\end{figure} | |
104 | + | |
105 | +Clicando-se nesse atalho, uma nova janela será apresentada (figura \ref{fig:create_new_mask}). | |
106 | +Selecione a faixa de limiar desejada e clique em \textbf{OK}. | |
107 | + | |
108 | +\begin{figure}[!htb] | |
109 | +\centering | |
110 | +\includegraphics[scale=0.5]{limiar_janela} | |
111 | +\caption{Criar uma nova máscara} | |
112 | +\label{fig:create_new_mask} | |
113 | +\end{figure} | |
114 | + | |
115 | +\newpage | |
116 | + | |
117 | +Com uma máscara de segmentação configurada, é possível gerar a superfície 3D correspondente | |
118 | +às imagens em estudo. A superfície será composta por uma malha de triângulos. O próximo capítulo | |
119 | +trará maiores detalhes sobre esse tipo de superfície. | |
120 | + | |
121 | +Para iniciar a geração, clique no botão \textbf{Gerar superfície} (figura \ref{fig:generate_surface}). | |
122 | +Caso já exista uma superfície gerada previamente, pode-se substituí-la pela nova. Para isso, basta | |
123 | +selecionar, \textbf{antes} da geração, a opção \textbf{Sobrescrever anterior}. | |
124 | + | |
125 | +\begin{figure}[!htb] | |
126 | +\centering | |
127 | +\includegraphics[scale=0.5]{generate_surface} | |
128 | +\caption{Botão Gerar superfície} | |
129 | +\label{fig:generate_surface} | |
130 | +\end{figure} | |
131 | + | |
132 | +Após alguns instantes, a superfície será exibida na janela de visualização 3D do InVesalius | |
133 | +(figura \ref{fig:surface}). | |
134 | + | |
135 | +\begin{figure}[!htb] | |
136 | +\centering | |
137 | +\includegraphics[scale=0.5]{3d_model} | |
138 | +\caption{Superfície 3D} | |
139 | +\label{fig:surface} | |
140 | +\end{figure} | |
141 | + | |
142 | + | |
143 | + | |
144 | +\section{Segmentação manual (Edição de imagens)} | |
145 | + | |
146 | +Há situações em que a segmentação por limiar não é eficiente, pois ela é aplicada ao conjunto | |
147 | +todo das imagens. Para aplicar a segmentação a imagens isoladas, pode-se usar a segmentação | |
148 | +manual. Com ela, é possível adicionar ou apagar uma determinada região da imagem que foi | |
149 | +segmentada por limiar. No entanto, a segmentação manual requer maior conhecimento de anatomia | |
150 | +por parte do usuário. Para utilizá-la, é necessário clicar em \textbf{Ferramentas avançadas | |
151 | +de edição} (figura \ref{fig:advanced_edition}) para abrir o painel de edição. | |
152 | + | |
153 | +\begin{figure}[!htb] | |
154 | +\centering | |
155 | +\includegraphics[scale=0.6]{edicao_avancada} | |
156 | +\caption{Ferramentas avançadas de edição} | |
157 | +\label{fig:advanced_edition} | |
158 | +\end{figure} | |
159 | + | |
160 | +O painel de edição aparece como mostra a figura \ref{fig:edition_slices_ref}. | |
161 | + | |
162 | +\begin{figure}[!htb] | |
163 | +\centering | |
164 | +\includegraphics[scale=0.5]{edition_slices} | |
165 | +\caption{Painel de edição} | |
166 | +\label{fig:edition_slices_ref} | |
167 | +\end{figure} | |
168 | + | |
169 | +Há dois tipos de pincel disponíveis para desenho: um em forma de círculo e outro em forma | |
170 | +de quadrado. Para escolher um pincel, clique no triângulo da lista de seleção para abri-la | |
171 | +e, a seguir, clique sobre o tipo escolhido. O pincel selecionado aparece no painel como | |
172 | +mostra a figura \ref{fig:brush_type}. | |
173 | + | |
174 | +\begin{figure}[!htb] | |
175 | +\centering | |
176 | +\includegraphics[scale=0.5]{edit_pencil} | |
177 | +\caption{Tipo de pincel} | |
178 | +\label{fig:brush_type} | |
179 | +\end{figure} | |
180 | + | |
181 | +\newpage | |
182 | + | |
183 | +Também é possível alterar o diâmetro do pincel, conforme mostra a figura \ref{fig:select_diameter}. | |
184 | + | |
185 | +\begin{figure}[!htb] | |
186 | +\centering | |
187 | +\includegraphics[scale=0.5]{diametro_pincel} | |
188 | +\caption{Seleção do diâmetro do pincel} | |
189 | +\label{fig:select_diameter} | |
190 | +\end{figure} | |
191 | + | |
192 | +É necessário selecionar o tipo de operação que será realizada pelo pincel. As opções são as | |
193 | +seguintes:\\ | |
194 | +\\ | |
195 | +\textbf{Desenhar}, para pintar uma região que não foi selecionada;\\ | |
196 | +\textbf{Apagar}, para remover uma região que foi selecionada;\\ | |
197 | +\textbf{Limiar}, para remover uma região que está fora do limiar e foi selecionada, ou pintar | |
198 | +uma região que está dentro do limiar e não foi selecionada.\\ | |
199 | + | |
200 | +A figura \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operações do pincel: | |
201 | + | |
202 | +\begin{figure}[!htb] | |
203 | +\centering | |
204 | +\includegraphics[scale=0.6]{select_brush_operation} | |
205 | +\caption{Seleção do tipo de operação do pincel} | |
206 | +\label{fig:select_brush_operations} | |
207 | +\end{figure} | |
208 | + | |
209 | +A figura \ref{fig:noise_amalgaman} mostra um caso em que algumas imagens contêm ruídos | |
210 | +causados pela presença de prótese dentária de amálgama no paciente. Observe os "raios" | |
211 | +saindo da região da arcada dentária. Isso ocorre porque a máscara de segmentação também | |
212 | +seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar para osso. | |
213 | + | |
214 | +\begin{figure}[!htb] | |
215 | +\centering | |
216 | +\includegraphics[scale=0.3]{noise_amalgam} | |
217 | +\caption{Imagem com ruído segmentada com limiar} | |
218 | +\label{fig:noise_amalgaman} | |
219 | +\end{figure} | |
220 | + | |
221 | +A figura \ref{fig:surface_amagaman} ilustra como é uma superfície gerada a partir dessa | |
222 | +segmentação. | |
223 | + | |
224 | +\begin{figure}[!htb] | |
225 | +\centering | |
226 | +\includegraphics[scale=0.3]{case_almagam} | |
227 | +\caption{Superfície gerada a partir de imagem com ruído} | |
228 | +\label{fig:surface_amagaman} | |
229 | +\end{figure} | |
230 | + | |
231 | +\begin{figure}[!htb] | |
232 | +\centering | |
233 | +\includegraphics[scale=0.3]{case_almagam_zoom} | |
234 | +\caption{Zoom da região com ruído} | |
235 | +\label{fig:surface_amagaman_zoom} | |
236 | +\end{figure} | |
237 | + | |
238 | +\newpage | |
239 | + | |
240 | +Em casos como este, utilizando o editor, com o pincel na opção \textbf{Apagar}, mantenha o | |
241 | +botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado enquanto o \textbf{arrasta} sobre a região que | |
242 | +deseja remover (na máscara). | |
243 | + | |
244 | +A figura \ref{fig:editor_amalgaman} mostra a imagem da figura \ref{fig:noise_amalgaman} após | |
245 | +edição. | |
246 | + | |
247 | +\begin{figure}[!htb] | |
248 | +\centering | |
249 | +\includegraphics[scale=0.3]{editor_amagam} | |
250 | +\caption{Imagem com ruído removido} | |
251 | +\label{fig:editor_amalgaman} | |
252 | +\end{figure} | |
253 | + | |
254 | +\begin{figure}[!htb] | |
255 | +\centering | |
256 | +\includegraphics[scale=0.3]{edited_amalgam} | |
257 | +\caption{Superfície criada a partir da imagem com ruído removido} | |
258 | +\label{fig:surface_edited_amalgaman} | |
259 | +\end{figure} | |
260 | + | |
261 | +\newpage | |
262 | +Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figura | |
263 | +\ref{fig:surface_edited_amalgaman}). | |
264 | +%\ref{fig:generate_surface}). | |
0 | 265 | \ No newline at end of file | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,246 @@ |
1 | +\chapter{Superfície (Malha de Triângulos)} | |
2 | + | |
3 | +No InVesalius, a superfície 3D é gerada com base em um modelo segmentado (obtido a partir | |
4 | +da segmentação das imagens). O método utilizado para gerar a superfície é o algoritmo | |
5 | +\textit{marching cubes}. Resumidamente, o algoritmo transforma os \textit{voxels} das | |
6 | +imagens que foram "empilhadas" e segmentadas em uma malha de polígonos simples - no caso, | |
7 | +triângulos. | |
8 | + | |
9 | +Os controles disponíveis para a configuração de superfícies 3D no InVesalius encontram-se | |
10 | +no painel esquerdo do software, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}, opção | |
11 | +\textbf{Propriedades da superfície}. | |
12 | + | |
13 | +\begin{figure}[!htb] | |
14 | +\centering | |
15 | +\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_23_Jan_23_23_10} | |
16 | +\caption{Configuração de uma superfície 3D} | |
17 | +\label{fig:3d_surface_managment} | |
18 | +\end{figure} | |
19 | + | |
20 | + | |
21 | +\section{Criando superfícies} | |
22 | + | |
23 | +É possível criar uma nova superfície com base em uma máscara de segmentação já existente. | |
24 | +Para isso, no painel esquerdo, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}, clique | |
25 | +no atalho ilustrado na figura \ref{fig:shortcut_new_surface}. | |
26 | + | |
27 | +\begin{figure}[!htb] | |
28 | +\centering | |
29 | +\includegraphics[scale=0.18]{object_add_original} | |
30 | +\caption{Atalho para criar uma superfície} | |
31 | +\label{fig:shortcut_new_surface} | |
32 | +\end{figure} | |
33 | + | |
34 | +Ao se clicar nesse atalho, uma janela se abre para permitir a configuração da superfície a | |
35 | +ser criada (figura \ref{fig:create_surface_1}). Além de ser possível determinar a qualidade | |
36 | +da superfície a gerar, há opções também para o preenchimento de buracos existentes e para a | |
37 | +seleção da maior região da superfície. | |
38 | + | |
39 | +\begin{figure}[!htb] | |
40 | +\centering | |
41 | +\includegraphics[scale=0.5]{screen_hunter1} | |
42 | +\caption{Janela para criação de superfície} | |
43 | +\label{fig:create_surface_1} | |
44 | +\end{figure} | |
45 | + | |
46 | +%Existe 2 opções para fechar os buracos existentes e para selecionar a maior região da superfície aonde em muitos | |
47 | +%casos é útil para remover o suporte ou a mesa do tomografo. | |
48 | + | |
49 | +A seleção da maior região pode ser usada, por exemplo, para remover do modelo o suporte ou a | |
50 | +mesa do tomógrafo. A figura \ref{fig:surface_ex1} ilustra um caso com as duas opções | |
51 | +selecionadas: "Preencher buracos" e "Manter maior região". | |
52 | + | |
53 | +\newpage | |
54 | + | |
55 | +\begin{figure} | |
56 | + \centering | |
57 | + \subfloat[Frente]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.338\textwidth]{ScreenHunter_48_Jan_23_23_34}} | |
58 | + \subfloat[Baixo]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{ScreenHunter_50Jan232334}} | |
59 | + \caption{Superfície com região maior selecionada e com buracos preenchidos} | |
60 | + \label{fig:surface_ex1} | |
61 | +\end{figure} | |
62 | + | |
63 | + | |
64 | +Já a figura \ref{fig:surface_ex2} mostra o mesmo caso sem essas opções selecionadas. Observa-se o | |
65 | +suporte do tomógrafo e a superfície aberta. | |
66 | + | |
67 | + | |
68 | +\begin{figure} | |
69 | + \centering | |
70 | + \subfloat[Frente]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.371\textwidth]{ScreenHunter_52Jan232335}} | |
71 | + \subfloat[Baixo]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{ScreenHunter_53Jan232336}} | |
72 | + \caption{Superfície sem a seleção da maior região e com buracos abertos} | |
73 | + \label{fig:surface_ex2} | |
74 | +\end{figure} | |
75 | + | |
76 | +\newpage | |
77 | + | |
78 | +\section{Transparência} | |
79 | + | |
80 | +É possível visualizar uma superfície com transparência. Para isso, primeiro selecione a | |
81 | +superfície por meio da lista de seleção, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}, opção | |
82 | +\textbf{Propriedades da superfície} (figura \ref{fig:select_surface}). | |
83 | + | |
84 | +\begin{figure}[!htb] | |
85 | +\centering | |
86 | +\includegraphics[scale=0.6]{select_surface} | |
87 | +\caption{Seleção de superfície} | |
88 | +\label{fig:select_surface} | |
89 | +\end{figure} | |
90 | + | |
91 | +Em seguida, para determinar o nível de transparência que a superfície selecionada receberá, arraste | |
92 | +o controle deslizante ilustrado na figura \ref{fig:select_transparency}. Quanto mais para a direita | |
93 | +o controle, maior será a transparência aplicada. | |
94 | + | |
95 | +\begin{figure}[!htb] | |
96 | +\centering | |
97 | +\includegraphics[scale=0.5]{transparency} | |
98 | +\caption{Seleção de nível de transparência} | |
99 | +\label{fig:select_transparency} | |
100 | +\end{figure} | |
101 | + | |
102 | +A figura \ref{fig:model_transparency} ilustra a visualização de duas superfícies: uma mais externa | |
103 | +(esverdeada) e outra mais interna (amarelada). A superfície mais externa aparece com a transparência | |
104 | +aumentada. | |
105 | + | |
106 | +\begin{figure}[!htb] | |
107 | +\centering | |
108 | +\includegraphics[scale=0.3]{transparency_2} | |
109 | +\caption{Superfícies com nível alterado de transparência} | |
110 | +\label{fig:model_transparency} | |
111 | +\end{figure} | |
112 | + | |
113 | +\newpage | |
114 | + | |
115 | +\section{Cor} | |
116 | + | |
117 | +A cor de uma superfície também pode ser alterada. Selecione a superfície (reveja a figura | |
118 | +\ref{fig:select_surface}) e, em seguida, clique no botão ao lado da superfície selecionada. A figura | |
119 | +\ref{fig:change_surface_color} ilustra o botão, também localizado no item \textbf{3. Configure a | |
120 | +superfície 3D}, opção \textbf{Propriedades da superfície}. | |
121 | + | |
122 | +\begin{figure}[!htb] | |
123 | +\centering | |
124 | +\includegraphics[scale=0.6]{button_select_color} | |
125 | +\caption{Botão para alteração de cor} | |
126 | +\label{fig:change_surface_color} | |
127 | +\end{figure} | |
128 | + | |
129 | +Uma janela de seleção de cores se abre (figura \ref{fig:button_select_color}). Selecione a cor | |
130 | +desejada e clique no botão \textbf{OK}. | |
131 | + | |
132 | +\begin{figure}[!htb] | |
133 | +\centering | |
134 | +\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142} | |
135 | +\caption{Opções de cor} | |
136 | +\label{fig:button_select_color} | |
137 | +\end{figure} | |
138 | + | |
139 | +\section{Separando regiões desconexas} | |
140 | + | |
141 | +Para separar regiões da superfície que se encontram desconexas, é necessário clicar na opção | |
142 | +\textbf{Ferramentas avançadas}, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}. Veja a | |
143 | +figura \ref{fig:advanced_tools}. | |
144 | + | |
145 | +\begin{figure}[!htb] | |
146 | +\centering | |
147 | +\includegraphics[scale=0.4]{ferramentas_avancadas} | |
148 | +\caption{Atalho para ferramentas avançadas} | |
149 | +\label{fig:advanced_tools} | |
150 | +\end{figure} | |
151 | + | |
152 | +\newpage | |
153 | + | |
154 | +Um menu com as opções disponíveis será exibido, como ilustra a figura | |
155 | +\ref{fig:advanced_tools_expanded}. | |
156 | + | |
157 | +\begin{figure}[!htb] | |
158 | +\centering | |
159 | +\includegraphics[scale=0.5]{exract_region} | |
160 | +\caption{Ferramentas avançadas} | |
161 | +\label{fig:advanced_tools_expanded} | |
162 | +\end{figure} | |
163 | + | |
164 | +\subsection{Separar maior superfície} | |
165 | + | |
166 | +A opção \textbf{Separar maior superfície} seleciona, automaticamente, somente a região | |
167 | +desconexa que contém maior volume. Para realizar a operação, basta clicar no atalho | |
168 | +que a figura \ref{fig:short_connectivity_largest} ilustra. É criada uma nova superfície | |
169 | +resultante da operação. | |
170 | + | |
171 | +\begin{figure}[!htb] | |
172 | +\centering | |
173 | +\includegraphics[scale=0.2]{connectivity_largest} | |
174 | +\caption{Atalho para separação da maior região desconexa} | |
175 | +\label{fig:short_connectivity_largest} | |
176 | +\end{figure} | |
177 | + | |
178 | +Como exemplo, a figura \ref{fig:extract_most_region_1} mostra um caso antes da separação | |
179 | +da maior região. | |
180 | + | |
181 | +\begin{figure}[!htb] | |
182 | +\centering | |
183 | +\includegraphics[scale=0.3]{extract_most_region_1} | |
184 | +\caption{Superfícies desconexas} | |
185 | +\label{fig:extract_most_region_1} | |
186 | +\end{figure} | |
187 | + | |
188 | +Na figura \ref{fig:extract_most_region2}, observa-se a superfície com a maior região | |
189 | +desconexa separada. | |
190 | + | |
191 | +\begin{figure}[!htb] | |
192 | +\centering | |
193 | +\includegraphics[scale=0.3]{extract_most_region2} | |
194 | +\caption{Maior região separada} | |
195 | +\label{fig:extract_most_region2} | |
196 | +\end{figure} | |
197 | + | |
198 | +\newpage | |
199 | + | |
200 | +\subsection{Selecionar as regiões de interesse} | |
201 | + | |
202 | +Outra modalidade de seleção se dá pela opção \textbf{Selecionar as regiões de interesse...}. | |
203 | +Para ativá-la, o usuário deve clicar sobre o botão ilustrado na figura | |
204 | +\ref{fig:short_connectivity_manual}. Em seguida, basta clicar sobre as regiões desconexas | |
205 | +da superfície que se pretende selecionar. | |
206 | + | |
207 | +\begin{figure}[!htb] | |
208 | +\centering | |
209 | +\includegraphics[scale=0.2]{connectivity_manual} | |
210 | +\caption{Atalho para seleção de regiões de interesse} | |
211 | +\label{fig:short_connectivity_manual} | |
212 | +\end{figure} | |
213 | + | |
214 | +No exemplo da figura \ref{fig:extract_most_region3}, foram selecionados o crânio e a parte | |
215 | +direita do suporte do tomógrafo. | |
216 | + | |
217 | +\begin{figure}[!htb] | |
218 | +\centering | |
219 | +\includegraphics[scale=0.35]{extract_most_region3} | |
220 | +\caption{Exemplo de regiões de interesse selecionadas} | |
221 | +\label{fig:extract_most_region3} | |
222 | +\end{figure} | |
223 | + | |
224 | + | |
225 | +\subsection{Separar todas regiões desconexas} | |
226 | + | |
227 | +É possível, também, separar automaticamente \textit{todas} as regiões desconexas. Para | |
228 | +isso, basta clicar no botão ilustrado pela figura \ref{fig:connectivity_split_all}, que | |
229 | +representa a opção \textbf{Separar todas regiões desconexas}. | |
230 | + | |
231 | +\begin{figure}[!htb] | |
232 | +\centering | |
233 | +\includegraphics[scale=0.2]{connectivity_split_all} | |
234 | +\caption{Atalho para separação de todas as regiões desconexas} | |
235 | +\label{fig:connectivity_split_all} | |
236 | +\end{figure} | |
237 | + | |
238 | +A figura \ref{fig:extrac_most_region_4} mostra um exemplo. | |
239 | + | |
240 | +\begin{figure}[!htb] | |
241 | +\centering | |
242 | +\includegraphics[scale=0.3]{extrac_most_region_4} | |
243 | +\caption{Exemplo de separação de todas as regiões desconexas} | |
244 | +\label{fig:extrac_most_region_4} | |
245 | +\end{figure} | |
246 | + | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,60 @@ |
1 | +\chapter{Visualização simultânea de imagens e superfície} | |
2 | + | |
3 | +A visualização simultânea de imagens e superfície pode ser acionada clicando com o botão | |
4 | +\textbf{esquerdo} do mouse sobre o atalho localizado no canto inferior direito da tela do | |
5 | +InVesalius. Veja a figura \ref{fig:slice_plane_original}. | |
6 | + | |
7 | +\begin{figure}[!htb] | |
8 | +\centering | |
9 | +\includegraphics[scale=0.6]{slice_plane_original} | |
10 | +\caption{Atalho para visualização simultânea} | |
11 | +\label{fig:slice_plane_original} | |
12 | +\end{figure} | |
13 | + | |
14 | +Este recurso permite habilitar ou desabilitar a exibição das imagens nas diferentes | |
15 | +orientações (ou planos) na mesma janela de visualização da superfície 3D. Para isso, basta | |
16 | +marcar ou desmarcar a opção correspondente no menu indicado na figura \ref{fig:view_2d_3d_1}. | |
17 | + | |
18 | +\begin{figure}[!htb] | |
19 | +\centering | |
20 | +\includegraphics[scale=0.6]{view_2d_3d_1} | |
21 | +\caption{Seleção das orientações (planos) a exibir} | |
22 | +\label{fig:view_2d_3d_1} | |
23 | +\end{figure} | |
24 | + | |
25 | +Vale notar que uma orientação, quando selecionada, apresenta uma marca na opção correspondente. | |
26 | +Isso é ilustrado na figura \ref{fig:view_2d_3d_2}. | |
27 | + | |
28 | +\begin{figure}[!htb] | |
29 | +\centering | |
30 | +\includegraphics[scale=0.6]{view_2d_3d_2} | |
31 | +\caption{Orientações selecionados para exibição} | |
32 | +\label{fig:view_2d_3d_2} | |
33 | +\end{figure} | |
34 | + | |
35 | + | |
36 | +\newpage | |
37 | + | |
38 | + | |
39 | +Se a superfície já estiver sendo exibida, os planos das orientações serão apresentados como mostra | |
40 | +a figura \ref{fig:3d_planes}. Caso contrário, somente os planos serão exibidos | |
41 | +(figura \ref{fig:only_2d_planes}). | |
42 | + | |
43 | +\begin{figure}[!htb] | |
44 | +\centering | |
45 | +\includegraphics[scale=0.5]{3d_planes} | |
46 | +\caption{Superfície e planos exibidos simultaneamente} | |
47 | +\label{fig:3d_planes} | |
48 | +\end{figure} | |
49 | + | |
50 | +\begin{figure}[!htb] | |
51 | +\centering | |
52 | +\includegraphics[scale=0.55]{only_2d_planes} | |
53 | +\caption{Exibição de planos (sem superfície)} | |
54 | +\label{fig:only_2d_planes} | |
55 | +\end{figure} | |
56 | + | |
57 | +\newpage | |
58 | + | |
59 | +Para desativar a exibição de um plano, basta desmarcar a opção correspondente no menu | |
60 | +(figura \ref{fig:view_2d_3d_2}). | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,197 @@ |
1 | +\chapter{Visualização volumétrica} | |
2 | + | |
3 | +Para a visualização volumétrica dos modelos, o InVesalius dispõe de uma técnica | |
4 | +conhecida como \textit{Raycasting}. Trata-se de uma técnica que, | |
5 | +resumidamente, consiste em simular, para cada pixel da tela, o traçado de um raio de luz em | |
6 | +direção ao objeto. A cor do pixel será baseada na cor e na transparência de cada voxel | |
7 | +interceptado pelo raio de luz. | |
8 | + | |
9 | +No InVesalius, existem diversos padrões pré-definidos (\textit{presets}) para visualizar | |
10 | +determinados tipos de tecidos ou diferentes tipos de exames (tomografia com contraste, por | |
11 | +exemplo). | |
12 | + | |
13 | +Para acessar esse recurso, basta clicar no atalho ilustrado pela figura | |
14 | +\ref{fig:volume_raycasting_origina}, localizado no canto inferior direito da tela (ao lado da | |
15 | +janela de exibição de superfícies) e selecionar um dos padrões disponíveis. | |
16 | + | |
17 | +Para desativar a visualização volumétrica, clique novamente no atalho indicado pela figura | |
18 | +\ref{fig:volume_raycasting_origina} e escolha a opção \textbf{Desabilitado}. | |
19 | + | |
20 | +\begin{figure}[!htb] | |
21 | +\centering | |
22 | +\includegraphics[scale=0.4]{volume_raycasting_origina} | |
23 | +\caption{Atalho para visualização volumétrica} | |
24 | +\label{fig:volume_raycasting_origina} | |
25 | +\end{figure} | |
26 | + | |
27 | +\section{Padrões de visualização} | |
28 | + | |
29 | +São diversos os padrões de visualização pré-definidos. Alguns exemplos são ilustrados nas | |
30 | +figuras seguintes. | |
31 | + | |
32 | +\begin{figure}[!htb] | |
33 | +\centering | |
34 | +\includegraphics[scale=0.68]{brilhante_I} | |
35 | +\caption{Brilhante} | |
36 | +\label{fig:brilhante_I} | |
37 | +\end{figure} | |
38 | + | |
39 | +\begin{figure}[!htb] | |
40 | +\centering | |
41 | +\includegraphics[scale=0.65]{vias_aereas_II} | |
42 | +\caption{Vias Aéreas II} | |
43 | +\label{fig:vias_aereas_II} | |
44 | +\end{figure} | |
45 | + | |
46 | +\begin{figure}[!htb] | |
47 | +\centering | |
48 | +\includegraphics[scale=0.42]{contraste_medio} | |
49 | +\caption{Contraste Médio} | |
50 | +\label{fig:contraste_medio} | |
51 | +\end{figure} | |
52 | + | |
53 | +\begin{figure}[!htb] | |
54 | +\centering | |
55 | +\includegraphics[scale=0.55]{MIP} | |
56 | +\caption{MIP} | |
57 | +\label{fig:MIP} | |
58 | +\end{figure} | |
59 | + | |
60 | + | |
61 | +\newpage | |
62 | + | |
63 | + | |
64 | +\section{Personalização de padrão} | |
65 | + | |
66 | +Alguns padrões podem ser personalizados (ou customizados). Veja a figura | |
67 | +\ref{fig:customize_1}, que exibe um padrão e alguns controles gráficos de ajuste. | |
68 | +Com eles, é possível alterar a cor de uma dada estrutura e sua opacidade, determinando | |
69 | +como e se ela será exibida. | |
70 | + | |
71 | +\begin{figure}[!htb] | |
72 | +\centering | |
73 | +\includegraphics[scale=0.6]{customize_1} | |
74 | +\caption{Ajustes para o padrão de visualização Mole + Pele II} | |
75 | +\label{fig:customize_1} | |
76 | +\end{figure} | |
77 | + | |
78 | + | |
79 | +\newpage | |
80 | + | |
81 | + | |
82 | +Caso se deseje ocultar uma estrutura, é necessário utilizar o controle gráfico de ajuste mantendo | |
83 | +baixa a opacidade da região correspondente. No exemplo da figura \ref{fig:customize_1}, | |
84 | +suponha que se pretende esconder a parte muscular, que aparece em vermelho. Para isso, basta | |
85 | +posicionar o ponteiro do mouse sobre o ponto em vermelho e, com o botão esquerdo pressionado, | |
86 | +\textbf{arrastar} o ponto para baixo, a fim de diminuir a opacidade (o que equivale a aumentar | |
87 | +a transparência). A figura \ref{fig:customize_2} ilustra o resultado. | |
88 | + | |
89 | +Nota: O valor \textit{Alpha} indica a opacidade da cor, e o valor \textit{Value}, a | |
90 | +intensidade da cor no pixel. | |
91 | + | |
92 | +\begin{figure}[!htb] | |
93 | +\centering | |
94 | +\includegraphics[scale=0.6]{customize_2} | |
95 | +\caption{Padrão de visualização Mole + Pele II alterado} | |
96 | +\label{fig:customize_2} | |
97 | +\end{figure} | |
98 | + | |
99 | + | |
100 | +\newpage | |
101 | + | |
102 | + | |
103 | +É possível remover ou adicionar pontos no controle gráfico de ajuste. Para a remoção, basta clicar | |
104 | +com o botão \textbf{direito} do mouse sobre o ponto. Para adicionar um novo ponto, clique com | |
105 | +o botão \textbf{esquerdo} sobre a linha do gráfico. Pode-se também salvar o padrão resultante, | |
106 | +clicando no atalho que a figura \ref{fig:save_preset} ilustra. | |
107 | + | |
108 | +\begin{figure}[!htb] | |
109 | +\centering | |
110 | +\includegraphics[scale=0.6]{save_preset} | |
111 | +\caption{Atalho para salvar padrão} | |
112 | +\label{fig:save_preset} | |
113 | +\end{figure} | |
114 | + | |
115 | +Ao salvar o padrão, o InVesalius exibe uma janela como a da figura \ref{fig:save_window_preset}. | |
116 | +Digite um nome para o padrão personalizado e clique em \textbf{OK}. O padrão salvo estará | |
117 | +disponível com os demais na próxima vez em que o software for aberto. | |
118 | + | |
119 | +\begin{figure}[!htb] | |
120 | +\centering | |
121 | +\includegraphics[scale=0.6]{save_window_preset} | |
122 | +\caption{Janela para nomear e salvar um padrão} | |
123 | +\label{fig:save_window_preset} | |
124 | +\end{figure} | |
125 | + | |
126 | +\section{Personalização de padrão com Brilho e Contraste} | |
127 | + | |
128 | +É possível personalizar um padrão sem utilizar o controle gráfico de ajuste, apresentado na seção | |
129 | +anterior. Isso é feito por meio do controle de brilho e \textbf{Contraste} presente na barra de | |
130 | +ferramentas. Para ativar o controle, clique no atalho ilustrado pela figura | |
131 | +\ref{fig:tool_contrast_original_vol}. | |
132 | + | |
133 | +\begin{figure}[!htb] | |
134 | +\centering | |
135 | +\includegraphics[scale=0.6]{tool_contrast_original} | |
136 | +\caption{Atalho para brilho e contraste} | |
137 | +\label{fig:tool_contrast_original_vol} | |
138 | +\end{figure} | |
139 | + | |
140 | +Com o controle ativado, arrastando o mouse com o botão esquerdo pressionado | |
141 | +sobre a janela do volume, é possível alterar os valores de \textit{window width} e | |
142 | +\textit{window level}. O procedimento é o mesmo aplicado para as fatias 2D, visto | |
143 | +na seção \ref{sec:ww_wl}. Arrastando o mouse na direção horizontal, altera-se o valor de | |
144 | +\textit{window level}. Para a esquerda, diminui-se seu valor e, para a direita, | |
145 | +aumenta-se seu valor. Arrastando o mouse na direção vertical, altera-se o valor de | |
146 | +\textit{window width}. Para baixo, diminui-se seu valor e, para cima, aumenta-se seu | |
147 | +valor. | |
148 | + | |
149 | +Com a manipulação desses valores, conseguem-se diferentes resultados de | |
150 | +visualização. Por exemplo, para adicionar tecido à visualização, \textbf{arraste} o | |
151 | +mouse diagonalmente, do canto inferior direito para o canto superior esquerdo da janela | |
152 | +de visualização. Para remover tecido da visualização, faça o contrário, ou seja, | |
153 | +\textbf{arraste} o mouse diagonalmente, do canto superior esquerdo para o canto inferior | |
154 | +direito. Veja a figura \ref{fig:raycasting_add}. | |
155 | + | |
156 | +\begin{figure}[!htb] | |
157 | + \centering | |
158 | + \subfloat[Osso]{\label{fig:raycasting_add_1}\includegraphics[width=0.33\textwidth]{raycasting_add_1}} | |
159 | + \hfill | |
160 | + \subfloat[Músculo]{\label{fig:raycasting_add_2}\includegraphics[width=0.333\textwidth]{raycasting_add_2}} | |
161 | + \hfill | |
162 | + \subfloat[Pele]{\label{fig:raycasting_add_3}\includegraphics[width=0.332\textwidth]{raycasting_add_3}} | |
163 | + \caption{Adição de tecido} | |
164 | + \label{fig:raycasting_add} | |
165 | +\end{figure} | |
166 | + | |
167 | +\newpage | |
168 | + | |
169 | + | |
170 | +\section{Corte} | |
171 | + | |
172 | +Em visualização volumétrica, o corte é utilizado para visualizar uma região interna do volume. | |
173 | +O InVesalius dispõe de uma ferramenta para corte com base em um plano de referência. Com | |
174 | +um padrão de visualização selecionado, clique em \textbf{Ferramentas} e, em seguida, em | |
175 | +\textbf{Plano para corte} (figura \ref{fig:activate_cut_plane}). | |
176 | + | |
177 | +\begin{figure}[!htb] | |
178 | +\centering | |
179 | +\includegraphics[scale=0.6]{activate_cut_plane} | |
180 | +\caption{Ativando plano para corte} | |
181 | +\label{fig:activate_cut_plane} | |
182 | +\end{figure} | |
183 | + | |
184 | +Uma representação do plano para corte é exibida junto ao volume. Para realizar o corte, | |
185 | +mantenha o botão \textbf{esquerdo} pressionado sobre o plano e \textbf{arraste} o mouse. | |
186 | +Para rotacionar o plano, mantenha o botão \textbf{esquerdo} pressionado sobre a sua borda | |
187 | +e movimente o mouse na direção desejada. Veja um exemplo na figura \ref{fig:cutted_image}. | |
188 | + | |
189 | +\begin{figure}[!htb] | |
190 | +\centering | |
191 | +\includegraphics[scale=0.6]{cutted_image} | |
192 | +\caption{Imagem com plano de corte} | |
193 | +\label{fig:cutted_image} | |
194 | +\end{figure} | |
195 | + | |
196 | +Para desativar o recurso de corte, clique novamente em \textbf{Ferramentas} e em | |
197 | +\textbf{Plano para corte} (figura \ref{fig:activate_cut_plane}). | ... | ... |
... | ... | @@ -0,0 +1,16 @@ |
1 | +\thispagestyle{empty} | |
2 | + | |
3 | +\begin{flushright} | |
4 | + | |
5 | +\flushright \scalebox{2.5}{\sffamily{\textbf{Software InVesalius}}} | |
6 | +\par | |
7 | +\vspace{180pt} | |
8 | +\scalebox{2.8}{\sffamily Guia do Usuário} | |
9 | +\ThisLLCornerWallPaper{1}{img/capa2.png} | |
10 | + | |
11 | +\begin{figure}[h!] | |
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15 | + | |
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