Commit be7a6a94a46498ca55634cb1dc364148267ea847

Authored by Paulo Henrique Junqueira Amorim
2 parents 55e4d7f8 6a15ee8e
Exists in user_guide_en

Merge branch 'user_guide_en' of https://github.com/paulojamorim/invesalius3 into user_guide_en

Showing 1 changed file with 35 additions and 39 deletions   Show diff stats
docs/user_guide_en_source/cap_segmen.tex
... ... @@ -78,99 +78,87 @@ Spongial Bone (Child) & 156 & 585\\
78 78  
79 79 The table~\ref{tab:limiar} is indicated to images obtained from medical tomographs. The range of gray values from images obtained from odontological tomographs are greater and non-regular. Thus, it's necessary to use sliding control (figure~\ref{fig:region_selection_bar}) to adjust the thresholding values.
80 80  
81   -Caso se deseje criar uma nova máscara, basta clicar no ícone do atalho presente no painel, dentro
82   -do item \textbf{2. Selecione a região de interesse}. Veja a figure \ref{fig:shortcut_new_mask}.
  81 +If you want to create a new mask click on the button \textbf{Create new mask} inside the item \textbf{2. Select region of interest}. See the figure~\ref{fig:shortcut_new_mask}.
83 82  
84 83 \begin{figure}[!htb]
85 84 \centering
86 85 \includegraphics[scale=0.2]{object_add_original}
87   -\caption{Atalho para criar nova máscara}
  86 +\caption{Button to create a new mask.}
88 87 \label{fig:shortcut_new_mask}
89 88 \end{figure}
90 89  
91   -Clicando-se nesse atalho, uma nova janela será apresentada (figure \ref{fig:create_new_mask}).
92   -Selecione a faixa de limiar desejada e clique em \textbf{OK}.
  90 +Clicando-se nesse atalho, uma nova janela será apresentada (figure \ref{fig:create_new_mask}). Selecione a faixa de limiar desejada e clique em \textbf{OK}.
  91 +
  92 +After clicking on this button a dialog will be shown (figure~\ref{fig:create_new_mask}). Select the desired threshold and click on \textbf{Ok}.
93 93  
94 94 \begin{figure}[!htb]
95 95 \centering
96 96 \includegraphics[scale=0.55]{segmentation_threshold_window_dialog_pt.png}
97   -\caption{Criar uma nova máscara}
  97 +\caption{Creating a new mask.}
98 98 \label{fig:create_new_mask}
99 99 \end{figure}
100 100  
101 101 \newpage
102 102  
103   -Com uma máscara de segmentação configurada, é possível gerar a superfície 3D correspondente
104   -às imagens em estudo. A superfície será composta por uma malha de triângulos. O próximo capítulo
105   -trará maiores detalhes sobre esse tipo de superfície.
  103 +After the segmentation it's possible to generate a corresponding 3D surface. The surface is formed by triangles. The following chapter will give more details about surfaces.
106 104  
107   -Para iniciar a geração, clique no botão \textbf{Gerar superfície} (figure \ref{fig:generate_surface}).
108   -Caso já exista uma superfície gerada previamente, pode-se substituí-la pela nova. Para isso, basta
109   -selecionar, \textbf{antes} da geração, a opção \textbf{Sobrescrever anterior}.
  105 +Click on the \textbf{Create surface} button (figure~\ref{fig:generate_surface}) to create a new surface. If there is a surface created previously you may overwrite it with the new one. To do this select the option \textbf{Overwrite last surface} before creating the new surface.
110 106  
111 107 \begin{figure}[!htb]
112 108 \centering
113 109 \includegraphics[scale=0.55]{segmentation_generate_surface_pt.png}
114   -\caption{Botão Gerar superfície}
  110 +\caption{Create surface button.}
115 111 \label{fig:generate_surface}
116 112 \end{figure}
117 113  
118   -Após alguns instantes, a superfície será exibida na janela de visualização 3D do InVesalius
119   -(figure \ref{fig:surface}).
  114 +After a few moments the surface will be displayed at the 3D visualization window of InVesalius (figure~\ref{fig:surface}).
120 115  
121 116 \begin{figure}[!htb]
122 117 \centering
123 118 \includegraphics[scale=0.5]{surface_from_threshold.png}
124   -\caption{Superfície 3D}
  119 +\caption{3D surface.}
125 120 \label{fig:surface}
126 121 \end{figure}
127   -
128 122  
129 123  
130   -\section{Segmentação manual (Edição de imagens)}
131 124  
132   -Há situações em que a segmentação por limiar não é eficiente, pois ela é aplicada ao conjunto
133   -todo das imagens. Para aplicar a segmentação a imagens isoladas, pode-se usar a segmentação
134   -manual. Com ela, é possível adicionar ou apagar uma determinada região da imagem que foi
135   -segmentada por limiar. No entanto, a segmentação manual requer maior conhecimento de anatomia
136   -por parte do usuário. Para utilizá-la, é necessário clicar em \textbf{Edição Manual} (figure \ref{fig:advanced_edition}) para abrir o painel de edição.
  125 +\section{Manual segmentation (Image edition)}
  126 +
  127 +Thresholding segmentation may not be efficient in some case since it's applied to the whole image. Manual segmentation may be used o segment only an isolated image region. Manual segmentation turns possible to add or remove some image regions to the segmentation. Manual segmentation requires more knowledge of human anatomy. To use it click on \textbf{Manual edition} (figure~\ref{fig:advanced_edition}) to open the manual segmentation panel.
137 128  
138 129 \begin{figure}[!htb]
139 130 \centering
140 131 \includegraphics[scale=0.75]{segmentation_manual_label_pt.png}
141   -\caption{Ícone para abrir a ferramenta de edição manual}
  132 +\caption{Icon to open the Manual segmentation panel.}
142 133 \label{fig:advanced_edition}
143 134 \end{figure}
144 135  
145   -O painel de edição aparece como mostra a figure \ref{fig:edition_slices_ref}.
  136 +Figure~\ref{fig:edition_slices_ref} show the Manual segmentation panel.
146 137  
147 138 \begin{figure}[!htb]
148 139 \centering
149 140 \includegraphics[scale=0.6]{segmentation_manual_window_pt.png}
150   -\caption{Painel de edição}
  141 +\caption{Manual segmentation panel.}
151 142 \label{fig:edition_slices_ref}
152 143 \end{figure}
153 144  
154   -Há dois tipos de pincel disponíveis para desenho: um em forma de círculo e outro em forma
155   -de quadrado. Para escolher um pincel, clique no triângulo da lista de seleção para abri-la
156   -e, a seguir, clique sobre o tipo escolhido. O pincel selecionado aparece no painel como
157   -mostra a figure \ref{fig:brush_type}.
  145 +There are two brushes used to segmentation: a circle and a square. Click on triangle icon (see figure~\ref{fig:brush_type}) to and click on the desired brush.
158 146  
159 147 \begin{figure}[!htb]
160 148 \centering
161 149 \includegraphics[scale=0.9]{segmentation_manual_pencil_type.png}
162   -\caption{Tipo de pincel}
  150 +\caption{Brush types.}
163 151 \label{fig:brush_type}
164 152 \end{figure}
165 153  
166 154 \newpage
167 155  
168   -Também é possível alterar o diâmetro do pincel, conforme mostra a figure \ref{fig:select_diameter}.
  156 +It's also possible to adjust the brush size, like shown in the figure~\ref{fig:select_diameter}.
169 157  
170 158 \begin{figure}[!htb]
171 159 \centering
172 160 \includegraphics[scale=0.8]{segmentation_manual_diameter.png}
173   -\caption{Seleção do diâmetro do pincel}
  161 +\caption{Adjusting the brush size.}
174 162 \label{fig:select_diameter}
175 163 \end{figure}
176 164  
... ... @@ -182,19 +170,27 @@ seguintes:\\
182 170 \textbf{Limiar}, para remover uma região que está fora do limiar e foi selecionada, ou pintar
183 171 uma região que está dentro do limiar e não foi selecionada.\\
184 172  
185   -A figure \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operações do pincel:
  173 +It's needed to select the operation to be performed by the brush. These are the options:
  174 +
  175 +\textbf{Draw}: to add a non-selected region to the segmentation;
  176 +
  177 +\textbf{Erase}: to remove a selected region from the segmentation;
  178 +
  179 +\textbf{Threshold}: applies the thresholding locally, adding or removing a
  180 +region if in inside or outside of the threshold range.
  181 +
  182 +Figure~\ref{fig:select_brush_operations} shows the operations.
186 183  
187 184 \begin{figure}[!htb]
188 185 \centering
189 186 \includegraphics[scale=0.7]{segmentation_manual_pencil_type_operation_type_pt.png}
190   -\caption{Seleção do tipo de operação do pincel}
  187 +\caption{Brush operations}
191 188 \label{fig:select_brush_operations}
192 189 \end{figure}
193 190  
194   -A figure \ref{fig:noise_amalgaman} mostra um caso em que algumas imagens contêm ruídos
195   -causados pela presença de prótese dentária de amálgama no paciente. Observe os "raios"
196   -saindo da região da arcada dentária. Isso ocorre porque a máscara de segmentação também
197   -seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar para osso.
  191 +A figure \ref{fig:noise_amalgaman} mostra um caso em que algumas imagens contêm ruídos causados pela presença de prótese dentária de amálgama no paciente. Observe os "raios" saindo da região da arcada dentária. Isso ocorre porque a máscara de segmentação também seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar para osso.
  192 +
  193 +Figure~\ref{fig:noise_amalgaman} shows a image with noises caused by the presence of dental prosthesis.
198 194  
199 195 \begin{figure}[!htb]
200 196 \centering
... ...