Commit 505bbb738cb8b00a2b6ba8189e87fa9ac887fdef

Authored by Paulo Henrique Junqueira Amorim
2 parents 28c2d68b d2292a30
Exists in user_guide_en

Merge branch 'user_guide_en' of https://github.com/paulojamorim/invesalius3 into user_guide_en

Showing 1 changed file with 57 additions and 71 deletions   Show diff stats
docs/user_guide_en_source/cap_segmen.tex
1 -\chapter{Segmentação} 1 +\chapter{Segmentation}
2 2
3 -Para selecionar um determinado tipo de tecido da imagem, é utilizado o recurso de  
4 -segmentação, disponível no InVesalius. 3 +To select a certain type of tissue from an image it's used the segmentation feature at InVesalius.
5 4
6 -\section{Limiar (\textit{Threshold})} 5 +\section{Threshold}
7 6
8 -Limiar é uma técnica de segmentação de imagens que permite selecionar da imagem somente  
9 -os \textit{pixels} cuja intensidade está dentro de um limiar definido pelo usuário.  
10 -O limiar é definido por dois números, limiares inicial e final, também conhecidos como  
11 -\textit{thresholds} mínimo e máximo. Como referência para a definição, é utilizada a  
12 -escala de Hounsfield (tabela \ref{tab:escala_hounsfield}). 7 +Limiar é uma técnica de segmentação de imagens que permite selecionar da imagem somente os \textit{pixels} cuja intensidade está dentro de um limiar definido pelo usuário. O limiar é definido por dois números, limiares inicial e final, também conhecidos como \textit{thresholds} mínimo e máximo. Como referência para a definição, é utilizada a escala de Hounsfield (tabela \ref{tab:escala_hounsfield}).
13 8
14 -A segmentação é acionada no painel situado no lado esquerdo da interface do InVesalius,  
15 -no item \textbf{2. Selecione a região de interesse} (figura \ref{fig:region_selection}). 9 +In thresholding segmentation technique only the \textit{pixels} whose intensity is inside threshold range defined by the user. Threshold is defined by two number, the initial and final threshold, also known as minimum and maximum threshold. ...
  10 +
  11 +Thresholding segmentation is located at the InVesalius left-panel, item \textbf{2. Select region of interest} (figure~\ref{fig:region_selection}).
16 12
17 \begin{figure}[!htb] 13 \begin{figure}[!htb]
18 \centering 14 \centering
19 \includegraphics[scale=0.6]{segmentation_threshold_window_left_pt.png} 15 \includegraphics[scale=0.6]{segmentation_threshold_window_left_pt.png}
20 -\caption{Seleção de região de interesse} 16 +\caption{Select region of interest}
21 \label{fig:region_selection} 17 \label{fig:region_selection}
22 \end{figure} 18 \end{figure}
23 19
24 -Antes de iniciar a segmentação, é necessário configurar uma máscara. A máscara é uma  
25 -imagem com a região selecionada colorida e sobreposta à imagem original. Veja a figura  
26 -(\ref{fig:region_selection_masc}) 20 +Before starting segment it's necessary to configure a mask. A mask is a image overlayed to exam image where the selected regions are colored. See figure~\ref{fig:region_selection_masc}
27 21
28 \begin{figure}[!htb] 22 \begin{figure}[!htb]
29 \centering 23 \centering
30 \includegraphics[scale=0.4]{segmentation_threshold_axial_pt.png} 24 \includegraphics[scale=0.4]{segmentation_threshold_axial_pt.png}
31 -\caption{Máscara (regiões em amarelo)} 25 +\caption{Mask - selected region in yellow.}
32 \label{fig:region_selection_masc} 26 \label{fig:region_selection_masc}
33 \end{figure} 27 \end{figure}
34 28
35 -Para alterar o limiar, pode-se utilizar a barra que representa os níveis de cinza na imagem (figura  
36 -\ref{fig:region_selection_bar}). É possível alterar o limiar inicial usando o controle deslizante  
37 -\textit{esquerdo} da barra. De forma semelhante, o limiar final pode ser alterado por meio do controle  
38 -\textit{direito}. É possível, ainda, digitar diretamente os valores desejados nas respectivas caixas  
39 -de texto nas extremidades da barra. Com a alteração dos valores, automaticamente a máscara será atualizada,  
40 -pintando somente os \textit{pixels} com intensidade dentro da faixa determinada. 29 +To change the threshold you may use the control that represents the image grayscale (figure~\ref{fig:region_selection_bar}). Move the \textit{left} sliding control to change the initial threshold. Move the \textit{right} sliding control to change the final threshold. It's also possible to to digit the desired threshold values in the text boxes in the left and right side of the thresholding control. Changing the thresholding values, automatically the mask will be updated, showing with a color the \textit{pixel} that are inside the thresholding range.
  30 +
41 31
42 \begin{figure}[!htb] 32 \begin{figure}[!htb]
43 \centering 33 \centering
44 \includegraphics[scale=0.75]{segmentation_threshold_bar.png} 34 \includegraphics[scale=0.75]{segmentation_threshold_bar.png}
45 -\caption{Seleção dos \textit{pixels} com intensidade entre 226 e 3021 (Osso)} 35 +\caption{Selecting the \textit{pixels} with intensity between $226$ and $3021$ (Bone)}
46 \label{fig:region_selection_bar} 36 \label{fig:region_selection_bar}
47 \end{figure} 37 \end{figure}
48 38
49 -Também existem valores pré-definidos de limiar de acordo com alguns tipos de tecido, como mostra a  
50 -figura \ref{fig:limiar_presets}. Basta selecionar o tecido desejado e a máscara será atualizada  
51 -automaticamente. 39 +It's also possible to select some predefined thresholding values based on some type of tissues, like displayed in the figure~\ref{fig:limiar_presets}. Just select the desired tissue and the mask automatically updated.
52 40
53 \begin{figure}[!htb] 41 \begin{figure}[!htb]
54 \centering 42 \centering
55 \includegraphics[scale=0.65]{segmentation_threshold_presets_pt.png} 43 \includegraphics[scale=0.65]{segmentation_threshold_presets_pt.png}
56 -\caption{Caixa de seleção de valores pré-definidos de limiar} 44 +\caption{Selection list with some predefined thresholding values.}
57 \label{fig:limiar_presets} 45 \label{fig:limiar_presets}
58 \end{figure} 46 \end{figure}
59 47
60 -A tabela \ref{tab:limiar} mostra a faixa de níveis de cinza de acordo com o tipo de tecido ou material. 48 +The table~\ref{tab:limiar} show thresholding values according to some tissues or materials.
61 49
62 \begin{table}[h] 50 \begin{table}[h]
63 \centering 51 \centering
64 -\caption{Limiares pré-definidos para alguns materiais} 52 +\caption{Predefined thresholding values to some materials}
65 \begin{tabular}{lcc}\\ 53 \begin{tabular}{lcc}\\
66 \hline % este comando coloca uma linha na tabela 54 \hline % este comando coloca uma linha na tabela
67 -Material & Limiar inicial & Limiar final\ 55 +Material & Initial threshold & Final Threshold\
68 \hline 56 \hline
69 \hline 57 \hline
70 -Esmalte (Adulto) & 1553 & 2850\\  
71 -Esmalte (Criança) & 2042 & 3021\\  
72 -Osso & 226 & 3021\\  
73 -Osso Compacto (Adulto) & 662 & 1988\\  
74 -Osso Compacto (Criança) & 586 & 2198\\  
75 -Osso Esponjoso (Adulto) & 148 & 661\\  
76 -Osso Esponjoso (Criança) & 156 & 585\\  
77 -Personalizado & Def. Usuário & Def. Usuário\\  
78 -Tecido Epitelial (Adulto) & -718 & -177\\  
79 -Tecido Epitelial (Criança) & -766 & -202\\  
80 -Tecido Gorduroso (Adulto) & -205 & -51\\  
81 -Tecido Gorduroso (Criança) & -212 & -72\\  
82 -Tecido Muscular (Adulto) & -5 & 135\\  
83 -Tecido Muscular (Criança) & -25 & 139\\  
84 -Tecidos Moles & -700 & 225\\ 58 +Bone & 226 & 3021\\
  59 +Compact Bone (Adult) & 662 & 1988\\
  60 +Compact Bone (Child) & 586 & 2198\\
  61 +Custom & User Def. & User Def.\\
  62 +Enamel (Adult) & 1553 & 2850\\
  63 +Enamel (Child) & 2042 & 3021\\
  64 +Fat Tissue (Adult) & -205 & -51\\
  65 +Fat Tissue (Child) & -212 & -72\\
  66 +Muscle Tissue (Adult) & -5 & 135\\
  67 +Muscle Tissue (Child) & -25 & 139\\
  68 +Skin Tissue (Adult) & -718 & -177\\
  69 +Skin Tissue (Child) & -766 & -202\\
  70 +Soft Tissue & -700 & 225\\
  71 +Spongial Bone (Adult) & 148 & 661\\
  72 +Spongial Bone (Child) & 156 & 585\\
85 \hline 73 \hline
86 \end{tabular} 74 \end{tabular}
87 \label{tab:limiar} 75 \label{tab:limiar}
88 \end{table} 76 \end{table}
89 \newpage 77 \newpage
90 78
91 -A tabela \ref{tab:limiar} é mais indicada para tomógrafos médicos. Nos tomógrafos odontológicos,  
92 -comumente as faixas de níveis de cinza são maiores e não regulares. Assim, é necessário utilizar  
93 -a barra de limiar (figura \ref{fig:region_selection_bar}) para ajustá-las. 79 +The table~\ref{tab:limiar} is indicated to images obtained from medical tomographs. The range of gray values from images obtained from odontological tomographs are greater and non-regular. Thus, it's necessary to use sliding control (figure~\ref{fig:region_selection_bar}) to adjust the thresholding values.
94 80
95 Caso se deseje criar uma nova máscara, basta clicar no ícone do atalho presente no painel, dentro 81 Caso se deseje criar uma nova máscara, basta clicar no ícone do atalho presente no painel, dentro
96 -do item \textbf{2. Selecione a região de interesse}. Veja a figura \ref{fig:shortcut_new_mask}. 82 +do item \textbf{2. Selecione a região de interesse}. Veja a figure \ref{fig:shortcut_new_mask}.
97 83
98 \begin{figure}[!htb] 84 \begin{figure}[!htb]
99 \centering 85 \centering
@@ -102,7 +88,7 @@ do item \textbf{2. Selecione a região de interesse}. Veja a figura \ref{fig:sho @@ -102,7 +88,7 @@ do item \textbf{2. Selecione a região de interesse}. Veja a figura \ref{fig:sho
102 \label{fig:shortcut_new_mask} 88 \label{fig:shortcut_new_mask}
103 \end{figure} 89 \end{figure}
104 90
105 -Clicando-se nesse atalho, uma nova janela será apresentada (figura \ref{fig:create_new_mask}). 91 +Clicando-se nesse atalho, uma nova janela será apresentada (figure \ref{fig:create_new_mask}).
106 Selecione a faixa de limiar desejada e clique em \textbf{OK}. 92 Selecione a faixa de limiar desejada e clique em \textbf{OK}.
107 93
108 \begin{figure}[!htb] 94 \begin{figure}[!htb]
@@ -118,7 +104,7 @@ Com uma máscara de segmentação configurada, é possível gerar a superfície @@ -118,7 +104,7 @@ Com uma máscara de segmentação configurada, é possível gerar a superfície
118 às imagens em estudo. A superfície será composta por uma malha de triângulos. O próximo capítulo 104 às imagens em estudo. A superfície será composta por uma malha de triângulos. O próximo capítulo
119 trará maiores detalhes sobre esse tipo de superfície. 105 trará maiores detalhes sobre esse tipo de superfície.
120 106
121 -Para iniciar a geração, clique no botão \textbf{Gerar superfície} (figura \ref{fig:generate_surface}). 107 +Para iniciar a geração, clique no botão \textbf{Gerar superfície} (figure \ref{fig:generate_surface}).
122 Caso já exista uma superfície gerada previamente, pode-se substituí-la pela nova. Para isso, basta 108 Caso já exista uma superfície gerada previamente, pode-se substituí-la pela nova. Para isso, basta
123 selecionar, \textbf{antes} da geração, a opção \textbf{Sobrescrever anterior}. 109 selecionar, \textbf{antes} da geração, a opção \textbf{Sobrescrever anterior}.
124 110
@@ -130,7 +116,7 @@ selecionar, \textbf{antes} da geração, a opção \textbf{Sobrescrever anterior @@ -130,7 +116,7 @@ selecionar, \textbf{antes} da geração, a opção \textbf{Sobrescrever anterior
130 \end{figure} 116 \end{figure}
131 117
132 Após alguns instantes, a superfície será exibida na janela de visualização 3D do InVesalius 118 Após alguns instantes, a superfície será exibida na janela de visualização 3D do InVesalius
133 -(figura \ref{fig:surface}). 119 +(figure \ref{fig:surface}).
134 120
135 \begin{figure}[!htb] 121 \begin{figure}[!htb]
136 \centering 122 \centering
@@ -147,7 +133,7 @@ Há situações em que a segmentação por limiar não é eficiente, pois ela é @@ -147,7 +133,7 @@ Há situações em que a segmentação por limiar não é eficiente, pois ela é
147 todo das imagens. Para aplicar a segmentação a imagens isoladas, pode-se usar a segmentação 133 todo das imagens. Para aplicar a segmentação a imagens isoladas, pode-se usar a segmentação
148 manual. Com ela, é possível adicionar ou apagar uma determinada região da imagem que foi 134 manual. Com ela, é possível adicionar ou apagar uma determinada região da imagem que foi
149 segmentada por limiar. No entanto, a segmentação manual requer maior conhecimento de anatomia 135 segmentada por limiar. No entanto, a segmentação manual requer maior conhecimento de anatomia
150 -por parte do usuário. Para utilizá-la, é necessário clicar em \textbf{Edição Manual} (figura \ref{fig:advanced_edition}) para abrir o painel de edição. 136 +por parte do usuário. Para utilizá-la, é necessário clicar em \textbf{Edição Manual} (figure \ref{fig:advanced_edition}) para abrir o painel de edição.
151 137
152 \begin{figure}[!htb] 138 \begin{figure}[!htb]
153 \centering 139 \centering
@@ -156,7 +142,7 @@ por parte do usuário. Para utilizá-la, é necessário clicar em \textbf{Ediçà @@ -156,7 +142,7 @@ por parte do usuário. Para utilizá-la, é necessário clicar em \textbf{EdiçÃ
156 \label{fig:advanced_edition} 142 \label{fig:advanced_edition}
157 \end{figure} 143 \end{figure}
158 144
159 -O painel de edição aparece como mostra a figura \ref{fig:edition_slices_ref}. 145 +O painel de edição aparece como mostra a figure \ref{fig:edition_slices_ref}.
160 146
161 \begin{figure}[!htb] 147 \begin{figure}[!htb]
162 \centering 148 \centering
@@ -168,7 +154,7 @@ O painel de edição aparece como mostra a figura \ref{fig:edition_slices_ref}. @@ -168,7 +154,7 @@ O painel de edição aparece como mostra a figura \ref{fig:edition_slices_ref}.
168 Há dois tipos de pincel disponíveis para desenho: um em forma de círculo e outro em forma 154 Há dois tipos de pincel disponíveis para desenho: um em forma de círculo e outro em forma
169 de quadrado. Para escolher um pincel, clique no triângulo da lista de seleção para abri-la 155 de quadrado. Para escolher um pincel, clique no triângulo da lista de seleção para abri-la
170 e, a seguir, clique sobre o tipo escolhido. O pincel selecionado aparece no painel como 156 e, a seguir, clique sobre o tipo escolhido. O pincel selecionado aparece no painel como
171 -mostra a figura \ref{fig:brush_type}. 157 +mostra a figure \ref{fig:brush_type}.
172 158
173 \begin{figure}[!htb] 159 \begin{figure}[!htb]
174 \centering 160 \centering
@@ -179,7 +165,7 @@ mostra a figura \ref{fig:brush_type}. @@ -179,7 +165,7 @@ mostra a figura \ref{fig:brush_type}.
179 165
180 \newpage 166 \newpage
181 167
182 -Também é possível alterar o diâmetro do pincel, conforme mostra a figura \ref{fig:select_diameter}. 168 +Também é possível alterar o diâmetro do pincel, conforme mostra a figure \ref{fig:select_diameter}.
183 169
184 \begin{figure}[!htb] 170 \begin{figure}[!htb]
185 \centering 171 \centering
@@ -196,7 +182,7 @@ seguintes:\\ @@ -196,7 +182,7 @@ seguintes:\\
196 \textbf{Limiar}, para remover uma região que está fora do limiar e foi selecionada, ou pintar 182 \textbf{Limiar}, para remover uma região que está fora do limiar e foi selecionada, ou pintar
197 uma região que está dentro do limiar e não foi selecionada.\\ 183 uma região que está dentro do limiar e não foi selecionada.\\
198 184
199 -A figura \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operações do pincel: 185 +A figure \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operações do pincel:
200 186
201 \begin{figure}[!htb] 187 \begin{figure}[!htb]
202 \centering 188 \centering
@@ -205,7 +191,7 @@ A figura \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operações do pin @@ -205,7 +191,7 @@ A figura \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operações do pin
205 \label{fig:select_brush_operations} 191 \label{fig:select_brush_operations}
206 \end{figure} 192 \end{figure}
207 193
208 -A figura \ref{fig:noise_amalgaman} mostra um caso em que algumas imagens contêm ruídos 194 +A figure \ref{fig:noise_amalgaman} mostra um caso em que algumas imagens contêm ruídos
209 causados pela presença de prótese dentária de amálgama no paciente. Observe os "raios" 195 causados pela presença de prótese dentária de amálgama no paciente. Observe os "raios"
210 saindo da região da arcada dentária. Isso ocorre porque a máscara de segmentação também 196 saindo da região da arcada dentária. Isso ocorre porque a máscara de segmentação também
211 seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar para osso. 197 seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar para osso.
@@ -217,7 +203,7 @@ seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar par @@ -217,7 +203,7 @@ seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar par
217 \label{fig:noise_amalgaman} 203 \label{fig:noise_amalgaman}
218 \end{figure} 204 \end{figure}
219 205
220 -A figura \ref{fig:surface_amagaman} ilustra como é uma superfície gerada a partir dessa 206 +A figure \ref{fig:surface_amagaman} ilustra como é uma superfície gerada a partir dessa
221 segmentação. 207 segmentação.
222 208
223 \begin{figure}[!htb] 209 \begin{figure}[!htb]
@@ -240,7 +226,7 @@ Em casos como este, utilizando o editor, com o pincel na opção \textbf{Apagar} @@ -240,7 +226,7 @@ Em casos como este, utilizando o editor, com o pincel na opção \textbf{Apagar}
240 botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado enquanto o \textbf{arrasta} sobre a região que 226 botão \textbf{esquerdo} do mouse pressionado enquanto o \textbf{arrasta} sobre a região que
241 deseja remover (na máscara). 227 deseja remover (na máscara).
242 228
243 -A figura \ref{fig:editor_amalgaman} mostra a imagem da figura \ref{fig:noise_amalgaman} após 229 +A figure \ref{fig:editor_amalgaman} mostra a imagem da figure \ref{fig:noise_amalgaman} após
244 edição. 230 edição.
245 231
246 \begin{figure}[!htb] 232 \begin{figure}[!htb]
@@ -258,10 +244,10 @@ edição. @@ -258,10 +244,10 @@ edição.
258 \end{figure} 244 \end{figure}
259 245
260 \newpage 246 \newpage
261 -Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figura 247 +Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figure
262 \ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Como houve edição, ao clicar em \textbf{Criar superfície}, será 248 \ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Como houve edição, ao clicar em \textbf{Criar superfície}, será
263 requerido se deseja gerar a superfície a partir do método \textbf{binário} ou utilizando o método de suavização 249 requerido se deseja gerar a superfície a partir do método \textbf{binário} ou utilizando o método de suavização
264 -\textbf{Suavização sensível ao contexto} (figura \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfície. 250 +\textbf{Suavização sensível ao contexto} (figure \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfície.
265 Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}. 251 Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}.
266 %\ref{fig:generate_surface}). 252 %\ref{fig:generate_surface}).
267 253
@@ -275,7 +261,7 @@ Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}. @@ -275,7 +261,7 @@ Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}.
275 261
276 \section{Watershed} 262 \section{Watershed}
277 263
278 -A segmentação por watershed, necessita que o usuário indique através de marcadores o que é objeto e o que é fundo. Esse método de segmentação interpreta a imagem como uma bacia hidrográfica, sendo que os valores dos níveis de cinza são as altitudes, formando vales e montanhas, os marcadores de fundo e objeto são as fontes de água. Essas fontes de água, começam "encher" essa bacia hidrográfica até se encontrarem, assim segmentando a imagem em fundo e objeto. Para utilizá-la, é necessário clicar na opção \textbf{Watershed} para abrir o painel de edição (figura~\ref{fig:watershed_painel}). 264 +A segmentação por watershed, necessita que o usuário indique através de marcadores o que é objeto e o que é fundo. Esse método de segmentação interpreta a imagem como uma bacia hidrográfica, sendo que os valores dos níveis de cinza são as altitudes, formando vales e montanhas, os marcadores de fundo e objeto são as fontes de água. Essas fontes de água, começam "encher" essa bacia hidrográfica até se encontrarem, assim segmentando a imagem em fundo e objeto. Para utilizá-la, é necessário clicar na opção \textbf{Watershed} para abrir o painel de edição (figure~\ref{fig:watershed_painel}).
279 265
280 \begin{figure}[!htb] 266 \begin{figure}[!htb]
281 \centering 267 \centering
@@ -298,7 +284,7 @@ seguintes: @@ -298,7 +284,7 @@ seguintes:
298 284
299 A opção "\textbf{Sobrescrever máscara}" é utilizada quando deseja-se que a máscara selecionada seja substituída pelo resultado da segmentação. Já a opção "\textbf{Considerar brilho e contraste}" é utilizada para o algoritmo levar em consideração a imagem que está sendo visualizada, assim é possível alterar o brilho e contraste e obter resultados melhores de segmentação. 285 A opção "\textbf{Sobrescrever máscara}" é utilizada quando deseja-se que a máscara selecionada seja substituída pelo resultado da segmentação. Já a opção "\textbf{Considerar brilho e contraste}" é utilizada para o algoritmo levar em consideração a imagem que está sendo visualizada, assim é possível alterar o brilho e contraste e obter resultados melhores de segmentação.
300 286
301 -É possível configurar o método de \textit{Watershed} através do botão ao lado esquerdo do painel (figura~\ref{fig:watershed_conf}). Ao abrir essa opção é mostrada a janela~\ref{fig:watershed_janela_conf}. A opção método permite alterar o algoritmo que é utilizado na segmentação, existe o Wartershed convencional e o Watershed baseado no método de IFT (\textit{Image Forest Transform}), em alguns casos, como segmentação de cérebro ele apresenta melhor resultado. 287 +É possível configurar o método de \textit{Watershed} através do botão ao lado esquerdo do painel (figure~\ref{fig:watershed_conf}). Ao abrir essa opção é mostrada a janela~\ref{fig:watershed_janela_conf}. A opção método permite alterar o algoritmo que é utilizado na segmentação, existe o Wartershed convencional e o Watershed baseado no método de IFT (\textit{Image Forest Transform}), em alguns casos, como segmentação de cérebro ele apresenta melhor resultado.
302 288
303 A conectividade dos pixels que serão levados em consideração, pode ser alterados, no caso 2D, é possível selecionar conectividade $4$ e $8$, já no caso 3D pode-se selecionar $6$,$18$ ou $26$. O valor "\textbf{Sigma da gaussiana}" é alterado para o método suavizar mais ou menos a imagem ao aplicar a segmentação, valores altos tendem a deixar a imagem mais suavizada e consequentemente o algoritmo seleciona menos detalhes e ruídos. 289 A conectividade dos pixels que serão levados em consideração, pode ser alterados, no caso 2D, é possível selecionar conectividade $4$ e $8$, já no caso 3D pode-se selecionar $6$,$18$ ou $26$. O valor "\textbf{Sigma da gaussiana}" é alterado para o método suavizar mais ou menos a imagem ao aplicar a segmentação, valores altos tendem a deixar a imagem mais suavizada e consequentemente o algoritmo seleciona menos detalhes e ruídos.
304 290
@@ -316,9 +302,9 @@ A conectividade dos pixels que serão levados em consideração, pode ser altera @@ -316,9 +302,9 @@ A conectividade dos pixels que serão levados em consideração, pode ser altera
316 \label{fig:watershed_janela_conf} 302 \label{fig:watershed_janela_conf}
317 \end{figure} 303 \end{figure}
318 304
319 -Existe a opção do método ser executado para todo o volume (expandir para outras fatias), para isso, após ser inserido os marcadores de objeto e de fundo, é necessário clicar no botão \textbf{Expandir watershed para 3D}, localizado no painel. Na figura~\ref{fig:watershed_2d} é exibido o resultado da segmentação do cérebro em uma fatia (2D), já na figura~\ref{fig:watershed_3d} é mostrado a expansão para todo o volume (3D). 305 +Existe a opção do método ser executado para todo o volume (expandir para outras fatias), para isso, após ser inserido os marcadores de objeto e de fundo, é necessário clicar no botão \textbf{Expandir watershed para 3D}, localizado no painel. Na figure~\ref{fig:watershed_2d} é exibido o resultado da segmentação do cérebro em uma fatia (2D), já na figure~\ref{fig:watershed_3d} é mostrado a expansão para todo o volume (3D).
320 306
321 -Ainda na figura~\ref{fig:watershed_2d}, podemos visualizar os marcadores de objeto em verde claro, os marcadores de fundo em vermelho e a máscara em verde transparente cobrindo a região selecionada (resultado). 307 +Ainda na figure~\ref{fig:watershed_2d}, podemos visualizar os marcadores de objeto em verde claro, os marcadores de fundo em vermelho e a máscara em verde transparente cobrindo a região selecionada (resultado).
322 308
323 \begin{figure}[!htb] 309 \begin{figure}[!htb]
324 \centering 310 \centering
@@ -336,7 +322,7 @@ Ainda na figura~\ref{fig:watershed_2d}, podemos visualizar os marcadores de obje @@ -336,7 +322,7 @@ Ainda na figura~\ref{fig:watershed_2d}, podemos visualizar os marcadores de obje
336 322
337 \section{Crescimento de região} 323 \section{Crescimento de região}
338 324
339 -A técnica de segmentação por crescimento de região é ativada no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Segmentação}, por último \textbf{Crescimento de região} (figura~\ref{fig:menu_segmentation_region_growing}). Inicialmente deve-se selecionar a configuração entre \textbf{2D - Fatia atual} ou \textbf{3D - Todas as fatias}, também é necessário selecionar a conectividade do crescimento entre $4$ ou $8$ para o 2D e $6$, $18$ ou $26$ para 3D. Por último é necessário selecionar o método, entre \textbf{Dinâmico, Limiar ou Confidência} (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic}). 325 +A técnica de segmentação por crescimento de região é ativada no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Segmentação}, por último \textbf{Crescimento de região} (figure~\ref{fig:menu_segmentation_region_growing}). Inicialmente deve-se selecionar a configuração entre \textbf{2D - Fatia atual} ou \textbf{3D - Todas as fatias}, também é necessário selecionar a conectividade do crescimento entre $4$ ou $8$ para o 2D e $6$, $18$ ou $26$ para 3D. Por último é necessário selecionar o método, entre \textbf{Dinâmico, Limiar ou Confidência} (figure~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic}).
340 326
341 \begin{figure}[!htb] 327 \begin{figure}[!htb]
342 \centering 328 \centering
@@ -355,7 +341,7 @@ A técnica de segmentação por crescimento de região é ativada no menu \textb @@ -355,7 +341,7 @@ A técnica de segmentação por crescimento de região é ativada no menu \textb
355 A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botão direito} do mouse, os pixels vizinhos que satisfazem as condições indicadas anteriormente são selecionados. Cada método leva em consideração diferentes condições, a seguir são apresentadas as diferenças entre cada método: 341 A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botão direito} do mouse, os pixels vizinhos que satisfazem as condições indicadas anteriormente são selecionados. Cada método leva em consideração diferentes condições, a seguir são apresentadas as diferenças entre cada método:
356 342
357 \begin{itemize} 343 \begin{itemize}
358 - \item \textbf{Dinâmico}: Esse método captura o valor do pixel que foi clicado, levando em consideração o desvio para baixo (min) e desvio para cima (max). A opção \textbf{Considerar o brilho e contraste} é ativada por padrão, essa opção permite levar em consideração os valores de níveis de cinza que são exibidos e/ou ajustados na opção brilho e contraste. Ao desativar essa opção será levado em consideração os valores de cinza gravados na imagem (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}). 344 + \item \textbf{Dinâmico}: Esse método captura o valor do pixel que foi clicado, levando em consideração o desvio para baixo (min) e desvio para cima (max). A opção \textbf{Considerar o brilho e contraste} é ativada por padrão, essa opção permite levar em consideração os valores de níveis de cinza que são exibidos e/ou ajustados na opção brilho e contraste. Ao desativar essa opção será levado em consideração os valores de cinza gravados na imagem (figure~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}).
359 345
360 \begin{figure}[!htb] 346 \begin{figure}[!htb]
361 \centering 347 \centering
@@ -364,7 +350,7 @@ A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botà @@ -364,7 +350,7 @@ A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botÃ
364 \label{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter} 350 \label{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}
365 \end{figure} 351 \end{figure}
366 352
367 - \item \textbf{Limiar}: O método limiar selecionará os pixels cuja a vizinhança estejam dentro do valor mínimo e máximo (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_limiar}). 353 + \item \textbf{Limiar}: O método limiar selecionará os pixels cuja a vizinhança estejam dentro do valor mínimo e máximo (figure~\ref{fig:segmentation_region_growing_limiar}).
368 354
369 \begin{figure}[!htb] 355 \begin{figure}[!htb]
370 \centering 356 \centering
@@ -373,7 +359,7 @@ A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botà @@ -373,7 +359,7 @@ A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botÃ
373 \label{fig:segmentation_region_growing_limiar} 359 \label{fig:segmentation_region_growing_limiar}
374 \end{figure} 360 \end{figure}
375 361
376 - \item \textbf{Confidência}: O método (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_confidence_parameter}) 362 + \item \textbf{Confidência}: O método (figure~\ref{fig:segmentation_region_growing_confidence_parameter})
377 363
378 \begin{figure}[!htb] 364 \begin{figure}[!htb]
379 \centering 365 \centering
@@ -383,4 +369,4 @@ A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botà @@ -383,4 +369,4 @@ A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botÃ
383 \end{figure} 369 \end{figure}
384 370
385 371
386 -\end{itemize}  
387 \ No newline at end of file 372 \ No newline at end of file
  373 +\end{itemize}