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Boa Tarde,

Trabalho em odontologia, mais especificamente em ortodontia. Gostaria de saber se há a possibilidade de se obter uma imagem 3D específica da arcada dentária, com detalhes individuais de cada dente, exportá-la e editá-la em algum software, por exemplo Pov-Ray, para alterar a posição original dos dentes. Seria um tratamento ortodôntico virtual.

Desde já agradeço. Parabéns pelo grande trabalho.

Atenciosamente,

Célio

Autor: Célio Fukunaga

2323 comentários

Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
19 de Fevereiro de 2010, 16:20

Boa tarde Célio!
Bem vindo a comunidade InVesalius!
A princípio, é possível fazer pelo menos parte do que você deseja utilizando o InVesalius.
> Gostaria de saber se há a possibilidade de se obter uma imagem 3D específica da arcada dentária,
Você tem o exame de tomografia computadorizada, no formato DICOM, da arcada dentária de interesse? Se tiver, sim, é possível.
> com detalhes individuais de cada dente,
Dependerá da qualidade do exame, mas a princípio é possível sim.
> exportá-la
Sim, o InVesalius permite exportar para OBJ, STL, dentre outros formatos 3D...
> e editá-la em algum software, por exemplo Pov-Ray, para alterar a posição original dos dentes
Não domino o Pov-Ray, deve ser possível... Uma alternativa para fazer isso seria com o Blender [1] ou qualquer software similar.
Abraços,
Tatiana
[1] www.blender.org
- Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
  
  19 de Fevereiro de 2010, 19:06
  
  Tatiana,
  Obrigado pelas boas vindas e pelo rápido atendimento.
  Sim, temos uma tomografia para testes, apenas não verifiquei a extensão do arquivo.
  Na verdade não tenho conhecimento nenhum sobre softwares 3D, mas já ouvi falar do Pov e do Blender. Até instalei o Blender aqui em casa para tentar aprender, mas confesso que não consegui. O tutorial era para uma versão mais antiga do que eu tinha. Desisti.
  Para exportar para o Blender que tipo de extensão eu uso?
  Outra dúvida: no Blender vou conseguir tratar os dentes independente da maxíla/mandíbula? Explicando melhor, vou conseguir inclinar, girar, etc, cada dente independentemente, sem afetar outras áreas do desenho?
  Desculpe-me pelas várias questões, mas realmente sou muito leigo no assunto.
  Gostaria de reportar um possível bug: quando tentei sair do programa através do menu Arquivo/Sair nada aconteceu. Tive que fechar pela barra de tarefas. Uso o Beta 1 no XP 32 bits. Minha máquina é um Pentium 4 - 3 gigas, 1 giga de memória e placa de vídeo onboard. Sei que não uma máquina recomendável, mas por enquanto é tudo que tenho.
  Agradeço mais uma vez pela prontidão.
  Atenciosamente,
  Célio
  - Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    
    22 de Fevereiro de 2010, 10:09
    
    Bom dia Célio!
    > Sim, temos uma tomografia para testes, apenas não verifiquei a extensão do arquivo.
    Muitas vezes os arquivos DICOM não possuem extensão (as vezes é usado .dcm), então a melhor forma de verificar se é DICOM ou não é tentando importar com o InVesalius
    > Até instalei o Blender aqui em casa para tentar aprender, mas confesso que não consegui. O tutorial era para uma versão mais antiga do que eu tinha. Desisti.
    De fato começar a utilizá-lo pode ser difícil. Em que cidade você mora..? Talvez possamos indicar algum colega / empresa que domine o software em sua localidade.
    > Para exportar para o Blender que tipo de extensão eu uso?
    Ou obj ou stl. OBJ tem se mostrado mais leve.
    > Outra dúvida: no Blender vou conseguir tratar os dentes independente da maxíla/mandíbula? Explicando melhor, vou conseguir inclinar, girar, etc, cada dente independentemente, sem afetar outras áreas do desenho?
    Sim..!
    > Desculpe-me pelas várias questões, mas realmente sou muito leigo no assunto.
    Não se preocupe, sinta-se a vontade para utilizar o fórum. Sugiro que você tente efetuar a reconstrução com o InVesalius. Tendo o resultado em mãos, você poderia contactar o próprio pessoald da comunidade blender [1]. Eles sem dúvida poderão esclarecer melhor suas dúvidas.
    > Gostaria de reportar um possível bug: quando tentei sair do programa através do menu Arquivo/Sair nada aconteceu. Tive que fechar pela barra de tarefas. Uso o Beta 1 no XP 32 bits. Minha máquina é um Pentium 4 - 3 gigas, 1 giga de memória e placa de vídeo onboard. Sei que não uma máquina recomendável, mas por enquanto é tudo que tenho.
    Obrigada por relatar o bug. Nosso colega Luiz Cláudio Mesquita de Aquino, também da comunidade InVesalius, havia relatado há pouco tempo [2]. Já corrigimos e na versão Beta 2 a correção estará disponível!
    Abraços,
    Tatiana
    [1] www.blender.com.br/forum
    [2] svn.softwarepublico.gov.br/trac/invesalius/ticket/157
    
    Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
    
    23 de Fevereiro de 2010, 10:57
    
    Bom dia, Tatiana
    Obrigado pelos esclarecimentos.
    Vou iniciar os testes e depois retorno os resultados.
    Quanto ao bug, depois de relatar é que vi o tópico do Luiz.
    Também vi alguém perguntando por pacotes RPM. Bom, lá em casa, converti os pacotes DEB para RPM, mas no meu Mandriva 2010.0 não consegui rodar. Problemas de dependência: é preciso libtiff.so.4 e só o libtiff.so.3 está disponível. Talvez tente compilar.
    Prá terminar, gostaria que me indicasse algum outro programa além do Blender.
    Parabéns mais uma vez pelo projeto e espero ansioso a versão estável.
    Abraços,
    Célio
    
    Thiago Franco Moraes(usuário não autenticado)
    
    23 de Fevereiro de 2010, 11:31
    
    Olá Célio,
    Infelizmente ainda não temos pacotes RPM. Você pode tentar instalar os pacotes daqui www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/CreatoolsInstallInstructionsv2.0.1Linux-8-9-10-11-Developer . Estes RPMs são para o fedora, não tenho certeza se funcionarão no Mandriva. Só tome o cuidado de tentar instalar os pacotes de uma versão do fedora equivalente à versão do seu mandriva. Outra alternativa é procurar pelos pacotes no www.rpmfind.net .
    Você terá que instalar os pacotes VTK, GDCM e o InsightToolkit.
    Abraços.
    
    Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
    
    23 de Fevereiro de 2010, 16:35
    
    Oi Thiago,
    Obrigado pela dica, mas acho que vou tentar compilar. Como na clínica usamos Windows, já tenho ele instalado para testes. É que meu computador de casa atende melhor as exigências de hardware, por isso queria instalá-lo lá. Mas...vamos ver se ainda tenho paciência prá compilar.
    Abraços,
    Célio
Cícero Moraes(usuário não autenticado)
3 de Abril de 2010, 0:43

Olá Célio! O que você deseja fazer é algo assim?http://www.ciceromoraes.com.br/pics/invesalius_1.pnghttp://www.ciceromoraes.com.br/pics/invesalius_2.pnghttp://www.ciceromoraes.com.br/pics/invesalius_3.pngCaso seja, basta 1. Exportar o arquivo como .STL 2. Importat o arquivo no Blender3. Entrar em modo de edição e remover os pontos duplos.4. Selecionar a área que deseja e separá-la com a tecla L. Coisas básicas em relação ao Blender. Caso não tenha conhecimento básico sobre esse programa, entre no meu site que além d euma apostila para iniciantes tem uma série de 7 videoaulas. www.ciceromoraes.com.br Grande abraço!
- Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
  
  6 de Abril de 2010, 22:09
  
  Oi Cícero,
  
  Obrigado pelas dicas. Ainda não consegui carregar um arquivo dicom prá gerar o modelo 3D. Falta memória na máquina. Mas quando conseguir seguirei suas sugestões.
  Abraços,
  Célio
  - Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    
    7 de Abril de 2010, 9:48
    
    Bom dia Célio,
    Você conseguiu abrir o arquivo de exemplo que vem com o InVesalius?
    Este erro está ocorrendo no Windows 32 ou no Mandriva? Você já descreveu que utilizava ambas plataformas. Ainda que seu computador não tenha placa de video off board, 3 GB são suficientes para abrir diversos casos...
    Você poderia compartilhar as imagens para as quais está tentando gerar superfície 3D e não está conseguindo? Sugiro que as compacte e armazene em [1] ou utilize um serviço como Dropbox [2].
    Quaisquer outros detalhes (quantidade de imagens, resolução, erro...) podem ajudar na resolução do problema.
    Abraços,
    Tatiana
    [1] www.softwarepublico.gov.br/dotlrn/clubs/invesalius/file-storage/index?folder_id=6825509
    [2] www.dropbox.com
    
    Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
    
    7 de Abril de 2010, 22:27
    
    Oi Tatiana,
    O arquivo exemplo consegui abrir no Windows, sim.
    Já o arquivo que tenho prá testes, deve ter, se não me falha a memória, mais ou menos 15000 fatias. Como só tenho dois gigas de memória, não esperei o carregamento das imagens até o final. Fechei o programa antes. Já estava a um bom tempo carregando. Não chegou a ocorrer nenhum erro, mas como estava monitorando a quantidade de memória utilizada, resolvi fechar o programa antes que o sistema travasse de vez. Ah, estava utilizando o Ubuntu 64.
    Na importação do arquivo dicom, estava consumindo por volta de 800 mb. Quando ele começou a gerar as imagens, pulou para 1,6 gb. Foi então que resolvi interromper.
    Como a grana anda curta, ainda vai demorar um pouco até poder fazer um upgrade de memória e poder, finalmente, começar a fazer meus testes.
    Abraços,
                        Célio
    
    Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    
    8 de Abril de 2010, 8:41
    
    Bom dia Célio,
    15.000 é um número muito grande. Enquanto seu computador não tiver mais memória, sugiro que trabalhe apenas com parte dos dados: selecione algumas destas imagens (colocando-as em uma pasta separada) e tente importá-las com o InVesalius.
    Abraços,
    Tatiana
    
    Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
    
    8 de Abril de 2010, 19:22
    
    Tatiana,
    Este é um outro problema. Eu só tenho um único arquivo .dcm que abre um monte de fatias. Não sei como separá-las, se é que isto seja possível. Por enquanto fico no aguardo da grana extra.
    
    abraços,
                           Célio
    
    Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    
    9 de Abril de 2010, 10:13
    
    Bom dia Célio,
    O InVesalius 3 __ainda__ não oferece suporte a um único arquivo DICOM contendo múltiplas fatias...! Estamos implementando tal funcionalidade, e se tudo der certo estará disponível no Beta 3.
    Talvez seja este o problema...! Você poderia compartilhar conosco este arquivo DICOM? Temos apenas um arquivo de teste deste tipo...!
    Abraços,
    Tatiana
    
    Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
    
    9 de Abril de 2010, 18:08
    
    Oi Tatiana,
    Claro que posso, apenas peço que retire do arquivo o nome do paciente, se isto for possível, ok?
    Envio no link que vc me passou anteriormente.
    Abraços,
       Célio
    
    Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    
    10 de Abril de 2010, 20:45
    
    Boa tarde Célio,
    Não encontrei o arquivo, você já subiu? Pode ficar tranquilo que removeremos as informações do paciente. Se você quiser subir em um espaço mais reservado, pode fazê-lo e enviar o link em particular, ok?
    Abraços,
    Tatiana
    
    Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
    
    14 de Abril de 2010, 9:09
    
    Oi Tatiana,
    Desculpe-me a demora. Estava em casa e o arquivo está aqui na clínica. Também não tinha visto seu post. Perdão.Tentei fazer o upload hoje mas, o arquivo ultrapassa o tamanho máximo permitido. Mesmo compactado. Há alguma outra alternativa?Abraços, Célio
    
    Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    
    14 de Abril de 2010, 9:32
    
    Olá Célio,
    Obrigada, não se preocupe.
    Por favor, crie uma pasta e suba o arquivo para:
    ftp://promed1:teste99@ftp.cti.gov.br
    Se você estiver utilizando Windows, sugiro que utilize o Windows Explorer (e não o Internet Explorer), para criar a pasta e subir o arquivo, ok?
    Por favor, me avise assim que tiver realizado o upload para que o arquivo seja baixado e apagado do servidor.
    Abraços,
    Tatiana
    
    Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
    
    14 de Abril de 2010, 14:35
    
    Oi Tatiana,
    Estava fazendo o up quando travou nos últimos 5 segundos. Esperei uma meia hora e não terminou. Cancelei a transferência. Não sei se o arquivo foi inteiro. Se vc não conseguiu baixar pelo Google, avise-me que tento de novo.Abraços, Célio
Cícero Moraes(usuário não autenticado)
10 de Abril de 2010, 1:19

Olá Célio! Estou escrevendo um tutorial descrevendo o processo de exportação e importação. Em alguns dias ficará pronto. Grande abraço!
- Célio Fukunaga(usuário não autenticado)
  
  10 de Abril de 2010, 16:31
  
  Valeu Cícero,
  É sempre bom ter o Cogitas3d dando uma força.
  Abraços,
  Célio
- Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
  
  10 de Abril de 2010, 20:54
  
  Tive a oportunidade ver o tutorial de Cícero "no forno" e está ficando excelente. Parabéns pelo excelente trabalho! Sem dúvidas muitas pessoas da Comunidade serão beneficiados por ele.
  Cícero, você toparia nos ajudar na elaboração do manual oficial do InVesalius? Todos que tiverem interesse em contribuir serão bem vindos, e daremos os devidos créditos tanto na distribuição do InVesalius quanto no wiki:
  svn.softwarepublico.gov.br/trac/invesalius/wiki/Credits
  Abraços,
  Tatiana
  - Cícero Moraes(usuário não autenticado)
    
    12 de Abril de 2010, 1:05
    
    Olá Tatiana! Já topei!O tutorial está pronto. Mandei ele para o site que publico meus tutoriais, vamos ver se passa :)Você vai dar uma olhada e ver se ele é publicável aqui.Tive umas idéias para mais documentos, sobre alguma dificuldades que o pessoal deve ter ao utilizar o Invesalius. Quanto ao Wiki vou ver como editar nele, se for fácil mando o documento essa semana ainda.Grande abraço!
    
    Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    
    14 de Abril de 2010, 9:36
    
    Bom dia Cícero!
    Que ótimo! A versão final do tutorial é aquela que você havia me enviado?
    Talvez precise de alguma revisão, que pretendo fazer hoje, ok? Será um prazer divulgar seu trabalho na Comunidade.
    Abraços,
    Tatiana

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