Estou usando o Firefox 2.0.0.8, e todas as telas do sitema apresentavam problemas com acentuação relacionados a codificação. A solução adotada foi colocar as linhas:
   mb_http_output("UTF-8");
   ob_start("mb_output_handler");

No inicio de varios arquivo (antes do session_start). Os seguintes arquivos tiveram essa adição:

Login
   /index.php

Contra
      Módulos
         /classes/contra/sistemas.php
         /classes/contra/menus.php
         /classes/contra/ajuda.php
         /classes/contra/mensagens.php
         /classes/contra/variaveis.php

      Acessos
         /classes/contra/caduser.php
         /classes/contra/usuarios.php
         /classes/contra/perfis.php
         /classes/contra/acessos.php
         /classes/contra/alterasenha.php

      Relatórios
         /classes/contra/frmfiltlog.php

Sisau
   /classes/sisau/direcionamento.php 

   Cadastros
      /classes/sisau/atendentes.php

      /classes/sisau/clsdiagnostico.php
      /classes/sisau/diagnostico.php
      /classes/sisau/divisao.php

      /classes/sisau/municipios.php
      /classes/sisau/tpserv.php
      /classes/sisau/unidades.php
      /classes/sisau/coordenacao.php

   Movimentações
      /classes/sisau/atendimento_rapido.php
      /classes/sisau/direcionamento.php

      /classes/sisau/gerencia.php
      /classes/sisau/chefe_divisao.php


   Relatórios
      /classes/sisau/pesquisa_atendimento.php
      /classes/sisau/consolidados.php
      /classes/sisau/relcruzado.php

Saci
   Cadastros
      /classes/saci/modelos.php
      /classes/saci/arquivomidia.php
      /classes/saci/cadplvchave.php
      /classes/saci/tpconteudo.php
      /classes/saci/grupos.php
      /classes/saci/contatos.php

   Gerenciamento
      /classes/saci/dominios.php
      /classes/saci/secoes.php
      /classes/saci/cadconteudo.php
      /classes/saci/abrangencia.php
      /classes/saci/liberacaoconteudo.php
      /classes/saci/banner.php

   Ajuda
       /bibliotecas/php/ajuda.php

   Sobre
      /bibliotecas/php/sobre.php

Referencias:
Briguinha Boba Com O Utf-8, pra variar problemas na acentuação,
http://forum.wmonline.com.br/index.php?s=41af9b88ef0fee1e5378170485dbf8f3&showtopic=157669&st=0&p=771966&#entry771966

Autor: Tiago Barabasz