55 comentários

• Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)

  9 de Março de 2010, 9:03

   

  Bom dia Renan,

  Para disponibilizarmos o InVesalius no Fedora só falta empacotar a dependência SIGAR:
  supp​ort.​hype​ric.​com/​disp​lay/​SIGA​R/Ho​me

  Você poderia nos ajudar gerando o pacote RPM do SIGAR para Python? Em caso afirmativo, sugiro que utilize a versão do trunk.

  Já geramos o pacote do InVesalius 3 e do GDCM, sendo que as demais dependências do InVesalius 3 estão disponíveis no repositório do Fedora.

  > Preciso do arquivo "setup.py".

  Não foi criado um arquivo setup.py para instalação do InVesalius 3 em GNU Linux pois ele não é necessário.

  > Tentei compilar para o fedora mas sem
  > resultados pois esse arquivo não consta do código baixado do site. Tentei
  > usar o arquivo da versão 1.0 mas o mesmo está desatualizado. Além deste
  > arquivo se vc puder me fornecer a install Path eu agradeço.

  Juntamente, para rodar o InVesalius no Fedora a partir do código fonte não é necessário o setup.py.

  Não se preocupe com o empacotamento do InVesalius 3 para Fedora, pois já temos pronto.

  Se você tiver disponibilidade e interesse em ajudar a comunidade, por favor, gere o pacote do SIGAR.

  > Em relação aos pacotes do Ubuntu posso dizer que o pessoal do fedora mudou o
  > pacote do gdcm para o mesmo usar o soft CharLS (
  > char​ls.c​odep​lex.​com/​) que teria melhor desempenho e menos perda de
  > qualidade.

  Pois é, ainda bem que já temos o pacote do GDCM para Fedora...! Um trabalho a menos.

  > Assim que conseguir a help posso montar um tutorial para o fedora 12 e
  > enviar o spec file ou pacote src para o projeto.

  Muito obrigada por oferecer ajuda. Se possível, no momento, você ajudaria muito empacotando o SIGAR.

  Abraços,

  Tatiana

  
  

  • Renan Calliari(usuário não autenticado)

    10 de Março de 2010, 20:19

     

    Tatiana,

     Testa esse spec file que criei. A Source trunk eu denominei de versão 1.7. Desativei a compilação do java que estava dando muitos problemas. Não consegui colocar o sigar em um diretório por essa razão ele instala  diretamente no site-packages. Se vc pduer me enviar o spec file do invesalius e suas possíveis patchs agradeço. Acho que vc já deve conhecer esse endereço: mrce​resa​.fed​orap​eopl​e.or​g/&n​bsp; . Amaioria dos pacotes retirei de lá, porém algumas dependências necessitam ser revisadas, consertei elas mas ainda não as enviei ao autor dos spec files.
    Ah! Se houverem erros grosseiros me avise pois não sou programador, apenas fuço bastante no Fedora.
    # $Revision: 1.0
    #
    # A few useful macros
    %{!?python_sitelib: %global python_sitelib %(%{__python} -c "from distutils.sysconfig import get_python_lib; print get_python_lib()")}

    Summary:    SIGAR - System Information Gatherer And Reporter
    Name:        hyperic-sigar
    Version:    1.7
    Release:    1%{?dist}
    Group:        Libraries
    License:    GNU GPL 3
    URL:        http://sigar.sourceforge.net/
    Source0:    http://dl.sourceforge.net/sigar/%{name}-%{version}.tar.gz
    # Source0:    http://svn.hyperic.org/projects/sigar_mirror/trunk sigar
    BuildRequires:    ant >= 1.6.5
    BuildRequires:    cmake >= 2.6
    BuildRequires:    java-1.6.0-openjdk java-1.6.0-openjdk-devel
    BuildRequires:    perl >= 5.6.1
    Buildroot: %{_tmppath}/%{name}-%{version}-%{release}-root-%(%{__id_u} -n)

    %description
    The Sigar API provides a portable interface for gathering system
    information such as:
    - System memory, swap, CPU, load average, uptime, logins
    - Per-process memory, CPU, credential info, state, arguments,
      environment, open files
    - File system detection and metrics
    - Network interface detection, configuration info and metrics
    - Network route and connection tables

    This information is available in most operating systems, but each OS
    has their own way(s) providing it. SIGAR provides developers with one
    API to access this information regardless of the underlying platform.
    The core API is implemented in pure C with bindings currently
    implemented for Java, Perl and C#.

    %prep
    %setup -q sigar-%{version}

    %build
    %cmake .
    %{__make}

    #cd bindings/java
    #%ant
    #chmod a+rx sigar-bin/lib/lib*.so

    cd bindings/python
    %{__python} setup.py build

    %install
    %{__rm} -rf %{buildroot}
    %{__install} -d -m 755 %{buildroot}
    cd bindings/python
    %{__python} setup.py install --skip-build --root %{buildroot}
    cd ..

    %clean
    %{__rm} -rf %{buildroot}

    %post
    /sbin/ldconfig

    %files
    %defattr(-,root,root,-)
    %doc ChangeLog LICENSES README EXCEPTIONS
    %{python_sitelib}/*.py*
    %{python_sitelib}/pysigar-0.1-py2.6.egg-info
    %{python_sitelib}/_sigar.so

    %changelog
    * Thu Mar 04 2010 Renan Calliari - 1.7
    - Initial package.
     

     

    
    
• Renan Calliari(usuário não autenticado)

  11 de Março de 2010, 16:49

   

  Tatiana, testei o seu pacote para o fedora e ele apresentou o erro abaixo, atalvez pq alguns pacotes por mim instalados sejam diferentes dos seus. Se vc tiver o src.rpm posso testar e ver se esse é o problema.

   

  UUID: 5c559682
  architecture: i686
  cmdline: python invesalius.py
  component: invesalius
  executable: /usr/share/invesalius-3.0/invesalius/invesalius.py
  kernel: 2.6.31.5-127.fc12.i686.PAE
  package: invesalius-3.0.0-1.beta2.fc12
  release: Fedora release 12 (Constantine)
  uuid: 5c559682

  backtrace
  -----
  Summary: TB5c559682 imagedata_utils.py:23:<module>:ImportError: No module named vtkgdcm

  Traceback (most recent call last):
    File "invesalius.py", line 271, in <module>
      main()
    File "invesalius.py", line 229, in main
      application = InVesalius(0)
    File "/usr/lib/python2.6/site-packages/wx-2.8-gtk2-unicode/wx/_core.py", line 7974, in __init__
      self._BootstrapApp()
    File "/usr/lib/python2.6/site-packages/wx-2.8-gtk2-unicode/wx/_core.py", line 7548, in _BootstrapApp
      return _core_.PyApp__BootstrapApp(*args, **kwargs)
    File "invesalius.py", line 54, in OnInit
      splash = SplashScreen()
    File "invesalius.py", line 110, in __init__
      session.CreateItens()
    File "/usr/share/invesalius-3.0/invesalius/session.py", line 25, in CreateItens
      import constants as const
    File "/usr/share/invesalius-3.0/invesalius/constants.py", line 25, in <module>
      from project import Project
    File "/usr/share/invesalius-3.0/invesalius/project.py", line 33, in <module>
      import data.imagedata_utils as iu
    File "/usr/share/invesalius-3.0/invesalius/data/imagedata_utils.py", line 23, in <module>
      import vtkgdcm
  ImportError: No module named vtkgdcm

  Local variables in innermost frame:
  vtk: None
  __builtins__: {'bytearray': <type 'bytearray'>, 'IndexError': <type 'exceptions.IndexError'>, 'all': <built-in function all>, 'help': Type help() for interactive help, or help(object) for help about object., 'vars': <built-in function vars>, 'SyntaxError': <type 'exceptions.SyntaxError'>, 'unicode': <type 'unicode'>, 'UnicodeDecodeError': <type 'exceptions.UnicodeDecodeError'>, 'isinstance': <built-in function isinstance>, 'copyright': Copyright (c) 2001-2009 Python Software Foundation.
  All Rights Reserved.

  Copyright (c) 2000 BeOpen.com.
  All Rights Reserved.

  
  

  • Thiago Franco Moraes(usuário não autenticado)

    11 de Março de 2010, 22:09

     

    Olá Renan,

    Você não está usando pacote do gdcm que nós geramos? Se você estiver utilizando o pacote do gdcm gerado pelo Mario Ceresa, você não conseguirá rodar o InVesalius mesmo, já que o pacote não é compilado com o suporte ao VTK. Veja no spec que ele gerou (http://mrceresa.fedorapeople.org/gdcm.spec) , DGDCM_USE_VTK:BOOL=OFF. Você pode tentar recompilar o pacote dele setar esta opção para ON.

    
    

    • Renan Calliari(usuário não autenticado)

      23 de Março de 2010, 22:56

       

      Thiago,

       Vc tinha razão. Acabei adaptando o pacote do Mario e agora o invesalius está funcionando.

      Valeu a dica.