Finished manual segmentation

Thiago Franco de Moraes
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@@ -188,65 +188,55 @@ Figure~\ref{fig:select_brush_operations} shows the operations.
 \label{fig:select_brush_operations}
 \end{figure}
  
-A figure \ref{fig:noise_amalgaman} mostra um caso em que algumas imagens contêm ruídos causados pela presença de prótese dentária de amálgama no paciente. Observe os "raios" saindo da região da arcada dentária. Isso ocorre porque a máscara de segmentação também seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar para osso.
-
-Figure~\ref{fig:noise_amalgaman} shows a image with noises caused by the presence of dental prosthesis.
+Figure~\ref{fig:noise_amalgaman} shows a image with noises caused by the presence of dental prosthesis. See the rays emerging from the dental arch. The thresholding segments the noise since its intensity is inside of the threshold of bone.
  
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam.jpg}
-\caption{Imagem com ruído segmentada com limiar}
+\caption{Noisy image segmented with threshold.}
 \label{fig:noise_amalgaman}
 \end{figure}
  
-A figure \ref{fig:surface_amagaman} ilustra como é uma superfície gerada a partir dessa
-segmentação.
+Figure~\ref{fig:surface_amagaman} shows a surface create from that segmentation.
  
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_3d.jpg}
-\caption{Superfície gerada a partir de imagem com ruído}
+\caption{Surface generated from noisy image.}
 \label{fig:surface_amagaman}
 \end{figure}
  
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_3d_zoom.jpg}
-\caption{Zoom da região com ruído}
+\caption{Zoom in the noisy area.}
 \label{fig:surface_amagaman_zoom}
 \end{figure}
  
-\newpage
-
-Em casos como este, utilizando o editor, com o pincel na opção \textbf{Apagar}, mantenha o
-botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado enquanto o \textbf{arrasta} sobre a região que
-deseja remover (na máscara).
+In such cases use the manual segmentation with the \textbf{erase} brush. Keep the \textbf{left} mouse button pressed while dragging the brush over region you want to remove (in mask).
  
-A figure \ref{fig:editor_amalgaman} mostra a imagem da figure \ref{fig:noise_amalgaman} após
-edição.
+Figure\ref{fig:editor_amalgaman} shows the image from figure~\ref{fig:noise_amalgaman} after the edition.
  
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_removed.jpg}
-\caption{Imagem com ruído removido}
+\caption{After removing the noise.}
 \label{fig:editor_amalgaman}
 \end{figure}
  
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_removed_3d_zoom.jpg}
-\caption{Superfície criada a partir da imagem com ruído removido}
+\caption{Surface generate after removing the noise.}
 \label{fig:surface_edited_amalgaman}
 \end{figure}
  
-\newpage
-Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figure
-\ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Como houve edição, ao clicar em \textbf{Criar superfície}, será
-requerido se deseja gerar a superfície a partir do método \textbf{binário} ou utilizando o método de suavização
-\textbf{Suavização sensível ao contexto} (figure \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfície.
-Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}.
+Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figure \ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Como houve edição, ao clicar em \textbf{Criar superfície}, será requerido se deseja gerar a superfície a partir do método \textbf{binário} ou utilizando o método de suavização \textbf{Suavização sensível ao contexto} (figure \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfície.  Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}.
 %\ref{fig:generate_surface}).
  
+It's possible to generate a surface after manual segmentation (figure~\ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Since it was used the manual segmentation, when you click on \textbf{Create surface} button, a dialog (figure~\ref{fig:new_surface_edited}) will be opened to  to select if the surface will be created with the method \textbf{Binary} (blocky aspect) or \textbf{Context aware smoothing} (smoother).
+
+
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
 \includegraphics[scale=0.5]{surface_generation_dialog_pt.png}
...	...	@@ -188,65 +188,55 @@ Figure~\ref{fig:select_brush_operations} shows the operations.
188	188	\label{fig:select_brush_operations}
189	189	\end{figure}
190	190
191		-A figure \ref{fig:noise_amalgaman} mostra um caso em que algumas imagens contêm ruídos causados pela presença de prótese dentária de amálgama no paciente. Observe os "raios" saindo da região da arcada dentária. Isso ocorre porque a máscara de segmentação também seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar para osso.
192		-
193		-Figure~\ref{fig:noise_amalgaman} shows a image with noises caused by the presence of dental prosthesis.
	191	+Figure~\ref{fig:noise_amalgaman} shows a image with noises caused by the presence of dental prosthesis. See the rays emerging from the dental arch. The thresholding segments the noise since its intensity is inside of the threshold of bone.
194	192
195	193	\begin{figure}[!htb]
196	194	\centering
197	195	\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam.jpg}
198		-\caption{Imagem com ruído segmentada com limiar}
	196	+\caption{Noisy image segmented with threshold.}
199	197	\label{fig:noise_amalgaman}
200	198	\end{figure}
201	199
202		-A figure \ref{fig:surface_amagaman} ilustra como é uma superfície gerada a partir dessa
203		-segmentação.
	200	+Figure~\ref{fig:surface_amagaman} shows a surface create from that segmentation.
204	201
205	202	\begin{figure}[!htb]
206	203	\centering
207	204	\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_3d.jpg}
208		-\caption{Superfície gerada a partir de imagem com ruído}
	205	+\caption{Surface generated from noisy image.}
209	206	\label{fig:surface_amagaman}
210	207	\end{figure}
211	208
212	209	\begin{figure}[!htb]
213	210	\centering
214	211	\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_3d_zoom.jpg}
215		-\caption{Zoom da região com ruído}
	212	+\caption{Zoom in the noisy area.}
216	213	\label{fig:surface_amagaman_zoom}
217	214	\end{figure}
218	215
219		-\newpage
220		-
221		-Em casos como este, utilizando o editor, com o pincel na opção \textbf{Apagar}, mantenha o
222		-botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado enquanto o \textbf{arrasta} sobre a região que
223		-deseja remover (na máscara).
	216	+In such cases use the manual segmentation with the \textbf{erase} brush. Keep the \textbf{left} mouse button pressed while dragging the brush over region you want to remove (in mask).
224	217
225		-A figure \ref{fig:editor_amalgaman} mostra a imagem da figure \ref{fig:noise_amalgaman} após
226		-edição.
	218	+Figure\ref{fig:editor_amalgaman} shows the image from figure~\ref{fig:noise_amalgaman} after the edition.
227	219
228	220	\begin{figure}[!htb]
229	221	\centering
230	222	\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_removed.jpg}
231		-\caption{Imagem com ruído removido}
	223	+\caption{After removing the noise.}
232	224	\label{fig:editor_amalgaman}
233	225	\end{figure}
234	226
235	227	\begin{figure}[!htb]
236	228	\centering
237	229	\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_removed_3d_zoom.jpg}
238		-\caption{Superfície criada a partir da imagem com ruído removido}
	230	+\caption{Surface generate after removing the noise.}
239	231	\label{fig:surface_edited_amalgaman}
240	232	\end{figure}
241	233
242		-\newpage
243		-Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figure
244		-\ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Como houve edição, ao clicar em \textbf{Criar superfície}, será
245		-requerido se deseja gerar a superfície a partir do método \textbf{binário} ou utilizando o método de suavização
246		-\textbf{Suavização sensível ao contexto} (figure \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfície.
247		-Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}.
	234	+Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figure \ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Como houve edição, ao clicar em \textbf{Criar superfície}, será requerido se deseja gerar a superfície a partir do método \textbf{binário} ou utilizando o método de suavização \textbf{Suavização sensível ao contexto} (figure \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfície. Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}.
248	235	%\ref{fig:generate_surface}).
249	236
	237	+It's possible to generate a surface after manual segmentation (figure~\ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Since it was used the manual segmentation, when you click on \textbf{Create surface} button, a dialog (figure~\ref{fig:new_surface_edited}) will be opened to to select if the surface will be created with the method \textbf{Binary} (blocky aspect) or \textbf{Context aware smoothing} (smoother).
	238	+
	239	+
250	240	\begin{figure}[!htb]
251	241	\centering
252	242	\includegraphics[scale=0.5]{surface_generation_dialog_pt.png}
...	...