Translated the surface chapter and solved some errors surface chapter pt_br

Thiago Franco de Moraes
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@@ -58,195 +58,167 @@ Whereas the figure~\ref{fig:surface_ex2} displays the surface create without act
 The item \textbf{Surface creation method} has the following options:\textbf{Binary}, \textbf{Context aware smoothing} and \textbf{Default}. Figure~\ref{fig:surf_method} shows an example of surface created using each of these 3 methods.
-O método \textbf{binário}, tem como partida a máscara que foi segmentada, sendo a região selecionada como 1 e o restante 0. Como existem somente 2 valores, as curvas na superfície que o algoritmo gera são abruptas ou popularmente conhecida como "degraus".
+The \textbf{Binary} method takes as input the segmentation mask which is binary, where selected regions have value 1 and non-selected have value 0. As it is binary, the surface generated has a blocky aspect, mainly in high curvature areas, appearing staircases.
-The \textbf{Binary} method takes as input the segmentation mask which is binary, where selected regions have value 1 and non-selected have value 0. As it is binary, the surface generated has a blocky aspect, mainly in high curvature areas.
+\textbf{Context aware smoothing} starts generating the surface using binary method. After that it uses the algorithm \textbf{Context aware smoothing} to smooth the surface to avoid the staircase artifacts. This method has 4 parameters presented bellow.
-No método \textbf{Context aware smoothing}, inicialmente a superfície é gerada a partir do método binário, mas em seguida é executado o algoritmo "Context aware smoothing" para suavizar a superfície resultante e evitar os "degraus" na mesma. Neste passo é requerido 4 valores, que serão apresentados a seguir.
+The \textbf{angle} parameter is the angle between 2 adjacent triangles. If the calculated angle is \textbf{greater than} the angle parameter the triangle will be considered a staircase triangle and will be smoothed. The angle parameter ranges from $0$ to $1$. Where $0$ is $0^\circ$  and $1$ is $90^\circ$. The \textbf{Max distance} is the maximum distance that a non-staircase triangle has to be from a staircase triangle to be considered to be smoothed. Non-staircase triangles with distance greater than \textbf{Max distance} also will be smoothed but the smoothing will be weighted by the \textbf{Min. weight} parameter. This parameter ranges from $0$ (without smoothing) to $1$ (total smoothing). The last parameter, \textbf{N. steps}, is the number of times the smoothing algorithm will be run. The greater this parameter the smoother the surface will be.
-O \textbf{ângulo}, nesse caso será formado entre 2 normais de triângulos adjacentes, que \textbf{caso esteja acima do valor} definido no campo ângulo, o triângulo é elegido para ser o ponto de partida da suavização, a faixa de valor é de 0 até 1, sendo $0^\circ$ e $90^\circ$ respectivamente. A \textbf{distância máxima} é o raio a partir dos triângulos elegidos no passo anterior, que será utilizada como limite de suavização. O \textbf{peso mínimo} é o quanto de suavização será aplicado nas áreas que estão fora do raio determinado anteriormente. O \textbf{número de passos} é quantas vezes o algoritmo vai executar.
-
-O método \textbf{padrão} é ativo \textbf{somente quando não existir edição manual na máscara}, os pixeis da imagem original que estão sob a máscara é utilizado para a geração de superfície, como normalmente imagens de tomografia ou ressonância possui vários níveis de cinza, é gerada uma superfície com curvas mais suaves.
+The \textbf{Default} method is enable only when \textbf{it was used thresholding segmentation and there is not a manual edition in the mask}. This method doesn't use the mask image, but the exam image, and generates a smoother surface.
 \begin{figure}[!htb]
   \centering
-  \subfloat[Binário]{\label{fig:surf_binary}\includegraphics[width=0.33\textwidth]{binary.png}}
+  \subfloat[Binary]{\label{fig:surf_binary}\includegraphics[width=0.33\textwidth]{binary.png}}
   \hfill
   \subfloat[Context aware]{\label{fig:surf_context}\includegraphics[width=0.32\textwidth]{context.png}}
   \hfill
-  \subfloat[Padrão]{\label{fig:surfa_default}\includegraphics[width=0.332\textwidth]{default.png}}
-  \caption{Superfícies geradas por diferentes métodos }
+  \subfloat[Default]{\label{fig:surfa_default}\includegraphics[width=0.332\textwidth]{default.png}}
+  \caption{Surface generated by each method.}
   \label{fig:surf_method}
 \end{figure}
+\section{Transparency}
-
-\section{Transparência}
-
-É possível visualizar uma superfície com transparência. Para isso, primeiro selecione a
-superfície por meio da lista de seleção, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}, opção
-\textbf{Propriedades da superfície} (figure \ref{fig:select_surface}).
+It's also possible to display a surface with some level of Transparency. To do that, first select the desired surface from the list of surfaces, in the item \textbf{3. Configure 3D surface}, \textbf{Surface properties} (figure \ref{fig:select_surface}).
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.8]{surface_select_menu.png}
-\caption{Seleção de superfície}
+\caption{Surface selection.}
 \label{fig:select_surface}
 \end{figure}
-Em seguida, para determinar o nível de transparência que a superfície selecionada receberá, arraste
-o controle deslizante ilustrado na figure \ref{fig:select_transparency}. Quanto mais para a direita
-o controle, maior será a transparência aplicada.
+Then, to set the level of surface transparency, use de sliding control shown in the figure~\ref{fig:select_transparency}. The more to right the more transparent the surface will be shown.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.7]{surface_transparency_pt.png}
-\caption{Seleção de nível de transparência}
+\caption{Selection of surface transparency.}
 \label{fig:select_transparency}
 \end{figure}
-A figure \ref{fig:model_transparency} ilustra a visualização de duas superfícies: uma mais externa
-(esverdeada) e outra mais interna (amarelada). A superfície mais externa aparece com a transparência
-aumentada.
+Figure~\ref{fig:model_transparency} shows 2 surfaces: the extern surface (green color) has some level of transparency which permits to see the intern surface (yellow color).
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{transparency_2}
-\caption{Superfícies com nível alterado de transparência}
+\caption{Surface with transparency.}
 \label{fig:model_transparency}
 \end{figure}
 \newpage
-\section{Cor}
+\section{Color}
-A cor de uma superfície também pode ser alterada. Selecione a superfície (reveja a figure
-\ref{fig:select_surface}) e, em seguida, clique no botão ao lado da superfície selecionada. A figure
-\ref{fig:change_surface_color} ilustra o botão, também localizado no item \textbf{3. Configure a
-superfície 3D}, opção \textbf{Propriedades da superfície}.
+It's possible to change a surface color. Select the surface (see figure~\ref{fig:select_surface}). Click on the colored button on the right to the surface selection list. Figure~\ref{fig:change_surface_color} displays this button, inside the item \textbf{3. Configure 3D surface}, \textbf{Surface properties}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.6]{surface_button_select_color_yellow.png}
-\caption{Botão para alteração de cor}
+\caption{Button to change surface color.}
 \label{fig:change_surface_color}
 \end{figure}
-Uma janela de seleção de cores se abre (figure \ref{fig:button_select_color}). Selecione a cor
-desejada e clique no botão \textbf{OK}.
+A dialog will be shown (figure~\ref{fig:button_select_color}). Select the desired color and click on \textbf{Ok}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.6]{surface_select_color_windows_so_pt.png}
-\caption{Opções de cor}
+\caption{Color dialog.}
 \label{fig:button_select_color}
 \end{figure}
-\section{Separando regiões desconexas}
+\section{Splitting disconnected surfaces}
-Para separar regiões da superfície que se encontram desconexas, é necessário clicar na opção
-\textbf{Ferramentas avançadas}, dentro do item \textbf{3. Configure a superfície 3D}. Veja a
-figure \ref{fig:advanced_tools}.
+To split disconnected surfaces it's necessary to go to \textbf{3. Configure 3D surface}, \textbf{Advanced options} (figure~\ref{fig:advanced_tools}).
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.7]{surface_painel_advanced_options_pt.png}
-\caption{Atalho para opções avançadas}
+\caption{Advanced options.}
 \label{fig:advanced_tools}
 \end{figure}
 \newpage
-Um menu com as opções disponíveis será exibido, como ilustra a figure
-\ref{fig:advanced_tools_expanded}.
+The advanced options panel will be displayed (figure~\ref{fig:advanced_tools_expanded}).
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.7]{surface_split_pt.png}
-\caption{Opções avançadas}
+\caption{Advanced options panel.}
 \label{fig:advanced_tools_expanded}
 \end{figure}
-\subsection{Separar maior superfície}
+\subsection{Select largest surface}
-A opção \textbf{Separar maior superfície} seleciona, automaticamente, somente a região
-desconexa que contém maior volume. Para realizar a operação, basta clicar no atalho
-que a figure \ref{fig:short_connectivity_largest} ilustra. É criada uma nova superfície
-resultante da operação.
+The option \textbf{Select largest surface} selects, automatically, only surface with the greater volume. To do this operation click on the button illustrated in the figure~\ref{fig:short_connectivity_largest}. This operation creates new surface with only the largest surface.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.2]{connectivity_largest}
-\caption{Atalho para separação da maior região desconexa}
+\caption{Button to split the largest disconnected surface}
 \label{fig:short_connectivity_largest}
 \end{figure}
-Como exemplo, a figure \ref{fig:extract_most_region_1} mostra um caso antes da separação
-da maior região.
+As an example, the figure~\ref{fig:extract_most_region_1} shows a surface before \textbf{Select largest surface}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region_1.jpg}
-\caption{Superfícies desconexas}
+\caption{Disconnected surfaces.}
 \label{fig:extract_most_region_1}
 \end{figure}
-Na figure \ref{fig:extract_most_region2}, observa-se a superfície com a maior região
-desconexa separada.
+Whereas the figure~\ref{fig:extract_most_region2} shows the surface with largest disconnected region separated.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region2.jpg}
-\caption{Maior região separada}
+\caption{Largest disconnected region separated.}
 \label{fig:extract_most_region2}
 \end{figure}
 \newpage
-\subsection{Selecionar as regiões de interesse}
+\subsection{Select regions of interest}
-Outra modalidade de seleção se dá pela opção \textbf{Selecionar as regiões de interesse...}.
-Para ativá-la, o usuário deve clicar sobre o botão ilustrado na figure
-\ref{fig:short_connectivity_manual}. Em seguida, basta clicar sobre as regiões desconexas
-da superfície que se pretende selecionar.
+Other selection option is \textbf{Select regions of interest ...}. To do this operation click on the button illustrated on the figure~\ref{fig:short_connectivity_manual}. Then click on desired disconnected surface regions you want to select. Next click on \textbf{Select regions of interest ...}. This operation will create new surface with only the selected disconnected regions.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.2]{connectivity_manual}
-\caption{Atalho para seleção de regiões de interesse}
+\caption{Button to select the regions of interest.}
 \label{fig:short_connectivity_manual}
 \end{figure}
-No exemplo da figure \ref{fig:extract_most_region3}, foram selecionados o crânio e a parte
-direita do suporte do tomógrafo.
+As an example, the figure~\ref{fig:extract_most_region3} shows the surface created after the user selects the cranium and the right part of the tomograph support.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.35]{surface_extract_most_region3.jpg}
-\caption{Exemplo de regiões de interesse selecionadas}
+\caption{Example of selected regions of interest}
 \label{fig:extract_most_region3}
 \end{figure}
-\subsection{Separar todas regiões desconexas}
+\subsection{Split all disconnected surfaces}
-É possível, também, separar automaticamente \textit{todas} as regiões desconexas. Para
-isso, basta clicar no botão ilustrado pela figure \ref{fig:connectivity_split_all}, que
-representa a opção \textbf{Separar todas regiões desconexas}.
+It's also possible to split all the disconnected surface regions automatically. To do this, click on the button illustrated in the figure~\ref{fig:connectivity_split_all}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.2]{connectivity_split_all}
-\caption{Atalho para separação de todas as regiões desconexas}
+\caption{Button to split all the disconnected regions surface.}
 \label{fig:connectivity_split_all}
 \end{figure}
-A figure \ref{fig:extrac_most_region_4} mostra um exemplo.
+Figure~\ref{fig:extrac_most_region_4} shows an example.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region_4.jpg}
-\caption{Exemplo de separação de todas as regiões desconexas}
+\caption{Example of split all disconnected regions surface.}
 \label{fig:extrac_most_region_4}
 \end{figure}
@@ -80,9 +80,9 @@ O método \textbf{binário}, tem como partida a máscara que foi segmentada, sen
 No método \textbf{Context aware smoothing}, inicialmente a superfície é gerada a partir do método binário, mas em seguida é executado o algoritmo "Context aware smoothing" para suavizar a superfície resultante e evitar os "degraus" na mesma. Neste passo é requerido 4 valores, que serão apresentados a seguir.
-O \textbf{ângulo}, nesse caso será formado entre 2 normais de triângulos adjacentes, que \textbf{caso esteja acima do valor} definido no campo ângulo, o triângulo é elegido para ser o ponto de partida da suavização, a faixa de valor é de 0 até 1, sendo $0^\circ$ e $90^\circ$ respectivamente. A \textbf{distância máxima} é o raio a partir dos triângulos elegidos no passo anterior, que será utilizada como limite de suavização. O \textbf{peso mínimo} é o quanto de suavização será aplicado nas áreas que estão fora do raio determinado anteriormente. O \textbf{número de passos} é quantas vezes o algoritmo vai executar. 
+O \textbf{ângulo}, nesse caso será formado entre 2 normais de triângulos adjacentes, que \textbf{caso esteja acima do valor} definido no campo ângulo, o triângulo é elegido para ser o ponto de partida da suavização, a faixa de valor é de 0 até 1, sendo $0^\circ$ e $90^\circ$ respectivamente. A \textbf{distância máxima} é o raio a partir dos triângulos elegidos no passo anterior, que será utilizada como limite de suavização. O \textbf{peso mínimo} é o quanto de suavização será aplicado nas áreas que estão fora do raio determinado anteriormente. Esse parâmetro varia de $0$ (sem suavização) à $1$ (suavização total). O \textbf{número de passos} é quantas vezes o algoritmo vai executar. Quantos maior o número de passos, mais suave a superfície será.
-O método \textbf{padrão} é ativo \textbf{somente quando não existir edição manual na máscara}, os pixeis da imagem original que estão sob a máscara é utilizado para a geração de superfície, como normalmente imagens de tomografia ou ressonância possui vários níveis de cinza, é gerada uma superfície com curvas mais suaves.
+O método \textbf{padrão} é ativo \textbf{somente quando usado a segmentação por limiar e não existir edição manual na máscara}, os pixeis da imagem original que estão sob a máscara é utilizado para a geração de superfície, como normalmente imagens de tomografia ou ressonância possui vários níveis de cinza, é gerada uma superfície com curvas mais suaves.
 \begin{figure}[!htb]
   \centering
@@ -224,7 +224,8 @@ desconexa separada.
 Outra modalidade de seleção se dá pela opção \textbf{Selecionar as regiões de interesse...}.
 Para ativá-la, o usuário deve clicar sobre o botão ilustrado na figura
 \ref{fig:short_connectivity_manual}. Em seguida, basta clicar sobre as regiões desconexas
-da superfície que se pretende selecionar.
+da superfície que se pretende selecionar. Depois, clique novamente em \textbf{Selecionar as regiões de interesse...}
+para gerar uma nova superfície com as regiões selecionadas.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering