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Leitura da (primeira imagem) quantidade de fatias da tomografia.

15 de Fevereiro de 2008, 13:07 , por Desconhecido - | Ninguém seguindo este artigo por enquanto.
Visualizado 41 vezes

Tatiana ou Colegas,

Eu estou testando alguns software para implantar um projeto aqui no Hospital.

Basicamente teremos um PC para visualizar as imagens gerada pelo equipamento  GE tomografia maquina CT HI-SPEED e ao fazer os testes, o software Efilm se saiu melhor, apesar da minha preferência e o motivo é que este não leu a primeira “imagem” ate comentei que uma s´, porem esta é a que mostra como e em que local foi feito as fatias.

Alguém já vivenciou isto, ou querem o arquivo (150 MB) para testes no inversálius.

A disposição

Ronaldo Emerick Moreira   12 8116-0856


Autor: ronaldo emerick


22 comentários

  • 48dfb8d5a4a0459d4285c752af22e7cb?only path=false&size=50&d=404Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    18 de Fevereiro de 2008, 23:14

     

    Olá Ronaldo,

    O software InVesalius tem como finalidade realizar a reconstrução em 3D de imagens 2D no formato DICOM. Para realizar tal reconstrução, é utilizado um conjunto de arquivos DICOM, de uma mesma série (tomada) que possuem a mesma orientação (ou axial, ou sagital, ou coronal) e que tenham posições distintas no plano cartesiano tridimensional.

    Muitas vezes durante a aquisicão de exames através de equipamentos de TC, radiologistas geram um conjunto de imagens em orientações diversas - que podem ter aplicacões distintas.  É muito comum a geração de uma imagem sagital, de referência, e posteriormente a aquisicão de um conjunto de imagens axiais. Neste caso específico, os dados utilizados para a reconstrução através do software InVesalius seriam apenas as imagens axiais. A imagem sagital seria enquadrada em uma série distinta e não teria utilidade para a reconstrução, não sendo aplicada no produto final da reconstrução.

    Cabe lembrar que, ao realizar a reconstrucão 3D, o InVesalius gera as demais orientacões (por exemplo, se o plano original das imagens era axial, o software gera as imagens correspondentes as seções sagital e coronal). Ou seja, apesar de não ter utilizado imagens em outras orientações, o InVesalius permite a visualização destas seções.

    No caso que você descreveu, o InVesalius (estou considerando a versão 2 beta) interpreta, sim, a primeira imagem. Tanto que você poderá ver tal imagem no painel de pré-visualizacao, ao abrir a janela de importação de imagens DICOM (que surge ao criar um novo projeto). Entretanto, quando você clica sobre o botão "importar fatias", as imagens são divididas em séries distintas - de acordo com as informações dos arquivos DICOM existentes na pasta. Esta primeira imagem, no seu caso, foi enquadrada em uma série unitária, que não será utilizada para a reconstrução.

    Para lhe ajudar, você poderia me informar por que precisa desta imagem que não será utilizada para a reconstrução? Se for apenas para ter uma referência de como e onde o exame foi obtido, será suficiente a exibição da mesma na tela de importação do InVesalius.

    Não sei quais serão as necessidades da sua instituicão, mas é interessante fazer uma breve comparação entre o eFilm e o InVesalius:

    Custo 

    eFilm: $ 950 ~ R$ 1850 (versão mais barata - considerando câmbio do dólar comercial ~R$ 1,90 com base na cotacao de hoje)
    InVesalius: $ 0

    Período de utilização

    eFilm: anual (a cada ano vc terá que pagar o mesmo valor - ou mais caro - para cada equipamento onde vocês tiverem o software instalado)
    InVesalius: eterno - está registrado como software livre no Instituto Nacional de Propriedade Intelectual e, portanto, sempre será livre

    Idioma

    eFilm: em inglês
    InVesalius: em português e inglês

    Lincença

    eFilm: é um software proprietário. Fazendo a aquisicao dele, vocês estão dependentes do fabricante original, de seus interesses de desenvolvimento e não tem possibilidades de adaptarem o mesmo para suas necessidades específicas.
    InVesalius: é um software livre.  Você tem uma série de liberdades: (1) de executar o programa para qualquer propósito; (2) de estudar como o programa funciona e adaptá-lo para as suas necessidades; (3) a liberdade de redistribuir cópias e instalar em quantos computadores quiser; (4) a liberdade de aperfeicoar o programa e distribuir seus aperfeicoamentos, auxiliando outras pessoas.
    Desenvolvedor

    eFilm: é desenvolvido por uma empresa isolada. Se a empresa falir, por exemplo, o programa morrerá com ela.
    InVesalius: tem apoio do Governo Federal. As chances do programa parar de ser desenvolvido são mínimas. E caso isso ocorra, outras pessoas podem continuar seu desenvolvimento no mesmo ambiente do Portal do Software Público - o código fonte do projeto está todo disponível! 

    Com uma parte dos recursos que você gastaria em um software proprietário, você poderia investir no desenvolvimento de um livre. Em um projeto nacional desenvolvido por uma instituição de pesquisa brasileira, continuando a sua evolução e atendendo demandas como as que apresenta.

    Estamos a disposicão para esclarecer outras dúvidas.

    Atenciosamente,

    Tatiana

    • Ec77d3effe78e779dd568d0a97dde45f?only path=false&size=50&d=404ronaldo emerick(usuário não autenticado)
      21 de Fevereiro de 2008, 7:56

       

      Tatiana,
      Eu sou 100% a favor do Inversalius, estou fazendo uns testes e mando
      noticias. Quando tiver novo curso, eu ou o médico envolvido no
      processo fará o curso. Obrigado pelos esclarecimentos. Ronaldo
      Emerick Moreira 12 8116-0856
      Prof. Msc.Engenheiro Biomédico e Gestor de TI. Eu como pessoa
      estou 100% a disposição, inclusive a procura de um projeto para
      Doutorado, já a minha instituição é poder publico.
      *_notification-3182493-1213@www.softwarepublico.gov.br_* escreveu:

      Forum: invesalius-usrs [1]
      Thread: Leitura da (primeira imagem) quantidade de fatias da
      tomografia. [2]
      Author: Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins
      Posted: 2008-02-19 02:14:27.177113+00

      Olá Ronaldo,

      O software InVesalius tem como finalidade realizar a reconstrução
      em 3D de imagens 2D no formato DICOM. Para realizar tal
      reconstrução, é utilizado um conjunto de arquivos DICOM, de *uma
      mesma série* (tomada) que possuem *a mesma orientação* (ou axial,
      ou sagital, ou coronal) e que tenham *posições distintas* no plano
      cartesiano tridimensional.

      Muitas vezes durante a aquisicão de exames através de equipamentos
      de TC, radiologistas geram um conjunto de imagens em orientações
      diversas - que podem ter aplicacões distintas. É muito comum a
      geração de uma imagem sagital, de referência, e posteriormente a
      aquisicão de um conjunto de imagens axiais. Neste caso específico,
      os dados utilizados para a reconstrução através do software
      InVesalius seriam apenas as imagens axiais. A imagem sagital seria
      enquadrada em uma série distinta e não teria utilidade para a
      reconstrução, não sendo aplicada no produto final da reconstrução.

      Cabe lembrar que, ao realizar a reconstrucão 3D, o InVesalius gera
      as demais orientacões (por exemplo, se o plano original das
      imagens era axial, o software gera as imagens correspondentes as
      seções sagital e coronal). Ou seja, apesar de não ter utilizado
      imagens em outras orientações, o InVesalius permite a visualização
      destas seções.

      No caso que você descreveu, o InVesalius (estou considerando a
      versão 2 beta) interpreta, sim, a primeira imagem. Tanto que você
      poderá ver tal imagem no painel de pré-visualizacao, ao abrir a
      janela de importação de imagens DICOM (que surge ao criar um novo
      projeto). Entretanto, quando você clica sobre o botão "importar
      fatias", as imagens são divididas em séries distintas - de acordo
      com as informações dos arquivos DICOM existentes na pasta. Esta
      primeira imagem, no seu caso, foi enquadrada em uma série
      unitária, que não será utilizada para a reconstrução.

      Para lhe ajudar, você poderia me informar por que precisa desta
      imagem que não será utilizada para a reconstrução? Se for apenas
      para ter uma referência de como e onde o exame foi obtido, será
      suficiente a exibição da mesma na tela de importação do
      InVesalius.

      Não sei quais serão as necessidades da sua instituicão, mas é
      interessante fazer uma breve comparação entre o eFilm e o
      InVesalius: *Custo*

      - eFilm: $ 950 ~ R$ 1850 (versão mais barata - considerando câmbio
      do dólar comercial ~R$ 1,90 com base na cotacao de hoje)
      - InVesalius: $ 0

      *Período de utilização*

      - eFilm: anual (a cada ano vc terá que pagar o mesmo valor - ou
      mais caro - para cada equipamento onde vocês tiverem o software
      instalado)
      - InVesalius: eterno - está registrado como software livre no
      Instituto Nacional de Propriedade Intelectual e, portanto, sempre
      será livre

      *Idioma*

      - eFilm: em inglês
      - InVesalius: em português e inglês

      *Lincença*

      - eFilm: é um software proprietário. Fazendo a aquisicao dele,
      vocês estão dependentes do fabricante original, de seus interesses
      de desenvolvimento e não tem possibilidades de adaptarem o mesmo
      para suas necessidades específicas.
      - InVesalius: é um software livre. Você tem uma série de
      liberdades: (1) de executar o programa para qualquer propósito;
      (2) de estudar como o programa funciona e adaptá-lo para as suas
      necessidades; (3) a liberdade de redistribuir cópias e instalar em
      quantos computadores quiser; (4) a liberdade de aperfeicoar o
      programa e distribuir seus aperfeicoamentos, auxiliando outras
      pessoas.

      *Desenvolvedor*

      - eFilm: é desenvolvido por uma empresa isolada. Se a empresa
      falir, por exemplo, o programa morrerá com ela.
      - InVesalius: tem apoio do Governo Federal. As chances do programa
      parar de ser desenvolvido são mínimas. E caso isso ocorra, outras
      pessoas podem continuar seu desenvolvimento no mesmo ambiente do
      Portal do Software Público - o código fonte do projeto está todo
      disponível!

      Com uma parte dos recursos que você gastaria em um software
      proprietário, você poderia investir no desenvolvimento de um
      livre. Em um projeto nacional desenvolvido por uma instituição de
      pesquisa brasileira, continuando a sua evolução e atendendo
      demandas como as que apresenta.

      Estamos a disposicão para esclarecer outras dúvidas.

      Atenciosamente,

      Tatiana
      Recebendo correspondência demais? Gerencie suas notificações em:
      www.​soft​ware​publ​ico.​gov.​br/n​otif​icat​ions​/man​age

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      Abra sua conta no Yahoo! Mail [3], o único sem limite de espaço para
      armazenamento!

      [1] www.​soft​ware​publ​ico.​gov.​br/d​otlr​n/cl​ubs/​inve​sali​us/f​orum​s/fo​rum-​view​?for​um_i​d=63​0994
      [2] www.​soft​ware​publ​ico.​gov.​br/d​otlr​n/cl​ubs/​inve​sali​us/f​orum​s/me​ssag​e-vi​ew?m​essa​ge_i​d=31​5927​1
      [3] br.r​d.ya​hoo.​com/​mail​/tag​line​s/ma​il/*​http​://b​r.ma​il.y​ahoo​.com​/

Tutorial passo-a-passo sobre uso do software InVesalius 3

17 de Abril de 2010, 11:45, por Desconhecido

Se você tem interesse em utilizar o software de reconstrução 3D de imagens médicas InVesalius, mas não sabe por onde começar, acesse já o tutorial escrito pelo designer Cícero Moraes:



InVesalius 3 Beta 2 disponível

6 de Março de 2010, 11:41, por Desconhecido

Para saber mais sobre o InVesalius 3.0.0 Beta 2, leia:
http://svn.softwarepublico.gov.br/trac/invesalius/wiki/releases/pt/changelog

Continue contribuindo com a Comunidade InVesalius!

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8 de Fevereiro de 2010, 9:57, por Desconhecido

Acompanhar o InVesalius pelo Twitter permitirá que você saiba, em primeira mão, sobre:



InVesalius 3 Beta 1 disponível para testes em Windows e GNU Linux

27 de Janeiro de 2010, 10:50, por Desconhecido



Trabalho acadêmico discute aplicação do OpenBRR ao InVesalius

6 de Novembro de 2009, 16:35, por Desconhecido

Autor: Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins