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Problemas ao criar um novo projeto com InVesalius 2.0.16

11 de Novembro de 2007, 11:31 , por Desconhecido - | Ninguém seguindo este artigo por enquanto.
Visualizado 19 vezes

Olá Comunidade,

Estou interessada na área de imagens médicas e resolvi testar o InVesalius. Desculpem pela pergunta iniciante, devo estar cometendo um erro simples.

Baixei um dos exemplos de entrada (caso com 109 imagens) do site e testei criar um novo projeto com o InVesalius versão 2.0.16. Os passos que segui foram:
- entrei na pasta onde estavam os arquivos deste exemplo, vendo as imagens em 2D;
- importei todas as fatias, selecionando com o botão direito e escolhendo a opção "Selecionar todas";
- selecionei a primeira caixinha que apareceu, deixando ela com um "certo";
- apertei Criar novo projeto
- e.... A janela do InVesalius simplesmente fechou!

Esta versão está com problemas para importar arquivos? O que fiz de errado?

Por favor, existe manual do usuário para esta nova versão? Quando deve sair?

Muito obrigada!

Nina

Autor: Nina Degremond


1313 comentários

  • 17f22521cca596b9c19b600ba0e15cb0?only path=false&size=50&d=404Elaine Pires(usuário não autenticado)
    16 de Novembro de 2007, 23:26

     

    O meu também está dando erro.

    A princípio não consegui criar um novo projeto. O botão CRIAR ficava sempre indisponível. Depois tentei abrir as imagens através de ABRIR. Deu certo, mas por pouco tempo.

    Deu erro no programa e ele fechou. Agora fecha em todos os casos, ao CRIAR PROJETO e ao ABRIR.

    Vou dar um Reset no computador. Talvez resolva.

     

    Até mais

    • 48dfb8d5a4a0459d4285c752af22e7cb?only path=false&size=50&d=404Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
      17 de Novembro de 2007, 10:43

       

      Olá Elaine,

      Qual versão você está testando?

      Quando você cria um novo projeto, há alguns passos básicos que devem ser seguidos. A princípio, o botão criar de fato está desabilitado, para que você efetue todos os passos anteriores necessários. Descreverei, a seguir, o passo a passo na criação de um novo projeto.

      [1] Seleção da pasta de interesse, onde estão os arquivos DICOM no sistema (seja localmente no computador (em geral unidade "C:"), ou no CD (muitas vezes unidade "D:")). Para este procedimento, escolhe-se as pastas que aparecem na árvore de diretórios, no lado superior esquerdo da tela de importação. Como resultado do sucesso desta operação, serão exibidas as imagens correspondentes na tela de pré-visualização, do lado direito da tela de importação.

      [2] Seleção das fatias de interesse, a partir da pasta escolhida. Para esta etapa, você tem basicamente duas opções: (a) selecionar imagem por imagem, quais serão usadas para a reconstrução ou (b) selecionar todas as imagens da pasta. No caso da opção (a), basta você clicar duas vezes sobre o nome da imagem de interessse (com o botão direito do mouse) - repetindo a operação para cada arquivo. Já no caso da opção (b), você deve clicar com o botão direito sobre a lista com o nome de imagens e selecionar a opção "Selecionar todas". Você verá quais arquivos foram selecionados para a importação examinando se o parâmetro "Importar" está com "Sim" ou com "Não". Após escolher as fatias de interesse, aperte o botão "Importar fatias".

      [3] Seleção da série de interesse. Após ter importado as fatias  de interesse (passo anterior), você verificará que irão aparecer na área "Séries", que fica ao lado esquerdo inferior, uma ou mais "caixinhas" (check box) com números ao lado. Este pré-processamento é realizado pois muitas vezes na hora da aquisição o radiologista salva em uma mesma pasta arquivos de tomadas diferentes - por exemplo imagens axiais misturadas com sagitais. Assim, o programa identifica automaticamente as séries de aquisição e as divide em partes, dando "rótulos" ou "números" para cada uma delas. Para analisar cada uma das séries geradas pela programa, você deve clicar sobre o número, com o botão direito do mouse. Fazendo isso, são listadas as imagens deste caso, na área inferior do lado direito. Após analisar cada uma das séries, você deve escolher a de interesse. Em geral escolhe-se a que possui mais fatias. Para escolher a série de interesse, deve-se clicar sobre a "caixinha" da série, ao lado esquerdo do número, de modo que ela apareça "checada" (com um certo em seu interior).

      [4] Criação de um novo projeto. Tendo-se executado os passos anteriores, o botão criar será habilitado. Então, bastará você clicar sobre este botão, com o botão esquerdo do mouse, para ter seu projeto criado (fazer a reconstrução de arquivos DICOM).

      Por favor, Elaine, envie dúvidas e informe problemas caso esse procedimento não funcionar.

      Abraços,

      Tatiana

      • 17f22521cca596b9c19b600ba0e15cb0?only path=false&size=50&d=404Elaine Pires(usuário não autenticado)
        17 de Novembro de 2007, 13:57

         

        É.. o problema realmente estava em mim.

         

        Consegui importar e trabalhar com as imagens.

        Valeu

        • 48dfb8d5a4a0459d4285c752af22e7cb?only path=false&size=50&d=404Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
          17 de Novembro de 2007, 16:21

           

          Que bom que você conseguiu agora! Esta parte de importação não é muito intuitiva. Se você tiver idéias de como melhorá-la, por favor, dê sugestões!

          Abraços!

          • 17f22521cca596b9c19b600ba0e15cb0?only path=false&size=50&d=404Elaine Pires(usuário não autenticado)
            17 de Novembro de 2007, 17:40

             

            Olha, acho que ficaria melhor de importar e criar o projeto se ao clicar com o botão direito do mouse nas imagens aparecesse as opções. Foi a primeira coisa que tentei fazer.

            No começo, selecionei todas as imagens desta forma pois apareceu a opção.

            Depois, quando as imagens selecionadas passam para "séries", o software poderia nos dar as opções sobre o que é possível fazer com as imagens da série onde dentre estas opções esteja CRIAR PROJETO.

            Será que deu p/ entender meu ponto de vista?

             

            • 48dfb8d5a4a0459d4285c752af22e7cb?only path=false&size=50&d=404Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
              21 de Novembro de 2007, 3:57

               

              Olá Elaine,

              Obrigada por suas sugestões! Acredito que entendemos seu ponto de vista e pretendemos em breve disponibilizar um instalador do InVesalius com a janela de importação um pouco mais operacional e intuitiva.

              Abraços,

              Tatiana

  • 17f22521cca596b9c19b600ba0e15cb0?only path=false&size=50&d=404Elaine Pires(usuário não autenticado)
    16 de Novembro de 2007, 23:48

     

    Bem,

    O problema continua.

    Não sei o que pode estar acontecendo. Não consigo criar nenhum projeto nem abrir imagens Dicom.

    Se alguém pudesse me ajudar, ficaria muito grata.

    Trabalho na Ressonância e Tomografia de um hospital de Brasília e gostaria de divulgar o software mas só farei isso quando conseguir fazer ele funcionar e aprender a utilizar

    Este software é de grande valia, ao meu ver, sobretudo por ser totalmente brasileiro.

    Parabéns!

    ----------

    Se for possível enviar uma cópia da ajuda para meu e-mail. elainebsb88@gmail.com

    Obrigada.

    -----------

    • 48dfb8d5a4a0459d4285c752af22e7cb?only path=false&size=50&d=404Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
      17 de Novembro de 2007, 10:14

       

      Prezadas Elaine e Nina,

      Desculpem pela demora em responder as mensagens de vocês.

      Primeiramente, muito obrigada por estarem utilizando o software InVesalius 2.0 e nos passando os erros. Esse é um passo muito importante para nossa equipe resolver os bugs.

      A versão 2.0.16 beta estava com um problema nos parâmetros de importação. Gostaria de pedir para vocês baixarem e instalarem a versão 2.0.18, da aba de downloads. Ela provavelmente irá funcionar para os casos de ambas - Nina e Elaine.

      Irei responder a mensagem de cada uma de vocês e tentarei avaliar os problemas que podem ter ocorrido. Ainda assim, caso depois da análise os problemas continuem, gostaria de pedir para vocês passarem os arquivos DICOM que vocês estão tentando reconstruir para mim, através do ftp do CenPRA, de modo que possamos reproduzir exatamente o que está ocorrendo e de forma que nossa equipe consiga sanar o problema.

      Atenciosamente,

      Tatiana

  • 48dfb8d5a4a0459d4285c752af22e7cb?only path=false&size=50&d=404Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
    17 de Novembro de 2007, 10:21

     

    Olá Nina,

    Seja bem vinda a área de imagens médicas e espero que o InVesalius possa lhe ajudar!

    Conforme mencionado na mensagem anterior, o InVesalius 2.0.16 estava com problemas nesta parte de importação de arquivos. Você não fez nada de errado. Todos os passos que você seguiu foram corretos. Por favor, teste a versão 2.0.18 e nos comunique se ocorrerem novos erros.

    Ainda não existe um manual de usuário para a segunda versão. Estamos nos organizando para elaborá-lo e em breve estaremos disponibilizando aqui no Portal. Por enquanto, há os vídeos em flash, disponíveis no wiki, por aqui. Pretendemos iniciar a elaboração do manual a partir do dia 2 de dezembro utilizando o Wiki da Comunidade, de modo que todos poderão contribuir com ele.

    Abraços,

    Tatiana

    • 8192bd811601934bf1d3b88632145b53?only path=false&size=50&d=404Adail Nunes Silva(usuário não autenticado)
      19 de Novembro de 2007, 17:40

       

      Ola! Tatiana, baixei a versão 2.018 e funcionou tanto a importação como a visualização, tive problemas apenas quando tentei utilizar a opção de segmentação, mas acredito que tenha sido memória insuficiente. Vou tentar outra vez e  avaliar...

      obrigado!

      Adail Nunes 

       

      • 48dfb8d5a4a0459d4285c752af22e7cb?only path=false&size=50&d=404Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
        21 de Novembro de 2007, 22:35

         

        Olá Adail,

        A segmentação foi otimizada na versão 2.0.19 beta, disponibilizada hoje aqui na Comunidade InVesalius. Com as adaptações que foram realizadas, problemas de memória insuficiente como o que você relatou não deverão ocorrer mais.

        Abraços,

        Tatiana

        • 8192bd811601934bf1d3b88632145b53?only path=false&size=50&d=404Adail Nunes Silva(usuário não autenticado)
          22 de Novembro de 2007, 16:19

           

          Oi Tatiana, ótimas as atualizações. EStou fazendo uns testes de segmentação e qualquer inconsistencia envio mensagem.

          abraços

          Adail

           

      • 48dfb8d5a4a0459d4285c752af22e7cb?only path=false&size=50&d=404Tatiana Al-Chueyr Pereira Martins(usuário não autenticado)
        21 de Novembro de 2007, 3:44

         

        Olá Adail,

        Estamos melhorando o desempenho da segmentação e ainda hoje devemos gerar um novo instalador (2.0.19). Com isso problemas de memória insuficiente devem ser contornados.

        Abraços,

        Tatiana

Tutorial passo-a-passo sobre uso do software InVesalius 3

17 de Abril de 2010, 11:45, por Desconhecido

Se você tem interesse em utilizar o software de reconstrução 3D de imagens médicas InVesalius, mas não sabe por onde começar, acesse já o tutorial escrito pelo designer Cícero Moraes:



InVesalius 3 Beta 2 disponível

6 de Março de 2010, 11:41, por Desconhecido

Para saber mais sobre o InVesalius 3.0.0 Beta 2, leia:
http://svn.softwarepublico.gov.br/trac/invesalius/wiki/releases/pt/changelog

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8 de Fevereiro de 2010, 9:57, por Desconhecido

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Trabalho acadêmico discute aplicação do OpenBRR ao InVesalius

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