- Aplicativo do SEI (ME/MEC)
- Integração Barramento PEN (ME)
- Protocolo Integrado (ME)
- Pesquisa Pública (CADE)
- Integração do SEI ao e-OUV (CGU)
- SEI Peticionamento e Intimação Eletrônicos (Anatel)
- SEI Litigioso (Anatel)
- SEI Utilidades/Controle de Desempenho (Anatel)
- SEI Relacionamento Institucional (Anatel)
- Webservice Complementar do SEI (Anatel)
- OCR Server (Anatel) - não é módulo do SEI, mas é importante para melhor desempenho no processamento de OCR de PDFs de digitalização
- SEI em Números (Anatel) - não é módulo do SEI, mas disponibiliza queries de banco importantes para construção de Painéis/Dashboards
- SEI-Broker (ANS)
- Estatísticas - Módulo coletor de estatísticas do SEI. Alimenta painel da comunidade com informações estatísticas gerais