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@@ -20,8 +20,31 @@ Fábio de Souza Azevedo
 \\
+André Salles Cunha Peres (Neuronavegador)
+
+\href{mailto:peres.asc@gmail.com}{peres.asc@gmail.com}
+\\
+
+Victor Hugo (Neuronavegador)
+
+\href{mailto:victorhos@hotmail.com}{victorhos@hotmail.com}
+\\
+
+
+Renan Matsuda (Neuronavegador)
+
+\href{mailto:renan\_hiroshi@hotmail.com}{renan\_hiroshi@hotmail.com}
+\\
+
+
+Oswaldo Baffa Filho (Neuronavegador)
+
+\href{mailto:baffa@usp.br}{baffa@usp.br}
+\\
+
 Jorge Vicente Lopes da Silva
 \href{mailto:jorge.silva@cti.gov.br}{jorge.silva@cti.gov.br}
 \\
+
@@ -20,7 +20,7 @@ visualização das imagens, conforme mostra a figura \ref{fig:closed_tool_menu}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{closed_tool_menu}
+\includegraphics[scale=0.4]{window_mpr_not_painels_pt.png}
 \caption{Menu lateral ocultado}
 \label{fig:closed_tool_menu}
 \end{figure}
@@ -49,7 +49,7 @@ direito da tela do InVesalius.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.8]{color_button}
+\includegraphics[scale=0.8]{colour_button.png}
 \caption{Atalho para cor de fundo da janela de volume/superfície}
 \label{fig:button_select_color_2}
 \end{figure}
@@ -59,7 +59,7 @@ Após isso, basta clicar sobre a cor desejada e, em seguida, clicar em \textbf{O
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142}
+\includegraphics[scale=0.6]{surface_select_color_windows_so_pt.png}
 \caption{Seleção de cor de fundo}
 \label{fig:color_window_background}
 \end{figure}
@@ -68,7 +68,7 @@ A figura \ref{fig:background_color} mostra um exemplo dessa janela com a cor de 
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{3d_background}
+\includegraphics[scale=0.7]{3d_background_changed.png}
 \caption{Cor de fundo alterada}
 \label{fig:background_color}
 \end{figure}
@@ -10,7 +10,7 @@ duplo com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre o item para expandi-lo. A fi
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{data_export}
+\includegraphics[scale=0.8]{painel_data_export_pt.png}
 \caption{Menu para exportação de dados}
 \label{fig:data_export}
 \end{figure}
@@ -24,7 +24,7 @@ figura \ref{fig:data_export_selection}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{data_export_selection}
+\includegraphics[scale=0.7]{painel_data_export_selection_pt.png}
 \caption{Seleção de superfície a exportar}
 \label{fig:data_export_selection}
 \end{figure}
@@ -39,12 +39,12 @@ Em seguida, clique sobre o ícone que a figura \ref{fig:surface_export_original}
 \end{figure}
 Na janela exibida (figura \ref{fig:export_data_window}), insira o nome do arquivo e
-selecione o formato desejado para a exportação. Em seguida, clique em \textbf{Save (Salvar)}.
+selecione o formato desejado para a exportação. Em seguida, clique em \textbf{Salvar}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{export_data_window}
+\includegraphics[scale=0.4]{export_surface.png}
 \caption{Janela para exportar superfície}
 \label{fig:export_data_window}
 \end{figure}
@@ -83,17 +83,17 @@ exibido na figura \ref{fig:menu_save_image_window} e selecione a sub-janela corr
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{menu_save_image_window}
+\includegraphics[scale=0.5]{menu_save_image_window_pt.png}
 \caption{Menu para exportar imagem}
 \label{fig:menu_save_image_window}
 \end{figure}
 Na janela exibida (figura \ref{fig:save_image_window}), selecione o formato do arquivo e
-clique no botão \textbf{Save (Salvar)}.
+clique no botão \textbf{Salvar}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{save_image_window}
+\includegraphics[scale=0.4]{export_bmp_pt.png}
 \caption{Janela para exportar imagem}
 \label{fig:save_image_window}
 \end{figure}
@@ -16,7 +16,7 @@ correspondentes aos elementos a que se referem.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{mask_manager}
+\includegraphics[scale=0.7]{painel_mask_manager_pt.png}
 \caption{Gerenciamento de dados}
 \label{fig:volumetric_data}
 \end{figure}
@@ -42,7 +42,7 @@ no atalho que a figura \ref{fig:delete_data} ilustra.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{selected_mask}
+\includegraphics[scale=0.7]{painel_selected_mask_pt.png}
 \caption{Dado selecionado}
 \label{fig:selected_mask}
 \end{figure}
@@ -50,7 +50,7 @@ no atalho que a figura \ref{fig:delete_data} ilustra.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.8]{delete_data}
+\includegraphics[scale=0.8]{data_remove.png}
 \caption{Excluir dado}
 \label{fig:delete_data}
 \end{figure}
@@ -60,7 +60,7 @@ Para criar uma nova máscara, superfície ou medição, basta clicar no atalho i
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.8]{new_data}
+\includegraphics[scale=0.8]{data_new.png}
 \caption{Novo dado}
 \label{fig:new_data}
 \end{figure}
@@ -70,7 +70,7 @@ ilustra.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.8]{duplicate_data}
+\includegraphics[scale=0.8]{data_duplicate.png}
 \caption{Copiar dado}
 \label{fig:duplicate_data}
 \end{figure}
@@ -94,11 +94,28 @@ traz um exemplo.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{surface_manager}
+\includegraphics[scale=0.7]{painel_volumetric_measures_pt.png}
 \caption{Gerenciamento de superfícies}
 \label{fig:surface_manager}
 \end{figure}
+\subsection{Importação de superfície}
+
+É possível importar arquivos do tipo STL, OBJ, PLY e VTP (VTK Polydata File Format) com um projeto do InVesalius ativo, para isso é necessário clicar no ícone que é mostrado na figura~\ref{fig:import_stl}, selecionar (figura~\ref{fig:import_surface}) o formato do arquivo que será importado e depois clicar no \textbf{Abrir}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.8]{load_mesh.png}
+\caption{Importar Superfície}
+\label{fig:import_stl}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{import_surface_pt.png}
+\caption{Janela para importação de superfície}
+\label{fig:import_surface}
+\end{figure}
 \newpage
@@ -112,7 +129,7 @@ a coluna \textbf{Valor} informa a medida propriamente dita. Veja a figura \ref{f
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{manager_mensuares}
+\includegraphics[scale=0.7]{painel_measures_manager_pt.png}
 \caption{Gerenciamento de medições}
 \label{fig:manager_mensuares}
 \end{figure}
@@ -0,0 +1,117 @@
+\chapter{Ajuste de imagem}
+
+O InVesalius não garante a correta ordem das imagens pois depende de informações que estão presentes nas imagens, algumas vezes essas imagens tem as informações incorretas ou não seguem o padrão DICOM. Dessa forma é recomendável confirmar se a lesão ou algum outro marco anatômico presente em um determinado paciente é exibido no lado correto da imagem. Caso não seja, é possível utilizar as ferramentas de espelhar a imagem ou inverter eixos. Também para o alinhamento da imagem, existe a ferramenta de rotação da imagem.
+
+\section{Espelhar}
+
+É possível espelhar um dos lados da imagem de modo que eles se invertam, para isso é necessário ir no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem}, \textbf{Espelhar} e clicar em uma das seguintes opções (figura~\ref{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}):
+
+\begin{itemize}
+	\item Direita - Esquerda
+	\item Anterior - Posterior
+	\item Superior - Inferior
+\end{itemize}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_img_mirroring_axis_pt.png}
+\caption{Menu para ativar ferramenta de espelhar imagem.}
+\label{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}
+\end{figure}
+
+
+A figura~\ref{fig:mirrored} apresenta um comparativo entre a imagem não espelhada e a imagem espelhada. Por o conjunto de imagens formar um volume, ao aplicar espelhamento todas as outras orientações são modificadas também.
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Imagem entrada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mirror_axial.png}}  \qquad
+  \subfloat[Imagem espelhada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mirror_axial_mirrored.png}}
+  \hfill
+  \caption{Exemplo de imagem com direita-esquerda espelhada.}
+  \label{fig:mirrored}
+\end{figure}
+
+\section{Trocar Eixo}
+
+A ferramenta de troca de eixo, muda as orientações da imagem caso ela tem sido importada erroneamente. Para isso é necessário ir no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem}, \textbf{Trocar Eixo} e clicar em uma das seguintes opções (figura~\ref{fig:menu_invert_axis}): 
+
+\begin{itemize}
+	\item Da Direita para Anterior-Posterior
+	\item Da Direita-Esquerda para Superior-Inferior
+	\item Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior
+\end{itemize}
+
+
+As figuras~\ref{fig:invert_axis_axial} e~\ref{fig:invert_axis_axial_inverted}, apresentam um exemplo de imagens com eixo invertido.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_invert_axis_pt.png}
+\caption{Menu para ativar espelhar um dos lados da imagem.}
+\label{fig:menu_invert_axis}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{invert_axis_axial_pt.png}
+\caption{Conjunto de imagens antes de inverter eixo - Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior.}
+\label{fig:invert_axis_axial}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{invert_axis_axial_inverted_pt.png}
+\caption{Conjunto de imagens com eixo invertido - Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior.}
+\label{fig:invert_axis_axial_inverted}
+\end{figure}
+
+\section{Reorientar imagem (Rotacionar)} 
+
+Caso seja necessário alinhar a imagem levando em consideração algum ponto de referencia como algum marco anatômico, é possível realizar essa tarefa utilizando a ferramenta de reorientação de imagem. Para abrir a ferramenta é necessário ir ao menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem} e por último \textbf{Reorientar imagem} (figura~\ref{fig:menu_img_reorient}).
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_img_reorient_pt.png}
+\caption{Menu para ativar o recurso de reorientar imagem.}
+\label{fig:menu_img_reorient}
+\end{figure}
+
+Ao abrir a ferramenta será exibida uma janela (figura~\ref{fig:image_reorient_window}) que mostra em qual orientação e quantos graus a imagem foi rotacionada.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_window_pt.png}
+\caption{Janela responsável por exibir os parâmetros de reorientação de imagem.}
+\label{fig:image_reorient_window}
+\end{figure}
+
+Inicialmente é necessário definir em função de qual ponto a imagem será rotacionada, para isso é necessário \textbf{manter o botão esquerdo do mouse pressionado} entre a interseção de duas linhas (figura~\ref{fig:image_reorient_adjust_center}) em uma das janelas de orientação axial, coronal ou sagital e arrastar até o ponto desejado.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_adjust_center.png}
+\caption{Definição do eixo de rotação da imagem.}
+\label{fig:image_reorient_adjust_center}
+\end{figure}
+
+Para rotacionar a imagem é necessário \textbf{manter o botão esquerdo do mouse pressionado} e \textbf{arrastar} de forma que o ponto de referencia ou marco anatômico fique alinhado com uma das linhas (figura~\ref{fig:image_reorient_rotated}). Após a imagem estar na posição desejada, é necessário clicar no botão \textbf{Aplicar}, presente na janela de parâmetros (figura~\ref{fig:image_reorient_window}), dependo do tamanho da imagem é necessário aguardar alguns segundos até o processo finalizar. A figura~\ref{fig:image_reorient_rotated_applied} apresenta uma imagem com o processo de de reorientação finalizada. 
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_rotated_pt.png}
+\caption{Imagem rotacionada.}
+\label{fig:image_reorient_rotated}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_rotated_applied_pt.png}
+\caption{Imagem rotacionada após a finalização do processo.}
+\label{fig:image_reorient_rotated_applied}
+\end{figure}
+
+
+
+
+
+
@@ -27,7 +27,7 @@ Clique em \textbf{OK}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec311139.jpg}
+\includegraphics[scale=0.5]{import_select_folder_pt.png}
 \caption{SeleÃ§Ã£o de diretÃ³rio}
 \label{fig:win_folder}
 \end{figure}
@@ -39,7 +39,7 @@ do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:ver_fil
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_03Dec311131.jpg}
+\includegraphics[scale=0.6]{import_load_files_pt.png}
 \caption{Status de verificaÃ§Ã£o e carregamento de arquivos}
 \label{fig:ver_file}
 \end{figure}
@@ -52,7 +52,7 @@ pular imagens para reconstruÃ§Ã£o.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_06Dec311139.jpg}
+\includegraphics[scale=0.4]{import_window_pt.png}
 \caption{Tela de importaÃ§Ã£o}
 \label{fig:win_import}
 \end{figure}
@@ -66,7 +66,7 @@ com o botÃ£o \textbf{esquerdo} do mouse sobre a descriÃ§Ã£o da sÃ©rie. Veja a fi
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_08Dec311139_.jpg}
+\includegraphics[scale=0.5]{import_window_detail_pt.png}
 \caption{SeleÃ§Ã£o de sÃ©rie}
 \label{fig:import_serie}
 \end{figure}
@@ -77,11 +77,11 @@ Em alguns casos, em particular quando nÃ£o se dispÃµe de um computador com memÃ³
 processamento satisfatÃ³rios para trabalhar com muitas imagens em uma sÃ©rie, pode ser
 recomendÃ¡vel pular (ignorar) algumas delas. Para isso, clique \textbf{uma vez} com o botÃ£o
 \textbf{esquerdo} do mouse sobre a descriÃ§Ã£o da sÃ©rie (figura \ref{fig:import_serie}) e selecione
-quantas imagens serÃ£o puladas (figura \ref{fig:skip_image}). Clique em \textbf{OK}.
+quantas imagens serÃ£o puladas (figura \ref{fig:skip_image}). Clique em \textbf{Importar}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_13Dec311140_.jpg}
+\includegraphics[scale=0.6]{import_window_skip_slice_pt.png}
 \caption{Pular imagens}
 \label{fig:skip_image}
 \end{figure}
@@ -96,7 +96,7 @@ cada imagem resultante terÃ¡ 307 x 307 pixeis. Caso deseje abrir com a resoluÃ§Ã
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{file_import_resize.png}
+\includegraphics[scale=0.5]{import_window_lower_memory_pt.png}
 \caption{ReduÃ§Ã£o de dimensÃ£o da imagem}
 \label{fig:resize_image}
 \end{figure}
@@ -106,7 +106,7 @@ da reconstruÃ§Ã£o (quando as imagens sÃ£o empilhadas e interpoladas).
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_14Dec311140.jpg}
+\includegraphics[scale=0.6]{import_window_progress.png} 
 \caption{Progresso da reconstruÃ§Ã£o}
 \label{fig:prog_recons}
 \end{figure}
@@ -119,7 +119,7 @@ Para importar arquivos no formato Analyze, no menu \textbf{Arquivo}, clique na o
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{analyze_menu.png}
+\includegraphics[scale=0.4]{import_analyze_menu_pt.png}
 \caption{Menu para importar imagens no formato analyze}
 \label{fig:analyze_menu}
 \end{figure}
@@ -128,7 +128,138 @@ Selecione o arquivo do tipo Analyze, na extensÃ£o \textbf{.hdr} e clique em \tex
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{analyze_import.png}
+\includegraphics[scale=0.4]{import_analyze_window_pt.png}
 \caption{Importar imagens no formato analyze}
 \label{fig:analyze_import}
+\end{figure}
+
+\section{NIfTI}
+
+Para importar arquivos no formato NIfTI, no menu \textbf{Arquivo}, clique na opÃ§Ã£o \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida a opÃ§Ã£o \textbf{NIfTI} como mostra a figura \ref{fig:import_nifti_menu_pt}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{import_nifti_menu_pt.png}
+\caption{Menu para importar imagens no formato NIfTI}
+\label{fig:import_nifti_menu_pt}
+\end{figure}
+
+Selecione o arquivo do tipo NIfTI, na extensÃ£o \textbf{nii.gz} ou \textbf{.nii} e clique em \textbf{Abrir}. (figura \ref{fig:import_nifti_window_pt}). Caso o arquivo esteja em outra extensÃ£o como \textbf{.hdr}, selecione a opÃ§Ã£o \textbf{all files(*.*)}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{import_nifti_window_pt.png}
+\caption{Importar imagens no formato NIfTI}
+\label{fig:import_nifti_window_pt}
+\end{figure}
+
+\section{PAR/REC}
+
+
+Para importar arquivos no formato PAR/REC, no menu \textbf{Arquivo}, clique na opÃ§Ã£o \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida a opÃ§Ã£o \textbf{PAR/REC} como mostra a figura \ref{fig:import_parrec_menu_pt}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{import_parrec_menu_pt.png}
+\caption{Menu para importar imagens no formato PAR/REC}
+\label{fig:import_parrec_menu_pt}
+\end{figure}
+
+Selecione o arquivo do tipo PAR/REC, na extensÃ£o \textbf{.par} e clique em \textbf{Abrir}. (figura \ref{fig:import_parrec_window_pt}). Caso o arquivo esteja sem extensÃ£o, selecione a opÃ§Ã£o \textbf{all files(*.*)}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{import_parrec_window_pt.png}
+\caption{Importar imagens no formato PAR/REC}
+\label{fig:import_parrec_window_pt}
+\end{figure}
+
+
+
+\section{TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG (micro-CT)}
+
+Arquivos em formato TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG para reconstruÃ§Ã£o podem ser providos de equipamentos de microtomografia (micro-CT ou $\mu$CT) e outros. O InVesalius importa arquivos nesses formatos desde que os pixels presentes estejam em escala de cinza.
+
+Para importar, clique no menu \textbf{Arquivo} e na opÃ§Ã£o \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida clique na opÃ§Ã£o \textbf{TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG ($\mu$CT)} como mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_menu_pt}. 
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{import_bmp_menu_pt.png}
+\caption{Importar imagens no formato BMP e outros}
+\label{fig:import_bmp_menu_pt}
+\end{figure}
+
+Selecione o diretÃ³rio que contenha os arquivos, como mostra a figura \ref{fig:import_bmp_select_folder}. O InVesalius irÃ¡ procurar por arquivos tambÃ©m em subdiretÃ³rios do diretÃ³rio escolhido, caso existam.
+
+Clique em \textbf{OK}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_select_folder_pt.png}
+\caption{SeleÃ§Ã£o de diretÃ³rio}
+\label{fig:import_bmp_select_folder}
+\end{figure}
+
+
+Enquanto o InVesalius procura por arquivos TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG no diretÃ³rio, Ã© exibido o progresso do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:import_bmp_load_pt}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{import_bmp_load_pt.png}
+\caption{Status de verificaÃ§Ã£o e carregamento de arquivos}
+\label{fig:import_bmp_load_pt}
+\end{figure}
+
+
+Se arquivos do tipo TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG  forem encontrados, Ã© aberta uma janela (figura~\ref{fig:import_bmp_window_pt}) para exibir os arquivos encontrados elegÃveis para reconstruÃ§Ã£o. TambÃ©m Ã© possÃvel pular imagens para reconstruÃ§Ã£o ou remover arquivos da lista para reconstruÃ§Ã£o. Os arquivos sÃ£o ordenados de acordo com o nome do arquivo, recomenda-se utilizar nÃºmeros em seus nomes de acordo com a ordem que deseja-se obter na reconstruÃ§Ã£o.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.3]{import_bmp_window_pt.png}
+\caption{Janela para importaÃ§Ã£o de arquivos do tipo BMP.}
+\label{fig:import_bmp_window_pt}
+\end{figure}
+
+Para excluir os arquivos que nÃ£o sÃ£o de interesse, Ã© possÃvel selecionar um arquivo clicando com o \textbf{botÃ£o esquerdo do mouse} e em seguida pressionar a tecla \textbf{delete}. Ã‰ possÃvel tambÃ©m escolher uma faixa de arquivos para deletar, para isso Ã© necessÃ¡rio clicar com o \textbf{botÃ£o esquerdo do mouse} no primeiro arquivo da faixa, manter pressionada a tecla \textbf{shift}, clicar novamente com o \textbf{botÃ£o esquerdo do mouse} no Ãºltimo arquivo da faixa e finalmente pressionar o botÃ£o \textbf{delete}.
+ 
+A exemplo da importaÃ§Ã£o de arquivos DICOM, Ã© possÃvel pular imagens BMP para reconstruÃ§Ã£o. Em alguns casos, em particular quando nÃ£o se dispÃµe de um computador com memÃ³ria e/ou processamento satisfatÃ³rios para trabalhar com muitas imagens em uma sÃ©rie, pode ser recomendÃ¡vel pular (ignorar) algumas delas. Para isso, selecione quantas imagens serÃ£o puladas (figura \ref{fig:import_bmp_skip_pt}). Clique em \textbf{Importar}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{import_bmp_skip_pt.png}
+\caption{Tela de importaÃ§Ã£o}
+\label{fig:import_bmp_skip_pt}
+\end{figure}
+
+Para a reconstruÃ§Ã£o desse tipo de arquivo Ã© necessÃ¡rio definir um nome para o projeto, indicar qual a orientaÃ§Ã£o das imagens (axial, coronal ou sagital), espaÃ§amento do voxel ($X$, $Y$ e $Z$) em \textbf{milÃmetros} como mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_spacing_pt}. O espaÃ§amento do voxel em $X$ Ã© largura do pixel de cada imagem, $Y$ o comprimento do pixel e $Z$ representa a distÃ¢ncia de cada fatia (altura do voxel). 
+
+Caso o conjunto de imagens seja de imagens de microtomografia, mais especificamente de equipamentos das marcas GE e Brucker, Ã© possÃvel que o InVesalius realize a leitura do arquivo texto com os parÃ¢metros de aquisiÃ§Ã£o que normalmente fica na mesma pasta das imagens e insira automaticamente o espaÃ§amento. Essa constataÃ§Ã£o pode ser feita quando os valores de $X$, $Y$ e $Z$ sÃ£o diferentes de "1.00000000", caso contrÃ¡rio Ã© necessÃ¡rio digitar os valores dos respectivos espaÃ§amento. 
+
+\textbf{AtenÃ§Ã£o, o espaÃ§amento Ã© um parÃ¢metro primordial para a correta dimensÃ£o dos objetos no software. EspaÃ§amento incorreto irÃ¡ fornecer medidas incorretas.}
+
+Uma vez preenchido todos os parÃ¢metros, basta clicar no botÃ£o \textbf{Ok}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_spacing_pt.png}
+\caption{Tela de importaÃ§Ã£o}
+\label{fig:import_bmp_spacing_pt}
+\end{figure}
+
+Caso seja detectado quantidade insuficiente de memÃ³ria disponÃvel na hora de carregar as imagens Ã© recomentado  reduzir a resoluÃ§Ã£o das fatias para trabalhar com visualizaÃ§Ã£o volumÃ©trica e de superfÃcie, como mostra a janela \ref{fig:import_bmp_resize_pt}.  As fatias serÃ£o redimensionadas de acordo com a porcentagem em relaÃ§Ã£o a resoluÃ§Ã£o original. Por exemplo,  se cada fatia do exame contÃ©m a dimensÃ£o de 512 x 512 pixeis e for sugerido a "Porcentagem da resoluÃ§Ã£o original" em 60\%, cada imagem resultante terÃ¡ 307 x 307 pixeis. Caso deseje abrir com a resoluÃ§Ã£o original selecione o valor 100.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_resize_pt.png}
+\caption{Redimensionamento de imagens}
+\label{fig:import_bmp_resize_pt}
+\end{figure}
+
+ApÃ³s os passos anteriores Ã© necessÃ¡rio aguardar um instante para completar a reconstruÃ§Ã£o multiplanar conforme mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_mpr_pt.png}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{import_bmp_mpr_pt.png}
+\caption{ReconstruÃ§Ã£o multiplanar em andamento.}
+\label{fig:import_bmp_mpr_pt.png}
 \end{figure}
 \ No newline at end of file
@@ -4,11 +4,11 @@
 Para instalar o InVesalius no MS-Windows, basta executar o programa instalador.
 Quando aparecer uma janela pedindo para confirmar a execução do arquivo, clique
-em \textbf{Executar}.
+em \textbf{Sim}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_02Dec311523.jpg}
+\includegraphics[scale=0.5]{installation_exec_pt.png}
 \end{figure}
 \newpage
@@ -17,7 +17,7 @@ o idioma e clique em \textbf{OK}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_03Dec311523.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_select_language_pt.png}
 \end{figure}
 \hspace{.2cm}
@@ -26,44 +26,42 @@ Em seguida, será exibida a janela do instalador. Clique em \textbf{Avançar}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_02Dec310024.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_welcome_pt.png}
 \end{figure}
 \newpage
 Selecione \textbf{Eu aceito os termos do Contrato} e clique em \textbf{Avançar}.
-\begin{figure}[!htb]
+\begin{figure}[!htb] 
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec310024.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_license_pt.png}
 \end{figure}
 \hspace{.2cm}
-Clique em \textbf{Avançar} novamente.
+Clique em \textbf{Avançar} novamente. 
-\begin{figure}[!htb]
+\begin{figure}[!htb]  
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_05Dec310024.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_folder_pt.png}
 \end{figure}
 \newpage
 Clique em \textbf{Avançar}.
-
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_06Dec310024.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_program_name_pt.png}
 \end{figure}
 \hspace{.2cm}
-Selecione \textbf{Criar um ícone na Área de Trabalho} e \textbf{Criar um ícone
-na Barra de Inicialização Rápida} e clique em \textbf{Avançar}.
+Selecione \textbf{Criar um ícone na Área de Trabalho} e clique em \textbf{Avançar}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_08Dec310024.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_desktop_shortcut_pt.png}
 \end{figure}
 \newpage
@@ -72,7 +70,7 @@ Clique em \textbf{Instalar}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_09Dec310024.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_resume_pt.png}
 \end{figure}
 \hspace{.2cm}
@@ -82,7 +80,7 @@ da instalação.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_11Dec310025.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_progress_pt.png}
 \end{figure}
 \newpage
@@ -91,7 +89,7 @@ Para executar o InVesalius após a instalação, clique em \textbf{Concluir}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_14Dec310025.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{installation_finish_pt.png}
 \end{figure}
 \hspace{.2cm}
@@ -102,7 +100,7 @@ para selecionar o idioma do InVesalius. Selecione o idioma desejado e clique em
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.7]{ScreenHunter_15Dec310025.jpg}
+\includegraphics[scale=0.7]{invesalius_language_select_pt.png}
 \end{figure}
 \newpage
@@ -112,7 +110,7 @@ seguinte.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_17Dec310026.jpg}
+\includegraphics[scale=0.4]{splash_pt.png}
 \end{figure}
 \hspace{.2cm}
@@ -121,7 +119,7 @@ Em seguida, a janela principal do programa é aberta.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_18Dec310026.jpg}
+\includegraphics[scale=0.4]{main_window_without_project_pt.png}
 \end{figure}
 \section{Mac Os X}
@@ -2,13 +2,13 @@
 \section{Reconstrução Multiplanar}
-Ao importar as imagens DICOM, o InVesalius mostra, automaticamente, a sua reconstrução
+Ao importar as imagens, o InVesalius mostra, automaticamente, a sua reconstrução
 multiplanar nas orientações Axial, Sagital e Coronal, bem como uma janela para manipulação 3D.
 Veja a figura \ref{fig:mpr}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_18Dec311140_1.jpg}
+\includegraphics[scale=0.30]{multiplanar_mask_window_pt.png}
 \caption{Reconstrução multiplanar}
 \label{fig:mpr}
 \end{figure}
@@ -27,7 +27,7 @@ da tela. Basta escolher a aba \textbf{Máscaras} e clicar \textbf{uma} vez com o
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_29Dec311141_.jpg}
+\includegraphics[scale=0.8]{data_mask_pt.png}
 \caption{Gerenciador de máscaras}
 \label{fig:ger_masc}
 \end{figure}
@@ -37,7 +37,7 @@ O ícone do olho desaparece, e as cores da máscara de segmentação são escond
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_28Dec311141_.jpg}
+\includegraphics[scale=0.30]{multiplanar_window_pt.png}
 \caption{Reconstrução multiplanar sem máscara de segmentação}
 \label{fig:mpr_sem_mask}
 \end{figure}
@@ -51,7 +51,7 @@ região do crânio.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_24Dec310029_.jpg}
+\includegraphics[scale=0.15]{axial.jpg}
 \caption{Corte axial}
 \label{fig:axial_corte}
 \end{figure}
@@ -65,7 +65,7 @@ A figura \ref{fig:sagital_slice} mostra uma imagem do crânio em orientação sa
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_25Dec310029_.jpg}
+\includegraphics[scale=0.15]{sagital.jpg}
 \caption{Corte sagital}
 \label{fig:sagital_slice}
 \end{figure}
@@ -81,13 +81,14 @@ coronal.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.15]{ScreenHunter_24Dec311141_.jpg}
+\includegraphics[scale=0.15]{coronal.jpg}
 \caption{Corte coronal}
 \label{fig:coronal_slice}
 \end{figure}
 \section{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal}
+\label{sec:corresp_all_orient}
 Para saber qual o ponto comum das imagens nas diferentes orientações, basta acionar o
 recurso "Cruz de interseção de fatias" pelo ícone de atalho localizado na barra de ferramentas.
@@ -111,7 +112,7 @@ Para modificar o ponto, mantenha \textbf{pressionado} o botão \textbf{esquerdo}
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_01Jan021941.jpg}
+\includegraphics[scale=0.4]{multiplanar_window_cross_pt.png}
 \caption{Ponto comum entre orientações diferentes}
 \label{fig:cross_all}
 \end{figure}
@@ -119,7 +120,29 @@ Para modificar o ponto, mantenha \textbf{pressionado} o botão \textbf{esquerdo}
 Para desativar a funcionalidade, basta clicar novamente sobre o atalho (figura \ref{fig:cross_icon}).
 Esse recurso pode ser utilizado em conjunto com o editor de fatias (que será comentado mais à frente).
-\newpage
+
+\section{Interpolação}
+
+Por padrão a visualização das imagens 2D são interpoladas (figura~\ref{fig:interp}).a, caso deseja desativar esse recurso, basta ir no menu \textbf{Visualizar}, \textbf{Fatias interpoladas} (figura~\ref{fig:menu_interpoleted_image_pt}). Dessa forma será possível visualizar cada pixel individualmente como mostra a figura~\ref{fig:interp}.b. 
+
+\textbf{Observação: Essa interpolação é apenas para efeitos de visualização, não influenciando diretamente na segmentação ou na geração de superfície 3D.}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{menu_interpoleted_image_pt.png}
+\caption{Menu para desativar e ativar interpolação}
+\label{fig:menu_interpoleted_image_pt}
+\end{figure}
+
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Interpolada]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{axial_interpoleted.png}}  \qquad
+  \subfloat[Não interpolada]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{axial_not_interpoleted.png}}
+  \hfill
+  \caption{Visualização de imagem interpolada e não interpolada.}
+  \label{fig:interp}
+\end{figure}
 \section{Mover}
@@ -137,7 +160,7 @@ A figura \ref{fig:move_img} mostra uma imagem deslocada (movida).
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_84Dec311201.jpg}
+\includegraphics[scale=0.25]{axial_pan.jpg}
 \caption{Imagem deslocada}
 \label{fig:move_img}
 \end{figure}
@@ -158,7 +181,7 @@ anti-horário, dependendo do sentido de rotação desejado.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_83Dec311201_.jpg}
+\includegraphics[scale=0.25]{axial_rotate.jpg}
 \caption{Imagem rotacionada}
 \label{fig:rotate_all}
 \end{figure}
@@ -180,7 +203,7 @@ anterior, basta clicar novamente no ícone.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_27Dec311141__.jpg}
+\includegraphics[scale=0.6]{maximize_sagital_mpr.png}
 \caption{Detalhe de uma subjanela (Observe o ícone de maximizar no canto superior direito)}
 \label{fig:maximize_window}
 \end{figure}
@@ -224,14 +247,14 @@ botão esquerdo do mouse for liberado, a operação de \textit{zoom} será aplic
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_06Jan062046.jpg}
+\includegraphics[scale=0.25]{tool_zoom_select_image.jpg}
 \caption{Área selecionada para \textit{zoom}}
 \label{fig:zoom_select}
 \end{figure}
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.25]{ScreenHunter_08Jan062046.jpg}
+\includegraphics[scale=0.25]{tool_image_with_zoom.jpg}
 \caption{Imagem ampliada}
 \label{fig:zoom_applied}
 \end{figure}
@@ -271,7 +294,7 @@ seguida, clique sobre a opção pré-definida, de acordo com o tipo de tecido, c
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.40]{ScreenHunter_12Jan021943_0.png}
+\includegraphics[scale=0.40]{menu_window_and_level_pt.png}
 \caption{Menu de contexto para seleção de brilho e contraste}
 \label{fig:window_level}
 \end{figure}
@@ -329,7 +352,7 @@ mostra a figura \ref{fig:pseudo_color}.
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.40]{pseudo_menu.png}
+\includegraphics[scale=0.40]{pseudo_menu_pt.png}
 \caption{Pseudo Cor}
 \label{fig:pseudo_color}
 \end{figure}
@@ -339,49 +362,49 @@ pseudocor disponíveis.\\
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_24Dec310029.jpg}
+\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_default.jpg}
 \caption{Padrão}
 \label{fig:image_default}
 \end{figure}
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_21Jan021944.jpg}
+\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_inverse.jpg}
 \caption{Imagem Cinza Invertido}
 \label{fig:image_inverted}
 \end{figure}
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_20Jan021944}
+\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_rainbow.jpg}
 \caption{Arco-íris}
 \label{fig:image_arc}
 \end{figure}
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_22Jan021944}
+\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_desert.jpg}
 \caption{Deserto}
 \label{fig:image_desert}
 \end{figure}
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_23Jan021944}
+\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_hue.jpg}
 \caption{Matiz}
 \label{fig:image_matiz}
 \end{figure}
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_24Jan021944}
+\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_ocean.jpg}
 \caption{Oceano}
 \label{fig:image_ocean}
 \end{figure}
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.30]{ScreenHunter_25Jan021944}
+\includegraphics[scale=0.30]{pseudo_saturation.jpg}
 \caption{Saturação}
 \label{fig:image_saturation}
 \end{figure}
@@ -394,7 +417,7 @@ pseudocor disponíveis.\\
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.60]{menu_projection}
+\includegraphics[scale=0.60]{menu_projection_pt.png}
 \caption{Menu de Tipo de projeção}
 \label{fig:menu_proj}
 \end{figure}
@@ -405,7 +428,7 @@ O modo normal é a visualização padrão, ou seja, sem nenhum tipo de projeçã
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.20]{proj_normal}
+\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_pt.png}
 \caption{Projeção normal}
 \label{fig:proj_normal}
 \end{figure}
@@ -416,7 +439,7 @@ MaxIP também é conhecido como MIP (\textit{Maximum Intensity Projection}), o m
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.20]{proj_maxIP}
+\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_maxip_pt.png}
 \caption{Projeção MaxIP ou MIP}
 \label{fig:proj_maxip}
 \end{figure}
@@ -425,7 +448,7 @@ Como mostra a figura~\ref{fig:proj_maxip_qtd}, a quantidade de imagens que irá 
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.50]{proj_maxIP_qtd}
+\includegraphics[scale=0.80]{multiplanar_window_maxip_number_pt.png}
 \caption{Seleção da quantidade de imagens que compõe o MaxIP ou MIP}
 \label{fig:proj_maxip_qtd}
 \end{figure}
@@ -436,7 +459,7 @@ Ao contrário do MaxIP, o MinIP (\textit{Minimun Intensity Projection}) selecion
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.20]{proj_minIP}
+\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_minip_pt.png}
 \caption{Projeção MinIP}
 \label{fig:proj_minIP}
 \end{figure}
@@ -446,7 +469,7 @@ A técnica MeanIP (\textit{Mean Intensity Projection}) que é mostrada na figura
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.20]{proj_meanIP}
+\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_mean_pt.png}
 \caption{Projeção MeanIP}
 \label{fig:proj_meanIP}
 \end{figure}
@@ -457,7 +480,7 @@ A técnica MIDA (\textit{Maximum Intensity Difference Accumulation}) projeta uma
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.18]{proj_MIDA}
+\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_mida_pt.png}
 \caption{Projeção MIDA}
 \label{fig:proj_MIDA}
 \end{figure}
@@ -466,7 +489,7 @@ Como mostra a figura~\ref{fig:proj_MIDA_inv}, é possível inverter a ordem que 
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.18]{proj_MIDA_inv}
+\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_mida_inverted_pt}
 \caption{Projeção MIDA em ordem invertida}
 \label{fig:proj_MIDA_inv}
 \end{figure}
@@ -477,7 +500,7 @@ Compõe a projeção 2D do conjunto de imagens que contém o volume usando a té
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.20]{proj_contornoMaxIP}
+\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_contour_maxip_pt.png}
 \caption{Projeção de Contorno MaxIP}
 \label{fig:proj_contorno_maxip}
 \end{figure}
@@ -488,7 +511,7 @@ Compõe a projeção 2D do conjunto de imagens que contém o volume usando a té
 \begin{figure}[H]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.20]{proj_contornoMIDA}
+\includegraphics[scale=0.40]{multiplanar_window_contour_mida_pt.png}
 \caption{Projeção de Contorno MIDA}
 \label{fig:proj_contorno_mida}
 \end{figure}
 \ No newline at end of file
@@ -0,0 +1,187 @@
+\chapter{Máscara}
+
+
+\section{Operações booleanas}
+
+Após efetuar segmentações, é possível realizar operações booleanas entre as máscaras. As operações booleanas suportadas são:\\
+\\
+\textbf{União}, realiza a união de duas máscaras;\\
+\textbf{Diferença}, realiza a diferença entre a primeira máscara com a segunda;\\
+\textbf{Intersecção}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.\\
+\textbf{Disjunção exclusiva}, também é conhecida como XOR, mantém as regiões de ambas as máscara que possuem diferença.\\
+
+Para ativar essa ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Operações boolenas}, como é exibido na figura~\ref{fig:booleano_menu} 
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{mask_operation_boolean_menu_pt.png}
+\caption{Menu para ativar a ferramenta de operações booleanas.}
+\label{fig:booleano_menu}
+\end{figure}
+
+É necessário selecionar a primeira máscara, a operação a ser realizada e a segunda máscara conforme mostra a figura~\ref{fig:booleano_janela}. Em seguida é necessário clicar no botão \textbf{Ok}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{mask_boolean_dialog_pt.png}
+\caption{Ferramenta de operações booleanas.}
+\label{fig:booleano_janela}
+\end{figure}
+
+Na figura~\ref{fig:op_boolana}, apresentamos um exemplo de utilização da ferramenta.
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Máscara A]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_a.png}}                
+  \hfill
+  \subfloat[Máscara B]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_b.png}}	
+  \hfill  
+  \subfloat[União (A $\cup$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_uniao.png}}
+  \hfill  
+  \subfloat[Diferença (A - B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_dif.png}}
+  \hfill  
+  \subfloat[Intersecção (A $\cap$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_interc.png}}
+  \hfill  
+  \subfloat[Disjunção exclusiva (A $\oplus$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_disj_exc.png}}
+  \caption{Exemplo de operações booleanas.}
+  \label{fig:op_boolana}
+\end{figure}
+
+\section{Limpeza total da máscara}
+\label{cap:limpeza_mascara}
+
+Pode-se efetuar a limpeza total da máscara (figura~\ref{fig:limpeza_mascara}), isso é recomendado antes de iniciar a inserção de marcadores de Watershed. A ferramenta está localizada no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara}, \textbf{Limpar máscara}, também é possível executa-la pressionando as teclas \textbf{CTRL+SHIFT+A}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{mask_clean_menu_pt.png}
+\caption{Limpeza de máscara}
+\label{fig:limpeza_mascara}
+\end{figure}
+
+\section{Fechar buracos manualmente}
+
+Ao realizar a segmentação é possível que pequenas partes (buracos) que deseja-se ser selecionadas não sejam e ao gerar a superfície para a impressão 3D pode ser que ocorra inconsistências por causa desses buracos, para evitar esse tipo de problema é recomendável preenche-los. Para isso é basta acessar o menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último clicar em \textbf{Fechar buracos manualmente} (figura~\ref{fig:menu_mask_manual_fill_holes}). Em seguida será exibido uma tela (figura~\ref{fig:mask_manual_fill_holes_window}) para configurar os parâmetros.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_manual_fill_holes_pt.png}
+\caption{Menu para acessa a ferramenta de fechamento de buracos manual.}
+\label{fig:menu_mask_manual_fill_holes}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{mask_manual_fill_holes_window_pt.png}
+\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
+\label{fig:mask_manual_fill_holes_window}
+\end{figure}
+
+Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias.
+
+Quando os parâmetros estiverem configurados, clique com o \textbf{botão esquerdo} do mouse sobre o buraco que deseja-se fechar.
+
+Podemos observar na imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.a, um exemplo de uma máscara sem preenchimento de buracos e outra com os buracos preenchidos (imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.b). Após o uso da ferramenta, para sair clique no botão \textbf{fechar ou close} no canto inferior direito da janela de configuração de parâmetros.
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Buracos]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_with_hole.png}}  \qquad
+  \subfloat[Buracos fechados]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_filled_hole.png}}
+  \hfill
+  \caption{Exemplo de máscara com buracos e buracos preenchidos.}
+  \label{fig:mask_fill_hole}
+\end{figure}
+
+
+\section{Fechar buracos automaticamente}
+
+Para abrir a ferramenta, no menu do InVesalius clique em \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Fechar buracos automaticamente} (figura~\ref{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}), será aberto uma janela para configurar os parâmetros dos buracos que deseja-se fechar. A ferramenta não requer que o usuário clique nos buracos que deseja fechar, ela leva em consideração o tamanho do buraco em voxels que é configurado na janela de configuração de parâmetros (figura~\ref{fig:mask_automatic_fill_holes_window})
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_automatic_fill_holes_pt.png}
+\caption{Menu para acessar a ferramenta de fechamento de buracos automático.}
+\label{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{mask_automatic_fill_holes_window_pt.png}
+\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
+\label{fig:mask_automatic_fill_holes_window}
+\end{figure}
+
+Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 2D é necessário indicar qual a janela será aplicado o fechamento de buracos, sendo axial, coronal ou sagital. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias. 
+
+Com os parâmetros configurados, clique no botão \textbf{Aplicar ou Apply}, caso o resultado não seja satisfatório, reconfigure o tamanho do buraco ou outros parâmetros como conectividade e aplique novamente. Para sair clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
+
+\section{Remover partes}
+
+Antes de gerar a superfície é recomendável remover as partes desconexas não desejadas na máscara, dessa forma ao gerar a superfície será utilizada menores quantidades de memória RAM e o processo será mais rápido. Para remover as partes não desejáveis é necessário abrir a ferramenta de remover partes, clicando no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e \textbf{Remover Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_remove_part}). Em seguida irá ser exibido uma janela para configurar os parâmetros de seleção (figura~\ref{fig:mask_remove_parts_window}). É possível selecionar partes desconectas apenas na máscara 2D (\textbf{2D - Fatia atual}) ou em todo o conjunto de imagens, selecionando a opção \textbf{3D - Todas as fatias}. Também é possível selecionar suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_remove_part_pt.png}
+\caption{Menu para acessar a ferramenta de remoção de partes.}
+\label{fig:menu_mask_remove_part}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{mask_remove_parts_window.png}
+\caption{Tela para configurar parâmetros de remoção de partes.}
+\label{fig:mask_remove_parts_window}
+\end{figure}
+
+Selecionado os parâmetros desejados, basta clicar com o \textbf{botão direito do mouse} sobre a região que deseja remover. A figura~\ref{fig:mask_removed_part} apresenta uma exemplo de parte removida e não removida. Para sair da ferramenta clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Imagem de entrada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_complete.png}}  \qquad
+  \subfloat[Imagem com suporte do tomografo removido]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part.png}}
+  \hfill
+  \caption{Exemplo de região removida na máscara.}
+  \label{fig:mask_removed_part}
+\end{figure}
+
+\section{Selecionar partes}
+
+Para abrir a ferramenta de seleção de partes desconexas é necessário ir ao menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Selecionar Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_select_part}). A ferramenta irá apresentar uma tela de configuração de parâmetros que consiste em qual conectividade será levada em consideração (figura~\ref{fig:mask_select_part}), podendo ser $6$, $18$ ou $26$ e o nome da nova máscara que irá ter a imagem resultante.
+
+Todas as imagens a região que tem conectividade com o pixel selecionado. Para selecionar o pixel, é necessário clicar com o \textbf{botão esquerdo do mouse} em sobre o pixel desejado, o objeto irá ficar da cor vermelha, é possível selecionar vários objetos. Após a seleção é necessário clicar no \textbf{botão Ok}. A figura~\ref{fig:mask_selected_part}.a apresenta um objeto selecionado na cor vermelha e a figura~\ref{fig:mask_selected_part}.b  somente o objeto após ter fechado a ferramenta (\textbf{botão Ok}).
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_select_part_pt.png}
+\caption{Menu para acessar a ferramenta de seleção de partes.}
+\label{fig:menu_mask_select_part}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{mask_select_part_pt.png}
+\caption{Tela para configurar parâmetros de seleção de partes.}
+\label{fig:mask_select_part}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Região selecionada em vermelho]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_select_part_pt.png}}  \qquad
+  \subfloat[Imagem final, somente com a região selecionada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part_pt.png}}
+  \hfill
+  \caption{Exemplo de região selecionada na máscara.}
+  \label{fig:mask_selected_part}
+\end{figure}
+
+\section{Cortar}
+
+É possível cortar parte da máscara afim de selecionar uma região de interesse, isso pode ajudar reduzindo a quantidade de informações a ser processadas ao gerar superfície. Para abrir a ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último \textbf{Cortar} (figura~\ref{fig:menu_mask_crop}).
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_crop_pt.png}
+\caption{Menu para acessar a ferramenta de corte.}
+\label{fig:menu_mask_crop}
+\end{figure}
+
+Será exibida uma caixa delimitadora em cada janela das orientações axial, coronal e sagital.
 \ No newline at end of file
@@ -25,22 +25,22 @@ superfície.
 A figura \ref{fig:axial_linear} mostra uma medida linear em 2D na orientação axial,
 e a figura \ref{fig:3d_linear} mostra outra medida linear em 3D (superfície).
+Uma vez feita a medida linear em 2D, é possível edita-la, para isso é necessário posicionar o mouse sobre uma das extremidades, manter o \textbf{botão direito do mouse} pressionado e arrastar para a posição desejada.
+
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{axial_linear}
+\includegraphics[scale=0.4]{axial_linear.png}
 \caption{Medida linear sobre imagem plana}
 \label{fig:axial_linear}
 \end{figure}
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{3d_linear}
+\includegraphics[scale=0.3]{3d_linear.jpg}
 \caption{Medida linear sobre superfície}
 \label{fig:3d_linear}
 \end{figure}
-\newpage
-
 \textbf{Nota: A medida linear é dada em milímetros (mm).}
 \section{Medição angular}
@@ -66,16 +66,18 @@ a imagem ou superfície.
 A figura \ref{fig:axial_angular} ilustra uma medida angular em uma imagem plana, e a
 figura \ref{fig:axial_superficie} ilustra uma medida angular sobre uma superfície.
+A exemplo da medida linear em 2D, também é possível editar a medida angular 2D, para isso é necessário posicionar o mouse sobre uma das extremidades, manter o \textbf{botão direito do mouse} pressionado e arrastar para a posição desejada.
+
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.38]{axial_angular}
+\includegraphics[scale=0.38]{axial_angular.png}
 \caption{Medida angular sobre imagem plana}
 \label{fig:axial_angular}
 \end{figure}
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.33]{angular_superficie}
+\includegraphics[scale=0.33]{angular_superficie.jpg}
 \caption{Medida angular sobre superfície}
 \label{fig:axial_superficie}
 \end{figure}
@@ -85,15 +87,15 @@ figura \ref{fig:axial_superficie} ilustra uma medida angular sobre uma superfíc
 \section{Medição volumétrica}
-As medições volumétricas são feitas automaticamente ao se criar uma nova superfície.
+As medições de volume e área são feitas automaticamente ao se criar uma nova superfície.
 Elas são exibidas na aba \textbf{Superfícies 3D}, no painel de gerenciamento de \textbf{Dados}, localizado no canto
 inferior esquerdo da tela, como ilustra a figura \ref{fig:volumetric_mensure}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{medida_volumetrica}
+\includegraphics[scale=0.7]{painel_volumetric_measures_pt.png}
 \caption{Medidas volumétricas}
 \label{fig:volumetric_mensure}
 \end{figure}
-\textbf{Nota: A medida volumétrica é dada em milímetros cúbicos ($mm^3$)}
+\textbf{Nota: A medida de volume é dada em milímetro cúbico ($mm^3$), já a de área em milímetro quadrado ($mm^2$)}
@@ -0,0 +1,162 @@
+\chapter{Neuronavegação}
+
+\section{Introdução}
+
+Neuronavegação é a uma técnica que através da visualização computacional permite rastrear instrumentos cirúrgicos em relação às estruturas neuronais. Além disso, sistemas de neuronavegação têm sido apontados como uma ferramenta fundamental para aumentar a precisão de experimentos em neurociência, como a estimulação magnética transcraniana (EMT), eletroencefalografia, magnetoencefalografia e espectroscopia no infravermelho próximo. Apesar do vasto campo de aplicações, o uso da neuronavegação em centros de pesquisa é limitado pelo alto custo. O modulo de neuronavegação do InVesalius oferece aos usuários uma alternativa de baixo custo e código aberto aos sistemas comercias de navegação. Desta maneira, é possível utilizar ferramentas específicas para neunavegação e ainda ter a possibilidade de desenvolvimento de funcionalidades sob demanda. O neuronavegador é distribuído em uma versão executável compatível com sistema operacional Windows 7, 8 e 10.
+
+\section{Modo Navegação}
+
+Para utilizar o neuronavegador, é necessário habilitar o modo de neuronavegação do InVesalius selecionando no menu \textbf{Modo} em seguida \textbf{Navegação} (figura~\ref{fig:nav_menu_pt}). Será ativada uma nova aba "Sistema de navegação" que ficará visível no painel à esquerda da janela principal como é apresentado na figura~\ref{fig:nav_painel_pt}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{nav_menu_pt.png}
+\caption{Menu para ativar o modulo de neuronavegação.}
+\label{fig:nav_menu_pt}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_painel_pt.png}
+\caption{Aba do sistema de neuronavegação.}
+\label{fig:nav_painel_pt}
+\end{figure}
+
+\section{Rastreadores espaciais e modo de referência}
+
+O sistema de neuronavegação se comunica com vários sistemas de rastreamento espacial. Atualmente, suporta os dispositivos fabricados pela ClaroNav (figura~\ref{fig:tracker_claron}) e Polhemus (figura~\ref{fig:tracker_polhemus}). 
+
+O usuário deve selecionar o dispositivo correspondente no botão \textbf{Selecione o rastreador:}, figura~\ref{fig:nav_select_tracker}.  Caso o usuário não possua nenhum dos rastreadores suportados e deseja realizar um teste do sistema, deve selecionar a opção \textbf{Depurar rastreador} e realizar normalmente os procedimentos que serão citados a seguir. Nessa opção, trata-se de uma simulação, do qual serão geradas coordenadas aleatórias.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{tracker_claron.png}
+\caption{Rastreador Claron - www.claronav.com/microntracker/.}
+\label{fig:tracker_claron}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{tracker_polhemus.jpg}
+\caption{Rastreador Polhemus - http://polhemus.com/motion-tracking/overview/.}
+\label{fig:tracker_polhemus}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{nav_select_tracker_pt.png}
+\caption{Menu para seleção de rastreador.}
+\label{fig:nav_select_tracker}
+\end{figure}
+
+É possível realizar a navegação com dois diferentes tipos de referência, estático e dinâmico (figura~\ref{fig:nav_menu_ref}). No modo estático as coordenadas do dispositivo de rastreamento são detectadas com apenas uma sonda. Este modo de navegação é chamado de modo de referência estática porque a cabeça dos sujeitos deve permanecer estática na posição em que foram detectados os pontos fiduciais (Mais informações na seção~\ref{sec:corregistro}). 
+Para evitar problemas relacionados com o movimento da cabeça, alguns dispositivos de rastreamento fornecem uma sonda de referência. A sonda de referência pode ser ligada a uma parte não móvel da cabeça, por exemplo testa, para acompanhar as translações e rotações durante o procedimento de navegação. O uso de uma sonda de referência é o chamado modo de referência dinâmica.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{nav_menu_ref.png}
+\caption{Menu para seleção de referência.}
+\label{fig:nav_menu_ref}
+\end{figure}
+
+\section{Corregistro}
+\label{sec:corregistro}
+
+O objetivo do corregistro é as coordenadas virtual (imagem) e a as coordendas física do dispositivo de rastreamento em comum. Para realizar o corregistro, o usuário deve selecionar três marcadores fiduciais na imagem, para isso primeiramente deverá ativar o recurso de \textbf{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal} (ver seção~\ref{sec:corresp_all_orient}), coletar as três coordenadas fiduciais usando a sonda do dispositivo de rastreamento. Os fiduciais mais utilizados são o trago auricular esquerdo, trago auricular direito e a fossa nasal. A figura~\ref{fig:nav_selec_coord} ilustra a coleta dos pontos fiduciais. Quando é selecionado algum ponto fiducial na imagem, automaticamente é criado um marcador (esfera da cor verde) no volume, figura~\ref{fig:nav_balls_in_head}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{nav_selec_coord_pt.png}
+\caption{Botões e coordenadas para seleção de pontos fiduciais.}
+\label{fig:nav_selec_coord}
+\end{figure}
+
+As siglas dos botões para coleta dos fiduciais representam:
+
+\begin{itemize}
+	\item OEI: trago auricular esquerdo na imagem
+	\item ODI: trago auricular direito na imagem
+	\item NAI: fossa nasal na imagem
+	\item OER: trago auricular esquerdo no rastreador
+	\item OER: trago auricular direito no rastreador
+	\item NAR: fossa nasal esquerdo no rastreador
+\end{itemize}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{nav_balls_in_head.png}
+\caption{Criação de marcadores nos pontos fiduciais da imagem.}
+\label{fig:nav_balls_in_head}
+\end{figure}
+
+
+\section{Erro de registro fiducial e navegação}
+
+Após o usuário selecionar os três pontos fiduciais na imagem e os respectivos pontos com o rastreador espacial, o próximo passo é clicar no \textbf{botão Navegar} e o procedimento de navegação será iniciado. Para pausar a navegação, basta clicar novamente no \textbf{botão Navegar}. Automaticamente após selecionado a navegação é calculado o erro de registro fiducial, conhecido como \textit{Fiducial Registration Error} (FRE). Esse erro representa a distância média quadrática do ponto fiducial na imagem com o respectivo ponto fiducial obtido após realizado o corregistro. 
+
+Ao lado do botão de navegação, há a caixa de texto respectivo ao FRE. Se o FRE apresentar um valor alto (acima de 3 mm) a navegação não será precisa e a caixa de texto ficará vermelha, figura~\ref{fig:nav_fre_error}, recomenda-se que o corregistro seja refeito. Caso contrário, para FRE menor que 3 mm a caixa de texto fica verde, representando que a navegação terá precisão aceitável, figura~\ref{fig:nav_fre_ok}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_error_pt.png}
+\caption{Botão de navegação e FRE com valor elevado para navegação.}
+\label{fig:nav_fre_error}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_ok_pt.png}
+\caption{Botão de navegação e FRE com valor aceitável para navegação.}
+\label{fig:nav_fre_ok}
+\end{figure}
+
+\section{Marcadores}
+
+Durante a navegação, é possível criar marcadores esféricos no volume 3D. Para acessar essa função, basta clicar na aba \textbf{Ferramentas extras}, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_extra_tools_pt.png}
+\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
+\label{fig:nav_extra_tools}
+\end{figure}
+
+A criação de marcadores pode ser executada clicando no botão correspondente, com isso será criado um marcador na posição da cruz vermelha com as características escolhidas na aba, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}. O número 4 representa o tamanho do raio da esfera que será criada. Ao lado do tamanho do marcador é possível definir a cor da esfera (figura~\ref{fig:nav_vol_with_markers}). 
+
+Depois da criação é possível criar uma identificação para o marcador, para isso, deve-se clicar com o botão direto sobre o marcador desejado e selecionar \textbf{Editar ID}, figura~\ref{fig:nav_id_list_markers}, será aberto uma janela para o usuário digitar a identificação, figura~\ref{fig:nav_edit_id_markers}.
+
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{nav_vol_with_markers.png}
+\caption{Volume com marcadores em diferentes cores.}
+\label{fig:nav_vol_with_markers}
+\end{figure} 
+
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_id_list_markers_pt.png}
+\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
+\label{fig:nav_id_list_markers}
+\end{figure} 
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_edit_id_markers_pt.png}
+\caption{Janela para editar identificação do marcador.}
+\label{fig:nav_edit_id_markers}
+\end{figure} 
+
+A exportação dos marcadores é feita através do \textbf{botão salvar}, a extensão do arquivo gerado é o .mks. Essa extensão de arquivo pode ser aberta por processadores de texto como bloco de notas. O arquivo possui as coordenadas $X$, $Y$ e $Z$ seguido o código $RGB$, tamanho de marcador e a identificação. Posteriormente, esse arquivo pode ser importado através do \textbf{botão Carregar}.
+
+Caso o usuário desejar excluir apenas um marcador basta \textbf{selecionar} o item desejado na lista e clicar no \textbf{botão Remover}, também existe a opção de excluir todos os marcadores criados, \textbf{Deletar todos marcadores}. Além disso, pode-se ocultar/mostrar a exibição dos marcadores no volume pelo \textbf{botão ocultar/mostrar}.
+
+\section{Caixas de seleção, trigger externo}
+
+Outra maneira para criação de marcadores é a monitoração externa de trigger. Para ativa-la basta selecionar a caixa de seleção \textbf{Trigger externo}. Essa função foi desenvolvida para comunicar dispositivos EMT e criar automaticamente o marcador em posições onde os pulsos foram aplicados. No entanto, outras aplicações são possíveis de acordo com a necessidade do usuário.
+A comunicação com o dispositivo externo é feita através da porta serial COM1, e basta enviar qualquer sinal do tipo RS-232 em uma velocidade \textit{baud rate} de 9600 no pino de recepção que será criado um marcador na atual posição da cruz.
+
+\section{Câmera do volume}
+
+O posicionamento da câmera do volume é atualizado automaticamente, tanto pela posição da cruz vermelha das fatias quanto pela posição da sonda durante a navegação. O usuário pode desabilitar a atualização automática e atualizar a câmera manualmente. O posicionamento será alterado caso o usuário o fizer na janela de volume.  Para isso, basta desmarcar a caixa de seleção \textbf{Câmera do volume}.
@@ -16,7 +16,7 @@ no item \textbf{2. Selecione a regiÃ£o de interesse} (figura \ref{fig:region_sel
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter01Jan201144.jpg}
+\includegraphics[scale=0.6]{segmentation_threshold_window_left_pt.png}
 \caption{SeleÃ§Ã£o de regiÃ£o de interesse}
 \label{fig:region_selection}
 \end{figure}
@@ -27,7 +27,7 @@ imagem com a regiÃ£o selecionada colorida e sobreposta Ã  imagem original. Veja 
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{limiar_principal}
+\includegraphics[scale=0.4]{segmentation_threshold_axial_pt.png}
 \caption{MÃ¡scara (regiÃµes em amarelo)}
 \label{fig:region_selection_masc}
 \end{figure}
@@ -41,7 +41,7 @@ pintando somente os \textit{pixels} com intensidade dentro da faixa determinada.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.7]{limiar_barra}
+\includegraphics[scale=0.75]{segmentation_threshold_bar.png}
 \caption{SeleÃ§Ã£o dos \textit{pixels} com intensidade entre 226 e 3021 (Osso)}
 \label{fig:region_selection_bar}
 \end{figure}
@@ -52,7 +52,7 @@ automaticamente.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{limiar_presets}
+\includegraphics[scale=0.65]{segmentation_threshold_presets_pt.png}
 \caption{Caixa de seleÃ§Ã£o de valores prÃ©-definidos de limiar}
 \label{fig:limiar_presets}
 \end{figure}
@@ -107,7 +107,7 @@ Selecione a faixa de limiar desejada e clique em \textbf{OK}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{limiar_janela}
+\includegraphics[scale=0.55]{segmentation_threshold_window_dialog_pt.png}
 \caption{Criar uma nova mÃ¡scara}
 \label{fig:create_new_mask}
 \end{figure}
@@ -124,7 +124,7 @@ selecionar, \textbf{antes} da geraÃ§Ã£o, a opÃ§Ã£o \textbf{Sobrescrever anterior
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{generate_surface}
+\includegraphics[scale=0.55]{segmentation_generate_surface_pt.png}
 \caption{BotÃ£o Gerar superfÃcie}
 \label{fig:generate_surface}
 \end{figure}
@@ -134,7 +134,7 @@ ApÃ³s alguns instantes, a superfÃcie serÃ¡ exibida na janela de visualizaÃ§Ã£o 
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{3d_model}
+\includegraphics[scale=0.5]{surface_from_threshold.png}
 \caption{SuperfÃcie 3D}
 \label{fig:surface}
 \end{figure}
@@ -151,8 +151,8 @@ por parte do usuÃ¡rio. Para utilizÃ¡-la, Ã© necessÃ¡rio clicar em \textbf{EdiÃ§Ã
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{edicao_avancada.png}
-\caption{Ferramentas avanÃ§adas de ediÃ§Ã£o}
+\includegraphics[scale=0.75]{segmentation_manual_label_pt.png}
+\caption{Ãcone para abrir a ferramenta de ediÃ§Ã£o manual}
 \label{fig:advanced_edition}
 \end{figure}
@@ -160,7 +160,7 @@ O painel de ediÃ§Ã£o aparece como mostra a figura \ref{fig:edition_slices_ref}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{edition_slices}
+\includegraphics[scale=0.6]{segmentation_manual_window_pt.png}
 \caption{Painel de ediÃ§Ã£o}
 \label{fig:edition_slices_ref}
 \end{figure}
@@ -172,7 +172,7 @@ mostra a figura \ref{fig:brush_type}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{edit_pencil}
+\includegraphics[scale=0.9]{segmentation_manual_pencil_type.png}
 \caption{Tipo de pincel}
 \label{fig:brush_type}
 \end{figure}
@@ -183,7 +183,7 @@ TambÃ©m Ã© possÃvel alterar o diÃ¢metro do pincel, conforme mostra a figura \re
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{diametro_pincel}
+\includegraphics[scale=0.8]{segmentation_manual_diameter.png}
 \caption{SeleÃ§Ã£o do diÃ¢metro do pincel}
 \label{fig:select_diameter}
 \end{figure}
@@ -200,7 +200,7 @@ A figura \ref{fig:select_brush_operations} ilustra a lista de operaÃ§Ãµes do pin
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{select_brush_operation}
+\includegraphics[scale=0.7]{segmentation_manual_pencil_type_operation_type_pt.png}
 \caption{SeleÃ§Ã£o do tipo de operaÃ§Ã£o do pincel}
 \label{fig:select_brush_operations}
 \end{figure}
@@ -212,7 +212,7 @@ seleciona parte dos ruÃdos, pois eles estÃ£o na mesma intensidade do limiar par
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{noise_amalgam}
+\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam.jpg}
 \caption{Imagem com ruÃdo segmentada com limiar}
 \label{fig:noise_amalgaman}
 \end{figure}
@@ -222,14 +222,14 @@ segmentaÃ§Ã£o.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{case_almagam}
+\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_3d.jpg}
 \caption{SuperfÃcie gerada a partir de imagem com ruÃdo}
 \label{fig:surface_amagaman}
 \end{figure}
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{case_almagam_zoom}
+\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_3d_zoom.jpg}
 \caption{Zoom da regiÃ£o com ruÃdo}
 \label{fig:surface_amagaman_zoom}
 \end{figure}
@@ -245,14 +245,14 @@ ediÃ§Ã£o.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{editor_amagam}
+\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_removed.jpg}
 \caption{Imagem com ruÃdo removido}
 \label{fig:editor_amalgaman}
 \end{figure}
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{edited_amalgam}
+\includegraphics[scale=0.3]{segmentation_manual_noise_amalgam_removed_3d_zoom.jpg}
 \caption{SuperfÃcie criada a partir da imagem com ruÃdo removido}
 \label{fig:surface_edited_amalgaman}
 \end{figure}
@@ -261,13 +261,13 @@ ediÃ§Ã£o.
 Realizada a ediÃ§Ã£o, basta gerar a superfÃcie a partir da imagem editada (figura
 \ref{fig:surface_edited_amalgaman}). Como houve ediÃ§Ã£o, ao clicar em \textbf{Criar superfÃcie}, serÃ¡
 requerido se deseja gerar a superfÃcie a partir do mÃ©todo \textbf{binÃ¡rio} ou utilizando o mÃ©todo de suavizaÃ§Ã£o
-\textbf{Context aware smoothing} (figura \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfÃcie.
+\textbf{SuavizaÃ§Ã£o sensÃvel ao contexto} (figura \ref{fig:new_surface_edited}) para minimizar os "degraus" na superfÃcie.
 Demais detalhes serÃ£o discutidos no capÃtulo \ref{cap_surface}.
 %\ref{fig:generate_surface}).
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{create_surface_edited.png}
+\includegraphics[scale=0.5]{surface_generation_dialog_pt.png}
 \caption{MÃ©todo de criaÃ§Ã£o de superfÃcie}
 \label{fig:new_surface_edited}
 \end{figure}
@@ -279,14 +279,7 @@ A segmentaÃ§Ã£o por watershed, necessita que o usuÃ¡rio indique atravÃ©s de marc
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{watershed_panel.png}
-\caption{Painel de segmentaÃ§Ã£o por Watershed}
-\label{fig:watershed_painel}
-\end{figure}
-
-\begin{figure}[!htb]
-\centering
-\includegraphics[scale=0.6]{watershed_panel.png}
+\includegraphics[scale=0.75]{segmentation_watershed_panel_pt.png}
 \caption{Painel de segmentaÃ§Ã£o por Watershed}
 \label{fig:watershed_painel}
 \end{figure}
@@ -296,11 +289,12 @@ Antes de iniciar a segmentaÃ§Ã£o por Watershed, Ã© recomendÃ¡vel limpar toda a m
 Para inserir marcadores de fundo e objeto, Ã© utilizada uma ferramenta em forma de pincel, a exemplo da segmentaÃ§Ã£o manual, existe a opÃ§Ã£o de selecionar pincel retangular ou circular, tambÃ©m Ã© possÃvel alterar o tamanho deles. 
 Ã‰ necessÃ¡rio tambÃ©m selecionar o tipo de operaÃ§Ã£o que serÃ¡ realizada pelo pincel. As opÃ§Ãµes sÃ£o as
-seguintes:\\
-\\
-\textbf{Objeto}, para inserir marcadores de objeto;\\
-\textbf{Fundo}, para inserir marcadores de fundo (nÃ£o Ã© objeto);\\
-\textbf{Apagar}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.\\
+seguintes:
+\begin{itemize}
+\item \textbf{Objeto}, para inserir marcadores de objeto;
+\item \textbf{Fundo}, para inserir marcadores de fundo (nÃ£o Ã© objeto);
+\item \textbf{Apagar}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.
+\end{itemize}
 A opÃ§Ã£o "\textbf{Sobrescrever mÃ¡scara}" Ã© utilizada quando deseja-se que a mÃ¡scara selecionada seja substituÃda pelo resultado da segmentaÃ§Ã£o. JÃ¡ a opÃ§Ã£o "\textbf{Considerar brilho e contraste}" Ã© utilizada para o algoritmo levar em consideraÃ§Ã£o a imagem que estÃ¡ sendo visualizada, assim Ã© possÃvel alterar o brilho e contraste e obter resultados melhores de segmentaÃ§Ã£o.
@@ -317,7 +311,7 @@ A conectividade dos pixels que serÃ£o levados em consideraÃ§Ã£o, pode ser altera
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{watershed_opcao.png}
+\includegraphics[scale=0.55]{segmentation_watershed_conf_pt.png}
 \caption{OpÃ§Ãµes de configuraÃ§Ã£o do mÃ©todo de Watershed}
 \label{fig:watershed_janela_conf}
 \end{figure}
@@ -328,72 +322,65 @@ Ainda na figura~\ref{fig:watershed_2d}, podemos visualizar os marcadores de obje
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.2]{watershed_2d.png}
+\includegraphics[scale=0.2]{segmentation_watershed_axial.png}
 \caption{Watershed aplicado em uma fatia de um volume.}
 \label{fig:watershed_2d}
 \end{figure}
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.2]{watershed_3d.png}
+\includegraphics[scale=0.4]{segmentation_watershed_multiplanar_3d_pt.png}
 \caption{SegmentaÃ§Ã£o do cÃ©rebro com o mÃ©todo de Watershed aplicado em todo um volume (expandido em 3D).}
 \label{fig:watershed_3d}
 \end{figure}
-\section{OperaÃ§Ãµes booleanas}
-
-ApÃ³s efetuar segmentaÃ§Ãµes, Ã© possÃvel realizar operaÃ§Ãµes booleanas entre as mÃ¡scaras. As operaÃ§Ãµes booleanas suportadas sÃ£o:\\
-\\
-\textbf{UniÃ£o}, realiza a uniÃ£o de duas mÃ¡scaras;\\
-\textbf{DiferenÃ§a}, realiza a diferenÃ§a entre a primeira mÃ¡scara com a segunda;\\
-\textbf{IntersecÃ§Ã£o}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.\\
-\textbf{DisjunÃ§Ã£o exclusiva}, tambÃ©m Ã© conhecida como XOR, mantÃ©m as regiÃµes de ambas as mÃ¡scara que possuem diferenÃ§a.\\
+\section{Crescimento de regiÃ£o}
-Para ativar essa ferramenta Ã© necessÃ¡rio ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{OperaÃ§Ãµes boolenas}, como Ã© exibido na figura~\ref{fig:booleano_menu} 
+A tÃ©cnica de segmentaÃ§Ã£o por crescimento de regiÃ£o Ã© ativada no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{SegmentaÃ§Ã£o}, por Ãºltimo \textbf{Crescimento de regiÃ£o} (figura~\ref{menu_segmentation_region_growing}). Inicialmente deve-se selecionar a configuraÃ§Ã£o entre \textbf{2D - Fatia atual} ou \textbf{3D - Todas as fatias}, tambÃ©m Ã© necessÃ¡rio selecionar a conectividade do crescimento entre $4$ ou $8$ para o 2D e $6$, $18$ ou $26$ para 3D. Por Ãºltimo Ã© necessÃ¡rio selecionar o mÃ©todo, entre \textbf{DinÃ¢mico, Limiar ou ConfidÃªncia} (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic}).
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{booleano_menu.png}
-\caption{Menu para ativar a ferramenta de operaÃ§Ãµes booleanas.}
-\label{fig:booleano_menu}
+\includegraphics[scale=0.5]{menu_segmentation_region_growing_pt.png}
+\caption{Menu para ativar a segmentaÃ§Ã£o por regiÃ£o de crescimento.}
+\label{fig:menu_segmentation_region_growing_pt}
 \end{figure}
-Ã‰ necessÃ¡rio selecionar a primeira mÃ¡scara, a operaÃ§Ã£o a ser realizada e a segunda mÃ¡scara conforme mostra a figura~\ref{fig:booleano_janela}. Em seguida Ã© necessÃ¡rio clicar no botÃ£o \textbf{Ok}.
-
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{boolano_janela.png}
-\caption{Ferramenta de operaÃ§Ãµes booleanas.}
-\label{fig:booleano_janela}
-\end{figure}
-
-Na figura~\ref{fig:op_boolana}, apresentamos um exemplo de utilizaÃ§Ã£o da ferramenta.
-
-\begin{figure}[!htb]
-  \centering
-  \subfloat[MÃ¡scara A]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_a}}                
-  \hfill
-  \subfloat[MÃ¡scara B]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_b}}	
-  \hfill  
-  \subfloat[UniÃ£o (A $\cup$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_uniao}}
-  \hfill  
-  \subfloat[DiferenÃ§a (A - B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_dif}}
-  \hfill  
-  \subfloat[IntersecÃ§Ã£o (A $\cap$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_interc}}
-  \hfill  
-  \subfloat[DisjunÃ§Ã£o exclusiva (A $\oplus$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_disj_exc}}
-  \caption{Exemplo de operaÃ§Ãµes booleanas.}
-  \label{fig:op_boolana}
+\includegraphics[scale=0.7]{segmentation_region_growing_dinamic_pt.png}
+\caption{Tela para ajuste de parÃ¢metros de segmentaÃ§Ã£o por crescimento de regiÃ£o.}
+\label{fig:segmentation_region_growing_dinamic}
 \end{figure}
-\section{Limpeza total da mÃ¡scara}
-\label{cap:limpeza_mascara}
-
-Pode-se efetuar a limpeza total da mÃ¡scara (figura~\ref{fig:limpeza_mascara}), isso Ã© recomendado antes de iniciar a inserÃ§Ã£o de marcadores de Watershed. A ferramenta estÃ¡ localizada no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{MÃ¡scara}, \textbf{Limpar mÃ¡scara}, tambÃ©m Ã© possÃvel executa-la pressionando as teclas \textbf{CTRL+SHIFT+A}.
-
-\begin{figure}[!htb]
-\centering
-\includegraphics[scale=0.6]{watershed_limpeza.png}
-\caption{Limpeza de mÃ¡scara}
-\label{fig:limpeza_mascara}
-\end{figure}
 \ No newline at end of file
+A tÃ©cnica parte de um pixel inicial que Ã© indicado clicando com o \textbf{botÃ£o direito} do mouse, os pixels vizinhos que satisfazem as condiÃ§Ãµes indicadas anteriormente sÃ£o selecionados. Cada mÃ©todo leva em consideraÃ§Ã£o diferentes condiÃ§Ãµes, a seguir sÃ£o apresentadas as diferenÃ§as entre cada mÃ©todo:
+
+\begin{itemize}
+	\item \textbf{DinÃ¢mico}: Esse mÃ©todo captura o valor do pixel que foi clicado, levando em consideraÃ§Ã£o o desvio para baixo (min) e desvio para cima (max). A opÃ§Ã£o \textbf{Considerar o brilho e contraste} Ã© ativada por padrÃ£o, essa opÃ§Ã£o permite levar em consideraÃ§Ã£o os valores de nÃveis de cinza que sÃ£o exibidos e/ou ajustados na opÃ§Ã£o brilho e contraste. Ao desativar essa opÃ§Ã£o serÃ¡ levado em consideraÃ§Ã£o os valores de cinza gravados na imagem (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}). 
+	
+	\begin{figure}[!htb]
+	\centering
+	\includegraphics[scale=0.7]{segmentation_region_growing_dinamic_parameter_pt.png}
+	\caption{Ajuste de parÃ¢metros para o mÃ©todo dinÃ¢mico.}
+	\label{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}
+	\end{figure}
+	
+	\item \textbf{Limiar}: O mÃ©todo limiar selecionarÃ¡ os pixels cuja a vizinhanÃ§a estejam dentro do valor mÃnimo e mÃ¡ximo (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_limiar}).
+
+	\begin{figure}[!htb]
+	\centering
+	\includegraphics[scale=0.7]{segmentation_region_growing_limiar_pt.png}
+	\caption{Ajuste de faixa de valores do mÃ©todo limiar.}
+	\label{fig:segmentation_region_growing_limiar}
+	\end{figure}	
+	
+	\item \textbf{ConfidÃªncia}: O mÃ©todo (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_confidence_parameter})
+	
+	\begin{figure}[!htb]
+	\centering
+	\includegraphics[scale=0.7]{segmentation_region_growing_confidence_parameter_pt.png}
+	\caption{Ajuste de faixa de valores do mÃ©todo limiar.}
+	\label{fig:segmentation_region_growing_confidence_parameter}
+	\end{figure}	
+	
+	
+\end{itemize}
 \ No newline at end of file
@@ -13,7 +13,7 @@ no painel esquerdo do software, dentro do item \textbf{3. Configure a superfíci
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_23_Jan_23_23_10}
+\includegraphics[scale=0.65]{surface_config_panel_pt.png}
 \caption{Configuração de uma superfície 3D}
 \label{fig:3d_surface_managment}
 \end{figure}
@@ -39,7 +39,7 @@ seleção da maior região da superfície.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{new_surface.png}
+\includegraphics[scale=0.5]{surface_config_window_pt.png}
 \caption{Janela para criação de superfície}
 \label{fig:create_surface_1}
 \end{figure}
@@ -55,8 +55,8 @@ selecionadas: &quot;Preencher buracos&quot; e &quot;Manter maior região&quot;.
 \begin{figure}
   \centering
-  \subfloat[Frente]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.338\textwidth]{ScreenHunter_48_Jan_23_23_34}}                
-  \subfloat[Baixo]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{ScreenHunter_50Jan232334}}
+  \subfloat[Frente]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.338\textwidth]{surface_model_front.jpg}}                
+  \subfloat[Baixo]{\label{fig:__1}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{surface_model_bottom.jpg}}
   \caption{Superfície com região maior selecionada e com buracos preenchidos}
   \label{fig:surface_ex1}
 \end{figure}
@@ -68,8 +68,8 @@ suporte do tomógrafo e a superfície aberta.
 \begin{figure}
   \centering
-  \subfloat[Frente]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.371\textwidth]{ScreenHunter_52Jan232335}}                
-  \subfloat[Baixo]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{ScreenHunter_53Jan232336}}
+  \subfloat[Frente]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.371\textwidth]{surface_model_front_all_parts.jpg}}                
+  \subfloat[Baixo]{\label{fig:__2}\includegraphics[width=0.3\textwidth]{surface_model_bottom_all_parts.jpg}}
   \caption{Superfície sem a seleção da maior região e com buracos abertos}
   \label{fig:surface_ex2}
 \end{figure}
@@ -105,7 +105,7 @@ superfície por meio da lista de seleção, dentro do item \textbf{3. Configure 
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{select_surface}
+\includegraphics[scale=0.8]{surface_select_menu.png}
 \caption{Seleção de superfície}
 \label{fig:select_surface}
 \end{figure}
@@ -116,7 +116,7 @@ o controle, maior será a transparência aplicada.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{transparency}
+\includegraphics[scale=0.7]{surface_transparency_pt.png}
 \caption{Seleção de nível de transparência}
 \label{fig:select_transparency}
 \end{figure}
@@ -143,7 +143,7 @@ superfície 3D}, opção \textbf{Propriedades da superfície}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{button_select_color}
+\includegraphics[scale=0.6]{surface_button_select_color_yellow.png}
 \caption{Botão para alteração de cor}
 \label{fig:change_surface_color}
 \end{figure}
@@ -153,7 +153,7 @@ desejada e clique no botão \textbf{OK}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142}
+\includegraphics[scale=0.6]{surface_select_color_windows_so_pt.png}
 \caption{Opções de cor}
 \label{fig:button_select_color}
 \end{figure}
@@ -166,8 +166,8 @@ figura \ref{fig:advanced_tools}.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.4]{ferramentas_avancadas}
-\caption{Atalho para ferramentas avançadas}
+\includegraphics[scale=0.7]{surface_painel_advanced_options_pt.png}
+\caption{Atalho para opções avançadas}
 \label{fig:advanced_tools}
 \end{figure}
@@ -178,8 +178,8 @@ Um menu com as opções disponíveis será exibido, como ilustra a figura
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.5]{exract_region}
-\caption{Ferramentas avançadas}
+\includegraphics[scale=0.7]{surface_split_pt.png}
+\caption{Opções avançadas}
 \label{fig:advanced_tools_expanded}
 \end{figure}
@@ -202,7 +202,7 @@ da maior região.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{extract_most_region_1}
+\includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region_1.jpg}
 \caption{Superfícies desconexas}
 \label{fig:extract_most_region_1}
 \end{figure}
@@ -212,7 +212,7 @@ desconexa separada.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{extract_most_region2}
+\includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region2.jpg}
 \caption{Maior região separada}
 \label{fig:extract_most_region2}
 \end{figure}
@@ -238,7 +238,7 @@ direita do suporte do tomógrafo.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.35]{extract_most_region3}
+\includegraphics[scale=0.35]{surface_extract_most_region3.jpg}
 \caption{Exemplo de regiões de interesse selecionadas}
 \label{fig:extract_most_region3}
 \end{figure}
@@ -261,7 +261,7 @@ A figura \ref{fig:extrac_most_region_4} mostra um exemplo.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.3]{extrac_most_region_4}
+\includegraphics[scale=0.3]{surface_extract_most_region_4.jpg}
 \caption{Exemplo de separação de todas as regiões desconexas}
 \label{fig:extrac_most_region_4}
 \end{figure}
@@ -118,7 +118,7 @@ disponível com os demais na próxima vez em que o software for aberto.
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{save_window_preset}
+\includegraphics[scale=0.7]{save_window_preset_pt.png}
 \caption{Janela para nomear e salvar um padrão}
 \label{fig:save_window_preset}
 \end{figure}
@@ -176,7 +176,7 @@ um padrão de visualização selecionado, clique em \textbf{Ferramentas} e, em s
 \begin{figure}[!htb]
 \centering
-\includegraphics[scale=0.6]{activate_cut_plane}
+\includegraphics[scale=0.6]{activate_cut_plane_pt.png}
 \caption{Ativando plano para corte}
 \label{fig:activate_cut_plane}
 \end{figure}
@@ -1,5 +0,0 @@
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-
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-
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-
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-
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-
	@@ -20,8 +20,31 @@ Fábio de Souza Azevedo		@@ -20,8 +20,31 @@ Fábio de Souza Azevedo
20	\\	20	\\
21		21
22		22
		23	+André Salles Cunha Peres (Neuronavegador)
		24	+
		25	+\href{mailto:peres.asc@gmail.com}{peres.asc@gmail.com}
		26	+\\
		27	+
		28	+Victor Hugo (Neuronavegador)
		29	+
		30	+\href{mailto:victorhos@hotmail.com}{victorhos@hotmail.com}
		31	+\\
		32	+
		33	+
		34	+Renan Matsuda (Neuronavegador)
		35	+
		36	+\href{mailto:renan\_hiroshi@hotmail.com}{renan\_hiroshi@hotmail.com}
		37	+\\
		38	+
		39	+
		40	+Oswaldo Baffa Filho (Neuronavegador)
		41	+
		42	+\href{mailto:baffa@usp.br}{baffa@usp.br}
		43	+\\
		44	+
23	Jorge Vicente Lopes da Silva	45	Jorge Vicente Lopes da Silva
24		46
25		47
26	\href{mailto:jorge.silva@cti.gov.br}{jorge.silva@cti.gov.br}	48	\href{mailto:jorge.silva@cti.gov.br}{jorge.silva@cti.gov.br}
27	\\	49	\\
		50	+
	@@ -20,7 +20,7 @@ visualização das imagens, conforme mostra a figura \ref{fig:closed_tool_menu}.		@@ -20,7 +20,7 @@ visualização das imagens, conforme mostra a figura \ref{fig:closed_tool_menu}.
20		20
21	\begin{figure}[!htb]	21	\begin{figure}[!htb]
22	\centering	22	\centering
23	-\includegraphics[scale=0.4]{closed_tool_menu}	23	+\includegraphics[scale=0.4]{window_mpr_not_painels_pt.png}
24	\caption{Menu lateral ocultado}	24	\caption{Menu lateral ocultado}
25	\label{fig:closed_tool_menu}	25	\label{fig:closed_tool_menu}
26	\end{figure}	26	\end{figure}
	@@ -49,7 +49,7 @@ direito da tela do InVesalius.		@@ -49,7 +49,7 @@ direito da tela do InVesalius.
49		49
50	\begin{figure}[!htb]	50	\begin{figure}[!htb]
51	\centering	51	\centering
52	-\includegraphics[scale=0.8]{color_button}	52	+\includegraphics[scale=0.8]{colour_button.png}
53	\caption{Atalho para cor de fundo da janela de volume/superfície}	53	\caption{Atalho para cor de fundo da janela de volume/superfície}
54	\label{fig:button_select_color_2}	54	\label{fig:button_select_color_2}
55	\end{figure}	55	\end{figure}
	@@ -59,7 +59,7 @@ Após isso, basta clicar sobre a cor desejada e, em seguida, clicar em \textbf{O		@@ -59,7 +59,7 @@ Após isso, basta clicar sobre a cor desejada e, em seguida, clicar em \textbf{O
59		59
60	\begin{figure}[!htb]	60	\begin{figure}[!htb]
61	\centering	61	\centering
62	-\includegraphics[scale=0.4]{ScreenHunter_33Dec311142}	62	+\includegraphics[scale=0.6]{surface_select_color_windows_so_pt.png}
63	\caption{Seleção de cor de fundo}	63	\caption{Seleção de cor de fundo}
64	\label{fig:color_window_background}	64	\label{fig:color_window_background}
65	\end{figure}	65	\end{figure}
	@@ -68,7 +68,7 @@ A figura \ref{fig:background_color} mostra um exemplo dessa janela com a cor de		@@ -68,7 +68,7 @@ A figura \ref{fig:background_color} mostra um exemplo dessa janela com a cor de
68		68
69	\begin{figure}[!htb]	69	\begin{figure}[!htb]
70	\centering	70	\centering
71	-\includegraphics[scale=0.6]{3d_background}	71	+\includegraphics[scale=0.7]{3d_background_changed.png}
72	\caption{Cor de fundo alterada}	72	\caption{Cor de fundo alterada}
73	\label{fig:background_color}	73	\label{fig:background_color}
74	\end{figure}	74	\end{figure}
	@@ -10,7 +10,7 @@ duplo com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre o item para expandi-lo. A fi		@@ -10,7 +10,7 @@ duplo com o botão \textbf{esquerdo} do mouse sobre o item para expandi-lo. A fi
10		10
11	\begin{figure}[!htb]	11	\begin{figure}[!htb]
12	\centering	12	\centering
13	-\includegraphics[scale=0.6]{data_export}	13	+\includegraphics[scale=0.8]{painel_data_export_pt.png}
14	\caption{Menu para exportação de dados}	14	\caption{Menu para exportação de dados}
15	\label{fig:data_export}	15	\label{fig:data_export}
16	\end{figure}	16	\end{figure}
	@@ -24,7 +24,7 @@ figura \ref{fig:data_export_selection}.		@@ -24,7 +24,7 @@ figura \ref{fig:data_export_selection}.
24		24
25	\begin{figure}[!htb]	25	\begin{figure}[!htb]
26	\centering	26	\centering
27	-\includegraphics[scale=0.6]{data_export_selection}	27	+\includegraphics[scale=0.7]{painel_data_export_selection_pt.png}
28	\caption{Seleção de superfície a exportar}	28	\caption{Seleção de superfície a exportar}
29	\label{fig:data_export_selection}	29	\label{fig:data_export_selection}
30	\end{figure}	30	\end{figure}
	@@ -39,12 +39,12 @@ Em seguida, clique sobre o ícone que a figura \ref{fig:surface_export_original}		@@ -39,12 +39,12 @@ Em seguida, clique sobre o ícone que a figura \ref{fig:surface_export_original}
39	\end{figure}	39	\end{figure}
40		40
41	Na janela exibida (figura \ref{fig:export_data_window}), insira o nome do arquivo e	41	Na janela exibida (figura \ref{fig:export_data_window}), insira o nome do arquivo e
42	-selecione o formato desejado para a exportação. Em seguida, clique em \textbf{Save (Salvar)}.	42	+selecione o formato desejado para a exportação. Em seguida, clique em \textbf{Salvar}.
43		43
44		44
45	\begin{figure}[!htb]	45	\begin{figure}[!htb]
46	\centering	46	\centering
47	-\includegraphics[scale=0.4]{export_data_window}	47	+\includegraphics[scale=0.4]{export_surface.png}
48	\caption{Janela para exportar superfície}	48	\caption{Janela para exportar superfície}
49	\label{fig:export_data_window}	49	\label{fig:export_data_window}
50	\end{figure}	50	\end{figure}
	@@ -83,17 +83,17 @@ exibido na figura \ref{fig:menu_save_image_window} e selecione a sub-janela corr		@@ -83,17 +83,17 @@ exibido na figura \ref{fig:menu_save_image_window} e selecione a sub-janela corr
83		83
84	\begin{figure}[!htb]	84	\begin{figure}[!htb]
85	\centering	85	\centering
86	-\includegraphics[scale=0.4]{menu_save_image_window}	86	+\includegraphics[scale=0.5]{menu_save_image_window_pt.png}
87	\caption{Menu para exportar imagem}	87	\caption{Menu para exportar imagem}
88	\label{fig:menu_save_image_window}	88	\label{fig:menu_save_image_window}
89	\end{figure}	89	\end{figure}
90		90
91	Na janela exibida (figura \ref{fig:save_image_window}), selecione o formato do arquivo e	91	Na janela exibida (figura \ref{fig:save_image_window}), selecione o formato do arquivo e
92	-clique no botão \textbf{Save (Salvar)}.	92	+clique no botão \textbf{Salvar}.
93		93
94	\begin{figure}[!htb]	94	\begin{figure}[!htb]
95	\centering	95	\centering
96	-\includegraphics[scale=0.4]{save_image_window}	96	+\includegraphics[scale=0.4]{export_bmp_pt.png}
97	\caption{Janela para exportar imagem}	97	\caption{Janela para exportar imagem}
98	\label{fig:save_image_window}	98	\label{fig:save_image_window}
99	\end{figure}	99	\end{figure}
@@ -0,0 +1,117 @@		@@ -0,0 +1,117 @@
	1	+\chapter{Ajuste de imagem}
	2	+
	3	+O InVesalius não garante a correta ordem das imagens pois depende de informações que estão presentes nas imagens, algumas vezes essas imagens tem as informações incorretas ou não seguem o padrão DICOM. Dessa forma é recomendável confirmar se a lesão ou algum outro marco anatômico presente em um determinado paciente é exibido no lado correto da imagem. Caso não seja, é possível utilizar as ferramentas de espelhar a imagem ou inverter eixos. Também para o alinhamento da imagem, existe a ferramenta de rotação da imagem.
	4	+
	5	+\section{Espelhar}
	6	+
	7	+É possível espelhar um dos lados da imagem de modo que eles se invertam, para isso é necessário ir no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem}, \textbf{Espelhar} e clicar em uma das seguintes opções (figura~\ref{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}):
	8	+
	9	+\begin{itemize}
	10	+ \item Direita - Esquerda
	11	+ \item Anterior - Posterior
	12	+ \item Superior - Inferior
	13	+\end{itemize}
	14	+
	15	+\begin{figure}[!htb]
	16	+\centering
	17	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_img_mirroring_axis_pt.png}
	18	+\caption{Menu para ativar ferramenta de espelhar imagem.}
	19	+\label{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}
	20	+\end{figure}
	21	+
	22	+
	23	+A figura~\ref{fig:mirrored} apresenta um comparativo entre a imagem não espelhada e a imagem espelhada. Por o conjunto de imagens formar um volume, ao aplicar espelhamento todas as outras orientações são modificadas também.
	24	+
	25	+\begin{figure}[!htb]
	26	+ \centering
	27	+ \subfloat[Imagem entrada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mirror_axial.png}} \qquad
	28	+ \subfloat[Imagem espelhada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mirror_axial_mirrored.png}}
	29	+ \hfill
	30	+ \caption{Exemplo de imagem com direita-esquerda espelhada.}
	31	+ \label{fig:mirrored}
	32	+\end{figure}
	33	+
	34	+\section{Trocar Eixo}
	35	+
	36	+A ferramenta de troca de eixo, muda as orientações da imagem caso ela tem sido importada erroneamente. Para isso é necessário ir no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem}, \textbf{Trocar Eixo} e clicar em uma das seguintes opções (figura~\ref{fig:menu_invert_axis}):
	37	+
	38	+\begin{itemize}
	39	+ \item Da Direita para Anterior-Posterior
	40	+ \item Da Direita-Esquerda para Superior-Inferior
	41	+ \item Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior
	42	+\end{itemize}
	43	+
	44	+
	45	+As figuras~\ref{fig:invert_axis_axial} e~\ref{fig:invert_axis_axial_inverted}, apresentam um exemplo de imagens com eixo invertido.
	46	+
	47	+\begin{figure}[!htb]
	48	+\centering
	49	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_invert_axis_pt.png}
	50	+\caption{Menu para ativar espelhar um dos lados da imagem.}
	51	+\label{fig:menu_invert_axis}
	52	+\end{figure}
	53	+
	54	+\begin{figure}[!htb]
	55	+\centering
	56	+\includegraphics[scale=0.4]{invert_axis_axial_pt.png}
	57	+\caption{Conjunto de imagens antes de inverter eixo - Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior.}
	58	+\label{fig:invert_axis_axial}
	59	+\end{figure}
	60	+
	61	+\begin{figure}[!htb]
	62	+\centering
	63	+\includegraphics[scale=0.4]{invert_axis_axial_inverted_pt.png}
	64	+\caption{Conjunto de imagens com eixo invertido - Da Anterior-Posterior para Superior-Inferior.}
	65	+\label{fig:invert_axis_axial_inverted}
	66	+\end{figure}
	67	+
	68	+\section{Reorientar imagem (Rotacionar)}
	69	+
	70	+Caso seja necessário alinhar a imagem levando em consideração algum ponto de referencia como algum marco anatômico, é possível realizar essa tarefa utilizando a ferramenta de reorientação de imagem. Para abrir a ferramenta é necessário ir ao menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem} e por último \textbf{Reorientar imagem} (figura~\ref{fig:menu_img_reorient}).
	71	+
	72	+\begin{figure}[!htb]
	73	+\centering
	74	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_img_reorient_pt.png}
	75	+\caption{Menu para ativar o recurso de reorientar imagem.}
	76	+\label{fig:menu_img_reorient}
	77	+\end{figure}
	78	+
	79	+Ao abrir a ferramenta será exibida uma janela (figura~\ref{fig:image_reorient_window}) que mostra em qual orientação e quantos graus a imagem foi rotacionada.
	80	+
	81	+\begin{figure}[!htb]
	82	+\centering
	83	+\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_window_pt.png}
	84	+\caption{Janela responsável por exibir os parâmetros de reorientação de imagem.}
	85	+\label{fig:image_reorient_window}
	86	+\end{figure}
	87	+
	88	+Inicialmente é necessário definir em função de qual ponto a imagem será rotacionada, para isso é necessário \textbf{manter o botão esquerdo do mouse pressionado} entre a interseção de duas linhas (figura~\ref{fig:image_reorient_adjust_center}) em uma das janelas de orientação axial, coronal ou sagital e arrastar até o ponto desejado.
	89	+
	90	+\begin{figure}[!htb]
	91	+\centering
	92	+\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_adjust_center.png}
	93	+\caption{Definição do eixo de rotação da imagem.}
	94	+\label{fig:image_reorient_adjust_center}
	95	+\end{figure}
	96	+
	97	+Para rotacionar a imagem é necessário \textbf{manter o botão esquerdo do mouse pressionado} e \textbf{arrastar} de forma que o ponto de referencia ou marco anatômico fique alinhado com uma das linhas (figura~\ref{fig:image_reorient_rotated}). Após a imagem estar na posição desejada, é necessário clicar no botão \textbf{Aplicar}, presente na janela de parâmetros (figura~\ref{fig:image_reorient_window}), dependo do tamanho da imagem é necessário aguardar alguns segundos até o processo finalizar. A figura~\ref{fig:image_reorient_rotated_applied} apresenta uma imagem com o processo de de reorientação finalizada.
	98	+
	99	+\begin{figure}[!htb]
	100	+\centering
	101	+\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_rotated_pt.png}
	102	+\caption{Imagem rotacionada.}
	103	+\label{fig:image_reorient_rotated}
	104	+\end{figure}
	105	+
	106	+\begin{figure}[!htb]
	107	+\centering
	108	+\includegraphics[scale=0.4]{image_reorient_rotated_applied_pt.png}
	109	+\caption{Imagem rotacionada após a finalização do processo.}
	110	+\label{fig:image_reorient_rotated_applied}
	111	+\end{figure}
	112	+
	113	+
	114	+
	115	+
	116	+
	117	+
	@@ -27,7 +27,7 @@ Clique em \textbf{OK}.		@@ -27,7 +27,7 @@ Clique em \textbf{OK}.
27		27
28	\begin{figure}[!htb]	28	\begin{figure}[!htb]
29	\centering	29	\centering
30	-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_04Dec311139.jpg}	30	+\includegraphics[scale=0.5]{import_select_folder_pt.png}
31	\caption{SeleÃ§Ã£o de diretÃ³rio}	31	\caption{SeleÃ§Ã£o de diretÃ³rio}
32	\label{fig:win_folder}	32	\label{fig:win_folder}
33	\end{figure}	33	\end{figure}
	@@ -39,7 +39,7 @@ do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:ver_fil		@@ -39,7 +39,7 @@ do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:ver_fil
39		39
40	\begin{figure}[!htb]	40	\begin{figure}[!htb]
41	\centering	41	\centering
42	-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_03Dec311131.jpg}	42	+\includegraphics[scale=0.6]{import_load_files_pt.png}
43	\caption{Status de verificaÃ§Ã£o e carregamento de arquivos}	43	\caption{Status de verificaÃ§Ã£o e carregamento de arquivos}
44	\label{fig:ver_file}	44	\label{fig:ver_file}
45	\end{figure}	45	\end{figure}
	@@ -52,7 +52,7 @@ pular imagens para reconstruÃ§Ã£o.		@@ -52,7 +52,7 @@ pular imagens para reconstruÃ§Ã£o.
52		52
53	\begin{figure}[!htb]	53	\begin{figure}[!htb]
54	\centering	54	\centering
55	-\includegraphics[scale=0.3]{ScreenHunter_06Dec311139.jpg}	55	+\includegraphics[scale=0.4]{import_window_pt.png}
56	\caption{Tela de importaÃ§Ã£o}	56	\caption{Tela de importaÃ§Ã£o}
57	\label{fig:win_import}	57	\label{fig:win_import}
58	\end{figure}	58	\end{figure}
	@@ -66,7 +66,7 @@ com o botÃ£o \textbf{esquerdo} do mouse sobre a descriÃ§Ã£o da sÃ©rie. Veja a fi		@@ -66,7 +66,7 @@ com o botÃ£o \textbf{esquerdo} do mouse sobre a descriÃ§Ã£o da sÃ©rie. Veja a fi
66		66
67	\begin{figure}[!htb]	67	\begin{figure}[!htb]
68	\centering	68	\centering
69	-\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_08Dec311139_.jpg}	69	+\includegraphics[scale=0.5]{import_window_detail_pt.png}
70	\caption{SeleÃ§Ã£o de sÃ©rie}	70	\caption{SeleÃ§Ã£o de sÃ©rie}
71	\label{fig:import_serie}	71	\label{fig:import_serie}
72	\end{figure}	72	\end{figure}
	@@ -77,11 +77,11 @@ Em alguns casos, em particular quando nÃ£o se dispÃµe de um computador com memÃ³		@@ -77,11 +77,11 @@ Em alguns casos, em particular quando nÃ£o se dispÃµe de um computador com memÃ³
77	processamento satisfatÃ³rios para trabalhar com muitas imagens em uma sÃ©rie, pode ser	77	processamento satisfatÃ³rios para trabalhar com muitas imagens em uma sÃ©rie, pode ser
78	recomendÃ¡vel pular (ignorar) algumas delas. Para isso, clique \textbf{uma vez} com o botÃ£o	78	recomendÃ¡vel pular (ignorar) algumas delas. Para isso, clique \textbf{uma vez} com o botÃ£o
79	\textbf{esquerdo} do mouse sobre a descriÃ§Ã£o da sÃ©rie (figura \ref{fig:import_serie}) e selecione	79	\textbf{esquerdo} do mouse sobre a descriÃ§Ã£o da sÃ©rie (figura \ref{fig:import_serie}) e selecione
80	-quantas imagens serÃ£o puladas (figura \ref{fig:skip_image}). Clique em \textbf{OK}.	80	+quantas imagens serÃ£o puladas (figura \ref{fig:skip_image}). Clique em \textbf{Importar}.
81		81
82	\begin{figure}[!htb]	82	\begin{figure}[!htb]
83	\centering	83	\centering
84	-\includegraphics[scale=0.6]{ScreenHunter_13Dec311140_.jpg}	84	+\includegraphics[scale=0.6]{import_window_skip_slice_pt.png}
85	\caption{Pular imagens}	85	\caption{Pular imagens}
86	\label{fig:skip_image}	86	\label{fig:skip_image}
87	\end{figure}	87	\end{figure}
	@@ -96,7 +96,7 @@ cada imagem resultante terÃ¡ 307 x 307 pixeis. Caso deseje abrir com a resoluÃ§Ã		@@ -96,7 +96,7 @@ cada imagem resultante terÃ¡ 307 x 307 pixeis. Caso deseje abrir com a resoluÃ§Ã
96		96
97	\begin{figure}[!htb]	97	\begin{figure}[!htb]
98	\centering	98	\centering
99	-\includegraphics[scale=0.5]{file_import_resize.png}	99	+\includegraphics[scale=0.5]{import_window_lower_memory_pt.png}
100	\caption{ReduÃ§Ã£o de dimensÃ£o da imagem}	100	\caption{ReduÃ§Ã£o de dimensÃ£o da imagem}
101	\label{fig:resize_image}	101	\label{fig:resize_image}
102	\end{figure}	102	\end{figure}
	@@ -106,7 +106,7 @@ da reconstruÃ§Ã£o (quando as imagens sÃ£o empilhadas e interpoladas).		@@ -106,7 +106,7 @@ da reconstruÃ§Ã£o (quando as imagens sÃ£o empilhadas e interpoladas).
106		106
107	\begin{figure}[!htb]	107	\begin{figure}[!htb]
108	\centering	108	\centering
109	-\includegraphics[scale=0.5]{ScreenHunter_14Dec311140.jpg}	109	+\includegraphics[scale=0.6]{import_window_progress.png}
110	\caption{Progresso da reconstruÃ§Ã£o}	110	\caption{Progresso da reconstruÃ§Ã£o}
111	\label{fig:prog_recons}	111	\label{fig:prog_recons}
112	\end{figure}	112	\end{figure}
	@@ -119,7 +119,7 @@ Para importar arquivos no formato Analyze, no menu \textbf{Arquivo}, clique na o		@@ -119,7 +119,7 @@ Para importar arquivos no formato Analyze, no menu \textbf{Arquivo}, clique na o
119		119
120	\begin{figure}[!htb]	120	\begin{figure}[!htb]
121	\centering	121	\centering
122	-\includegraphics[scale=0.4]{analyze_menu.png}	122	+\includegraphics[scale=0.4]{import_analyze_menu_pt.png}
123	\caption{Menu para importar imagens no formato analyze}	123	\caption{Menu para importar imagens no formato analyze}
124	\label{fig:analyze_menu}	124	\label{fig:analyze_menu}
125	\end{figure}	125	\end{figure}
	@@ -128,7 +128,138 @@ Selecione o arquivo do tipo Analyze, na extensÃ£o \textbf{.hdr} e clique em \tex		@@ -128,7 +128,138 @@ Selecione o arquivo do tipo Analyze, na extensÃ£o \textbf{.hdr} e clique em \tex
128		128
129	\begin{figure}[!htb]	129	\begin{figure}[!htb]
130	\centering	130	\centering
131	-\includegraphics[scale=0.4]{analyze_import.png}	131	+\includegraphics[scale=0.4]{import_analyze_window_pt.png}
132	\caption{Importar imagens no formato analyze}	132	\caption{Importar imagens no formato analyze}
133	\label{fig:analyze_import}	133	\label{fig:analyze_import}
		134	+\end{figure}
		135	+
		136	+\section{NIfTI}
		137	+
		138	+Para importar arquivos no formato NIfTI, no menu \textbf{Arquivo}, clique na opÃ§Ã£o \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida a opÃ§Ã£o \textbf{NIfTI} como mostra a figura \ref{fig:import_nifti_menu_pt}.
		139	+
		140	+\begin{figure}[!htb]
		141	+\centering
		142	+\includegraphics[scale=0.4]{import_nifti_menu_pt.png}
		143	+\caption{Menu para importar imagens no formato NIfTI}
		144	+\label{fig:import_nifti_menu_pt}
		145	+\end{figure}
		146	+
		147	+Selecione o arquivo do tipo NIfTI, na extensÃ£o \textbf{nii.gz} ou \textbf{.nii} e clique em \textbf{Abrir}. (figura \ref{fig:import_nifti_window_pt}). Caso o arquivo esteja em outra extensÃ£o como \textbf{.hdr}, selecione a opÃ§Ã£o \textbf{all files(.)}.
		148	+
		149	+\begin{figure}[!htb]
		150	+\centering
		151	+\includegraphics[scale=0.4]{import_nifti_window_pt.png}
		152	+\caption{Importar imagens no formato NIfTI}
		153	+\label{fig:import_nifti_window_pt}
		154	+\end{figure}
		155	+
		156	+\section{PAR/REC}
		157	+
		158	+
		159	+Para importar arquivos no formato PAR/REC, no menu \textbf{Arquivo}, clique na opÃ§Ã£o \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida a opÃ§Ã£o \textbf{PAR/REC} como mostra a figura \ref{fig:import_parrec_menu_pt}.
		160	+
		161	+\begin{figure}[!htb]
		162	+\centering
		163	+\includegraphics[scale=0.4]{import_parrec_menu_pt.png}
		164	+\caption{Menu para importar imagens no formato PAR/REC}
		165	+\label{fig:import_parrec_menu_pt}
		166	+\end{figure}
		167	+
		168	+Selecione o arquivo do tipo PAR/REC, na extensÃ£o \textbf{.par} e clique em \textbf{Abrir}. (figura \ref{fig:import_parrec_window_pt}). Caso o arquivo esteja sem extensÃ£o, selecione a opÃ§Ã£o \textbf{all files(.)}.
		169	+
		170	+\begin{figure}[!htb]
		171	+\centering
		172	+\includegraphics[scale=0.4]{import_parrec_window_pt.png}
		173	+\caption{Importar imagens no formato PAR/REC}
		174	+\label{fig:import_parrec_window_pt}
		175	+\end{figure}
		176	+
		177	+
		178	+
		179	+\section{TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG (micro-CT)}
		180	+
		181	+Arquivos em formato TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG para reconstruÃ§Ã£o podem ser providos de equipamentos de microtomografia (micro-CT ou $\mu$CT) e outros. O InVesalius importa arquivos nesses formatos desde que os pixels presentes estejam em escala de cinza.
		182	+
		183	+Para importar, clique no menu \textbf{Arquivo} e na opÃ§Ã£o \textbf{Importar outros arquivos...} em seguida clique na opÃ§Ã£o \textbf{TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG ($\mu$CT)} como mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_menu_pt}.
		184	+
		185	+\begin{figure}[!htb]
		186	+\centering
		187	+\includegraphics[scale=0.4]{import_bmp_menu_pt.png}
		188	+\caption{Importar imagens no formato BMP e outros}
		189	+\label{fig:import_bmp_menu_pt}
		190	+\end{figure}
		191	+
		192	+Selecione o diretÃ³rio que contenha os arquivos, como mostra a figura \ref{fig:import_bmp_select_folder}. O InVesalius irÃ¡ procurar por arquivos tambÃ©m em subdiretÃ³rios do diretÃ³rio escolhido, caso existam.
		193	+
		194	+Clique em \textbf{OK}.
		195	+
		196	+\begin{figure}[!htb]
		197	+\centering
		198	+\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_select_folder_pt.png}
		199	+\caption{SeleÃ§Ã£o de diretÃ³rio}
		200	+\label{fig:import_bmp_select_folder}
		201	+\end{figure}
		202	+
		203	+
		204	+Enquanto o InVesalius procura por arquivos TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG no diretÃ³rio, Ã© exibido o progresso do carregamento dos arquivos verificados, como ilustra a figura \ref{fig:import_bmp_load_pt}.
		205	+
		206	+\begin{figure}[!htb]
		207	+\centering
		208	+\includegraphics[scale=0.6]{import_bmp_load_pt.png}
		209	+\caption{Status de verificaÃ§Ã£o e carregamento de arquivos}
		210	+\label{fig:import_bmp_load_pt}
		211	+\end{figure}
		212	+
		213	+
		214	+Se arquivos do tipo TIFF, JPG, BMP, JPEG ou PNG forem encontrados, Ã© aberta uma janela (figura~\ref{fig:import_bmp_window_pt}) para exibir os arquivos encontrados elegÃveis para reconstruÃ§Ã£o. TambÃ©m Ã© possÃvel pular imagens para reconstruÃ§Ã£o ou remover arquivos da lista para reconstruÃ§Ã£o. Os arquivos sÃ£o ordenados de acordo com o nome do arquivo, recomenda-se utilizar nÃºmeros em seus nomes de acordo com a ordem que deseja-se obter na reconstruÃ§Ã£o.
		215	+
		216	+\begin{figure}[!htb]
		217	+\centering
		218	+\includegraphics[scale=0.3]{import_bmp_window_pt.png}
		219	+\caption{Janela para importaÃ§Ã£o de arquivos do tipo BMP.}
		220	+\label{fig:import_bmp_window_pt}
		221	+\end{figure}
		222	+
		223	+Para excluir os arquivos que nÃ£o sÃ£o de interesse, Ã© possÃvel selecionar um arquivo clicando com o \textbf{botÃ£o esquerdo do mouse} e em seguida pressionar a tecla \textbf{delete}. Ã‰ possÃvel tambÃ©m escolher uma faixa de arquivos para deletar, para isso Ã© necessÃ¡rio clicar com o \textbf{botÃ£o esquerdo do mouse} no primeiro arquivo da faixa, manter pressionada a tecla \textbf{shift}, clicar novamente com o \textbf{botÃ£o esquerdo do mouse} no Ãºltimo arquivo da faixa e finalmente pressionar o botÃ£o \textbf{delete}.
		224	+
		225	+A exemplo da importaÃ§Ã£o de arquivos DICOM, Ã© possÃvel pular imagens BMP para reconstruÃ§Ã£o. Em alguns casos, em particular quando nÃ£o se dispÃµe de um computador com memÃ³ria e/ou processamento satisfatÃ³rios para trabalhar com muitas imagens em uma sÃ©rie, pode ser recomendÃ¡vel pular (ignorar) algumas delas. Para isso, selecione quantas imagens serÃ£o puladas (figura \ref{fig:import_bmp_skip_pt}). Clique em \textbf{Importar}.
		226	+
		227	+\begin{figure}[!htb]
		228	+\centering
		229	+\includegraphics[scale=0.4]{import_bmp_skip_pt.png}
		230	+\caption{Tela de importaÃ§Ã£o}
		231	+\label{fig:import_bmp_skip_pt}
		232	+\end{figure}
		233	+
		234	+Para a reconstruÃ§Ã£o desse tipo de arquivo Ã© necessÃ¡rio definir um nome para o projeto, indicar qual a orientaÃ§Ã£o das imagens (axial, coronal ou sagital), espaÃ§amento do voxel ($X$, $Y$ e $Z$) em \textbf{milÃmetros} como mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_spacing_pt}. O espaÃ§amento do voxel em $X$ Ã© largura do pixel de cada imagem, $Y$ o comprimento do pixel e $Z$ representa a distÃ¢ncia de cada fatia (altura do voxel).
		235	+
		236	+Caso o conjunto de imagens seja de imagens de microtomografia, mais especificamente de equipamentos das marcas GE e Brucker, Ã© possÃvel que o InVesalius realize a leitura do arquivo texto com os parÃ¢metros de aquisiÃ§Ã£o que normalmente fica na mesma pasta das imagens e insira automaticamente o espaÃ§amento. Essa constataÃ§Ã£o pode ser feita quando os valores de $X$, $Y$ e $Z$ sÃ£o diferentes de "1.00000000", caso contrÃ¡rio Ã© necessÃ¡rio digitar os valores dos respectivos espaÃ§amento.
		237	+
		238	+\textbf{AtenÃ§Ã£o, o espaÃ§amento Ã© um parÃ¢metro primordial para a correta dimensÃ£o dos objetos no software. EspaÃ§amento incorreto irÃ¡ fornecer medidas incorretas.}
		239	+
		240	+Uma vez preenchido todos os parÃ¢metros, basta clicar no botÃ£o \textbf{Ok}.
		241	+
		242	+\begin{figure}[!htb]
		243	+\centering
		244	+\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_spacing_pt.png}
		245	+\caption{Tela de importaÃ§Ã£o}
		246	+\label{fig:import_bmp_spacing_pt}
		247	+\end{figure}
		248	+
		249	+Caso seja detectado quantidade insuficiente de memÃ³ria disponÃvel na hora de carregar as imagens Ã© recomentado reduzir a resoluÃ§Ã£o das fatias para trabalhar com visualizaÃ§Ã£o volumÃ©trica e de superfÃcie, como mostra a janela \ref{fig:import_bmp_resize_pt}. As fatias serÃ£o redimensionadas de acordo com a porcentagem em relaÃ§Ã£o a resoluÃ§Ã£o original. Por exemplo, se cada fatia do exame contÃ©m a dimensÃ£o de 512 x 512 pixeis e for sugerido a "Porcentagem da resoluÃ§Ã£o original" em 60\%, cada imagem resultante terÃ¡ 307 x 307 pixeis. Caso deseje abrir com a resoluÃ§Ã£o original selecione o valor 100.
		250	+
		251	+\begin{figure}[!htb]
		252	+\centering
		253	+\includegraphics[scale=0.5]{import_bmp_resize_pt.png}
		254	+\caption{Redimensionamento de imagens}
		255	+\label{fig:import_bmp_resize_pt}
		256	+\end{figure}
		257	+
		258	+ApÃ³s os passos anteriores Ã© necessÃ¡rio aguardar um instante para completar a reconstruÃ§Ã£o multiplanar conforme mostra a figura~\ref{fig:import_bmp_mpr_pt.png}.
		259	+
		260	+\begin{figure}[!htb]
		261	+\centering
		262	+\includegraphics[scale=0.6]{import_bmp_mpr_pt.png}
		263	+\caption{ReconstruÃ§Ã£o multiplanar em andamento.}
		264	+\label{fig:import_bmp_mpr_pt.png}
134	\end{figure}	265	\end{figure}
135	\ No newline at end of file	266	\ No newline at end of file
	@@ -0,0 +1,187 @@		@@ -0,0 +1,187 @@
		1	+\chapter{Máscara}
		2	+
		3	+
		4	+\section{Operações booleanas}
		5	+
		6	+Após efetuar segmentações, é possível realizar operações booleanas entre as máscaras. As operações booleanas suportadas são:\\
		7	+\\
		8	+\textbf{União}, realiza a união de duas máscaras;\\
		9	+\textbf{Diferença}, realiza a diferença entre a primeira máscara com a segunda;\\
		10	+\textbf{Intersecção}, para apagar marcadores de objeto ou fundo.\\
		11	+\textbf{Disjunção exclusiva}, também é conhecida como XOR, mantém as regiões de ambas as máscara que possuem diferença.\\
		12	+
		13	+Para ativar essa ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Operações boolenas}, como é exibido na figura~\ref{fig:booleano_menu}
		14	+
		15	+\begin{figure}[!htb]
		16	+\centering
		17	+\includegraphics[scale=0.5]{mask_operation_boolean_menu_pt.png}
		18	+\caption{Menu para ativar a ferramenta de operações booleanas.}
		19	+\label{fig:booleano_menu}
		20	+\end{figure}
		21	+
		22	+É necessário selecionar a primeira máscara, a operação a ser realizada e a segunda máscara conforme mostra a figura~\ref{fig:booleano_janela}. Em seguida é necessário clicar no botão \textbf{Ok}.
		23	+
		24	+\begin{figure}[!htb]
		25	+\centering
		26	+\includegraphics[scale=0.5]{mask_boolean_dialog_pt.png}
		27	+\caption{Ferramenta de operações booleanas.}
		28	+\label{fig:booleano_janela}
		29	+\end{figure}
		30	+
		31	+Na figura~\ref{fig:op_boolana}, apresentamos um exemplo de utilização da ferramenta.
		32	+
		33	+\begin{figure}[!htb]
		34	+ \centering
		35	+ \subfloat[Máscara A]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_a.png}}
		36	+ \hfill
		37	+ \subfloat[Máscara B]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_m_b.png}}
		38	+ \hfill
		39	+ \subfloat[União (A $\cup$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_uniao.png}}
		40	+ \hfill
		41	+ \subfloat[Diferença (A - B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_dif.png}}
		42	+ \hfill
		43	+ \subfloat[Intersecção (A $\cap$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_interc.png}}
		44	+ \hfill
		45	+ \subfloat[Disjunção exclusiva (A $\oplus$ B)]{\includegraphics[width=0.332\textwidth]{booleano_disj_exc.png}}
		46	+ \caption{Exemplo de operações booleanas.}
		47	+ \label{fig:op_boolana}
		48	+\end{figure}
		49	+
		50	+\section{Limpeza total da máscara}
		51	+\label{cap:limpeza_mascara}
		52	+
		53	+Pode-se efetuar a limpeza total da máscara (figura~\ref{fig:limpeza_mascara}), isso é recomendado antes de iniciar a inserção de marcadores de Watershed. A ferramenta está localizada no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara}, \textbf{Limpar máscara}, também é possível executa-la pressionando as teclas \textbf{CTRL+SHIFT+A}.
		54	+
		55	+\begin{figure}[!htb]
		56	+\centering
		57	+\includegraphics[scale=0.5]{mask_clean_menu_pt.png}
		58	+\caption{Limpeza de máscara}
		59	+\label{fig:limpeza_mascara}
		60	+\end{figure}
		61	+
		62	+\section{Fechar buracos manualmente}
		63	+
		64	+Ao realizar a segmentação é possível que pequenas partes (buracos) que deseja-se ser selecionadas não sejam e ao gerar a superfície para a impressão 3D pode ser que ocorra inconsistências por causa desses buracos, para evitar esse tipo de problema é recomendável preenche-los. Para isso é basta acessar o menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último clicar em \textbf{Fechar buracos manualmente} (figura~\ref{fig:menu_mask_manual_fill_holes}). Em seguida será exibido uma tela (figura~\ref{fig:mask_manual_fill_holes_window}) para configurar os parâmetros.
		65	+
		66	+\begin{figure}[!htb]
		67	+\centering
		68	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_manual_fill_holes_pt.png}
		69	+\caption{Menu para acessa a ferramenta de fechamento de buracos manual.}
		70	+\label{fig:menu_mask_manual_fill_holes}
		71	+\end{figure}
		72	+
		73	+\begin{figure}[!htb]
		74	+\centering
		75	+\includegraphics[scale=0.7]{mask_manual_fill_holes_window_pt.png}
		76	+\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
		77	+\label{fig:mask_manual_fill_holes_window}
		78	+\end{figure}
		79	+
		80	+Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias.
		81	+
		82	+Quando os parâmetros estiverem configurados, clique com o \textbf{botão esquerdo} do mouse sobre o buraco que deseja-se fechar.
		83	+
		84	+Podemos observar na imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.a, um exemplo de uma máscara sem preenchimento de buracos e outra com os buracos preenchidos (imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.b). Após o uso da ferramenta, para sair clique no botão \textbf{fechar ou close} no canto inferior direito da janela de configuração de parâmetros.
		85	+
		86	+\begin{figure}[!htb]
		87	+ \centering
		88	+ \subfloat[Buracos]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_with_hole.png}} \qquad
		89	+ \subfloat[Buracos fechados]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_filled_hole.png}}
		90	+ \hfill
		91	+ \caption{Exemplo de máscara com buracos e buracos preenchidos.}
		92	+ \label{fig:mask_fill_hole}
		93	+\end{figure}
		94	+
		95	+
		96	+\section{Fechar buracos automaticamente}
		97	+
		98	+Para abrir a ferramenta, no menu do InVesalius clique em \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Fechar buracos automaticamente} (figura~\ref{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}), será aberto uma janela para configurar os parâmetros dos buracos que deseja-se fechar. A ferramenta não requer que o usuário clique nos buracos que deseja fechar, ela leva em consideração o tamanho do buraco em voxels que é configurado na janela de configuração de parâmetros (figura~\ref{fig:mask_automatic_fill_holes_window})
		99	+
		100	+\begin{figure}[!htb]
		101	+\centering
		102	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_automatic_fill_holes_pt.png}
		103	+\caption{Menu para acessar a ferramenta de fechamento de buracos automático.}
		104	+\label{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}
		105	+\end{figure}
		106	+
		107	+\begin{figure}[!htb]
		108	+\centering
		109	+\includegraphics[scale=0.7]{mask_automatic_fill_holes_window_pt.png}
		110	+\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
		111	+\label{fig:mask_automatic_fill_holes_window}
		112	+\end{figure}
		113	+
		114	+Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 2D é necessário indicar qual a janela será aplicado o fechamento de buracos, sendo axial, coronal ou sagital. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias.
		115	+
		116	+Com os parâmetros configurados, clique no botão \textbf{Aplicar ou Apply}, caso o resultado não seja satisfatório, reconfigure o tamanho do buraco ou outros parâmetros como conectividade e aplique novamente. Para sair clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
		117	+
		118	+\section{Remover partes}
		119	+
		120	+Antes de gerar a superfície é recomendável remover as partes desconexas não desejadas na máscara, dessa forma ao gerar a superfície será utilizada menores quantidades de memória RAM e o processo será mais rápido. Para remover as partes não desejáveis é necessário abrir a ferramenta de remover partes, clicando no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e \textbf{Remover Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_remove_part}). Em seguida irá ser exibido uma janela para configurar os parâmetros de seleção (figura~\ref{fig:mask_remove_parts_window}). É possível selecionar partes desconectas apenas na máscara 2D (\textbf{2D - Fatia atual}) ou em todo o conjunto de imagens, selecionando a opção \textbf{3D - Todas as fatias}. Também é possível selecionar suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$.
		121	+
		122	+\begin{figure}[!htb]
		123	+\centering
		124	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_remove_part_pt.png}
		125	+\caption{Menu para acessar a ferramenta de remoção de partes.}
		126	+\label{fig:menu_mask_remove_part}
		127	+\end{figure}
		128	+
		129	+\begin{figure}[!htb]
		130	+\centering
		131	+\includegraphics[scale=0.7]{mask_remove_parts_window.png}
		132	+\caption{Tela para configurar parâmetros de remoção de partes.}
		133	+\label{fig:mask_remove_parts_window}
		134	+\end{figure}
		135	+
		136	+Selecionado os parâmetros desejados, basta clicar com o \textbf{botão direito do mouse} sobre a região que deseja remover. A figura~\ref{fig:mask_removed_part} apresenta uma exemplo de parte removida e não removida. Para sair da ferramenta clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
		137	+
		138	+\begin{figure}[!htb]
		139	+ \centering
		140	+ \subfloat[Imagem de entrada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_complete.png}} \qquad
		141	+ \subfloat[Imagem com suporte do tomografo removido]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part.png}}
		142	+ \hfill
		143	+ \caption{Exemplo de região removida na máscara.}
		144	+ \label{fig:mask_removed_part}
		145	+\end{figure}
		146	+
		147	+\section{Selecionar partes}
		148	+
		149	+Para abrir a ferramenta de seleção de partes desconexas é necessário ir ao menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Selecionar Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_select_part}). A ferramenta irá apresentar uma tela de configuração de parâmetros que consiste em qual conectividade será levada em consideração (figura~\ref{fig:mask_select_part}), podendo ser $6$, $18$ ou $26$ e o nome da nova máscara que irá ter a imagem resultante.
		150	+
		151	+Todas as imagens a região que tem conectividade com o pixel selecionado. Para selecionar o pixel, é necessário clicar com o \textbf{botão esquerdo do mouse} em sobre o pixel desejado, o objeto irá ficar da cor vermelha, é possível selecionar vários objetos. Após a seleção é necessário clicar no \textbf{botão Ok}. A figura~\ref{fig:mask_selected_part}.a apresenta um objeto selecionado na cor vermelha e a figura~\ref{fig:mask_selected_part}.b somente o objeto após ter fechado a ferramenta (\textbf{botão Ok}).
		152	+
		153	+\begin{figure}[!htb]
		154	+\centering
		155	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_select_part_pt.png}
		156	+\caption{Menu para acessar a ferramenta de seleção de partes.}
		157	+\label{fig:menu_mask_select_part}
		158	+\end{figure}
		159	+
		160	+\begin{figure}[!htb]
		161	+\centering
		162	+\includegraphics[scale=0.7]{mask_select_part_pt.png}
		163	+\caption{Tela para configurar parâmetros de seleção de partes.}
		164	+\label{fig:mask_select_part}
		165	+\end{figure}
		166	+
		167	+\begin{figure}[!htb]
		168	+ \centering
		169	+ \subfloat[Região selecionada em vermelho]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_select_part_pt.png}} \qquad
		170	+ \subfloat[Imagem final, somente com a região selecionada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part_pt.png}}
		171	+ \hfill
		172	+ \caption{Exemplo de região selecionada na máscara.}
		173	+ \label{fig:mask_selected_part}
		174	+\end{figure}
		175	+
		176	+\section{Cortar}
		177	+
		178	+É possível cortar parte da máscara afim de selecionar uma região de interesse, isso pode ajudar reduzindo a quantidade de informações a ser processadas ao gerar superfície. Para abrir a ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último \textbf{Cortar} (figura~\ref{fig:menu_mask_crop}).
		179	+
		180	+\begin{figure}[!htb]
		181	+\centering
		182	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_crop_pt.png}
		183	+\caption{Menu para acessar a ferramenta de corte.}
		184	+\label{fig:menu_mask_crop}
		185	+\end{figure}
		186	+
		187	+Será exibida uma caixa delimitadora em cada janela das orientações axial, coronal e sagital.
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@@ -0,0 +1,162 @@		@@ -0,0 +1,162 @@
	1	+\chapter{Neuronavegação}
	2	+
	3	+\section{Introdução}
	4	+
	5	+Neuronavegação é a uma técnica que através da visualização computacional permite rastrear instrumentos cirúrgicos em relação às estruturas neuronais. Além disso, sistemas de neuronavegação têm sido apontados como uma ferramenta fundamental para aumentar a precisão de experimentos em neurociência, como a estimulação magnética transcraniana (EMT), eletroencefalografia, magnetoencefalografia e espectroscopia no infravermelho próximo. Apesar do vasto campo de aplicações, o uso da neuronavegação em centros de pesquisa é limitado pelo alto custo. O modulo de neuronavegação do InVesalius oferece aos usuários uma alternativa de baixo custo e código aberto aos sistemas comercias de navegação. Desta maneira, é possível utilizar ferramentas específicas para neunavegação e ainda ter a possibilidade de desenvolvimento de funcionalidades sob demanda. O neuronavegador é distribuído em uma versão executável compatível com sistema operacional Windows 7, 8 e 10.
	6	+
	7	+\section{Modo Navegação}
	8	+
	9	+Para utilizar o neuronavegador, é necessário habilitar o modo de neuronavegação do InVesalius selecionando no menu \textbf{Modo} em seguida \textbf{Navegação} (figura~\ref{fig:nav_menu_pt}). Será ativada uma nova aba "Sistema de navegação" que ficará visível no painel à esquerda da janela principal como é apresentado na figura~\ref{fig:nav_painel_pt}.
	10	+
	11	+\begin{figure}[!htb]
	12	+\centering
	13	+\includegraphics[scale=0.4]{nav_menu_pt.png}
	14	+\caption{Menu para ativar o modulo de neuronavegação.}
	15	+\label{fig:nav_menu_pt}
	16	+\end{figure}
	17	+
	18	+\begin{figure}[!htb]
	19	+\centering
	20	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_painel_pt.png}
	21	+\caption{Aba do sistema de neuronavegação.}
	22	+\label{fig:nav_painel_pt}
	23	+\end{figure}
	24	+
	25	+\section{Rastreadores espaciais e modo de referência}
	26	+
	27	+O sistema de neuronavegação se comunica com vários sistemas de rastreamento espacial. Atualmente, suporta os dispositivos fabricados pela ClaroNav (figura~\ref{fig:tracker_claron}) e Polhemus (figura~\ref{fig:tracker_polhemus}).
	28	+
	29	+O usuário deve selecionar o dispositivo correspondente no botão \textbf{Selecione o rastreador:}, figura~\ref{fig:nav_select_tracker}. Caso o usuário não possua nenhum dos rastreadores suportados e deseja realizar um teste do sistema, deve selecionar a opção \textbf{Depurar rastreador} e realizar normalmente os procedimentos que serão citados a seguir. Nessa opção, trata-se de uma simulação, do qual serão geradas coordenadas aleatórias.
	30	+
	31	+\begin{figure}[!htb]
	32	+\centering
	33	+\includegraphics[scale=0.4]{tracker_claron.png}
	34	+\caption{Rastreador Claron - www.claronav.com/microntracker/.}
	35	+\label{fig:tracker_claron}
	36	+\end{figure}
	37	+
	38	+\begin{figure}[!htb]
	39	+\centering
	40	+\includegraphics[scale=0.5]{tracker_polhemus.jpg}
	41	+\caption{Rastreador Polhemus - http://polhemus.com/motion-tracking/overview/.}
	42	+\label{fig:tracker_polhemus}
	43	+\end{figure}
	44	+
	45	+\begin{figure}[!htb]
	46	+\centering
	47	+\includegraphics[scale=0.5]{nav_select_tracker_pt.png}
	48	+\caption{Menu para seleção de rastreador.}
	49	+\label{fig:nav_select_tracker}
	50	+\end{figure}
	51	+
	52	+É possível realizar a navegação com dois diferentes tipos de referência, estático e dinâmico (figura~\ref{fig:nav_menu_ref}). No modo estático as coordenadas do dispositivo de rastreamento são detectadas com apenas uma sonda. Este modo de navegação é chamado de modo de referência estática porque a cabeça dos sujeitos deve permanecer estática na posição em que foram detectados os pontos fiduciais (Mais informações na seção~\ref{sec:corregistro}).
	53	+Para evitar problemas relacionados com o movimento da cabeça, alguns dispositivos de rastreamento fornecem uma sonda de referência. A sonda de referência pode ser ligada a uma parte não móvel da cabeça, por exemplo testa, para acompanhar as translações e rotações durante o procedimento de navegação. O uso de uma sonda de referência é o chamado modo de referência dinâmica.
	54	+
	55	+\begin{figure}[!htb]
	56	+\centering
	57	+\includegraphics[scale=0.5]{nav_menu_ref.png}
	58	+\caption{Menu para seleção de referência.}
	59	+\label{fig:nav_menu_ref}
	60	+\end{figure}
	61	+
	62	+\section{Corregistro}
	63	+\label{sec:corregistro}
	64	+
	65	+O objetivo do corregistro é as coordenadas virtual (imagem) e a as coordendas física do dispositivo de rastreamento em comum. Para realizar o corregistro, o usuário deve selecionar três marcadores fiduciais na imagem, para isso primeiramente deverá ativar o recurso de \textbf{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal} (ver seção~\ref{sec:corresp_all_orient}), coletar as três coordenadas fiduciais usando a sonda do dispositivo de rastreamento. Os fiduciais mais utilizados são o trago auricular esquerdo, trago auricular direito e a fossa nasal. A figura~\ref{fig:nav_selec_coord} ilustra a coleta dos pontos fiduciais. Quando é selecionado algum ponto fiducial na imagem, automaticamente é criado um marcador (esfera da cor verde) no volume, figura~\ref{fig:nav_balls_in_head}.
	66	+
	67	+\begin{figure}[!htb]
	68	+\centering
	69	+\includegraphics[scale=0.5]{nav_selec_coord_pt.png}
	70	+\caption{Botões e coordenadas para seleção de pontos fiduciais.}
	71	+\label{fig:nav_selec_coord}
	72	+\end{figure}
	73	+
	74	+As siglas dos botões para coleta dos fiduciais representam:
	75	+
	76	+\begin{itemize}
	77	+ \item OEI: trago auricular esquerdo na imagem
	78	+ \item ODI: trago auricular direito na imagem
	79	+ \item NAI: fossa nasal na imagem
	80	+ \item OER: trago auricular esquerdo no rastreador
	81	+ \item OER: trago auricular direito no rastreador
	82	+ \item NAR: fossa nasal esquerdo no rastreador
	83	+\end{itemize}
	84	+
	85	+\begin{figure}[!htb]
	86	+\centering
	87	+\includegraphics[scale=0.5]{nav_balls_in_head.png}
	88	+\caption{Criação de marcadores nos pontos fiduciais da imagem.}
	89	+\label{fig:nav_balls_in_head}
	90	+\end{figure}
	91	+
	92	+
	93	+\section{Erro de registro fiducial e navegação}
	94	+
	95	+Após o usuário selecionar os três pontos fiduciais na imagem e os respectivos pontos com o rastreador espacial, o próximo passo é clicar no \textbf{botão Navegar} e o procedimento de navegação será iniciado. Para pausar a navegação, basta clicar novamente no \textbf{botão Navegar}. Automaticamente após selecionado a navegação é calculado o erro de registro fiducial, conhecido como \textit{Fiducial Registration Error} (FRE). Esse erro representa a distância média quadrática do ponto fiducial na imagem com o respectivo ponto fiducial obtido após realizado o corregistro.
	96	+
	97	+Ao lado do botão de navegação, há a caixa de texto respectivo ao FRE. Se o FRE apresentar um valor alto (acima de 3 mm) a navegação não será precisa e a caixa de texto ficará vermelha, figura~\ref{fig:nav_fre_error}, recomenda-se que o corregistro seja refeito. Caso contrário, para FRE menor que 3 mm a caixa de texto fica verde, representando que a navegação terá precisão aceitável, figura~\ref{fig:nav_fre_ok}.
	98	+
	99	+\begin{figure}[!htb]
	100	+\centering
	101	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_error_pt.png}
	102	+\caption{Botão de navegação e FRE com valor elevado para navegação.}
	103	+\label{fig:nav_fre_error}
	104	+\end{figure}
	105	+
	106	+\begin{figure}[!htb]
	107	+\centering
	108	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_ok_pt.png}
	109	+\caption{Botão de navegação e FRE com valor aceitável para navegação.}
	110	+\label{fig:nav_fre_ok}
	111	+\end{figure}
	112	+
	113	+\section{Marcadores}
	114	+
	115	+Durante a navegação, é possível criar marcadores esféricos no volume 3D. Para acessar essa função, basta clicar na aba \textbf{Ferramentas extras}, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}.
	116	+
	117	+\begin{figure}[!htb]
	118	+\centering
	119	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_extra_tools_pt.png}
	120	+\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
	121	+\label{fig:nav_extra_tools}
	122	+\end{figure}
	123	+
	124	+A criação de marcadores pode ser executada clicando no botão correspondente, com isso será criado um marcador na posição da cruz vermelha com as características escolhidas na aba, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}. O número 4 representa o tamanho do raio da esfera que será criada. Ao lado do tamanho do marcador é possível definir a cor da esfera (figura~\ref{fig:nav_vol_with_markers}).
	125	+
	126	+Depois da criação é possível criar uma identificação para o marcador, para isso, deve-se clicar com o botão direto sobre o marcador desejado e selecionar \textbf{Editar ID}, figura~\ref{fig:nav_id_list_markers}, será aberto uma janela para o usuário digitar a identificação, figura~\ref{fig:nav_edit_id_markers}.
	127	+
	128	+
	129	+\begin{figure}[!htb]
	130	+\centering
	131	+\includegraphics[scale=0.4]{nav_vol_with_markers.png}
	132	+\caption{Volume com marcadores em diferentes cores.}
	133	+\label{fig:nav_vol_with_markers}
	134	+\end{figure}
	135	+
	136	+
	137	+\begin{figure}[!htb]
	138	+\centering
	139	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_id_list_markers_pt.png}
	140	+\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
	141	+\label{fig:nav_id_list_markers}
	142	+\end{figure}
	143	+
	144	+\begin{figure}[!htb]
	145	+\centering
	146	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_edit_id_markers_pt.png}
	147	+\caption{Janela para editar identificação do marcador.}
	148	+\label{fig:nav_edit_id_markers}
	149	+\end{figure}
	150	+
	151	+A exportação dos marcadores é feita através do \textbf{botão salvar}, a extensão do arquivo gerado é o .mks. Essa extensão de arquivo pode ser aberta por processadores de texto como bloco de notas. O arquivo possui as coordenadas $X$, $Y$ e $Z$ seguido o código $RGB$, tamanho de marcador e a identificação. Posteriormente, esse arquivo pode ser importado através do \textbf{botão Carregar}.
	152	+
	153	+Caso o usuário desejar excluir apenas um marcador basta \textbf{selecionar} o item desejado na lista e clicar no \textbf{botão Remover}, também existe a opção de excluir todos os marcadores criados, \textbf{Deletar todos marcadores}. Além disso, pode-se ocultar/mostrar a exibição dos marcadores no volume pelo \textbf{botão ocultar/mostrar}.
	154	+
	155	+\section{Caixas de seleção, trigger externo}
	156	+
	157	+Outra maneira para criação de marcadores é a monitoração externa de trigger. Para ativa-la basta selecionar a caixa de seleção \textbf{Trigger externo}. Essa função foi desenvolvida para comunicar dispositivos EMT e criar automaticamente o marcador em posições onde os pulsos foram aplicados. No entanto, outras aplicações são possíveis de acordo com a necessidade do usuário.
	158	+A comunicação com o dispositivo externo é feita através da porta serial COM1, e basta enviar qualquer sinal do tipo RS-232 em uma velocidade \textit{baud rate} de 9600 no pino de recepção que será criado um marcador na atual posição da cruz.
	159	+
	160	+\section{Câmera do volume}
	161	+
	162	+O posicionamento da câmera do volume é atualizado automaticamente, tanto pela posição da cruz vermelha das fatias quanto pela posição da sonda durante a navegação. O usuário pode desabilitar a atualização automática e atualizar a câmera manualmente. O posicionamento será alterado caso o usuário o fizer na janela de volume. Para isso, basta desmarcar a caixa de seleção \textbf{Câmera do volume}.
	@@ -118,7 +118,7 @@ disponível com os demais na próxima vez em que o software for aberto.		@@ -118,7 +118,7 @@ disponível com os demais na próxima vez em que o software for aberto.
118		118
119	\begin{figure}[!htb]	119	\begin{figure}[!htb]
120	\centering	120	\centering
121	-\includegraphics[scale=0.6]{save_window_preset}	121	+\includegraphics[scale=0.7]{save_window_preset_pt.png}
122	\caption{Janela para nomear e salvar um padrão}	122	\caption{Janela para nomear e salvar um padrão}
123	\label{fig:save_window_preset}	123	\label{fig:save_window_preset}
124	\end{figure}	124	\end{figure}
	@@ -176,7 +176,7 @@ um padrão de visualização selecionado, clique em \textbf{Ferramentas} e, em s		@@ -176,7 +176,7 @@ um padrão de visualização selecionado, clique em \textbf{Ferramentas} e, em s
176		176
177	\begin{figure}[!htb]	177	\begin{figure}[!htb]
178	\centering	178	\centering
179	-\includegraphics[scale=0.6]{activate_cut_plane}	179	+\includegraphics[scale=0.6]{activate_cut_plane_pt.png}
180	\caption{Ativando plano para corte}	180	\caption{Ativando plano para corte}
181	\label{fig:activate_cut_plane}	181	\label{fig:activate_cut_plane}
182	\end{figure}	182	\end{figure}
	@@ -1,5 +0,0 @@	@@ -1,5 +0,0 @@
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