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Authored by Paulo Henrique Junqueira Amorim
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  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -20,8 +20,31 @@ Fábio de Souza Azevedo
20 20 \\
21 21  
22 22  
  23 +André Salles Cunha Peres (Neuronavegador)
  24 +
  25 +\href{mailto:peres.asc@gmail.com}{peres.asc@gmail.com}
  26 +\\
  27 +
  28 +Victor Hugo (Neuronavegador)
  29 +
  30 +\href{mailto:victorhos@hotmail.com}{victorhos@hotmail.com}
  31 +\\
  32 +
  33 +
  34 +Renan Matsuda (Neuronavegador)
  35 +
  36 +\href{mailto:renan\_hiroshi@hotmail.com}{renan\_hiroshi@hotmail.com}
  37 +\\
  38 +
  39 +
  40 +Oswaldo Baffa Filho (Neuronavegador)
  41 +
  42 +\href{mailto:baffa@usp.br}{baffa@usp.br}
  43 +\\
  44 +
23 45 Jorge Vicente Lopes da Silva
24 46  
25 47  
26 48 \href{mailto:jorge.silva@cti.gov.br}{jorge.silva@cti.gov.br}
27 49 \\
  50 +
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_cust.tex
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -20,7 +20,7 @@ visualização das imagens, conforme mostra a figura \ref{fig:closed_tool_menu}.
20 20  
21 21 \begin{figure}[!htb]
22 22 \centering
23   -\includegraphics[scale=0.4]{closed_tool_menu}
  23 +\includegraphics[scale=0.4]{window_mpr_not_painels_pt.png}
24 24 \caption{Menu lateral ocultado}
25 25 \label{fig:closed_tool_menu}
26 26 \end{figure}
... ... @@ -49,7 +49,7 @@ direito da tela do InVesalius.
49 49  
50 50 \begin{figure}[!htb]
51 51 \centering
52   -\includegraphics[scale=0.8]{color_button}
  52 +\includegraphics[scale=0.8]{colour_button.png}
53 53 \caption{Atalho para cor de fundo da janela de volume/superfície}
54 54 \label{fig:button_select_color_2}
55 55 \end{figure}
... ... @@ -59,7 +59,7 @@ Após isso, basta clicar sobre a cor desejada e, em seguida, clicar em \textbf{O
59 59  
60 60 \begin{figure}[!htb]
61 61 \centering
62   -\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142}
  62 +\includegraphics[scale=0.6]{surface_select_color_windows_so_pt.png}
63 63 \caption{Seleção de cor de fundo}
64 64 \label{fig:color_window_background}
65 65 \end{figure}
... ... @@ -68,7 +68,7 @@ A figura \ref{fig:background_color} mostra um exemplo dessa janela com a cor de
68 68  
69 69 \begin{figure}[!htb]
70 70 \centering
71   -\includegraphics[scale=0.6]{3d_background}
  71 +\includegraphics[scale=0.7]{3d_background_changed.png}
72 72 \caption{Cor de fundo alterada}
73 73 \label{fig:background_color}
74 74 \end{figure}
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_export.tex
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -10,7 +10,7 @@ duplo com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre o item para expandi-lo. A fi
10 10  
11 11 \begin{figure}[!htb]
12 12 \centering
13   -\includegraphics[scale=0.6]{data_export}
  13 +\includegraphics[scale=0.8]{painel_data_export_pt.png}
14 14 \caption{Menu para exportação de dados}
15 15 \label{fig:data_export}
16 16 \end{figure}
... ... @@ -24,7 +24,7 @@ figura \ref{fig:data_export_selection}.
24 24  
25 25 \begin{figure}[!htb]
26 26 \centering
27   -\includegraphics[scale=0.6]{data_export_selection}
  27 +\includegraphics[scale=0.7]{painel_data_export_selection_pt.png}
28 28 \caption{Seleção de superfície a exportar}
29 29 \label{fig:data_export_selection}
30 30 \end{figure}
... ... @@ -39,12 +39,12 @@ Em seguida, clique sobre o ícone que a figura \ref{fig:surface_export_original}
39 39 \end{figure}
40 40  
41 41 Na janela exibida (figura \ref{fig:export_data_window}), insira o nome do arquivo e
42   -selecione o formato desejado para a exportação. Em seguida, clique em \textbf{Save (Salvar)}.
  42 +selecione o formato desejado para a exportação. Em seguida, clique em \textbf{Salvar}.
43 43  
44 44  
45 45 \begin{figure}[!htb]
46 46 \centering
47   -\includegraphics[scale=0.4]{export_data_window}
  47 +\includegraphics[scale=0.4]{export_surface.png}
48 48 \caption{Janela para exportar superfície}
49 49 \label{fig:export_data_window}
50 50 \end{figure}
... ... @@ -83,17 +83,17 @@ exibido na figura \ref{fig:menu_save_image_window} e selecione a sub-janela corr
83 83  
84 84 \begin{figure}[!htb]
85 85 \centering
86   -\includegraphics[scale=0.4]{menu_save_image_window}
  86 +\includegraphics[scale=0.5]{menu_save_image_window_pt.png}
87 87 \caption{Menu para exportar imagem}
88 88 \label{fig:menu_save_image_window}
89 89 \end{figure}
90 90  
91 91 Na janela exibida (figura \ref{fig:save_image_window}), selecione o formato do arquivo e
92   -clique no botão \textbf{Save (Salvar)}.
  92 +clique no botão \textbf{Salvar}.
93 93  
94 94 \begin{figure}[!htb]
95 95 \centering
96   -\includegraphics[scale=0.4]{save_image_window}
  96 +\includegraphics[scale=0.4]{export_bmp_pt.png}
97 97 \caption{Janela para exportar imagem}
98 98 \label{fig:save_image_window}
99 99 \end{figure}
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_geren_dados.tex
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -16,7 +16,7 @@ correspondentes aos elementos a que se referem.
16 16  
17 17 \begin{figure}[!htb]
18 18 \centering
19   -\includegraphics[scale=0.5]{mask_manager}
  19 +\includegraphics[scale=0.7]{painel_mask_manager_pt.png}
20 20 \caption{Gerenciamento de dados}
21 21 \label{fig:volumetric_data}
22 22 \end{figure}
... ... @@ -42,7 +42,7 @@ no atalho que a figura \ref{fig:delete_data} ilustra.
42 42  
43 43 \begin{figure}[!htb]
44 44 \centering
45   -\includegraphics[scale=0.5]{selected_mask}
  45 +\includegraphics[scale=0.7]{painel_selected_mask_pt.png}
46 46 \caption{Dado selecionado}
47 47 \label{fig:selected_mask}
48 48 \end{figure}
... ... @@ -50,7 +50,7 @@ no atalho que a figura \ref{fig:delete_data} ilustra.
50 50  
51 51 \begin{figure}[!htb]
52 52 \centering
53   -\includegraphics[scale=0.8]{delete_data}
  53 +\includegraphics[scale=0.8]{data_remove.png}
54 54 \caption{Excluir dado}
55 55 \label{fig:delete_data}
56 56 \end{figure}
... ... @@ -60,7 +60,7 @@ Para criar uma nova máscara, superfície ou medição, basta clicar no atalho i
60 60  
61 61 \begin{figure}[!htb]
62 62 \centering
63   -\includegraphics[scale=0.8]{new_data}
  63 +\includegraphics[scale=0.8]{data_new.png}
64 64 \caption{Novo dado}
65 65 \label{fig:new_data}
66 66 \end{figure}
... ... @@ -70,7 +70,7 @@ ilustra.
70 70  
71 71 \begin{figure}[!htb]
72 72 \centering
73   -\includegraphics[scale=0.8]{duplicate_data}
  73 +\includegraphics[scale=0.8]{data_duplicate.png}
74 74 \caption{Copiar dado}
75 75 \label{fig:duplicate_data}
76 76 \end{figure}
... ... @@ -94,11 +94,28 @@ traz um exemplo.
94 94  
95 95 \begin{figure}[!htb]
96 96 \centering
97   -\includegraphics[scale=0.5]{surface_manager}
  97 +\includegraphics[scale=0.7]{painel_volumetric_measures_pt.png}
98 98 \caption{Gerenciamento de superfícies}
99 99 \label{fig:surface_manager}
100 100 \end{figure}
101 101  
  102 +\subsection{Importação de superfície}
  103 +
  104 +É possível importar arquivos do tipo STL, OBJ, PLY e VTP (VTK Polydata File Format) com um projeto do InVesalius ativo, para isso é necessário clicar no ícone que é mostrado na figura~\ref{fig:import_stl}, selecionar (figura~\ref{fig:import_surface}) o formato do arquivo que será importado e depois clicar no \textbf{Abrir}.
  105 +
  106 +\begin{figure}[!htb]
  107 +\centering
  108 +\includegraphics[scale=0.8]{load_mesh.png}
  109 +\caption{Importar Superfície}
  110 +\label{fig:import_stl}
  111 +\end{figure}
  112 +
  113 +\begin{figure}[!htb]
  114 +\centering
  115 +\includegraphics[scale=0.4]{import_surface_pt.png}
  116 +\caption{Janela para importação de superfície}
  117 +\label{fig:import_surface}
  118 +\end{figure}
102 119  
103 120 \newpage
104 121  
... ... @@ -112,7 +129,7 @@ a coluna \textbf{Valor} informa a medida propriamente dita. Veja a figura \ref{f
112 129  
113 130 \begin{figure}[!htb]
114 131 \centering
115   -\includegraphics[scale=0.5]{manager_mensuares}
  132 +\includegraphics[scale=0.7]{painel_measures_manager_pt.png}
116 133 \caption{Gerenciamento de medições}
117 134 \label{fig:manager_mensuares}
118 135 \end{figure}
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_img.tex 0 → 100644
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -0,0 +1,117 @@
  1 +\chapter{Ajuste de imagem}
  2 +
  3 +O InVesalius não garante a correta ordem das imagens pois depende de informações que estão presentes nas imagens, algumas vezes essas imagens tem as informações incorretas ou não seguem o padrão DICOM. Dessa forma é recomendável confirmar se a lesão ou algum outro marco anatômico presente em um determinado paciente é exibido no lado correto da imagem. Caso não seja, é possível utilizar as ferramentas de espelhar a imagem ou inverter eixos. Também para o alinhamento da imagem, existe a ferramenta de rotação da imagem.
  4 +
  5 +\section{Espelhar}
  6 +
  7 +É possível espelhar um dos lados da imagem de modo que eles se invertam, para isso é necessário ir no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem}, \textbf{Espelhar} e clicar em uma das seguintes opções (figura~\ref{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}):
  8 +
  9 +\begin{itemize}
  10 + \item Direita - Esquerda
  11 + \item Anterior - Posterior
  12 + \item Superior - Inferior
  13 +\end{itemize}
  14 +
  15 +\begin{figure}[!htb]
  16 +\centering
  17 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_img_mirroring_axis_pt.png}
  18 +\caption{Menu para ativar ferramenta de espelhar imagem.}
  19 +\label{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}
  20 +\end{figure}
  21 +
  22 +
  23 +A figura~\ref{fig:mirrored} apresenta um comparativo entre a imagem não espelhada e a imagem espelhada. Por o conjunto de imagens formar um volume, ao aplicar espelhamento todas as outras orientações são modificadas também.
  24 +
  25 +\begin{figure}[!htb]
  26 + \centering
  27 + \subfloat[Imagem entrada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mirror_axial.png}} \qquad
  28 + \subfloat[Imagem espelhada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mirror_axial_mirrored.png}}
  29 + \hfill
  30 + \caption{Exemplo de imagem com direita-esquerda espelhada.}
  31 + \label{fig:mirrored}
  32 +\end{figure}
  33 +
  34 +\section{Trocar Eixo}
  35 +
  36 +A ferramenta de troca de eixo, muda as orientações da imagem caso ela tem sido importada erroneamente. Para isso é necessário ir no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem}, \textbf{Trocar Eixo} e clicar em uma das seguintes opções (figura~\ref{fig:menu_invert_axis}):
  37 +
  38 +\begin{itemize}
  39 + \item Da Direita para Anterior-Posterior
  40 + \item Da Direita-Esquerda para Superior-Inferior
  41 + \item Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior
  42 +\end{itemize}
  43 +
  44 +
  45 +As figuras~\ref{fig:invert_axis_axial} e~\ref{fig:invert_axis_axial_inverted}, apresentam um exemplo de imagens com eixo invertido.
  46 +
  47 +\begin{figure}[!htb]
  48 +\centering
  49 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_invert_axis_pt.png}
  50 +\caption{Menu para ativar espelhar um dos lados da imagem.}
  51 +\label{fig:menu_invert_axis}
  52 +\end{figure}
  53 +
  54 +\begin{figure}[!htb]
  55 +\centering
  56 +\includegraphics[scale=0.4]{invert_axis_axial_pt.png}
  57 +\caption{Conjunto de imagens antes de inverter eixo - Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior.}
  58 +\label{fig:invert_axis_axial}
  59 +\end{figure}
  60 +
  61 +\begin{figure}[!htb]
  62 +\centering
  63 +\includegraphics[scale=0.4]{invert_axis_axial_inverted_pt.png}
  64 +\caption{Conjunto de imagens com eixo invertido - Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior.}
  65 +\label{fig:invert_axis_axial_inverted}
  66 +\end{figure}
  67 +
  68 +\section{Reorientar imagem (Rotacionar)}
  69 +
  70 +Caso seja necessário alinhar a imagem levando em consideração algum ponto de referencia como algum marco anatômico, é possível realizar essa tarefa utilizando a ferramenta de reorientação de imagem. Para abrir a ferramenta é necessário ir ao menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem} e por último \textbf{Reorientar imagem} (figura~\ref{fig:menu_img_reorient}).
  71 +
  72 +\begin{figure}[!htb]
  73 +\centering
  74 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_img_reorient_pt.png}
  75 +\caption{Menu para ativar o recurso de reorientar imagem.}
  76 +\label{fig:menu_img_reorient}
  77 +\end{figure}
  78 +
  79 +Ao abrir a ferramenta será exibida uma janela (figura~\ref{fig:image_reorient_window}) que mostra em qual orientação e quantos graus a imagem foi rotacionada.
  80 +
  81 +\begin{figure}[!htb]
  82 +\centering
  83 +\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_window_pt.png}
  84 +\caption{Janela responsável por exibir os parâmetros de reorientação de imagem.}
  85 +\label{fig:image_reorient_window}
  86 +\end{figure}
  87 +
  88 +Inicialmente é necessário definir em função de qual ponto a imagem será rotacionada, para isso é necessário \textbf{manter o botão esquerdo do mouse pressionado} entre a interseção de duas linhas (figura~\ref{fig:image_reorient_adjust_center}) em uma das janelas de orientação axial, coronal ou sagital e arrastar até o ponto desejado.
  89 +
  90 +\begin{figure}[!htb]
  91 +\centering
  92 +\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_adjust_center.png}
  93 +\caption{Definição do eixo de rotação da imagem.}
  94 +\label{fig:image_reorient_adjust_center}
  95 +\end{figure}
  96 +
  97 +Para rotacionar a imagem é necessário \textbf{manter o botão esquerdo do mouse pressionado} e \textbf{arrastar} de forma que o ponto de referencia ou marco anatômico fique alinhado com uma das linhas (figura~\ref{fig:image_reorient_rotated}). Após a imagem estar na posição desejada, é necessário clicar no botão \textbf{Aplicar}, presente na janela de parâmetros (figura~\ref{fig:image_reorient_window}), dependo do tamanho da imagem é necessário aguardar alguns segundos até o processo finalizar. A figura~\ref{fig:image_reorient_rotated_applied} apresenta uma imagem com o processo de de reorientação finalizada.
  98 +
  99 +\begin{figure}[!htb]
  100 +\centering
  101 +\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_rotated_pt.png}
  102 +\caption{Imagem rotacionada.}
  103 +\label{fig:image_reorient_rotated}
  104 +\end{figure}
  105 +
  106 +\begin{figure}[!htb]
  107 +\centering
  108 +\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_rotated_applied_pt.png}
  109 +\caption{Imagem rotacionada após a finalização do processo.}
  110 +\label{fig:image_reorient_rotated_applied}
  111 +\end{figure}
  112 +
  113 +
  114 +
  115 +
  116 +
  117 +
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_import.tex
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -27,7 +27,7 @@ Clique em \textbf{OK}.
27 27  
28 28 \begin{figure}[!htb]
29 29 \centering
30   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec311139.jpg}
  30 +\includegraphics[scale=0.5]{import_select_folder_pt.png}
31 31 \caption{Seleção de diretório}
32 32 \label{fig:win_folder}
33 33 \end{figure}
... ... @@ -39,7 +39,7 @@ do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:ver_fil
39 39  
40 40 \begin{figure}[!htb]
41 41 \centering
42   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_03Dec311131.jpg}
  42 +\includegraphics[scale=0.6]{import_load_files_pt.png}
43 43 \caption{Status de verificação e carregamento de arquivos}
44 44 \label{fig:ver_file}
45 45 \end{figure}
... ... @@ -52,7 +52,7 @@ pular imagens para reconstrução.
52 52  
53 53 \begin{figure}[!htb]
54 54 \centering
55   -\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_06Dec311139.jpg}
  55 +\includegraphics[scale=0.4]{import_window_pt.png}
56 56 \caption{Tela de importação}
57 57 \label{fig:win_import}
58 58 \end{figure}
... ... @@ -66,7 +66,7 @@ com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre a descrição da série. Veja a fi
66 66  
67 67 \begin{figure}[!htb]
68 68 \centering
69   -\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_08Dec311139_.jpg}
  69 +\includegraphics[scale=0.5]{import_window_detail_pt.png}
70 70 \caption{Seleção de série}
71 71 \label{fig:import_serie}
72 72 \end{figure}
... ... @@ -77,11 +77,11 @@ Em alguns casos, em particular quando não se dispõe de um computador com memó
77 77 processamento satisfatórios para trabalhar com muitas imagens em uma série, pode ser
78 78 recomendável pular (ignorar) algumas delas. Para isso, clique \textbf{uma vez} com o botão
79 79 \textbf{esquerdo} do mouse sobre a descrição da série (figura \ref{fig:import_serie}) e selecione
80   -quantas imagens serão puladas (figura \ref{fig:skip_image}). Clique em \textbf{OK}.
  80 +quantas imagens serão puladas (figura \ref{fig:skip_image}). Clique em \textbf{Importar}.
81 81  
82 82 \begin{figure}[!htb]
83 83 \centering
84   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_13Dec311140_.jpg}
  84 +\includegraphics[scale=0.6]{import_window_skip_slice_pt.png}
85 85 \caption{Pular imagens}
86 86 \label{fig:skip_image}
87 87 \end{figure}
... ... @@ -96,7 +96,7 @@ cada imagem resultante terá 307 x 307 pixeis. Caso deseje abrir com a resoluçÃ
96 96  
97 97 \begin{figure}[!htb]
98 98 \centering
99   -\includegraphics[scale=0.5]{file_import_resize.png}
  99 +\includegraphics[scale=0.5]{import_window_lower_memory_pt.png}
100 100 \caption{Redução de dimensão da imagem}
101 101 \label{fig:resize_image}
102 102 \end{figure}
... ... @@ -106,7 +106,7 @@ da reconstrução (quando as imagens são empilhadas e interpoladas).
106 106  
107 107 \begin{figure}[!htb]
108 108 \centering
109   -\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_14Dec311140.jpg}
  109 +\includegraphics[scale=0.6]{import_window_progress.png}
110 110 \caption{Progresso da reconstrução}
111 111 \label{fig:prog_recons}
112 112 \end{figure}
... ... @@ -119,7 +119,7 @@ Para importar arquivos no formato Analyze, no menu \textbf{Arquivo}, clique na o
119 119  
120 120 \begin{figure}[!htb]
121 121 \centering
122   -\includegraphics[scale=0.4]{analyze_menu.png}
  122 +\includegraphics[scale=0.4]{import_analyze_menu_pt.png}
123 123 \caption{Menu para importar imagens no formato analyze}
124 124 \label{fig:analyze_menu}
125 125 \end{figure}
... ... @@ -128,7 +128,138 @@ Selecione o arquivo do tipo Analyze, na extensão \textbf{.hdr} e clique em \tex
128 128  
129 129 \begin{figure}[!htb]
130 130 \centering
131   -\includegraphics[scale=0.4]{analyze_import.png}
  131 +\includegraphics[scale=0.4]{import_analyze_window_pt.png}
132 132 \caption{Importar imagens no formato analyze}
133 133 \label{fig:analyze_import}
  134 +\end{figure}
  135 +
  136 +\section{NIfTI}
  137 +
  138 +Para importar arquivos no formato NIfTI, no menu \textbf{Arquivo}, clique na opção \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida a opção \textbf{NIfTI} como mostra a figura \ref{fig:import_nifti_menu_pt}.
  139 +
  140 +\begin{figure}[!htb]
  141 +\centering
  142 +\includegraphics[scale=0.4]{import_nifti_menu_pt.png}
  143 +\caption{Menu para importar imagens no formato NIfTI}
  144 +\label{fig:import_nifti_menu_pt}
  145 +\end{figure}
  146 +
  147 +Selecione o arquivo do tipo NIfTI, na extensão \textbf{nii.gz} ou \textbf{.nii} e clique em \textbf{Abrir}. (figura \ref{fig:import_nifti_window_pt}). Caso o arquivo esteja em outra extensão como \textbf{.hdr}, selecione a opção \textbf{all files(*.*)}.
  148 +
  149 +\begin{figure}[!htb]
  150 +\centering
  151 +\includegraphics[scale=0.4]{import_nifti_window_pt.png}
  152 +\caption{Importar imagens no formato NIfTI}
  153 +\label{fig:import_nifti_window_pt}
  154 +\end{figure}
  155 +
  156 +\section{PAR/REC}
  157 +
  158 +
  159 +Para importar arquivos no formato PAR/REC, no menu \textbf{Arquivo}, clique na opção \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida a opção \textbf{PAR/REC} como mostra a figura \ref{fig:import_parrec_menu_pt}.
  160 +
  161 +\begin{figure}[!htb]
  162 +\centering
  163 +\includegraphics[scale=0.4]{import_parrec_menu_pt.png}
  164 +\caption{Menu para importar imagens no formato PAR/REC}
  165 +\label{fig:import_parrec_menu_pt}
  166 +\end{figure}
  167 +
  168 +Selecione o arquivo do tipo PAR/REC, na extensão \textbf{.par} e clique em \textbf{Abrir}. (figura \ref{fig:import_parrec_window_pt}). Caso o arquivo esteja sem extensão, selecione a opção \textbf{all files(*.*)}.
  169 +
  170 +\begin{figure}[!htb]
  171 +\centering
  172 +\includegraphics[scale=0.4]{import_parrec_window_pt.png}
  173 +\caption{Importar imagens no formato PAR/REC}
  174 +\label{fig:import_parrec_window_pt}
  175 +\end{figure}
  176 +
  177 +
  178 +
  179 +\section{TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG (micro-CT)}
  180 +
  181 +Arquivos em formato TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG para reconstrução podem ser providos de equipamentos de microtomografia (micro-CT ou $\mu$CT) e outros. O InVesalius importa arquivos nesses formatos desde que os pixels presentes estejam em escala de cinza.
  182 +
  183 +Para importar, clique no menu \textbf{Arquivo} e na opção \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida clique na opção \textbf{TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG ($\mu$CT)} como mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_menu_pt}.
  184 +
  185 +\begin{figure}[!htb]
  186 +\centering
  187 +\includegraphics[scale=0.4]{import_bmp_menu_pt.png}
  188 +\caption{Importar imagens no formato BMP e outros}
  189 +\label{fig:import_bmp_menu_pt}
  190 +\end{figure}
  191 +
  192 +Selecione o diretório que contenha os arquivos, como mostra a figura \ref{fig:import_bmp_select_folder}. O InVesalius irá procurar por arquivos também em subdiretórios do diretório escolhido, caso existam.
  193 +
  194 +Clique em \textbf{OK}.
  195 +
  196 +\begin{figure}[!htb]
  197 +\centering
  198 +\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_select_folder_pt.png}
  199 +\caption{Seleção de diretório}
  200 +\label{fig:import_bmp_select_folder}
  201 +\end{figure}
  202 +
  203 +
  204 +Enquanto o InVesalius procura por arquivos TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG no diretório, é exibido o progresso do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:import_bmp_load_pt}.
  205 +
  206 +\begin{figure}[!htb]
  207 +\centering
  208 +\includegraphics[scale=0.6]{import_bmp_load_pt.png}
  209 +\caption{Status de verificação e carregamento de arquivos}
  210 +\label{fig:import_bmp_load_pt}
  211 +\end{figure}
  212 +
  213 +
  214 +Se arquivos do tipo TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG forem encontrados, é aberta uma janela (figura~\ref{fig:import_bmp_window_pt}) para exibir os arquivos encontrados elegíveis para reconstrução. Também é possível pular imagens para reconstrução ou remover arquivos da lista para reconstrução. Os arquivos são ordenados de acordo com o nome do arquivo, recomenda-se utilizar números em seus nomes de acordo com a ordem que deseja-se obter na reconstrução.
  215 +
  216 +\begin{figure}[!htb]
  217 +\centering
  218 +\includegraphics[scale=0.3]{import_bmp_window_pt.png}
  219 +\caption{Janela para importação de arquivos do tipo BMP.}
  220 +\label{fig:import_bmp_window_pt}
  221 +\end{figure}
  222 +
  223 +Para excluir os arquivos que não são de interesse, é possível selecionar um arquivo clicando com o \textbf{botão esquerdo do mouse} e em seguida pressionar a tecla \textbf{delete}. É possível também escolher uma faixa de arquivos para deletar, para isso é necessário clicar com o \textbf{botão esquerdo do mouse} no primeiro arquivo da faixa, manter pressionada a tecla \textbf{shift}, clicar novamente com o \textbf{botão esquerdo do mouse} no último arquivo da faixa e finalmente pressionar o botão \textbf{delete}.
  224 +
  225 +A exemplo da importação de arquivos DICOM, é possível pular imagens BMP para reconstrução. Em alguns casos, em particular quando não se dispõe de um computador com memória e/ou processamento satisfatórios para trabalhar com muitas imagens em uma série, pode ser recomendável pular (ignorar) algumas delas. Para isso, selecione quantas imagens serão puladas (figura \ref{fig:import_bmp_skip_pt}). Clique em \textbf{Importar}.
  226 +
  227 +\begin{figure}[!htb]
  228 +\centering
  229 +\includegraphics[scale=0.4]{import_bmp_skip_pt.png}
  230 +\caption{Tela de importação}
  231 +\label{fig:import_bmp_skip_pt}
  232 +\end{figure}
  233 +
  234 +Para a reconstrução desse tipo de arquivo é necessário definir um nome para o projeto, indicar qual a orientação das imagens (axial, coronal ou sagital), espaçamento do voxel ($X$, $Y$ e $Z$) em \textbf{milímetros} como mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_spacing_pt}. O espaçamento do voxel em $X$ é largura do pixel de cada imagem, $Y$ o comprimento do pixel e $Z$ representa a distância de cada fatia (altura do voxel).
  235 +
  236 +Caso o conjunto de imagens seja de imagens de microtomografia, mais especificamente de equipamentos das marcas GE e Brucker, é possível que o InVesalius realize a leitura do arquivo texto com os parâmetros de aquisição que normalmente fica na mesma pasta das imagens e insira automaticamente o espaçamento. Essa constatação pode ser feita quando os valores de $X$, $Y$ e $Z$ são diferentes de "1.00000000", caso contrário é necessário digitar os valores dos respectivos espaçamento.
  237 +
  238 +\textbf{Atenção, o espaçamento é um parâmetro primordial para a correta dimensão dos objetos no software. Espaçamento incorreto irá fornecer medidas incorretas.}
  239 +
  240 +Uma vez preenchido todos os parâmetros, basta clicar no botão \textbf{Ok}.
  241 +
  242 +\begin{figure}[!htb]
  243 +\centering
  244 +\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_spacing_pt.png}
  245 +\caption{Tela de importação}
  246 +\label{fig:import_bmp_spacing_pt}
  247 +\end{figure}
  248 +
  249 +Caso seja detectado quantidade insuficiente de memória disponível na hora de carregar as imagens é recomentado reduzir a resolução das fatias para trabalhar com visualização volumétrica e de superfície, como mostra a janela \ref{fig:import_bmp_resize_pt}. As fatias serão redimensionadas de acordo com a porcentagem em relação a resolução original. Por exemplo, se cada fatia do exame contém a dimensão de 512 x 512 pixeis e for sugerido a "Porcentagem da resolução original" em 60\%, cada imagem resultante terá 307 x 307 pixeis. Caso deseje abrir com a resolução original selecione o valor 100.
  250 +
  251 +\begin{figure}[!htb]
  252 +\centering
  253 +\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_resize_pt.png}
  254 +\caption{Redimensionamento de imagens}
  255 +\label{fig:import_bmp_resize_pt}
  256 +\end{figure}
  257 +
  258 +Após os passos anteriores é necessário aguardar um instante para completar a reconstrução multiplanar conforme mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_mpr_pt.png}.
  259 +
  260 +\begin{figure}[!htb]
  261 +\centering
  262 +\includegraphics[scale=0.6]{import_bmp_mpr_pt.png}
  263 +\caption{Reconstrução multiplanar em andamento.}
  264 +\label{fig:import_bmp_mpr_pt.png}
134 265 \end{figure}
135 266 \ No newline at end of file
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_instal.tex
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -4,11 +4,11 @@
4 4  
5 5 Para instalar o InVesalius no MS-Windows, basta executar o programa instalador.
6 6 Quando aparecer uma janela pedindo para confirmar a execução do arquivo, clique
7   -em \textbf{Executar}.
  7 +em \textbf{Sim}.
8 8  
9 9 \begin{figure}[!htb]
10 10 \centering
11   -\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_02Dec311523.jpg}
  11 +\includegraphics[scale=0.5]{installation_exec_pt.png}
12 12 \end{figure}
13 13  
14 14 \newpage
... ... @@ -17,7 +17,7 @@ o idioma e clique em \textbf{OK}.
17 17  
18 18 \begin{figure}[!htb]
19 19 \centering
20   -\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_03Dec311523.jpg}
  20 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_select_language_pt.png}
21 21 \end{figure}
22 22  
23 23 \hspace{.2cm}
... ... @@ -26,44 +26,42 @@ Em seguida, será exibida a janela do instalador. Clique em \textbf{Avançar}.
26 26  
27 27 \begin{figure}[!htb]
28 28 \centering
29   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_02Dec310024.jpg}
  29 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_welcome_pt.png}
30 30 \end{figure}
31 31  
32 32 \newpage
33 33  
34 34 Selecione \textbf{Eu aceito os termos do Contrato} e clique em \textbf{Avançar}.
35 35  
36   -\begin{figure}[!htb]
  36 +\begin{figure}[!htb]
37 37 \centering
38   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec310024.jpg}
  38 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_license_pt.png}
39 39 \end{figure}
40 40  
41 41 \hspace{.2cm}
42 42  
43   -Clique em \textbf{Avançar} novamente.
  43 +Clique em \textbf{Avançar} novamente.
44 44  
45   -\begin{figure}[!htb]
  45 +\begin{figure}[!htb]
46 46 \centering
47   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_05Dec310024.jpg}
  47 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_folder_pt.png}
48 48 \end{figure}
49 49  
50 50 \newpage
51 51  
52 52 Clique em \textbf{Avançar}.
53   -
54 53 \begin{figure}[!htb]
55 54 \centering
56   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_06Dec310024.jpg}
  55 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_program_name_pt.png}
57 56 \end{figure}
58 57  
59 58 \hspace{.2cm}
60 59  
61   -Selecione \textbf{Criar um ícone na Área de Trabalho} e \textbf{Criar um ícone
62   -na Barra de Inicialização Rápida} e clique em \textbf{Avançar}.
  60 +Selecione \textbf{Criar um ícone na Área de Trabalho} e clique em \textbf{Avançar}.
63 61  
64 62 \begin{figure}[!htb]
65 63 \centering
66   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_08Dec310024.jpg}
  64 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_desktop_shortcut_pt.png}
67 65 \end{figure}
68 66  
69 67 \newpage
... ... @@ -72,7 +70,7 @@ Clique em \textbf{Instalar}.
72 70  
73 71 \begin{figure}[!htb]
74 72 \centering
75   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_09Dec310024.jpg}
  73 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_resume_pt.png}
76 74 \end{figure}
77 75  
78 76 \hspace{.2cm}
... ... @@ -82,7 +80,7 @@ da instalação.
82 80  
83 81 \begin{figure}[!htb]
84 82 \centering
85   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_11Dec310025.jpg}
  83 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_progress_pt.png}
86 84 \end{figure}
87 85  
88 86 \newpage
... ... @@ -91,7 +89,7 @@ Para executar o InVesalius após a instalação, clique em \textbf{Concluir}.
91 89  
92 90 \begin{figure}[!htb]
93 91 \centering
94   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_14Dec310025.jpg}
  92 +\includegraphics[scale=0.7]{installation_finish_pt.png}
95 93 \end{figure}
96 94  
97 95 \hspace{.2cm}
... ... @@ -102,7 +100,7 @@ para selecionar o idioma do InVesalius. Selecione o idioma desejado e clique em
102 100  
103 101 \begin{figure}[!htb]
104 102 \centering
105   -\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_15Dec310025.jpg}
  103 +\includegraphics[scale=0.7]{invesalius_language_select_pt.png}
106 104 \end{figure}
107 105  
108 106 \newpage
... ... @@ -112,7 +110,7 @@ seguinte.
112 110  
113 111 \begin{figure}[!htb]
114 112 \centering
115   -\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_17Dec310026.jpg}
  113 +\includegraphics[scale=0.4]{splash_pt.png}
116 114 \end{figure}
117 115  
118 116 \hspace{.2cm}
... ... @@ -121,7 +119,7 @@ Em seguida, a janela principal do programa é aberta.
121 119  
122 120 \begin{figure}[!htb]
123 121 \centering
124   -\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_18Dec310026.jpg}
  122 +\includegraphics[scale=0.4]{main_window_without_project_pt.png}
125 123 \end{figure}
126 124  
127 125 \section{Mac Os X}
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_manip.tex
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -2,13 +2,13 @@
2 2  
3 3 \section{Reconstrução Multiplanar}
4 4  
5   -Ao importar as imagens DICOM, o InVesalius mostra, automaticamente, a sua reconstrução
  5 +Ao importar as imagens, o InVesalius mostra, automaticamente, a sua reconstrução
6 6 multiplanar nas orientações Axial, Sagital e Coronal, bem como uma janela para manipulação 3D.
7 7 Veja a figura \ref{fig:mpr}.
8 8  
9 9 \begin{figure}[!htb]
10 10 \centering
11   -\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_18Dec311140_1.jpg}
  11 +\includegraphics[scale=0.30]{multiplanar_mask_window_pt.png}
12 12 \caption{Reconstrução multiplanar}
13 13 \label{fig:mpr}
14 14 \end{figure}
... ... @@ -27,7 +27,7 @@ da tela. Basta escolher a aba \textbf{Máscaras} e clicar \textbf{uma} vez com o
27 27  
28 28 \begin{figure}[!htb]
29 29 \centering
30   -\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_29Dec311141_.jpg}
  30 +\includegraphics[scale=0.8]{data_mask_pt.png}
31 31 \caption{Gerenciador de máscaras}
32 32 \label{fig:ger_masc}
33 33 \end{figure}
... ... @@ -37,7 +37,7 @@ O ícone do olho desaparece, e as cores da máscara de segmentação são escond
37 37  
38 38 \begin{figure}[!htb]
39 39 \centering
40   -\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_28Dec311141_.jpg}
  40 +\includegraphics[scale=0.30]{multiplanar_window_pt.png}
41 41 \caption{Reconstrução multiplanar sem máscara de segmentação}
42 42 \label{fig:mpr_sem_mask}
43 43 \end{figure}
... ... @@ -51,7 +51,7 @@ região do crânio.
51 51  
52 52 \begin{figure}[!htb]
53 53 \centering
54   -\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_24Dec310029_.jpg}
  54 +\includegraphics[scale=0.15]{axial.jpg}
55 55 \caption{Corte axial}
56 56 \label{fig:axial_corte}
57 57 \end{figure}
... ... @@ -65,7 +65,7 @@ A figura \ref{fig:sagital_slice} mostra uma imagem do crânio em orientação sa
65 65  
66 66 \begin{figure}[!htb]
67 67 \centering
68   -\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_25Dec310029_.jpg}
  68 +\includegraphics[scale=0.15]{sagital.jpg}
69 69 \caption{Corte sagital}
70 70 \label{fig:sagital_slice}
71 71 \end{figure}
... ... @@ -81,13 +81,14 @@ coronal.
81 81  
82 82 \begin{figure}[!htb]
83 83 \centering
84   -\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_24Dec311141_.jpg}
  84 +\includegraphics[scale=0.15]{coronal.jpg}
85 85 \caption{Corte coronal}
86 86 \label{fig:coronal_slice}
87 87 \end{figure}
88 88  
89 89  
90 90 \section{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal}
  91 +\label{sec:corresp_all_orient}
91 92  
92 93 Para saber qual o ponto comum das imagens nas diferentes orientações, basta acionar o
93 94 recurso "Cruz de interseção de fatias" pelo ícone de atalho localizado na barra de ferramentas.
... ... @@ -111,7 +112,7 @@ Para modificar o ponto, mantenha \textbf{pressionado} o botão \textbf{esquerdo}
111 112  
112 113 \begin{figure}[!htb]
113 114 \centering
114   -\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_01Jan021941.jpg}
  115 +\includegraphics[scale=0.4]{multiplanar_window_cross_pt.png}
115 116 \caption{Ponto comum entre orientações diferentes}
116 117 \label{fig:cross_all}
117 118 \end{figure}
... ... @@ -119,7 +120,29 @@ Para modificar o ponto, mantenha \textbf{pressionado} o botão \textbf{esquerdo}
119 120 Para desativar a funcionalidade, basta clicar novamente sobre o atalho (figura \ref{fig:cross_icon}).
120 121 Esse recurso pode ser utilizado em conjunto com o editor de fatias (que será comentado mais à frente).
121 122  
122   -\newpage
  123 +
  124 +\section{Interpolação}
  125 +
  126 +Por padrão a visualização das imagens 2D são interpoladas (figura~\ref{fig:interp}).a, caso deseja desativar esse recurso, basta ir no menu \textbf{Visualizar}, \textbf{Fatias interpoladas} (figura~\ref{fig:menu_interpoleted_image_pt}). Dessa forma será possível visualizar cada pixel individualmente como mostra a figura~\ref{fig:interp}.b.
  127 +
  128 +\textbf{Observação: Essa interpolação é apenas para efeitos de visualização, não influenciando diretamente na segmentação ou na geração de superfície 3D.}
  129 +
  130 +\begin{figure}[!htb]
  131 +\centering
  132 +\includegraphics[scale=0.7]{menu_interpoleted_image_pt.png}
  133 +\caption{Menu para desativar e ativar interpolação}
  134 +\label{fig:menu_interpoleted_image_pt}
  135 +\end{figure}
  136 +
  137 +
  138 +\begin{figure}[!htb]
  139 + \centering
  140 + \subfloat[Interpolada]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{axial_interpoleted.png}} \qquad
  141 + \subfloat[Não interpolada]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{axial_not_interpoleted.png}}
  142 + \hfill
  143 + \caption{Visualização de imagem interpolada e não interpolada.}
  144 + \label{fig:interp}
  145 +\end{figure}
123 146  
124 147 \section{Mover}
125 148  
... ... @@ -137,7 +160,7 @@ A figura \ref{fig:move_img} mostra uma imagem deslocada (movida).
137 160  
138 161 \begin{figure}[!htb]
139 162 \centering
140   -\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_84Dec311201.jpg}
  163 +\includegraphics[scale=0.25]{axial_pan.jpg}
141 164 \caption{Imagem deslocada}
142 165 \label{fig:move_img}
143 166 \end{figure}
... ... @@ -158,7 +181,7 @@ anti-horário, dependendo do sentido de rotação desejado.
158 181  
159 182 \begin{figure}[!htb]
160 183 \centering
161   -\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_83Dec311201_.jpg}
  184 +\includegraphics[scale=0.25]{axial_rotate.jpg}
162 185 \caption{Imagem rotacionada}
163 186 \label{fig:rotate_all}
164 187 \end{figure}
... ... @@ -180,7 +203,7 @@ anterior, basta clicar novamente no ícone.
180 203  
181 204 \begin{figure}[!htb]
182 205 \centering
183   -\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_27Dec311141__.jpg}
  206 +\includegraphics[scale=0.6]{maximize_sagital_mpr.png}
184 207 \caption{Detalhe de uma subjanela (Observe o ícone de maximizar no canto superior direito)}
185 208 \label{fig:maximize_window}
186 209 \end{figure}
... ... @@ -224,14 +247,14 @@ botão esquerdo do mouse for liberado, a operação de \textit{zoom} será aplic
224 247  
225 248 \begin{figure}[!htb]
226 249 \centering
227   -\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_06Jan062046.jpg}
  250 +\includegraphics[scale=0.25]{tool_zoom_select_image.jpg}
228 251 \caption{Área selecionada para \textit{zoom}}
229 252 \label{fig:zoom_select}
230 253 \end{figure}
231 254  
232 255 \begin{figure}[!htb]
233 256 \centering
234   -\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_08Jan062046.jpg}
  257 +\includegraphics[scale=0.25]{tool_image_with_zoom.jpg}
235 258 \caption{Imagem ampliada}
236 259 \label{fig:zoom_applied}
237 260 \end{figure}
... ... @@ -271,7 +294,7 @@ seguida, clique sobre a opção pré-definida, de acordo com o tipo de tecido, c
271 294  
272 295 \begin{figure}[!htb]
273 296 \centering
274   -\includegraphics[scale=0.40]{ScreenHunter_12Jan021943_0.png}
  297 +\includegraphics[scale=0.40]{menu_window_and_level_pt.png}
275 298 \caption{Menu de contexto para seleção de brilho e contraste}
276 299 \label{fig:window_level}
277 300 \end{figure}
... ... @@ -329,7 +352,7 @@ mostra a figura \ref{fig:pseudo_color}.
329 352  
330 353 \begin{figure}[H]
331 354 \centering
332   -\includegraphics[scale=0.40]{pseudo_menu.png}
  355 +\includegraphics[scale=0.40]{pseudo_menu_pt.png}
333 356 \caption{Pseudo Cor}
334 357 \label{fig:pseudo_color}
335 358 \end{figure}
... ... @@ -339,49 +362,49 @@ pseudocor disponíveis.\\
339 362  
340 363 \begin{figure}[H]
341 364 \centering
342   -\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_24Dec310029.jpg}
  365 +\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_default.jpg}
343 366 \caption{Padrão}
344 367 \label{fig:image_default}
345 368 \end{figure}
346 369  
347 370 \begin{figure}[H]
348 371 \centering
349   -\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_21Jan021944.jpg}
  372 +\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_inverse.jpg}
350 373 \caption{Imagem Cinza Invertido}
351 374 \label{fig:image_inverted}
352 375 \end{figure}
353 376  
354 377 \begin{figure}[H]
355 378 \centering
356   -\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_20Jan021944}
  379 +\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_rainbow.jpg}
357 380 \caption{Arco-íris}
358 381 \label{fig:image_arc}
359 382 \end{figure}
360 383  
361 384 \begin{figure}[H]
362 385 \centering
363   -\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_22Jan021944}
  386 +\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_desert.jpg}
364 387 \caption{Deserto}
365 388 \label{fig:image_desert}
366 389 \end{figure}
367 390  
368 391 \begin{figure}[H]
369 392 \centering
370   -\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_23Jan021944}
  393 +\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_hue.jpg}
371 394 \caption{Matiz}
372 395 \label{fig:image_matiz}
373 396 \end{figure}
374 397  
375 398 \begin{figure}[H]
376 399 \centering
377   -\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_24Jan021944}
  400 +\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_ocean.jpg}
378 401 \caption{Oceano}
379 402 \label{fig:image_ocean}
380 403 \end{figure}
381 404  
382 405 \begin{figure}[H]
383 406 \centering
384   -\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_25Jan021944}
  407 +\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_saturation.jpg}
385 408 \caption{Saturação}
386 409 \label{fig:image_saturation}
387 410 \end{figure}
... ... @@ -394,7 +417,7 @@ pseudocor disponíveis.\\
394 417  
395 418 \begin{figure}[H]
396 419 \centering
397   -\includegraphics[scale=0.60]{menu_projection}
  420 +\includegraphics[scale=0.60]{menu_projection_pt.png}
398 421 \caption{Menu de Tipo de projeção}
399 422 \label{fig:menu_proj}
400 423 \end{figure}
... ... @@ -405,7 +428,7 @@ O modo normal é a visualização padrão, ou seja, sem nenhum tipo de projeçã
405 428  
406 429 \begin{figure}[H]
407 430 \centering
408   -\includegraphics[scale=0.20]{proj_normal}
  431 +\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_pt.png}
409 432 \caption{Projeção normal}
410 433 \label{fig:proj_normal}
411 434 \end{figure}
... ... @@ -416,7 +439,7 @@ MaxIP também é conhecido como MIP (\textit{Maximum Intensity Projection}), o m
416 439  
417 440 \begin{figure}[H]
418 441 \centering
419   -\includegraphics[scale=0.20]{proj_maxIP}
  442 +\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_maxip_pt.png}
420 443 \caption{Projeção MaxIP ou MIP}
421 444 \label{fig:proj_maxip}
422 445 \end{figure}
... ... @@ -425,7 +448,7 @@ Como mostra a figura~\ref{fig:proj_maxip_qtd}, a quantidade de imagens que irá
425 448  
426 449 \begin{figure}[H]
427 450 \centering
428   -\includegraphics[scale=0.50]{proj_maxIP_qtd}
  451 +\includegraphics[scale=0.80]{multiplanar_window_maxip_number_pt.png}
429 452 \caption{Seleção da quantidade de imagens que compõe o MaxIP ou MIP}
430 453 \label{fig:proj_maxip_qtd}
431 454 \end{figure}
... ... @@ -436,7 +459,7 @@ Ao contrário do MaxIP, o MinIP (\textit{Minimun Intensity Projection}) selecion
436 459  
437 460 \begin{figure}[H]
438 461 \centering
439   -\includegraphics[scale=0.20]{proj_minIP}
  462 +\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_minip_pt.png}
440 463 \caption{Projeção MinIP}
441 464 \label{fig:proj_minIP}
442 465 \end{figure}
... ... @@ -446,7 +469,7 @@ A técnica MeanIP (\textit{Mean Intensity Projection}) que é mostrada na figura
446 469  
447 470 \begin{figure}[H]
448 471 \centering
449   -\includegraphics[scale=0.20]{proj_meanIP}
  472 +\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_mean_pt.png}
450 473 \caption{Projeção MeanIP}
451 474 \label{fig:proj_meanIP}
452 475 \end{figure}
... ... @@ -457,7 +480,7 @@ A técnica MIDA (\textit{Maximum Intensity Difference Accumulation}) projeta uma
457 480  
458 481 \begin{figure}[H]
459 482 \centering
460   -\includegraphics[scale=0.18]{proj_MIDA}
  483 +\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_mida_pt.png}
461 484 \caption{Projeção MIDA}
462 485 \label{fig:proj_MIDA}
463 486 \end{figure}
... ... @@ -466,7 +489,7 @@ Como mostra a figura~\ref{fig:proj_MIDA_inv}, é possível inverter a ordem que
466 489  
467 490 \begin{figure}[H]
468 491 \centering
469   -\includegraphics[scale=0.18]{proj_MIDA_inv}
  492 +\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_mida_inverted_pt}
470 493 \caption{Projeção MIDA em ordem invertida}
471 494 \label{fig:proj_MIDA_inv}
472 495 \end{figure}
... ... @@ -477,7 +500,7 @@ Compõe a projeção 2D do conjunto de imagens que contém o volume usando a té
477 500  
478 501 \begin{figure}[H]
479 502 \centering
480   -\includegraphics[scale=0.20]{proj_contornoMaxIP}
  503 +\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_contour_maxip_pt.png}
481 504 \caption{Projeção de Contorno MaxIP}
482 505 \label{fig:proj_contorno_maxip}
483 506 \end{figure}
... ... @@ -488,7 +511,7 @@ Compõe a projeção 2D do conjunto de imagens que contém o volume usando a té
488 511  
489 512 \begin{figure}[H]
490 513 \centering
491   -\includegraphics[scale=0.20]{proj_contornoMIDA}
  514 +\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_contour_mida_pt.png}
492 515 \caption{Projeção de Contorno MIDA}
493 516 \label{fig:proj_contorno_mida}
494 517 \end{figure}
495 518 \ No newline at end of file
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_masc.tex 0 → 100644
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -0,0 +1,187 @@
  1 +\chapter{Máscara}
  2 +
  3 +
  4 +\section{Operações booleanas}
  5 +
  6 +Após efetuar segmentações, é possível realizar operações booleanas entre as máscaras. As operações booleanas suportadas são:\\
  7 +\\
  8 +\textbf{União}, realiza a união de duas máscaras;\\
  9 +\textbf{Diferença}, realiza a diferença entre a primeira máscara com a segunda;\\
  10 +\textbf{Intersecção}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.\\
  11 +\textbf{Disjunção exclusiva}, também é conhecida como XOR, mantém as regiões de ambas as máscara que possuem diferença.\\
  12 +
  13 +Para ativar essa ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Operações boolenas}, como é exibido na figura~\ref{fig:booleano_menu}
  14 +
  15 +\begin{figure}[!htb]
  16 +\centering
  17 +\includegraphics[scale=0.5]{mask_operation_boolean_menu_pt.png}
  18 +\caption{Menu para ativar a ferramenta de operações booleanas.}
  19 +\label{fig:booleano_menu}
  20 +\end{figure}
  21 +
  22 +É necessário selecionar a primeira máscara, a operação a ser realizada e a segunda máscara conforme mostra a figura~\ref{fig:booleano_janela}. Em seguida é necessário clicar no botão \textbf{Ok}.
  23 +
  24 +\begin{figure}[!htb]
  25 +\centering
  26 +\includegraphics[scale=0.5]{mask_boolean_dialog_pt.png}
  27 +\caption{Ferramenta de operações booleanas.}
  28 +\label{fig:booleano_janela}
  29 +\end{figure}
  30 +
  31 +Na figura~\ref{fig:op_boolana}, apresentamos um exemplo de utilização da ferramenta.
  32 +
  33 +\begin{figure}[!htb]
  34 + \centering
  35 + \subfloat[Máscara A]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_a.png}}
  36 + \hfill
  37 + \subfloat[Máscara B]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_b.png}}
  38 + \hfill
  39 + \subfloat[União (A $\cup$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_uniao.png}}
  40 + \hfill
  41 + \subfloat[Diferença (A - B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_dif.png}}
  42 + \hfill
  43 + \subfloat[Intersecção (A $\cap$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_interc.png}}
  44 + \hfill
  45 + \subfloat[Disjunção exclusiva (A $\oplus$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_disj_exc.png}}
  46 + \caption{Exemplo de operações booleanas.}
  47 + \label{fig:op_boolana}
  48 +\end{figure}
  49 +
  50 +\section{Limpeza total da máscara}
  51 +\label{cap:limpeza_mascara}
  52 +
  53 +Pode-se efetuar a limpeza total da máscara (figura~\ref{fig:limpeza_mascara}), isso é recomendado antes de iniciar a inserção de marcadores de Watershed. A ferramenta está localizada no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara}, \textbf{Limpar máscara}, também é possível executa-la pressionando as teclas \textbf{CTRL+SHIFT+A}.
  54 +
  55 +\begin{figure}[!htb]
  56 +\centering
  57 +\includegraphics[scale=0.5]{mask_clean_menu_pt.png}
  58 +\caption{Limpeza de máscara}
  59 +\label{fig:limpeza_mascara}
  60 +\end{figure}
  61 +
  62 +\section{Fechar buracos manualmente}
  63 +
  64 +Ao realizar a segmentação é possível que pequenas partes (buracos) que deseja-se ser selecionadas não sejam e ao gerar a superfície para a impressão 3D pode ser que ocorra inconsistências por causa desses buracos, para evitar esse tipo de problema é recomendável preenche-los. Para isso é basta acessar o menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último clicar em \textbf{Fechar buracos manualmente} (figura~\ref{fig:menu_mask_manual_fill_holes}). Em seguida será exibido uma tela (figura~\ref{fig:mask_manual_fill_holes_window}) para configurar os parâmetros.
  65 +
  66 +\begin{figure}[!htb]
  67 +\centering
  68 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_manual_fill_holes_pt.png}
  69 +\caption{Menu para acessa a ferramenta de fechamento de buracos manual.}
  70 +\label{fig:menu_mask_manual_fill_holes}
  71 +\end{figure}
  72 +
  73 +\begin{figure}[!htb]
  74 +\centering
  75 +\includegraphics[scale=0.7]{mask_manual_fill_holes_window_pt.png}
  76 +\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
  77 +\label{fig:mask_manual_fill_holes_window}
  78 +\end{figure}
  79 +
  80 +Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias.
  81 +
  82 +Quando os parâmetros estiverem configurados, clique com o \textbf{botão esquerdo} do mouse sobre o buraco que deseja-se fechar.
  83 +
  84 +Podemos observar na imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.a, um exemplo de uma máscara sem preenchimento de buracos e outra com os buracos preenchidos (imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.b). Após o uso da ferramenta, para sair clique no botão \textbf{fechar ou close} no canto inferior direito da janela de configuração de parâmetros.
  85 +
  86 +\begin{figure}[!htb]
  87 + \centering
  88 + \subfloat[Buracos]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_with_hole.png}} \qquad
  89 + \subfloat[Buracos fechados]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_filled_hole.png}}
  90 + \hfill
  91 + \caption{Exemplo de máscara com buracos e buracos preenchidos.}
  92 + \label{fig:mask_fill_hole}
  93 +\end{figure}
  94 +
  95 +
  96 +\section{Fechar buracos automaticamente}
  97 +
  98 +Para abrir a ferramenta, no menu do InVesalius clique em \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Fechar buracos automaticamente} (figura~\ref{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}), será aberto uma janela para configurar os parâmetros dos buracos que deseja-se fechar. A ferramenta não requer que o usuário clique nos buracos que deseja fechar, ela leva em consideração o tamanho do buraco em voxels que é configurado na janela de configuração de parâmetros (figura~\ref{fig:mask_automatic_fill_holes_window})
  99 +
  100 +\begin{figure}[!htb]
  101 +\centering
  102 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_automatic_fill_holes_pt.png}
  103 +\caption{Menu para acessar a ferramenta de fechamento de buracos automático.}
  104 +\label{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}
  105 +\end{figure}
  106 +
  107 +\begin{figure}[!htb]
  108 +\centering
  109 +\includegraphics[scale=0.7]{mask_automatic_fill_holes_window_pt.png}
  110 +\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
  111 +\label{fig:mask_automatic_fill_holes_window}
  112 +\end{figure}
  113 +
  114 +Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 2D é necessário indicar qual a janela será aplicado o fechamento de buracos, sendo axial, coronal ou sagital. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias.
  115 +
  116 +Com os parâmetros configurados, clique no botão \textbf{Aplicar ou Apply}, caso o resultado não seja satisfatório, reconfigure o tamanho do buraco ou outros parâmetros como conectividade e aplique novamente. Para sair clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
  117 +
  118 +\section{Remover partes}
  119 +
  120 +Antes de gerar a superfície é recomendável remover as partes desconexas não desejadas na máscara, dessa forma ao gerar a superfície será utilizada menores quantidades de memória RAM e o processo será mais rápido. Para remover as partes não desejáveis é necessário abrir a ferramenta de remover partes, clicando no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e \textbf{Remover Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_remove_part}). Em seguida irá ser exibido uma janela para configurar os parâmetros de seleção (figura~\ref{fig:mask_remove_parts_window}). É possível selecionar partes desconectas apenas na máscara 2D (\textbf{2D - Fatia atual}) ou em todo o conjunto de imagens, selecionando a opção \textbf{3D - Todas as fatias}. Também é possível selecionar suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$.
  121 +
  122 +\begin{figure}[!htb]
  123 +\centering
  124 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_remove_part_pt.png}
  125 +\caption{Menu para acessar a ferramenta de remoção de partes.}
  126 +\label{fig:menu_mask_remove_part}
  127 +\end{figure}
  128 +
  129 +\begin{figure}[!htb]
  130 +\centering
  131 +\includegraphics[scale=0.7]{mask_remove_parts_window.png}
  132 +\caption{Tela para configurar parâmetros de remoção de partes.}
  133 +\label{fig:mask_remove_parts_window}
  134 +\end{figure}
  135 +
  136 +Selecionado os parâmetros desejados, basta clicar com o \textbf{botão direito do mouse} sobre a região que deseja remover. A figura~\ref{fig:mask_removed_part} apresenta uma exemplo de parte removida e não removida. Para sair da ferramenta clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
  137 +
  138 +\begin{figure}[!htb]
  139 + \centering
  140 + \subfloat[Imagem de entrada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_complete.png}} \qquad
  141 + \subfloat[Imagem com suporte do tomografo removido]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part.png}}
  142 + \hfill
  143 + \caption{Exemplo de região removida na máscara.}
  144 + \label{fig:mask_removed_part}
  145 +\end{figure}
  146 +
  147 +\section{Selecionar partes}
  148 +
  149 +Para abrir a ferramenta de seleção de partes desconexas é necessário ir ao menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Selecionar Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_select_part}). A ferramenta irá apresentar uma tela de configuração de parâmetros que consiste em qual conectividade será levada em consideração (figura~\ref{fig:mask_select_part}), podendo ser $6$, $18$ ou $26$ e o nome da nova máscara que irá ter a imagem resultante.
  150 +
  151 +Todas as imagens a região que tem conectividade com o pixel selecionado. Para selecionar o pixel, é necessário clicar com o \textbf{botão esquerdo do mouse} em sobre o pixel desejado, o objeto irá ficar da cor vermelha, é possível selecionar vários objetos. Após a seleção é necessário clicar no \textbf{botão Ok}. A figura~\ref{fig:mask_selected_part}.a apresenta um objeto selecionado na cor vermelha e a figura~\ref{fig:mask_selected_part}.b somente o objeto após ter fechado a ferramenta (\textbf{botão Ok}).
  152 +
  153 +\begin{figure}[!htb]
  154 +\centering
  155 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_select_part_pt.png}
  156 +\caption{Menu para acessar a ferramenta de seleção de partes.}
  157 +\label{fig:menu_mask_select_part}
  158 +\end{figure}
  159 +
  160 +\begin{figure}[!htb]
  161 +\centering
  162 +\includegraphics[scale=0.7]{mask_select_part_pt.png}
  163 +\caption{Tela para configurar parâmetros de seleção de partes.}
  164 +\label{fig:mask_select_part}
  165 +\end{figure}
  166 +
  167 +\begin{figure}[!htb]
  168 + \centering
  169 + \subfloat[Região selecionada em vermelho]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_select_part_pt.png}} \qquad
  170 + \subfloat[Imagem final, somente com a região selecionada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part_pt.png}}
  171 + \hfill
  172 + \caption{Exemplo de região selecionada na máscara.}
  173 + \label{fig:mask_selected_part}
  174 +\end{figure}
  175 +
  176 +\section{Cortar}
  177 +
  178 +É possível cortar parte da máscara afim de selecionar uma região de interesse, isso pode ajudar reduzindo a quantidade de informações a ser processadas ao gerar superfície. Para abrir a ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último \textbf{Cortar} (figura~\ref{fig:menu_mask_crop}).
  179 +
  180 +\begin{figure}[!htb]
  181 +\centering
  182 +\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_crop_pt.png}
  183 +\caption{Menu para acessar a ferramenta de corte.}
  184 +\label{fig:menu_mask_crop}
  185 +\end{figure}
  186 +
  187 +Será exibida uma caixa delimitadora em cada janela das orientações axial, coronal e sagital.
0 188 \ No newline at end of file
... ...
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  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -25,22 +25,22 @@ superfície.
25 25 A figura \ref{fig:axial_linear} mostra uma medida linear em 2D na orientação axial,
26 26 e a figura \ref{fig:3d_linear} mostra outra medida linear em 3D (superfície).
27 27  
  28 +Uma vez feita a medida linear em 2D, é possível edita-la, para isso é necessário posicionar o mouse sobre uma das extremidades, manter o \textbf{botão direito do mouse} pressionado e arrastar para a posição desejada.
  29 +
28 30 \begin{figure}[!htb]
29 31 \centering
30   -\includegraphics[scale=0.4]{axial_linear}
  32 +\includegraphics[scale=0.4]{axial_linear.png}
31 33 \caption{Medida linear sobre imagem plana}
32 34 \label{fig:axial_linear}
33 35 \end{figure}
34 36  
35 37 \begin{figure}[!htb]
36 38 \centering
37   -\includegraphics[scale=0.3]{3d_linear}
  39 +\includegraphics[scale=0.3]{3d_linear.jpg}
38 40 \caption{Medida linear sobre superfície}
39 41 \label{fig:3d_linear}
40 42 \end{figure}
41 43  
42   -\newpage
43   -
44 44 \textbf{Nota: A medida linear é dada em milímetros (mm).}
45 45  
46 46 \section{Medição angular}
... ... @@ -66,16 +66,18 @@ a imagem ou superfície.
66 66 A figura \ref{fig:axial_angular} ilustra uma medida angular em uma imagem plana, e a
67 67 figura \ref{fig:axial_superficie} ilustra uma medida angular sobre uma superfície.
68 68  
  69 +A exemplo da medida linear em 2D, também é possível editar a medida angular 2D, para isso é necessário posicionar o mouse sobre uma das extremidades, manter o \textbf{botão direito do mouse} pressionado e arrastar para a posição desejada.
  70 +
69 71 \begin{figure}[!htb]
70 72 \centering
71   -\includegraphics[scale=0.38]{axial_angular}
  73 +\includegraphics[scale=0.38]{axial_angular.png}
72 74 \caption{Medida angular sobre imagem plana}
73 75 \label{fig:axial_angular}
74 76 \end{figure}
75 77  
76 78 \begin{figure}[!htb]
77 79 \centering
78   -\includegraphics[scale=0.33]{angular_superficie}
  80 +\includegraphics[scale=0.33]{angular_superficie.jpg}
79 81 \caption{Medida angular sobre superfície}
80 82 \label{fig:axial_superficie}
81 83 \end{figure}
... ... @@ -85,15 +87,15 @@ figura \ref{fig:axial_superficie} ilustra uma medida angular sobre uma superfíc
85 87  
86 88 \section{Medição volumétrica}
87 89  
88   -As medições volumétricas são feitas automaticamente ao se criar uma nova superfície.
  90 +As medições de volume e área são feitas automaticamente ao se criar uma nova superfície.
89 91 Elas são exibidas na aba \textbf{Superfícies 3D}, no painel de gerenciamento de \textbf{Dados}, localizado no canto
90 92 inferior esquerdo da tela, como ilustra a figura \ref{fig:volumetric_mensure}.
91 93  
92 94 \begin{figure}[!htb]
93 95 \centering
94   -\includegraphics[scale=0.5]{medida_volumetrica}
  96 +\includegraphics[scale=0.7]{painel_volumetric_measures_pt.png}
95 97 \caption{Medidas volumétricas}
96 98 \label{fig:volumetric_mensure}
97 99 \end{figure}
98 100  
99   -\textbf{Nota: A medida volumétrica é dada em milímetros cúbicos ($mm^3$)}
  101 +\textbf{Nota: A medida de volume é dada em milímetro cúbico ($mm^3$), já a de área em milímetro quadrado ($mm^2$)}
... ...
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... ... @@ -0,0 +1,162 @@
  1 +\chapter{Neuronavegação}
  2 +
  3 +\section{Introdução}
  4 +
  5 +Neuronavegação é a uma técnica que através da visualização computacional permite rastrear instrumentos cirúrgicos em relação às estruturas neuronais. Além disso, sistemas de neuronavegação têm sido apontados como uma ferramenta fundamental para aumentar a precisão de experimentos em neurociência, como a estimulação magnética transcraniana (EMT), eletroencefalografia, magnetoencefalografia e espectroscopia no infravermelho próximo. Apesar do vasto campo de aplicações, o uso da neuronavegação em centros de pesquisa é limitado pelo alto custo. O modulo de neuronavegação do InVesalius oferece aos usuários uma alternativa de baixo custo e código aberto aos sistemas comercias de navegação. Desta maneira, é possível utilizar ferramentas específicas para neunavegação e ainda ter a possibilidade de desenvolvimento de funcionalidades sob demanda. O neuronavegador é distribuído em uma versão executável compatível com sistema operacional Windows 7, 8 e 10.
  6 +
  7 +\section{Modo Navegação}
  8 +
  9 +Para utilizar o neuronavegador, é necessário habilitar o modo de neuronavegação do InVesalius selecionando no menu \textbf{Modo} em seguida \textbf{Navegação} (figura~\ref{fig:nav_menu_pt}). Será ativada uma nova aba "Sistema de navegação" que ficará visível no painel à esquerda da janela principal como é apresentado na figura~\ref{fig:nav_painel_pt}.
  10 +
  11 +\begin{figure}[!htb]
  12 +\centering
  13 +\includegraphics[scale=0.4]{nav_menu_pt.png}
  14 +\caption{Menu para ativar o modulo de neuronavegação.}
  15 +\label{fig:nav_menu_pt}
  16 +\end{figure}
  17 +
  18 +\begin{figure}[!htb]
  19 +\centering
  20 +\includegraphics[scale=0.6]{nav_painel_pt.png}
  21 +\caption{Aba do sistema de neuronavegação.}
  22 +\label{fig:nav_painel_pt}
  23 +\end{figure}
  24 +
  25 +\section{Rastreadores espaciais e modo de referência}
  26 +
  27 +O sistema de neuronavegação se comunica com vários sistemas de rastreamento espacial. Atualmente, suporta os dispositivos fabricados pela ClaroNav (figura~\ref{fig:tracker_claron}) e Polhemus (figura~\ref{fig:tracker_polhemus}).
  28 +
  29 +O usuário deve selecionar o dispositivo correspondente no botão \textbf{Selecione o rastreador:}, figura~\ref{fig:nav_select_tracker}. Caso o usuário não possua nenhum dos rastreadores suportados e deseja realizar um teste do sistema, deve selecionar a opção \textbf{Depurar rastreador} e realizar normalmente os procedimentos que serão citados a seguir. Nessa opção, trata-se de uma simulação, do qual serão geradas coordenadas aleatórias.
  30 +
  31 +\begin{figure}[!htb]
  32 +\centering
  33 +\includegraphics[scale=0.4]{tracker_claron.png}
  34 +\caption{Rastreador Claron - www.claronav.com/microntracker/.}
  35 +\label{fig:tracker_claron}
  36 +\end{figure}
  37 +
  38 +\begin{figure}[!htb]
  39 +\centering
  40 +\includegraphics[scale=0.5]{tracker_polhemus.jpg}
  41 +\caption{Rastreador Polhemus - http://polhemus.com/motion-tracking/overview/.}
  42 +\label{fig:tracker_polhemus}
  43 +\end{figure}
  44 +
  45 +\begin{figure}[!htb]
  46 +\centering
  47 +\includegraphics[scale=0.5]{nav_select_tracker_pt.png}
  48 +\caption{Menu para seleção de rastreador.}
  49 +\label{fig:nav_select_tracker}
  50 +\end{figure}
  51 +
  52 +É possível realizar a navegação com dois diferentes tipos de referência, estático e dinâmico (figura~\ref{fig:nav_menu_ref}). No modo estático as coordenadas do dispositivo de rastreamento são detectadas com apenas uma sonda. Este modo de navegação é chamado de modo de referência estática porque a cabeça dos sujeitos deve permanecer estática na posição em que foram detectados os pontos fiduciais (Mais informações na seção~\ref{sec:corregistro}).
  53 +Para evitar problemas relacionados com o movimento da cabeça, alguns dispositivos de rastreamento fornecem uma sonda de referência. A sonda de referência pode ser ligada a uma parte não móvel da cabeça, por exemplo testa, para acompanhar as translações e rotações durante o procedimento de navegação. O uso de uma sonda de referência é o chamado modo de referência dinâmica.
  54 +
  55 +\begin{figure}[!htb]
  56 +\centering
  57 +\includegraphics[scale=0.5]{nav_menu_ref.png}
  58 +\caption{Menu para seleção de referência.}
  59 +\label{fig:nav_menu_ref}
  60 +\end{figure}
  61 +
  62 +\section{Corregistro}
  63 +\label{sec:corregistro}
  64 +
  65 +O objetivo do corregistro é as coordenadas virtual (imagem) e a as coordendas física do dispositivo de rastreamento em comum. Para realizar o corregistro, o usuário deve selecionar três marcadores fiduciais na imagem, para isso primeiramente deverá ativar o recurso de \textbf{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal} (ver seção~\ref{sec:corresp_all_orient}), coletar as três coordenadas fiduciais usando a sonda do dispositivo de rastreamento. Os fiduciais mais utilizados são o trago auricular esquerdo, trago auricular direito e a fossa nasal. A figura~\ref{fig:nav_selec_coord} ilustra a coleta dos pontos fiduciais. Quando é selecionado algum ponto fiducial na imagem, automaticamente é criado um marcador (esfera da cor verde) no volume, figura~\ref{fig:nav_balls_in_head}.
  66 +
  67 +\begin{figure}[!htb]
  68 +\centering
  69 +\includegraphics[scale=0.5]{nav_selec_coord_pt.png}
  70 +\caption{Botões e coordenadas para seleção de pontos fiduciais.}
  71 +\label{fig:nav_selec_coord}
  72 +\end{figure}
  73 +
  74 +As siglas dos botões para coleta dos fiduciais representam:
  75 +
  76 +\begin{itemize}
  77 + \item OEI: trago auricular esquerdo na imagem
  78 + \item ODI: trago auricular direito na imagem
  79 + \item NAI: fossa nasal na imagem
  80 + \item OER: trago auricular esquerdo no rastreador
  81 + \item OER: trago auricular direito no rastreador
  82 + \item NAR: fossa nasal esquerdo no rastreador
  83 +\end{itemize}
  84 +
  85 +\begin{figure}[!htb]
  86 +\centering
  87 +\includegraphics[scale=0.5]{nav_balls_in_head.png}
  88 +\caption{Criação de marcadores nos pontos fiduciais da imagem.}
  89 +\label{fig:nav_balls_in_head}
  90 +\end{figure}
  91 +
  92 +
  93 +\section{Erro de registro fiducial e navegação}
  94 +
  95 +Após o usuário selecionar os três pontos fiduciais na imagem e os respectivos pontos com o rastreador espacial, o próximo passo é clicar no \textbf{botão Navegar} e o procedimento de navegação será iniciado. Para pausar a navegação, basta clicar novamente no \textbf{botão Navegar}. Automaticamente após selecionado a navegação é calculado o erro de registro fiducial, conhecido como \textit{Fiducial Registration Error} (FRE). Esse erro representa a distância média quadrática do ponto fiducial na imagem com o respectivo ponto fiducial obtido após realizado o corregistro.
  96 +
  97 +Ao lado do botão de navegação, há a caixa de texto respectivo ao FRE. Se o FRE apresentar um valor alto (acima de 3 mm) a navegação não será precisa e a caixa de texto ficará vermelha, figura~\ref{fig:nav_fre_error}, recomenda-se que o corregistro seja refeito. Caso contrário, para FRE menor que 3 mm a caixa de texto fica verde, representando que a navegação terá precisão aceitável, figura~\ref{fig:nav_fre_ok}.
  98 +
  99 +\begin{figure}[!htb]
  100 +\centering
  101 +\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_error_pt.png}
  102 +\caption{Botão de navegação e FRE com valor elevado para navegação.}
  103 +\label{fig:nav_fre_error}
  104 +\end{figure}
  105 +
  106 +\begin{figure}[!htb]
  107 +\centering
  108 +\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_ok_pt.png}
  109 +\caption{Botão de navegação e FRE com valor aceitável para navegação.}
  110 +\label{fig:nav_fre_ok}
  111 +\end{figure}
  112 +
  113 +\section{Marcadores}
  114 +
  115 +Durante a navegação, é possível criar marcadores esféricos no volume 3D. Para acessar essa função, basta clicar na aba \textbf{Ferramentas extras}, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}.
  116 +
  117 +\begin{figure}[!htb]
  118 +\centering
  119 +\includegraphics[scale=0.6]{nav_extra_tools_pt.png}
  120 +\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
  121 +\label{fig:nav_extra_tools}
  122 +\end{figure}
  123 +
  124 +A criação de marcadores pode ser executada clicando no botão correspondente, com isso será criado um marcador na posição da cruz vermelha com as características escolhidas na aba, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}. O número 4 representa o tamanho do raio da esfera que será criada. Ao lado do tamanho do marcador é possível definir a cor da esfera (figura~\ref{fig:nav_vol_with_markers}).
  125 +
  126 +Depois da criação é possível criar uma identificação para o marcador, para isso, deve-se clicar com o botão direto sobre o marcador desejado e selecionar \textbf{Editar ID}, figura~\ref{fig:nav_id_list_markers}, será aberto uma janela para o usuário digitar a identificação, figura~\ref{fig:nav_edit_id_markers}.
  127 +
  128 +
  129 +\begin{figure}[!htb]
  130 +\centering
  131 +\includegraphics[scale=0.4]{nav_vol_with_markers.png}
  132 +\caption{Volume com marcadores em diferentes cores.}
  133 +\label{fig:nav_vol_with_markers}
  134 +\end{figure}
  135 +
  136 +
  137 +\begin{figure}[!htb]
  138 +\centering
  139 +\includegraphics[scale=0.6]{nav_id_list_markers_pt.png}
  140 +\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
  141 +\label{fig:nav_id_list_markers}
  142 +\end{figure}
  143 +
  144 +\begin{figure}[!htb]
  145 +\centering
  146 +\includegraphics[scale=0.6]{nav_edit_id_markers_pt.png}
  147 +\caption{Janela para editar identificação do marcador.}
  148 +\label{fig:nav_edit_id_markers}
  149 +\end{figure}
  150 +
  151 +A exportação dos marcadores é feita através do \textbf{botão salvar}, a extensão do arquivo gerado é o .mks. Essa extensão de arquivo pode ser aberta por processadores de texto como bloco de notas. O arquivo possui as coordenadas $X$, $Y$ e $Z$ seguido o código $RGB$, tamanho de marcador e a identificação. Posteriormente, esse arquivo pode ser importado através do \textbf{botão Carregar}.
  152 +
  153 +Caso o usuário desejar excluir apenas um marcador basta \textbf{selecionar} o item desejado na lista e clicar no \textbf{botão Remover}, também existe a opção de excluir todos os marcadores criados, \textbf{Deletar todos marcadores}. Além disso, pode-se ocultar/mostrar a exibição dos marcadores no volume pelo \textbf{botão ocultar/mostrar}.
  154 +
  155 +\section{Caixas de seleção, trigger externo}
  156 +
  157 +Outra maneira para criação de marcadores é a monitoração externa de trigger. Para ativa-la basta selecionar a caixa de seleção \textbf{Trigger externo}. Essa função foi desenvolvida para comunicar dispositivos EMT e criar automaticamente o marcador em posições onde os pulsos foram aplicados. No entanto, outras aplicações são possíveis de acordo com a necessidade do usuário.
  158 +A comunicação com o dispositivo externo é feita através da porta serial COM1, e basta enviar qualquer sinal do tipo RS-232 em uma velocidade \textit{baud rate} de 9600 no pino de recepção que será criado um marcador na atual posição da cruz.
  159 +
  160 +\section{Câmera do volume}
  161 +
  162 +O posicionamento da câmera do volume é atualizado automaticamente, tanto pela posição da cruz vermelha das fatias quanto pela posição da sonda durante a navegação. O usuário pode desabilitar a atualização automática e atualizar a câmera manualmente. O posicionamento será alterado caso o usuário o fizer na janela de volume. Para isso, basta desmarcar a caixa de seleção \textbf{Câmera do volume}.
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_segmen.tex
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... ... @@ -16,7 +16,7 @@ no item \textbf{2. Selecione a região de interesse} (figura \ref{fig:region_sel
16 16  
17 17 \begin{figure}[!htb]
18 18 \centering
19   -\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter01Jan201144.jpg}
  19 +\includegraphics[scale=0.6]{segmentation_threshold_window_left_pt.png}
20 20 \caption{Seleção de região de interesse}
21 21 \label{fig:region_selection}
22 22 \end{figure}
... ... @@ -27,7 +27,7 @@ imagem com a região selecionada colorida e sobreposta à imagem original. Veja
27 27  
28 28 \begin{figure}[!htb]
29 29 \centering
30   -\includegraphics[scale=0.4]{limiar_principal}
  30 +\includegraphics[scale=0.4]{segmentation_threshold_axial_pt.png}
31 31 \caption{Máscara (regiões em amarelo)}
32 32 \label{fig:region_selection_masc}
33 33 \end{figure}
... ... @@ -41,7 +41,7 @@ pintando somente os \textit{pixels} com intensidade dentro da faixa determinada.
41 41  
42 42 \begin{figure}[!htb]
43 43 \centering
44   -\includegraphics[scale=0.7]{limiar_barra}
  44 +\includegraphics[scale=0.75]{segmentation_threshold_bar.png}
45 45 \caption{Seleção dos \textit{pixels} com intensidade entre 226 e 3021 (Osso)}
46 46 \label{fig:region_selection_bar}
47 47 \end{figure}
... ... @@ -52,7 +52,7 @@ automaticamente.
52 52  
53 53 \begin{figure}[!htb]
54 54 \centering
55   -\includegraphics[scale=0.6]{limiar_presets}
  55 +\includegraphics[scale=0.65]{segmentation_threshold_presets_pt.png}
56 56 \caption{Caixa de seleção de valores pré-definidos de limiar}
57 57 \label{fig:limiar_presets}
58 58 \end{figure}
... ... @@ -107,7 +107,7 @@ Selecione a faixa de limiar desejada e clique em \textbf{OK}.
107 107  
108 108 \begin{figure}[!htb]
109 109 \centering
110   -\includegraphics[scale=0.5]{limiar_janela}
  110 +\includegraphics[scale=0.55]{segmentation_threshold_window_dialog_pt.png}
111 111 \caption{Criar uma nova máscara}
112 112 \label{fig:create_new_mask}
113 113 \end{figure}
... ... @@ -124,7 +124,7 @@ selecionar, \textbf{antes} da geração, a opção \textbf{Sobrescrever anterior
124 124  
125 125 \begin{figure}[!htb]
126 126 \centering
127   -\includegraphics[scale=0.5]{generate_surface}
  127 +\includegraphics[scale=0.55]{segmentation_generate_surface_pt.png}
128 128 \caption{Botão Gerar superfície}
129 129 \label{fig:generate_surface}
130 130 \end{figure}
... ... @@ -134,7 +134,7 @@ Após alguns instantes, a superfície será exibida na janela de visualização
134 134  
135 135 \begin{figure}[!htb]
136 136 \centering
137   -\includegraphics[scale=0.5]{3d_model}
  137 +\includegraphics[scale=0.5]{surface_from_threshold.png}
138 138 \caption{Superfície 3D}
139 139 \label{fig:surface}
140 140 \end{figure}
... ... @@ -151,8 +151,8 @@ por parte do usuário. Para utilizá-la, é necessário clicar em \textbf{EdiçÃ
151 151  
152 152 \begin{figure}[!htb]
153 153 \centering
154   -\includegraphics[scale=0.6]{edicao_avancada.png}
155   -\caption{Ferramentas avançadas de edição}
  154 +\includegraphics[scale=0.75]{segmentation_manual_label_pt.png}
  155 +\caption{Ãcone para abrir a ferramenta de edição manual}
156 156 \label{fig:advanced_edition}
157 157 \end{figure}
158 158  
... ... @@ -160,7 +160,7 @@ O painel de edição aparece como mostra a figura \ref{fig:edition_slices_ref}.
160 160  
161 161 \begin{figure}[!htb]
162 162 \centering
163   -\includegraphics[scale=0.5]{edition_slices}
  163 +\includegraphics[scale=0.6]{segmentation_manual_window_pt.png}
164 164 \caption{Painel de edição}
165 165 \label{fig:edition_slices_ref}
166 166 \end{figure}
... ... @@ -172,7 +172,7 @@ mostra a figura \ref{fig:brush_type}.
172 172  
173 173 \begin{figure}[!htb]
174 174 \centering
175   -\includegraphics[scale=0.5]{edit_pencil}
  175 +\includegraphics[scale=0.9]{segmentation_manual_pencil_type.png}
176 176 \caption{Tipo de pincel}
177 177 \label{fig:brush_type}
178 178 \end{figure}
... ... @@ -183,7 +183,7 @@ Também é possível alterar o diâmetro do pincel, conforme mostra a figura \re
183 183  
184 184 \begin{figure}[!htb]
185 185 \centering
186   -\includegraphics[scale=0.5]{diametro_pincel}
  186 +\includegraphics[scale=0.8]{segmentation_manual_diameter.png}
187 187 \caption{Seleção do diâmetro do pincel}
188 188 \label{fig:select_diameter}
189 189 \end{figure}
... ... @@ -200,7 +200,7 @@ A figura \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operações do pin
200 200  
201 201 \begin{figure}[!htb]
202 202 \centering
203   -\includegraphics[scale=0.6]{select_brush_operation}
  203 +\includegraphics[scale=0.7]{segmentation_manual_pencil_type_operation_type_pt.png}
204 204 \caption{Seleção do tipo de operação do pincel}
205 205 \label{fig:select_brush_operations}
206 206 \end{figure}
... ... @@ -212,7 +212,7 @@ seleciona parte dos ruídos, pois eles estão na mesma intensidade do limiar par
212 212  
213 213 \begin{figure}[!htb]
214 214 \centering
215   -\includegraphics[scale=0.3]{noise_amalgam}
  215 +\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam.jpg}
216 216 \caption{Imagem com ruído segmentada com limiar}
217 217 \label{fig:noise_amalgaman}
218 218 \end{figure}
... ... @@ -222,14 +222,14 @@ segmentação.
222 222  
223 223 \begin{figure}[!htb]
224 224 \centering
225   -\includegraphics[scale=0.3]{case_almagam}
  225 +\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_3d.jpg}
226 226 \caption{Superfície gerada a partir de imagem com ruído}
227 227 \label{fig:surface_amagaman}
228 228 \end{figure}
229 229  
230 230 \begin{figure}[!htb]
231 231 \centering
232   -\includegraphics[scale=0.3]{case_almagam_zoom}
  232 +\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_3d_zoom.jpg}
233 233 \caption{Zoom da região com ruído}
234 234 \label{fig:surface_amagaman_zoom}
235 235 \end{figure}
... ... @@ -245,14 +245,14 @@ edição.
245 245  
246 246 \begin{figure}[!htb]
247 247 \centering
248   -\includegraphics[scale=0.3]{editor_amagam}
  248 +\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_removed.jpg}
249 249 \caption{Imagem com ruído removido}
250 250 \label{fig:editor_amalgaman}
251 251 \end{figure}
252 252  
253 253 \begin{figure}[!htb]
254 254 \centering
255   -\includegraphics[scale=0.3]{edited_amalgam}
  255 +\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_removed_3d_zoom.jpg}
256 256 \caption{Superfície criada a partir da imagem com ruído removido}
257 257 \label{fig:surface_edited_amalgaman}
258 258 \end{figure}
... ... @@ -261,13 +261,13 @@ edição.
261 261 Realizada a edição, basta gerar a superfície a partir da imagem editada (figura
262 262 \ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Como houve edição, ao clicar em \textbf{Criar superfície}, será
263 263 requerido se deseja gerar a superfície a partir do método \textbf{binário} ou utilizando o método de suavização
264   -\textbf{Context aware smoothing} (figura \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfície.
  264 +\textbf{Suavização sensível ao contexto} (figura \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfície.
265 265 Demais detalhes serão discutidos no capítulo \ref{cap_surface}.
266 266 %\ref{fig:generate_surface}).
267 267  
268 268 \begin{figure}[!htb]
269 269 \centering
270   -\includegraphics[scale=0.5]{create_surface_edited.png}
  270 +\includegraphics[scale=0.5]{surface_generation_dialog_pt.png}
271 271 \caption{Método de criação de superfície}
272 272 \label{fig:new_surface_edited}
273 273 \end{figure}
... ... @@ -279,14 +279,7 @@ A segmentação por watershed, necessita que o usuário indique através de marc
279 279  
280 280 \begin{figure}[!htb]
281 281 \centering
282   -\includegraphics[scale=0.6]{watershed_panel.png}
283   -\caption{Painel de segmentação por Watershed}
284   -\label{fig:watershed_painel}
285   -\end{figure}
286   -
287   -\begin{figure}[!htb]
288   -\centering
289   -\includegraphics[scale=0.6]{watershed_panel.png}
  282 +\includegraphics[scale=0.75]{segmentation_watershed_panel_pt.png}
290 283 \caption{Painel de segmentação por Watershed}
291 284 \label{fig:watershed_painel}
292 285 \end{figure}
... ... @@ -296,11 +289,12 @@ Antes de iniciar a segmentação por Watershed, é recomendável limpar toda a m
296 289 Para inserir marcadores de fundo e objeto, é utilizada uma ferramenta em forma de pincel, a exemplo da segmentação manual, existe a opção de selecionar pincel retangular ou circular, também é possível alterar o tamanho deles.
297 290  
298 291 É necessário também selecionar o tipo de operação que será realizada pelo pincel. As opções são as
299   -seguintes:\\
300   -\\
301   -\textbf{Objeto}, para inserir marcadores de objeto;\\
302   -\textbf{Fundo}, para inserir marcadores de fundo (não é objeto);\\
303   -\textbf{Apagar}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.\\
  292 +seguintes:
  293 +\begin{itemize}
  294 +\item \textbf{Objeto}, para inserir marcadores de objeto;
  295 +\item \textbf{Fundo}, para inserir marcadores de fundo (não é objeto);
  296 +\item \textbf{Apagar}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.
  297 +\end{itemize}
304 298  
305 299 A opção "\textbf{Sobrescrever máscara}" é utilizada quando deseja-se que a máscara selecionada seja substituída pelo resultado da segmentação. Já a opção "\textbf{Considerar brilho e contraste}" é utilizada para o algoritmo levar em consideração a imagem que está sendo visualizada, assim é possível alterar o brilho e contraste e obter resultados melhores de segmentação.
306 300  
... ... @@ -317,7 +311,7 @@ A conectividade dos pixels que serão levados em consideração, pode ser altera
317 311  
318 312 \begin{figure}[!htb]
319 313 \centering
320   -\includegraphics[scale=0.5]{watershed_opcao.png}
  314 +\includegraphics[scale=0.55]{segmentation_watershed_conf_pt.png}
321 315 \caption{Opções de configuração do método de Watershed}
322 316 \label{fig:watershed_janela_conf}
323 317 \end{figure}
... ... @@ -328,72 +322,65 @@ Ainda na figura~\ref{fig:watershed_2d}, podemos visualizar os marcadores de obje
328 322  
329 323 \begin{figure}[!htb]
330 324 \centering
331   -\includegraphics[scale=0.2]{watershed_2d.png}
  325 +\includegraphics[scale=0.2]{segmentation_watershed_axial.png}
332 326 \caption{Watershed aplicado em uma fatia de um volume.}
333 327 \label{fig:watershed_2d}
334 328 \end{figure}
335 329  
336 330 \begin{figure}[!htb]
337 331 \centering
338   -\includegraphics[scale=0.2]{watershed_3d.png}
  332 +\includegraphics[scale=0.4]{segmentation_watershed_multiplanar_3d_pt.png}
339 333 \caption{Segmentação do cérebro com o método de Watershed aplicado em todo um volume (expandido em 3D).}
340 334 \label{fig:watershed_3d}
341 335 \end{figure}
342 336  
343   -\section{Operações booleanas}
344   -
345   -Após efetuar segmentações, é possível realizar operações booleanas entre as máscaras. As operações booleanas suportadas são:\\
346   -\\
347   -\textbf{União}, realiza a união de duas máscaras;\\
348   -\textbf{Diferença}, realiza a diferença entre a primeira máscara com a segunda;\\
349   -\textbf{Intersecção}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.\\
350   -\textbf{Disjunção exclusiva}, também é conhecida como XOR, mantém as regiões de ambas as máscara que possuem diferença.\\
  337 +\section{Crescimento de região}
351 338  
352   -Para ativar essa ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Operações boolenas}, como é exibido na figura~\ref{fig:booleano_menu}
  339 +A técnica de segmentação por crescimento de região é ativada no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Segmentação}, por último \textbf{Crescimento de região} (figura~\ref{menu_segmentation_region_growing}). Inicialmente deve-se selecionar a configuração entre \textbf{2D - Fatia atual} ou \textbf{3D - Todas as fatias}, também é necessário selecionar a conectividade do crescimento entre $4$ ou $8$ para o 2D e $6$, $18$ ou $26$ para 3D. Por último é necessário selecionar o método, entre \textbf{Dinâmico, Limiar ou Confidência} (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic}).
353 340  
354 341 \begin{figure}[!htb]
355 342 \centering
356   -\includegraphics[scale=0.5]{booleano_menu.png}
357   -\caption{Menu para ativar a ferramenta de operações booleanas.}
358   -\label{fig:booleano_menu}
  343 +\includegraphics[scale=0.5]{menu_segmentation_region_growing_pt.png}
  344 +\caption{Menu para ativar a segmentação por região de crescimento.}
  345 +\label{fig:menu_segmentation_region_growing_pt}
359 346 \end{figure}
360 347  
361   -É necessário selecionar a primeira máscara, a operação a ser realizada e a segunda máscara conforme mostra a figura~\ref{fig:booleano_janela}. Em seguida é necessário clicar no botão \textbf{Ok}.
362   -
363 348 \begin{figure}[!htb]
364 349 \centering
365   -\includegraphics[scale=0.5]{boolano_janela.png}
366   -\caption{Ferramenta de operações booleanas.}
367   -\label{fig:booleano_janela}
368   -\end{figure}
369   -
370   -Na figura~\ref{fig:op_boolana}, apresentamos um exemplo de utilização da ferramenta.
371   -
372   -\begin{figure}[!htb]
373   - \centering
374   - \subfloat[Máscara A]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_a}}
375   - \hfill
376   - \subfloat[Máscara B]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_b}}
377   - \hfill
378   - \subfloat[União (A $\cup$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_uniao}}
379   - \hfill
380   - \subfloat[Diferença (A - B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_dif}}
381   - \hfill
382   - \subfloat[Intersecção (A $\cap$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_interc}}
383   - \hfill
384   - \subfloat[Disjunção exclusiva (A $\oplus$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_disj_exc}}
385   - \caption{Exemplo de operações booleanas.}
386   - \label{fig:op_boolana}
  350 +\includegraphics[scale=0.7]{segmentation_region_growing_dinamic_pt.png}
  351 +\caption{Tela para ajuste de parâmetros de segmentação por crescimento de região.}
  352 +\label{fig:segmentation_region_growing_dinamic}
387 353 \end{figure}
388 354  
389   -\section{Limpeza total da máscara}
390   -\label{cap:limpeza_mascara}
391   -
392   -Pode-se efetuar a limpeza total da máscara (figura~\ref{fig:limpeza_mascara}), isso é recomendado antes de iniciar a inserção de marcadores de Watershed. A ferramenta está localizada no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara}, \textbf{Limpar máscara}, também é possível executa-la pressionando as teclas \textbf{CTRL+SHIFT+A}.
393   -
394   -\begin{figure}[!htb]
395   -\centering
396   -\includegraphics[scale=0.6]{watershed_limpeza.png}
397   -\caption{Limpeza de máscara}
398   -\label{fig:limpeza_mascara}
399   -\end{figure}
400 355 \ No newline at end of file
  356 +A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botão direito} do mouse, os pixels vizinhos que satisfazem as condições indicadas anteriormente são selecionados. Cada método leva em consideração diferentes condições, a seguir são apresentadas as diferenças entre cada método:
  357 +
  358 +\begin{itemize}
  359 + \item \textbf{Dinâmico}: Esse método captura o valor do pixel que foi clicado, levando em consideração o desvio para baixo (min) e desvio para cima (max). A opção \textbf{Considerar o brilho e contraste} é ativada por padrão, essa opção permite levar em consideração os valores de níveis de cinza que são exibidos e/ou ajustados na opção brilho e contraste. Ao desativar essa opção será levado em consideração os valores de cinza gravados na imagem (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}).
  360 +
  361 + \begin{figure}[!htb]
  362 + \centering
  363 + \includegraphics[scale=0.7]{segmentation_region_growing_dinamic_parameter_pt.png}
  364 + \caption{Ajuste de parâmetros para o método dinâmico.}
  365 + \label{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}
  366 + \end{figure}
  367 +
  368 + \item \textbf{Limiar}: O método limiar selecionará os pixels cuja a vizinhança estejam dentro do valor mínimo e máximo (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_limiar}).
  369 +
  370 + \begin{figure}[!htb]
  371 + \centering
  372 + \includegraphics[scale=0.7]{segmentation_region_growing_limiar_pt.png}
  373 + \caption{Ajuste de faixa de valores do método limiar.}
  374 + \label{fig:segmentation_region_growing_limiar}
  375 + \end{figure}
  376 +
  377 + \item \textbf{Confidência}: O método (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_confidence_parameter})
  378 +
  379 + \begin{figure}[!htb]
  380 + \centering
  381 + \includegraphics[scale=0.7]{segmentation_region_growing_confidence_parameter_pt.png}
  382 + \caption{Ajuste de faixa de valores do método limiar.}
  383 + \label{fig:segmentation_region_growing_confidence_parameter}
  384 + \end{figure}
  385 +
  386 +
  387 +\end{itemize}
401 388 \ No newline at end of file
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_superf.tex
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -13,7 +13,7 @@ no painel esquerdo do software, dentro do item \textbf{3. Configure a superfíci
13 13  
14 14 \begin{figure}[!htb]
15 15 \centering
16   -\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_23_Jan_23_23_10}
  16 +\includegraphics[scale=0.65]{surface_config_panel_pt.png}
17 17 \caption{Configuração de uma superfície 3D}
18 18 \label{fig:3d_surface_managment}
19 19 \end{figure}
... ... @@ -39,7 +39,7 @@ seleção da maior região da superfície.
39 39  
40 40 \begin{figure}[!htb]
41 41 \centering
42   -\includegraphics[scale=0.5]{new_surface.png}
  42 +\includegraphics[scale=0.5]{surface_config_window_pt.png}
43 43 \caption{Janela para criação de superfície}
44 44 \label{fig:create_surface_1}
45 45 \end{figure}
... ... @@ -55,8 +55,8 @@ selecionadas: "Preencher buracos" e "Manter maior região".
55 55  
56 56 \begin{figure}
57 57 \centering
58   - \subfloat[Frente]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.338\textwidth]{ScreenHunter_48_Jan_23_23_34}}
59   - \subfloat[Baixo]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{ScreenHunter_50Jan232334}}
  58 + \subfloat[Frente]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.338\textwidth]{surface_model_front.jpg}}
  59 + \subfloat[Baixo]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{surface_model_bottom.jpg}}
60 60 \caption{Superfície com região maior selecionada e com buracos preenchidos}
61 61 \label{fig:surface_ex1}
62 62 \end{figure}
... ... @@ -68,8 +68,8 @@ suporte do tomógrafo e a superfície aberta.
68 68  
69 69 \begin{figure}
70 70 \centering
71   - \subfloat[Frente]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.371\textwidth]{ScreenHunter_52Jan232335}}
72   - \subfloat[Baixo]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{ScreenHunter_53Jan232336}}
  71 + \subfloat[Frente]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.371\textwidth]{surface_model_front_all_parts.jpg}}
  72 + \subfloat[Baixo]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{surface_model_bottom_all_parts.jpg}}
73 73 \caption{Superfície sem a seleção da maior região e com buracos abertos}
74 74 \label{fig:surface_ex2}
75 75 \end{figure}
... ... @@ -105,7 +105,7 @@ superfície por meio da lista de seleção, dentro do item \textbf{3. Configure
105 105  
106 106 \begin{figure}[!htb]
107 107 \centering
108   -\includegraphics[scale=0.6]{select_surface}
  108 +\includegraphics[scale=0.8]{surface_select_menu.png}
109 109 \caption{Seleção de superfície}
110 110 \label{fig:select_surface}
111 111 \end{figure}
... ... @@ -116,7 +116,7 @@ o controle, maior será a transparência aplicada.
116 116  
117 117 \begin{figure}[!htb]
118 118 \centering
119   -\includegraphics[scale=0.5]{transparency}
  119 +\includegraphics[scale=0.7]{surface_transparency_pt.png}
120 120 \caption{Seleção de nível de transparência}
121 121 \label{fig:select_transparency}
122 122 \end{figure}
... ... @@ -143,7 +143,7 @@ superfície 3D}, opção \textbf{Propriedades da superfície}.
143 143  
144 144 \begin{figure}[!htb]
145 145 \centering
146   -\includegraphics[scale=0.6]{button_select_color}
  146 +\includegraphics[scale=0.6]{surface_button_select_color_yellow.png}
147 147 \caption{Botão para alteração de cor}
148 148 \label{fig:change_surface_color}
149 149 \end{figure}
... ... @@ -153,7 +153,7 @@ desejada e clique no botão \textbf{OK}.
153 153  
154 154 \begin{figure}[!htb]
155 155 \centering
156   -\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142}
  156 +\includegraphics[scale=0.6]{surface_select_color_windows_so_pt.png}
157 157 \caption{Opções de cor}
158 158 \label{fig:button_select_color}
159 159 \end{figure}
... ... @@ -166,8 +166,8 @@ figura \ref{fig:advanced_tools}.
166 166  
167 167 \begin{figure}[!htb]
168 168 \centering
169   -\includegraphics[scale=0.4]{ferramentas_avancadas}
170   -\caption{Atalho para ferramentas avançadas}
  169 +\includegraphics[scale=0.7]{surface_painel_advanced_options_pt.png}
  170 +\caption{Atalho para opções avançadas}
171 171 \label{fig:advanced_tools}
172 172 \end{figure}
173 173  
... ... @@ -178,8 +178,8 @@ Um menu com as opções disponíveis será exibido, como ilustra a figura
178 178  
179 179 \begin{figure}[!htb]
180 180 \centering
181   -\includegraphics[scale=0.5]{exract_region}
182   -\caption{Ferramentas avançadas}
  181 +\includegraphics[scale=0.7]{surface_split_pt.png}
  182 +\caption{Opções avançadas}
183 183 \label{fig:advanced_tools_expanded}
184 184 \end{figure}
185 185  
... ... @@ -202,7 +202,7 @@ da maior região.
202 202  
203 203 \begin{figure}[!htb]
204 204 \centering
205   -\includegraphics[scale=0.3]{extract_most_region_1}
  205 +\includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region_1.jpg}
206 206 \caption{Superfícies desconexas}
207 207 \label{fig:extract_most_region_1}
208 208 \end{figure}
... ... @@ -212,7 +212,7 @@ desconexa separada.
212 212  
213 213 \begin{figure}[!htb]
214 214 \centering
215   -\includegraphics[scale=0.3]{extract_most_region2}
  215 +\includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region2.jpg}
216 216 \caption{Maior região separada}
217 217 \label{fig:extract_most_region2}
218 218 \end{figure}
... ... @@ -238,7 +238,7 @@ direita do suporte do tomógrafo.
238 238  
239 239 \begin{figure}[!htb]
240 240 \centering
241   -\includegraphics[scale=0.35]{extract_most_region3}
  241 +\includegraphics[scale=0.35]{surface_extract_most_region3.jpg}
242 242 \caption{Exemplo de regiões de interesse selecionadas}
243 243 \label{fig:extract_most_region3}
244 244 \end{figure}
... ... @@ -261,7 +261,7 @@ A figura \ref{fig:extrac_most_region_4} mostra um exemplo.
261 261  
262 262 \begin{figure}[!htb]
263 263 \centering
264   -\includegraphics[scale=0.3]{extrac_most_region_4}
  264 +\includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region_4.jpg}
265 265 \caption{Exemplo de separação de todas as regiões desconexas}
266 266 \label{fig:extrac_most_region_4}
267 267 \end{figure}
... ...
docs/user_guide_pt_BR_source/cap_visual_vol.tex
  Diff comments   View file @b3bd187
... ... @@ -118,7 +118,7 @@ disponível com os demais na próxima vez em que o software for aberto.
118 118  
119 119 \begin{figure}[!htb]
120 120 \centering
121   -\includegraphics[scale=0.6]{save_window_preset}
  121 +\includegraphics[scale=0.7]{save_window_preset_pt.png}
122 122 \caption{Janela para nomear e salvar um padrão}
123 123 \label{fig:save_window_preset}
124 124 \end{figure}
... ... @@ -176,7 +176,7 @@ um padrão de visualização selecionado, clique em \textbf{Ferramentas} e, em s
176 176  
177 177 \begin{figure}[!htb]
178 178 \centering
179   -\includegraphics[scale=0.6]{activate_cut_plane}
  179 +\includegraphics[scale=0.6]{activate_cut_plane_pt.png}
180 180 \caption{Ativando plano para corte}
181 181 \label{fig:activate_cut_plane}
182 182 \end{figure}
... ...
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