99 comentários

• Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)

  24 de Março de 2009, 11:03

   

  Bom dia Victor,

  Como você está?

  Estive de férias um tempo. Enquanto estive fora Paulo e Thiago comentaram que haviam auxiliado um pouco vocês. Recentemente em visita de André ele também esclareceu algumas dúvidas.

  Você continua exatamente com o mesmo problema? O GDCM continua não funcionando?

  Abraços,

  Tatiana

  
  

  • Victor Hugo de Oliveira Souza(usuário não autenticado)

    24 de Março de 2009, 11:12

     

    Bom dia Tatiana.

    Estou bem obrigado. E você?

    Então,o André trouxe uma pasta com o GDCM já compilado. Mesmo assim ainda não consegui importá-lo. Estamos tendo os mesmos problemas.

    O Paulo também tinha aconselhado utilizar o vtkImageActor para visualizar as imagens do vtkDICOMImageReader. Mas o erro que citei no tópico acima aparece, dizendo que a entrada do Actor não é o esperado.

    Estamos travados por causa desses pequenos problemas.

     Obrigado pela atençao!

     Abraços.

     Victor Hugo

    
    

    • Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)

      25 de Março de 2009, 7:59

       

      Olá Victor,

      Tudo ótimo..!

      O VTK está funcionando?

      Se estiver, gostaria de lhe pedir para copiar os arquivos que estão dentro deste zip: www.​soft​ware​publ​ico.​gov.​br/d​otlr​n/cl​ubs/​inve​sali​us/f​ile-​stor​age/​down​load​/gdc​m2.1​.zip​?fil​e%5f​id=1​0251​496

      Dentro da própria pasta do VTK.

      Surtiu algum resultado? Tente fazer:

      >>> import gdcm

      >>> import vtkgdcm

      A princípio, seguindo estes passos, não será necessário colocar nenhum caminho adicional ao PYTHONPATH ou ao PATH do sistema.

      Abraços,

      Tatiana

      
      

      • Victor Hugo de Oliveira Souza(usuário não autenticado)

        25 de Março de 2009, 13:58

         

        Olá Tatiana;

        O vtk está funcionando perfeitamente.

        Obrigado pela pasta do gdcm, ela funcionou. Não por completo.
        Eu consigo importar o gdcm e o gdcmswig, mas não o vtkgdcm. Aparece uma mensagem: Não foi possível localizar o ponto de entrada do procedimonto ?GetNumberOfUserDefinedValues@vtkMedicalImageProperties@@QAEIXZ na biblioteca de vínculo dinâmico vtkIO.dll.

        Tentei utilizar a classe vtkGDCMImageReader(), mas o interpretador não a reconheceu. Presumo que ela esteja vinculada com o módulo vtkgdcm que não pode ser importado.

         Alguma solução?!

        Obrigado pelo suporte.

        Abraços!

         Victor Hugo

        
        

        • Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)

          25 de Março de 2009, 14:54

           

          Olá Victor,

          É bastante provável que a versão do VTK que utilizamos para gerar este wrapper do GDCM seja diferente da sua, por isso o problema.

          Para resolver, pelo menos por enquanto, sugiro que você substitua sua pasta vtk (que está explícita no PYTHONPATH e/ou PATH) pela contida no arquivo Wrapper Python VTK 5.3 e GDCM 2.1 disponível na pasta:

           http://www.softwarepublico.gov.br/dotlrn/clubs/invesalius/file-storage/index?folder_id=10259993

          O zip ultrapassava o tamanho permitido por arquivo no Portal (20M), então comprimi em 7z, que é um padrão livre de compressão mais eficiente que zip para grande parte dos casos.

          Confirme se deu certo, ok?

          Abraços!

          
          

          • Victor Hugo de Oliveira Souza(usuário não autenticado)

            25 de Março de 2009, 16:20

             

            Tatiana,

            Muito obrigado. O gdcm está funcionando corretamente.

            No entanto, a princípio não consegui fazê-lo interagir com o vtkImageActor. Num programinha básico feito no boa constructor, um frame com dois painéis, sendo que em um deles é para projetar a imagem. Eu consigo fazer com o vtkBMPReader, mas quando utilizo um leitor de dicom aparece a seguinte mensagem de erro:

            ERROR: In ..\..\Rendering\vtkImageActor.cxx, line 267 vtkOpenGLImageActor (056D9C30): This filter requires unsigned char scalars as input

             Tem alguma idéia do que seja.

            Obrigado pela atenção.

             Victor Hugo

            
            

            • Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)

              25 de Março de 2009, 17:30

               

              Olá Victor,

              Por favor, você disponibilizaro código fonte inteiro que você está executando, que está gerando este problema?

              Se possível, por favor, comprima os arquivos e coloque o arquivo comprimido nesta pasta:

              www.​soft​ware​publ​ico.​gov.​br/d​otlr​n/cl​ubs/​inve​sali​us/f​ile-​stor​age/​?fol​der_​id=1​0263​431

              Não desanime, no início sempre surgem dificuldades, mas logo você já estará programando melhor que nós três do CTI.. ;)

              Abraços,

              Tatiana

              
              
            • Thiago Franco Moraes(usuário não autenticado)

              25 de Março de 2009, 20:31

               

              Olá, Victor. Tudo bem?

               

              Este erro ocorre porque o vktImageActor espera receber como entrada uma imagem com os dados no formato unsigned char. Para conseguir uma imagem com este formato, você passar a imagem pelo filtro vtkImageCast, e setar a saida para unsigned char pelo método SetOutputScalarTypeToUnsignedChar. Abaixo um exemplo de código.

               

              cast = vtkImageCast()

              cast.SetOutputScalarTypeToUnsignedChar()

              cast.SetInput(image)

              actor = vtk.vtkImageActor()

              actor.SetInput(cast.GetOutput())

              
              

              • Victor Hugo de Oliveira Souza(usuário não autenticado)

                25 de Março de 2009, 21:47

                 

                Opa, tudo bom!

                Thiago, fazendo esta conversão deu certo, está rodando direitinho agora, obrigado.

                Tatiana, acho que não será necessário enviar o código fonte agora. Caso venha a surgir algum problema maior eu colocarei no fórum.

                Muito obrigado pela ajuda pesoal.

                 Abraços.

                Victor Hugo