Manual update

Paulo Henrique Junqueira Amorim
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docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mask_manual_fill_holes_window_pt.png
docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mask_remove_parts_window.png
docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/mask_select_part_pt.png
docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_img_mirroring_axis_pt.png
docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_mask_automatic_fill_holes_pt.png
docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_mask_crop_pt.png
docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_mask_manual_fill_holes_pt.png
docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_mask_remove_part_pt.png
docs/user_guide_pt_BR_source/img/invesalius_screen/menu_mask_select_part_pt.png
@@ -0,0 +1,26 @@
+\chapter{Ajuste da imagem}
+
+O InVesalius não garante a correta ordem das imagens pois depende de informações que estão presentes nas imagens, algumas vezes essas imagens tem as informações incorretas ou não seguem o padrão DICOM. Dessa forma é recomendável confirmar se a lesão ou algum outro marco anatômico presente em um determinado paciente é exibido no lado correto da imagem. Caso não seja, é possível utilizar as ferramentas de espelhar a imagem ou inverter eixos. Também para o alinhamento da imagem, existe a ferramenta de rotação da imagem.
+
+\section{Espelhar}
+
+É possível espelhar um dos lados da imagem de modo que eles se invertam, para isso é necessário ir no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem}, \textbf{Espelhar} e clicar em uma das seguintes opções (figura~\ref{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}):
+
+\begin{itemize}
+	\item Direita - Esquerda
+	\item Anterior - Posterior
+	\item Superior - Inferior
+\end{itemize}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_img_mirroring_axis_pt.png}
+\caption{Menu para ativar espelhar um dos lados da imagem.}
+\label{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}
+\end{figure}
+
+
+
+\section{Inverter Eixo}
+
+\section{Rotacionar} 
 \ No newline at end of file
@@ -57,4 +57,131 @@ Pode-se efetuar a limpeza total da máscara (figura~\ref{fig:limpeza_mascara}), 
 \includegraphics[scale=0.5]{mask_clean_menu_pt.png}
 \caption{Limpeza de máscara}
 \label{fig:limpeza_mascara}
-\end{figure}
 \ No newline at end of file
+\end{figure}
+
+\section{Fechar buracos manualmente}
+
+Ao realizar a segmentação é possível que pequenas partes (buracos) que deseja-se ser selecionadas não sejam e ao gerar a superfície para a impressão 3D pode ser que ocorra inconsistências por causa desses buracos, para evitar esse tipo de problema é recomendável preenche-los. Para isso é basta acessar o menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último clicar em \textbf{Fechar buracos manualmente} (figura~\ref{fig:menu_mask_manual_fill_holes}). Em seguida será exibido uma tela (figura~\ref{fig:mask_manual_fill_holes_window}) para configurar os parâmetros.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_manual_fill_holes_pt.png}
+\caption{Menu para acessa a ferramenta de fechamento de buracos manual.}
+\label{fig:menu_mask_manual_fill_holes}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{mask_manual_fill_holes_window_pt.png}
+\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
+\label{fig:mask_manual_fill_holes_window}
+\end{figure}
+
+Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias.
+
+Quando os parâmetros estiverem configurados, clique com o \textbf{botão esquerdo} do mouse sobre o buraco que deseja-se fechar.
+
+Podemos observar na imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.a, um exemplo de uma máscara sem preenchimento de buracos e outra com os buracos preenchidos (imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.b). Após o uso da ferramenta, para sair clique no botão \textbf{fechar ou close} no canto inferior direito da janela de configuração de parâmetros.
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Buracos]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_with_hole.png}}  \qquad
+  \subfloat[Buracos fechados]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_filled_hole.png}}
+  \hfill
+  \caption{Exemplo de máscara com buracos e buracos preenchidos.}
+  \label{fig:mask_fill_hole}
+\end{figure}
+
+
+\section{Fechar buracos automaticamente}
+
+Para abrir a ferramenta, no menu do InVesalius clique em \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Fechar buracos automaticamente} (figura~\ref{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}), será aberto uma janela para configurar os parâmetros dos buracos que deseja-se fechar. A ferramenta não requer que o usuário clique nos buracos que deseja fechar, ela leva em consideração o tamanho do buraco em voxels que é configurado na janela de configuração de parâmetros (figura~\ref{fig:mask_automatic_fill_holes_window})
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_automatic_fill_holes_pt.png}
+\caption{Menu para acessar a ferramenta de fechamento de buracos automático.}
+\label{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{mask_automatic_fill_holes_window_pt.png}
+\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
+\label{fig:mask_automatic_fill_holes_window}
+\end{figure}
+
+Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 2D é necessário indicar qual a janela será aplicado o fechamento de buracos, sendo axial, coronal ou sagital. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias. 
+
+Com os parâmetros configurados, clique no botão \textbf{Aplicar ou Apply}, caso o resultado não seja satisfatório, reconfigure o tamanho do buraco ou outros parâmetros como conectividade e aplique novamente. Para sair clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
+
+\section{Remover partes}
+
+Antes de gerar a superfície é recomendável remover as partes desconexas não desejadas na máscara, dessa forma ao gerar a superfície será utilizada menores quantidades de memória RAM e o processo será mais rápido. Para remover as partes não desejáveis é necessário abrir a ferramenta de remover partes, clicando no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e \textbf{Remover Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_remove_part}). Em seguida irá ser exibido uma janela para configurar os parâmetros de seleção (figura~\ref{fig:mask_remove_parts_window}). É possível selecionar partes desconectas apenas na máscara 2D (\textbf{2D - Fatia atual}) ou em todo o conjunto de imagens, selecionando a opção \textbf{3D - Todas as fatias}. Também é possível selecionar suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_remove_part_pt.png}
+\caption{Menu para acessar a ferramenta de remoção de partes.}
+\label{fig:menu_mask_remove_part}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{mask_remove_parts_window.png}
+\caption{Tela para configurar parâmetros de remoção de partes.}
+\label{fig:mask_remove_parts_window}
+\end{figure}
+
+Selecionado os parâmetros desejados, basta clicar com o \textbf{botão direito do mouse} sobre a região que deseja remover. A figura~\ref{fig:mask_removed_part} apresenta uma exemplo de parte removida e não removida. Para sair da ferramenta clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Imagem de entrada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_complete.png}}  \qquad
+  \subfloat[Imagem com suporte do tomografo removido]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part.png}}
+  \hfill
+  \caption{Exemplo de região removida na máscara.}
+  \label{fig:mask_removed_part}
+\end{figure}
+
+\section{Selecionar partes}
+
+Para abrir a ferramenta de seleção de partes desconexas é necessário ir ao menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Selecionar Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_select_part}). A ferramenta irá apresentar uma tela de configuração de parâmetros que consiste em qual conectividade será levada em consideração (figura~\ref{fig:mask_select_part}), podendo ser $6$, $18$ ou $26$ e o nome da nova máscara que irá ter a imagem resultante.
+
+Todas as imagens a região que tem conectividade com o pixel selecionado. Para selecionar o pixel, é necessário clicar com o \textbf{botão esquerdo do mouse} em sobre o pixel desejado, o objeto irá ficar da cor vermelha, é possível selecionar vários objetos. Após a seleção é necessário clicar no \textbf{botão Ok}. A figura~\ref{fig:mask_selected_part}.a apresenta um objeto selecionado na cor vermelha e a figura~\ref{fig:mask_selected_part}.b  somente o objeto após ter fechado a ferramenta (\textbf{botão Ok}).
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_select_part_pt.png}
+\caption{Menu para acessar a ferramenta de seleção de partes.}
+\label{fig:menu_mask_select_part}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.7]{mask_select_part_pt.png}
+\caption{Tela para configurar parâmetros de seleção de partes.}
+\label{fig:mask_select_part}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+  \centering
+  \subfloat[Região selecionada em vermelho]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_select_part_pt.png}}  \qquad
+  \subfloat[Imagem final, somente com a região selecionada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part_pt.png}}
+  \hfill
+  \caption{Exemplo de região selecionada na máscara.}
+  \label{fig:mask_selected_part}
+\end{figure}
+
+\section{Cortar}
+
+É possível cortar parte da máscara afim de selecionar uma região de interesse, isso pode ajudar reduzindo a quantidade de informações a ser processadas ao gerar superfície. Para abrir a ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último \textbf{Cortar} (figura~\ref{fig:menu_mask_crop}).
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_crop_pt.png}
+\caption{Menu para acessar a ferramenta de corte.}
+\label{fig:menu_mask_crop}
+\end{figure}
+
+Irá aparecer uma caixa delimitadora em cada janela das orientações axial, coronal e sagital.
 \ No newline at end of file
@@ -355,7 +355,7 @@ A técnica de segmentação por crescimento de região é ativada no menu \textb
 A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botão direito} do mouse, os pixels vizinhos que satisfazem as condições indicadas anteriormente são selecionados. Cada método leva em consideração diferentes condições, a seguir são apresentadas as diferenças entre cada método:
  
 \begin{itemize}
-	\item \textbf{Dinâmico}: Esse método captura o valor do pixel que foi clicado, levando em consideração o desvio para baixo (min) e desvio para cima (max). A opção \textbf{Considerar o brilho e contraste} é ativada por padrão, essa opção permite levar em consideração os valores de níveis de cinza que são exibidos e/ou ajustados na opção brilho e contraste. Ao desativar essa opção será levado em consideração os valores de cinza gravador na imagem (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}). 
+	\item \textbf{Dinâmico}: Esse método captura o valor do pixel que foi clicado, levando em consideração o desvio para baixo (min) e desvio para cima (max). A opção \textbf{Considerar o brilho e contraste} é ativada por padrão, essa opção permite levar em consideração os valores de níveis de cinza que são exibidos e/ou ajustados na opção brilho e contraste. Ao desativar essa opção será levado em consideração os valores de cinza gravados na imagem (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}). 
  
 	\begin{figure}[!htb]
 	\centering
@@ -39,6 +39,7 @@
 \include{intro}
 \include{cap_instal}
 \include{cap_import}
+\include{cap_img}
 \include{cap_manip}
 \include{cap_segmen}
 \include{cap_masc}
...	...	@@ -0,0 +1,26 @@
	1	+\chapter{Ajuste da imagem}
	2	+
	3	+O InVesalius não garante a correta ordem das imagens pois depende de informações que estão presentes nas imagens, algumas vezes essas imagens tem as informações incorretas ou não seguem o padrão DICOM. Dessa forma é recomendável confirmar se a lesão ou algum outro marco anatômico presente em um determinado paciente é exibido no lado correto da imagem. Caso não seja, é possível utilizar as ferramentas de espelhar a imagem ou inverter eixos. Também para o alinhamento da imagem, existe a ferramenta de rotação da imagem.
	4	+
	5	+\section{Espelhar}
	6	+
	7	+É possível espelhar um dos lados da imagem de modo que eles se invertam, para isso é necessário ir no menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Imagem}, \textbf{Espelhar} e clicar em uma das seguintes opções (figura~\ref{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}):
	8	+
	9	+\begin{itemize}
	10	+ \item Direita - Esquerda
	11	+ \item Anterior - Posterior
	12	+ \item Superior - Inferior
	13	+\end{itemize}
	14	+
	15	+\begin{figure}[!htb]
	16	+\centering
	17	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_img_mirroring_axis_pt.png}
	18	+\caption{Menu para ativar espelhar um dos lados da imagem.}
	19	+\label{fig:menu_img_mirroring_axis_pt}
	20	+\end{figure}
	21	+
	22	+
	23	+
	24	+\section{Inverter Eixo}
	25	+
	26	+\section{Rotacionar}
0	27	\ No newline at end of file
...	...
...	...	@@ -57,4 +57,131 @@ Pode-se efetuar a limpeza total da máscara (figura~\ref{fig:limpeza_mascara}),
57	57	\includegraphics[scale=0.5]{mask_clean_menu_pt.png}
58	58	\caption{Limpeza de máscara}
59	59	\label{fig:limpeza_mascara}
60		-\end{figure}
61	60	\ No newline at end of file
	61	+\end{figure}
	62	+
	63	+\section{Fechar buracos manualmente}
	64	+
	65	+Ao realizar a segmentação é possível que pequenas partes (buracos) que deseja-se ser selecionadas não sejam e ao gerar a superfície para a impressão 3D pode ser que ocorra inconsistências por causa desses buracos, para evitar esse tipo de problema é recomendável preenche-los. Para isso é basta acessar o menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último clicar em \textbf{Fechar buracos manualmente} (figura~\ref{fig:menu_mask_manual_fill_holes}). Em seguida será exibido uma tela (figura~\ref{fig:mask_manual_fill_holes_window}) para configurar os parâmetros.
	66	+
	67	+\begin{figure}[!htb]
	68	+\centering
	69	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_manual_fill_holes_pt.png}
	70	+\caption{Menu para acessa a ferramenta de fechamento de buracos manual.}
	71	+\label{fig:menu_mask_manual_fill_holes}
	72	+\end{figure}
	73	+
	74	+\begin{figure}[!htb]
	75	+\centering
	76	+\includegraphics[scale=0.7]{mask_manual_fill_holes_window_pt.png}
	77	+\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
	78	+\label{fig:mask_manual_fill_holes_window}
	79	+\end{figure}
	80	+
	81	+Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias.
	82	+
	83	+Quando os parâmetros estiverem configurados, clique com o \textbf{botão esquerdo} do mouse sobre o buraco que deseja-se fechar.
	84	+
	85	+Podemos observar na imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.a, um exemplo de uma máscara sem preenchimento de buracos e outra com os buracos preenchidos (imagem~\ref{fig:mask_fill_hole}.b). Após o uso da ferramenta, para sair clique no botão \textbf{fechar ou close} no canto inferior direito da janela de configuração de parâmetros.
	86	+
	87	+\begin{figure}[!htb]
	88	+ \centering
	89	+ \subfloat[Buracos]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_with_hole.png}} \qquad
	90	+ \subfloat[Buracos fechados]{\includegraphics[width=0.4\textwidth]{mask_axial_filled_hole.png}}
	91	+ \hfill
	92	+ \caption{Exemplo de máscara com buracos e buracos preenchidos.}
	93	+ \label{fig:mask_fill_hole}
	94	+\end{figure}
	95	+
	96	+
	97	+\section{Fechar buracos automaticamente}
	98	+
	99	+Para abrir a ferramenta, no menu do InVesalius clique em \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Fechar buracos automaticamente} (figura~\ref{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}), será aberto uma janela para configurar os parâmetros dos buracos que deseja-se fechar. A ferramenta não requer que o usuário clique nos buracos que deseja fechar, ela leva em consideração o tamanho do buraco em voxels que é configurado na janela de configuração de parâmetros (figura~\ref{fig:mask_automatic_fill_holes_window})
	100	+
	101	+\begin{figure}[!htb]
	102	+\centering
	103	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_automatic_fill_holes_pt.png}
	104	+\caption{Menu para acessar a ferramenta de fechamento de buracos automático.}
	105	+\label{fig:menu_mask_automatic_fill_holes}
	106	+\end{figure}
	107	+
	108	+\begin{figure}[!htb]
	109	+\centering
	110	+\includegraphics[scale=0.7]{mask_automatic_fill_holes_window_pt.png}
	111	+\caption{Tela para configurar parâmetros de fechamento de buracos.}
	112	+\label{fig:mask_automatic_fill_holes_window}
	113	+\end{figure}
	114	+
	115	+Entre os parâmetros existe a opção de realizar o fechamento de buraco levando em consideração somente a fatia atual (\textbf{2D - Fatia Atual}) ou todas as fatias (\textbf{3D - Todas as fatias}) e suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$. No caso 2D é necessário indicar qual a janela será aplicado o fechamento de buracos, sendo axial, coronal ou sagital. No caso 3D se houver conectividade no buraco em diferentes fatias ele irá expandir para as demais fatias.
	116	+
	117	+Com os parâmetros configurados, clique no botão \textbf{Aplicar ou Apply}, caso o resultado não seja satisfatório, reconfigure o tamanho do buraco ou outros parâmetros como conectividade e aplique novamente. Para sair clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
	118	+
	119	+\section{Remover partes}
	120	+
	121	+Antes de gerar a superfície é recomendável remover as partes desconexas não desejadas na máscara, dessa forma ao gerar a superfície será utilizada menores quantidades de memória RAM e o processo será mais rápido. Para remover as partes não desejáveis é necessário abrir a ferramenta de remover partes, clicando no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e \textbf{Remover Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_remove_part}). Em seguida irá ser exibido uma janela para configurar os parâmetros de seleção (figura~\ref{fig:mask_remove_parts_window}). É possível selecionar partes desconectas apenas na máscara 2D (\textbf{2D - Fatia atual}) ou em todo o conjunto de imagens, selecionando a opção \textbf{3D - Todas as fatias}. Também é possível selecionar suas respectivas conectividades, no caso 2D, conectividade $4$ ou $8$, conectividade $6$,$18$ ou $26$.
	122	+
	123	+\begin{figure}[!htb]
	124	+\centering
	125	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_remove_part_pt.png}
	126	+\caption{Menu para acessar a ferramenta de remoção de partes.}
	127	+\label{fig:menu_mask_remove_part}
	128	+\end{figure}
	129	+
	130	+\begin{figure}[!htb]
	131	+\centering
	132	+\includegraphics[scale=0.7]{mask_remove_parts_window.png}
	133	+\caption{Tela para configurar parâmetros de remoção de partes.}
	134	+\label{fig:mask_remove_parts_window}
	135	+\end{figure}
	136	+
	137	+Selecionado os parâmetros desejados, basta clicar com o \textbf{botão direito do mouse} sobre a região que deseja remover. A figura~\ref{fig:mask_removed_part} apresenta uma exemplo de parte removida e não removida. Para sair da ferramenta clique no botão \textbf{Sair ou Close}.
	138	+
	139	+\begin{figure}[!htb]
	140	+ \centering
	141	+ \subfloat[Imagem de entrada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_complete.png}} \qquad
	142	+ \subfloat[Imagem com suporte do tomografo removido]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part.png}}
	143	+ \hfill
	144	+ \caption{Exemplo de região removida na máscara.}
	145	+ \label{fig:mask_removed_part}
	146	+\end{figure}
	147	+
	148	+\section{Selecionar partes}
	149	+
	150	+Para abrir a ferramenta de seleção de partes desconexas é necessário ir ao menu, \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por fim \textbf{Selecionar Partes} (figura~\ref{fig:menu_mask_select_part}). A ferramenta irá apresentar uma tela de configuração de parâmetros que consiste em qual conectividade será levada em consideração (figura~\ref{fig:mask_select_part}), podendo ser $6$, $18$ ou $26$ e o nome da nova máscara que irá ter a imagem resultante.
	151	+
	152	+Todas as imagens a região que tem conectividade com o pixel selecionado. Para selecionar o pixel, é necessário clicar com o \textbf{botão esquerdo do mouse} em sobre o pixel desejado, o objeto irá ficar da cor vermelha, é possível selecionar vários objetos. Após a seleção é necessário clicar no \textbf{botão Ok}. A figura~\ref{fig:mask_selected_part}.a apresenta um objeto selecionado na cor vermelha e a figura~\ref{fig:mask_selected_part}.b somente o objeto após ter fechado a ferramenta (\textbf{botão Ok}).
	153	+
	154	+\begin{figure}[!htb]
	155	+\centering
	156	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_select_part_pt.png}
	157	+\caption{Menu para acessar a ferramenta de seleção de partes.}
	158	+\label{fig:menu_mask_select_part}
	159	+\end{figure}
	160	+
	161	+\begin{figure}[!htb]
	162	+\centering
	163	+\includegraphics[scale=0.7]{mask_select_part_pt.png}
	164	+\caption{Tela para configurar parâmetros de seleção de partes.}
	165	+\label{fig:mask_select_part}
	166	+\end{figure}
	167	+
	168	+\begin{figure}[!htb]
	169	+ \centering
	170	+ \subfloat[Região selecionada em vermelho]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_select_part_pt.png}} \qquad
	171	+ \subfloat[Imagem final, somente com a região selecionada]{\includegraphics[width=0.45\textwidth]{mask_axial_selected_part_pt.png}}
	172	+ \hfill
	173	+ \caption{Exemplo de região selecionada na máscara.}
	174	+ \label{fig:mask_selected_part}
	175	+\end{figure}
	176	+
	177	+\section{Cortar}
	178	+
	179	+É possível cortar parte da máscara afim de selecionar uma região de interesse, isso pode ajudar reduzindo a quantidade de informações a ser processadas ao gerar superfície. Para abrir a ferramenta é necessário ir no menu \textbf{Ferramentas}, \textbf{Máscara} e por último \textbf{Cortar} (figura~\ref{fig:menu_mask_crop}).
	180	+
	181	+\begin{figure}[!htb]
	182	+\centering
	183	+\includegraphics[scale=0.4]{menu_mask_crop_pt.png}
	184	+\caption{Menu para acessar a ferramenta de corte.}
	185	+\label{fig:menu_mask_crop}
	186	+\end{figure}
	187	+
	188	+Irá aparecer uma caixa delimitadora em cada janela das orientações axial, coronal e sagital.
62	189	\ No newline at end of file
...	...
...	...	@@ -355,7 +355,7 @@ A técnica de segmentação por crescimento de região é ativada no menu \textb
355	355	A técnica parte de um pixel inicial que é indicado clicando com o \textbf{botão direito} do mouse, os pixels vizinhos que satisfazem as condições indicadas anteriormente são selecionados. Cada método leva em consideração diferentes condições, a seguir são apresentadas as diferenças entre cada método:
356	356
357	357	\begin{itemize}
358		- \item \textbf{Dinâmico}: Esse método captura o valor do pixel que foi clicado, levando em consideração o desvio para baixo (min) e desvio para cima (max). A opção \textbf{Considerar o brilho e contraste} é ativada por padrão, essa opção permite levar em consideração os valores de níveis de cinza que são exibidos e/ou ajustados na opção brilho e contraste. Ao desativar essa opção será levado em consideração os valores de cinza gravador na imagem (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}).
	358	+ \item \textbf{Dinâmico}: Esse método captura o valor do pixel que foi clicado, levando em consideração o desvio para baixo (min) e desvio para cima (max). A opção \textbf{Considerar o brilho e contraste} é ativada por padrão, essa opção permite levar em consideração os valores de níveis de cinza que são exibidos e/ou ajustados na opção brilho e contraste. Ao desativar essa opção será levado em consideração os valores de cinza gravados na imagem (figura~\ref{fig:segmentation_region_growing_dinamic_parameter}).
359	359
360	360	\begin{figure}[!htb]
361	361	\centering
...	...
...	...	@@ -39,6 +39,7 @@
39	39	\include{intro}
40	40	\include{cap_instal}
41	41	\include{cap_import}
	42	+\include{cap_img}
42	43	\include{cap_manip}
43	44	\include{cap_segmen}
44	45	\include{cap_masc}
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