Manual update

Paulo Henrique Junqueira Amorim
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@@ -20,8 +20,31 @@ Fábio de Souza Azevedo
 \\
  
  
+André Salles Cunha Peres (Neuronavegador)
+
+\href{mailto:peres.asc@gmail.com}{peres.asc@gmail.com}
+\\
+
+Victor Hugo (Neuronavegador)
+
+\href{mailto:victorhos@hotmail.com}{victorhos@hotmail.com}
+\\
+
+
+Renan Matsuda (Neuronavegador)
+
+\href{mailto:renan\_hiroshi@hotmail.com}{renan\_hiroshi@hotmail.com}
+\\
+
+
+Oswaldo Baffa Filho (Neuronavegador)
+
+\href{mailto:baffa@usp.br}{baffa@usp.br}
+\\
+
 Jorge Vicente Lopes da Silva
  
  
 \href{mailto:jorge.silva@cti.gov.br}{jorge.silva@cti.gov.br}
 \\
+
@@ -88,6 +88,7 @@ coronal.
  
  
 \section{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal}
+\label{sec:corresp_all_orient}
  
 Para saber qual o ponto comum das imagens nas diferentes orientações, basta acionar o
 recurso "Cruz de interseção de fatias" pelo ícone de atalho localizado na barra de ferramentas.
@@ -0,0 +1,162 @@
+\chapter{Neuronavegação}
+
+\section{Introdução}
+
+Neuronavegação é a uma técnica que através da visualização computacional permite rastrear instrumentos cirúrgicos em relação às estruturas neuronais. Além disso, sistemas de neuronavegação têm sido apontados como uma ferramenta fundamental para aumentar a precisão de experimentos em neurociência, como a estimulação magnética transcraniana (EMT), eletroencefalografia, magnetoencefalografia e espectroscopia no infravermelho próximo. Apesar do vasto campo de aplicações, o uso da neuronavegação em centros de pesquisa é limitado pelo alto custo. O modulo de neuronavegação do InVesalius oferece aos usuários uma alternativa de baixo custo e código aberto aos sistemas comercias de navegação. Desta maneira, é possível utilizar ferramentas específicas para neunavegação e ainda ter a possibilidade de desenvolvimento de funcionalidades sob demanda. O neuronavegador é distribuído em uma versão executável compatível com sistema operacional Windows 7, 8 e 10.
+
+\section{Modo Navegação}
+
+Para utilizar o neuronavegador, é necessário habilitar o modo de neuronavegação do InVesalius selecionando no menu \textbf{Modo} em seguida \textbf{Navegação} (figura~\ref{fig:nav_menu_pt}). Será ativada uma nova aba "Sistema de navegação" que ficará visível no painel à esquerda da janela principal como é apresentado na figura~\ref{fig:nav_painel_pt}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{nav_menu_pt.png}
+\caption{Menu para ativar o modulo de neuronavegação.}
+\label{fig:nav_menu_pt}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_painel_pt.png}
+\caption{Aba do sistema de neuronavegação.}
+\label{fig:nav_painel_pt}
+\end{figure}
+
+\section{Rastreadores espaciais e modo de referência}
+
+O sistema de neuronavegação se comunica com vários sistemas de rastreamento espacial. Atualmente, suporta os dispositivos fabricados pela ClaroNav (figura~\ref{fig:tracker_claron}) e Polhemus (figura~\ref{fig:tracker_polhemus}). 
+
+O usuário deve selecionar o dispositivo correspondente no botão \textbf{Selecione o rastreador:}, figura~\ref{fig:nav_select_tracker}.  Caso o usuário não possua nenhum dos rastreadores suportados e deseja realizar um teste do sistema, deve selecionar a opção \textbf{Depurar rastreador} e realizar normalmente os procedimentos que serão citados a seguir. Nessa opção, trata-se de uma simulação, do qual serão geradas coordenadas aleatórias.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{tracker_claron.png}
+\caption{Rastreador Claron - www.claronav.com/microntracker/.}
+\label{fig:tracker_claron}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{tracker_polhemus.jpg}
+\caption{Rastreador Polhemus - http://polhemus.com/motion-tracking/overview/.}
+\label{fig:tracker_polhemus}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{nav_select_tracker_pt.png}
+\caption{Menu para seleção de rastreador.}
+\label{fig:nav_select_tracker}
+\end{figure}
+
+É possível realizar a navegação com dois diferentes tipos de referência, estático e dinâmico (figura~\ref{fig:nav_menu_ref}). No modo estático as coordenadas do dispositivo de rastreamento são detectadas com apenas uma sonda. Este modo de navegação é chamado de modo de referência estática porque a cabeça dos sujeitos deve permanecer estática na posição em que foram detectados os pontos fiduciais (Mais informações na seção~\ref{sec:corregistro}). 
+Para evitar problemas relacionados com o movimento da cabeça, alguns dispositivos de rastreamento fornecem uma sonda de referência. A sonda de referência pode ser ligada a uma parte não móvel da cabeça, por exemplo testa, para acompanhar as translações e rotações durante o procedimento de navegação. O uso de uma sonda de referência é o chamado modo de referência dinâmica.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{nav_menu_ref.png}
+\caption{Menu para seleção de referência.}
+\label{fig:nav_menu_ref}
+\end{figure}
+
+\section{Corregistro}
+\label{sec:corregistro}
+
+O objetivo do corregistro é as coordenadas virtual (imagem) e a as coordendas física do dispositivo de rastreamento em comum. Para realizar o corregistro, o usuário deve selecionar três marcadores fiduciais na imagem, para isso primeiramente deverá ativar o recurso de \textbf{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal} (ver seção~\ref{sec:corresp_all_orient}), coletar as três coordenadas fiduciais usando a sonda do dispositivo de rastreamento. Os fiduciais mais utilizados são o trago auricular esquerdo, trago auricular direito e a fossa nasal. A figura~\ref{fig:nav_selec_coord} ilustra a coleta dos pontos fiduciais. Quando é selecionado algum ponto fiducial na imagem, automaticamente é criado um marcador (esfera da cor verde) no volume, figura~\ref{fig:nav_balls_in_head}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{nav_selec_coord_pt.png}
+\caption{Botões e coordenadas para seleção de pontos fiduciais.}
+\label{fig:nav_selec_coord}
+\end{figure}
+
+As siglas dos botões para coleta dos fiduciais representam:
+
+\begin{itemize}
+	\item OEI: trago auricular esquerdo na imagem
+	\item ODI: trago auricular direito na imagem
+	\item NAI: fossa nasal na imagem
+	\item OER: trago auricular esquerdo no rastreador
+	\item OER: trago auricular direito no rastreador
+	\item NAR: fossa nasal esquerdo no rastreador
+\end{itemize}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.5]{nav_balls_in_head.png}
+\caption{Criação de marcadores nos pontos fiduciais da imagem.}
+\label{fig:nav_balls_in_head}
+\end{figure}
+
+
+\section{Erro de registro fiducial e navegação}
+
+Após o usuário selecionar os três pontos fiduciais na imagem e os respectivos pontos com o rastreador espacial, o próximo passo é clicar no \textbf{botão Navegar} e o procedimento de navegação será iniciado. Para pausar a navegação, basta clicar novamente no \textbf{botão Navegar}. Automaticamente após selecionado a navegação é calculado o erro de registro fiducial, conhecido como \textit{Fiducial Registration Error} (FRE). Esse erro representa a distância média quadrática do ponto fiducial na imagem com o respectivo ponto fiducial obtido após realizado o corregistro. 
+
+Ao lado do botão de navegação, há a caixa de texto respectivo ao FRE. Se o FRE apresentar um valor alto (acima de 3 mm) a navegação não será precisa e a caixa de texto ficará vermelha, figura~\ref{fig:nav_fre_error}, recomenda-se que o corregistro seja refeito. Caso contrário, para FRE menor que 3 mm a caixa de texto fica verde, representando que a navegação terá precisão aceitável, figura~\ref{fig:nav_fre_ok}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_error_pt.png}
+\caption{Botão de navegação e FRE com valor elevado para navegação.}
+\label{fig:nav_fre_error}
+\end{figure}
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_ok_pt.png}
+\caption{Botão de navegação e FRE com valor aceitável para navegação.}
+\label{fig:nav_fre_ok}
+\end{figure}
+
+\section{Marcadores}
+
+Durante a navegação, é possível criar marcadores esféricos no volume 3D. Para acessar essa função, basta clicar na aba \textbf{Ferramentas extras}, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}.
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_extra_tools_pt.png}
+\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
+\label{fig:nav_extra_tools}
+\end{figure}
+
+A criação de marcadores pode ser executada clicando no botão correspondente, com isso será criado um marcador na posição da cruz vermelha com as características escolhidas na aba, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}. O número 4 representa o tamanho do raio da esfera que será criada. Ao lado do tamanho do marcador é possível definir a cor da esfera (figura~\ref{fig:nav_vol_with_markers}). 
+
+Depois da criação é possível criar uma identificação para o marcador, para isso, deve-se clicar com o botão direto sobre o marcador desejado e selecionar \textbf{Editar ID}, figura~\ref{fig:nav_id_list_markers}, será aberto uma janela para o usuário digitar a identificação, figura~\ref{fig:nav_edit_id_markers}.
+
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.4]{nav_vol_with_markers.png}
+\caption{Volume com marcadores em diferentes cores.}
+\label{fig:nav_vol_with_markers}
+\end{figure} 
+
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_id_list_markers_pt.png}
+\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
+\label{fig:nav_id_list_markers}
+\end{figure} 
+
+\begin{figure}[!htb]
+\centering
+\includegraphics[scale=0.6]{nav_edit_id_markers_pt.png}
+\caption{Janela para editar identificação do marcador.}
+\label{fig:nav_edit_id_markers}
+\end{figure} 
+
+A exportação dos marcadores é feita através do \textbf{botão salvar}, a extensão do arquivo gerado é o .mks. Essa extensão de arquivo pode ser aberta por processadores de texto como bloco de notas. O arquivo possui as coordenadas $X$, $Y$ e $Z$ seguido o código $RGB$, tamanho de marcador e a identificação. Posteriormente, esse arquivo pode ser importado através do \textbf{botão Carregar}.
+
+Caso o usuário desejar excluir apenas um marcador basta \textbf{selecionar} o item desejado na lista e clicar no \textbf{botão Remover}, também existe a opção de excluir todos os marcadores criados, \textbf{Deletar todos marcadores}. Além disso, pode-se ocultar/mostrar a exibição dos marcadores no volume pelo \textbf{botão ocultar/mostrar}.
+
+\section{Caixas de seleção, trigger externo}
+
+Outra maneira para criação de marcadores é a monitoração externa de trigger. Para ativa-la basta selecionar a caixa de seleção \textbf{Trigger externo}. Essa função foi desenvolvida para comunicar dispositivos EMT e criar automaticamente o marcador em posições onde os pulsos foram aplicados. No entanto, outras aplicações são possíveis de acordo com a necessidade do usuário.
+A comunicação com o dispositivo externo é feita através da porta serial COM1, e basta enviar qualquer sinal do tipo RS-232 em uma velocidade \textit{baud rate} de 9600 no pino de recepção que será criado um marcador na atual posição da cruz.
+
+\section{Câmera do volume}
+
+O posicionamento da câmera do volume é atualizado automaticamente, tanto pela posição da cruz vermelha das fatias quanto pela posição da sonda durante a navegação. O usuário pode desabilitar a atualização automática e atualizar a câmera manualmente. O posicionamento será alterado caso o usuário o fizer na janela de volume.  Para isso, basta desmarcar a caixa de seleção \textbf{Câmera do volume}.
@@ -15,6 +15,7 @@
 \usepackage{wallpaper}
 \usepackage{subfig}
 \usepackage{float}
+\usepackage{esvect}
  
  
 \hypersetup{
@@ -50,6 +51,7 @@
 \include{cap_visual_vol}
 \include{cap_export}
 \include{cap_cust}
+\include{cap_nav}
 \include{autores}
 \end{document}
...	...	@@ -20,8 +20,31 @@ Fábio de Souza Azevedo
20	20	\\
21	21
22	22
	23	+André Salles Cunha Peres (Neuronavegador)
	24	+
	25	+\href{mailto:peres.asc@gmail.com}{peres.asc@gmail.com}
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	28	+Victor Hugo (Neuronavegador)
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	32	+
	33	+
	34	+Renan Matsuda (Neuronavegador)
	35	+
	36	+\href{mailto:renan\_hiroshi@hotmail.com}{renan\_hiroshi@hotmail.com}
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	40	+Oswaldo Baffa Filho (Neuronavegador)
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	44	+
23	45	Jorge Vicente Lopes da Silva
24	46
25	47
26	48	\href{mailto:jorge.silva@cti.gov.br}{jorge.silva@cti.gov.br}
27	49	\\
	50	+
...	...
...	...	@@ -88,6 +88,7 @@ coronal.
88	88
89	89
90	90	\section{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal}
	91	+\label{sec:corresp_all_orient}
91	92
92	93	Para saber qual o ponto comum das imagens nas diferentes orientações, basta acionar o
93	94	recurso "Cruz de interseção de fatias" pelo ícone de atalho localizado na barra de ferramentas.
...	...
...	...	@@ -0,0 +1,162 @@
	1	+\chapter{Neuronavegação}
	2	+
	3	+\section{Introdução}
	4	+
	5	+Neuronavegação é a uma técnica que através da visualização computacional permite rastrear instrumentos cirúrgicos em relação às estruturas neuronais. Além disso, sistemas de neuronavegação têm sido apontados como uma ferramenta fundamental para aumentar a precisão de experimentos em neurociência, como a estimulação magnética transcraniana (EMT), eletroencefalografia, magnetoencefalografia e espectroscopia no infravermelho próximo. Apesar do vasto campo de aplicações, o uso da neuronavegação em centros de pesquisa é limitado pelo alto custo. O modulo de neuronavegação do InVesalius oferece aos usuários uma alternativa de baixo custo e código aberto aos sistemas comercias de navegação. Desta maneira, é possível utilizar ferramentas específicas para neunavegação e ainda ter a possibilidade de desenvolvimento de funcionalidades sob demanda. O neuronavegador é distribuído em uma versão executável compatível com sistema operacional Windows 7, 8 e 10.
	6	+
	7	+\section{Modo Navegação}
	8	+
	9	+Para utilizar o neuronavegador, é necessário habilitar o modo de neuronavegação do InVesalius selecionando no menu \textbf{Modo} em seguida \textbf{Navegação} (figura~\ref{fig:nav_menu_pt}). Será ativada uma nova aba "Sistema de navegação" que ficará visível no painel à esquerda da janela principal como é apresentado na figura~\ref{fig:nav_painel_pt}.
	10	+
	11	+\begin{figure}[!htb]
	12	+\centering
	13	+\includegraphics[scale=0.4]{nav_menu_pt.png}
	14	+\caption{Menu para ativar o modulo de neuronavegação.}
	15	+\label{fig:nav_menu_pt}
	16	+\end{figure}
	17	+
	18	+\begin{figure}[!htb]
	19	+\centering
	20	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_painel_pt.png}
	21	+\caption{Aba do sistema de neuronavegação.}
	22	+\label{fig:nav_painel_pt}
	23	+\end{figure}
	24	+
	25	+\section{Rastreadores espaciais e modo de referência}
	26	+
	27	+O sistema de neuronavegação se comunica com vários sistemas de rastreamento espacial. Atualmente, suporta os dispositivos fabricados pela ClaroNav (figura~\ref{fig:tracker_claron}) e Polhemus (figura~\ref{fig:tracker_polhemus}).
	28	+
	29	+O usuário deve selecionar o dispositivo correspondente no botão \textbf{Selecione o rastreador:}, figura~\ref{fig:nav_select_tracker}. Caso o usuário não possua nenhum dos rastreadores suportados e deseja realizar um teste do sistema, deve selecionar a opção \textbf{Depurar rastreador} e realizar normalmente os procedimentos que serão citados a seguir. Nessa opção, trata-se de uma simulação, do qual serão geradas coordenadas aleatórias.
	30	+
	31	+\begin{figure}[!htb]
	32	+\centering
	33	+\includegraphics[scale=0.4]{tracker_claron.png}
	34	+\caption{Rastreador Claron - www.claronav.com/microntracker/.}
	35	+\label{fig:tracker_claron}
	36	+\end{figure}
	37	+
	38	+\begin{figure}[!htb]
	39	+\centering
	40	+\includegraphics[scale=0.5]{tracker_polhemus.jpg}
	41	+\caption{Rastreador Polhemus - http://polhemus.com/motion-tracking/overview/.}
	42	+\label{fig:tracker_polhemus}
	43	+\end{figure}
	44	+
	45	+\begin{figure}[!htb]
	46	+\centering
	47	+\includegraphics[scale=0.5]{nav_select_tracker_pt.png}
	48	+\caption{Menu para seleção de rastreador.}
	49	+\label{fig:nav_select_tracker}
	50	+\end{figure}
	51	+
	52	+É possível realizar a navegação com dois diferentes tipos de referência, estático e dinâmico (figura~\ref{fig:nav_menu_ref}). No modo estático as coordenadas do dispositivo de rastreamento são detectadas com apenas uma sonda. Este modo de navegação é chamado de modo de referência estática porque a cabeça dos sujeitos deve permanecer estática na posição em que foram detectados os pontos fiduciais (Mais informações na seção~\ref{sec:corregistro}).
	53	+Para evitar problemas relacionados com o movimento da cabeça, alguns dispositivos de rastreamento fornecem uma sonda de referência. A sonda de referência pode ser ligada a uma parte não móvel da cabeça, por exemplo testa, para acompanhar as translações e rotações durante o procedimento de navegação. O uso de uma sonda de referência é o chamado modo de referência dinâmica.
	54	+
	55	+\begin{figure}[!htb]
	56	+\centering
	57	+\includegraphics[scale=0.5]{nav_menu_ref.png}
	58	+\caption{Menu para seleção de referência.}
	59	+\label{fig:nav_menu_ref}
	60	+\end{figure}
	61	+
	62	+\section{Corregistro}
	63	+\label{sec:corregistro}
	64	+
	65	+O objetivo do corregistro é as coordenadas virtual (imagem) e a as coordendas física do dispositivo de rastreamento em comum. Para realizar o corregistro, o usuário deve selecionar três marcadores fiduciais na imagem, para isso primeiramente deverá ativar o recurso de \textbf{Correspondência entre as orientações axial, sagital e coronal} (ver seção~\ref{sec:corresp_all_orient}), coletar as três coordenadas fiduciais usando a sonda do dispositivo de rastreamento. Os fiduciais mais utilizados são o trago auricular esquerdo, trago auricular direito e a fossa nasal. A figura~\ref{fig:nav_selec_coord} ilustra a coleta dos pontos fiduciais. Quando é selecionado algum ponto fiducial na imagem, automaticamente é criado um marcador (esfera da cor verde) no volume, figura~\ref{fig:nav_balls_in_head}.
	66	+
	67	+\begin{figure}[!htb]
	68	+\centering
	69	+\includegraphics[scale=0.5]{nav_selec_coord_pt.png}
	70	+\caption{Botões e coordenadas para seleção de pontos fiduciais.}
	71	+\label{fig:nav_selec_coord}
	72	+\end{figure}
	73	+
	74	+As siglas dos botões para coleta dos fiduciais representam:
	75	+
	76	+\begin{itemize}
	77	+ \item OEI: trago auricular esquerdo na imagem
	78	+ \item ODI: trago auricular direito na imagem
	79	+ \item NAI: fossa nasal na imagem
	80	+ \item OER: trago auricular esquerdo no rastreador
	81	+ \item OER: trago auricular direito no rastreador
	82	+ \item NAR: fossa nasal esquerdo no rastreador
	83	+\end{itemize}
	84	+
	85	+\begin{figure}[!htb]
	86	+\centering
	87	+\includegraphics[scale=0.5]{nav_balls_in_head.png}
	88	+\caption{Criação de marcadores nos pontos fiduciais da imagem.}
	89	+\label{fig:nav_balls_in_head}
	90	+\end{figure}
	91	+
	92	+
	93	+\section{Erro de registro fiducial e navegação}
	94	+
	95	+Após o usuário selecionar os três pontos fiduciais na imagem e os respectivos pontos com o rastreador espacial, o próximo passo é clicar no \textbf{botão Navegar} e o procedimento de navegação será iniciado. Para pausar a navegação, basta clicar novamente no \textbf{botão Navegar}. Automaticamente após selecionado a navegação é calculado o erro de registro fiducial, conhecido como \textit{Fiducial Registration Error} (FRE). Esse erro representa a distância média quadrática do ponto fiducial na imagem com o respectivo ponto fiducial obtido após realizado o corregistro.
	96	+
	97	+Ao lado do botão de navegação, há a caixa de texto respectivo ao FRE. Se o FRE apresentar um valor alto (acima de 3 mm) a navegação não será precisa e a caixa de texto ficará vermelha, figura~\ref{fig:nav_fre_error}, recomenda-se que o corregistro seja refeito. Caso contrário, para FRE menor que 3 mm a caixa de texto fica verde, representando que a navegação terá precisão aceitável, figura~\ref{fig:nav_fre_ok}.
	98	+
	99	+\begin{figure}[!htb]
	100	+\centering
	101	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_error_pt.png}
	102	+\caption{Botão de navegação e FRE com valor elevado para navegação.}
	103	+\label{fig:nav_fre_error}
	104	+\end{figure}
	105	+
	106	+\begin{figure}[!htb]
	107	+\centering
	108	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_fre_ok_pt.png}
	109	+\caption{Botão de navegação e FRE com valor aceitável para navegação.}
	110	+\label{fig:nav_fre_ok}
	111	+\end{figure}
	112	+
	113	+\section{Marcadores}
	114	+
	115	+Durante a navegação, é possível criar marcadores esféricos no volume 3D. Para acessar essa função, basta clicar na aba \textbf{Ferramentas extras}, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}.
	116	+
	117	+\begin{figure}[!htb]
	118	+\centering
	119	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_extra_tools_pt.png}
	120	+\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
	121	+\label{fig:nav_extra_tools}
	122	+\end{figure}
	123	+
	124	+A criação de marcadores pode ser executada clicando no botão correspondente, com isso será criado um marcador na posição da cruz vermelha com as características escolhidas na aba, figura~\ref{fig:nav_extra_tools}. O número 4 representa o tamanho do raio da esfera que será criada. Ao lado do tamanho do marcador é possível definir a cor da esfera (figura~\ref{fig:nav_vol_with_markers}).
	125	+
	126	+Depois da criação é possível criar uma identificação para o marcador, para isso, deve-se clicar com o botão direto sobre o marcador desejado e selecionar \textbf{Editar ID}, figura~\ref{fig:nav_id_list_markers}, será aberto uma janela para o usuário digitar a identificação, figura~\ref{fig:nav_edit_id_markers}.
	127	+
	128	+
	129	+\begin{figure}[!htb]
	130	+\centering
	131	+\includegraphics[scale=0.4]{nav_vol_with_markers.png}
	132	+\caption{Volume com marcadores em diferentes cores.}
	133	+\label{fig:nav_vol_with_markers}
	134	+\end{figure}
	135	+
	136	+
	137	+\begin{figure}[!htb]
	138	+\centering
	139	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_id_list_markers_pt.png}
	140	+\caption{Aba para manipulação de marcadores.}
	141	+\label{fig:nav_id_list_markers}
	142	+\end{figure}
	143	+
	144	+\begin{figure}[!htb]
	145	+\centering
	146	+\includegraphics[scale=0.6]{nav_edit_id_markers_pt.png}
	147	+\caption{Janela para editar identificação do marcador.}
	148	+\label{fig:nav_edit_id_markers}
	149	+\end{figure}
	150	+
	151	+A exportação dos marcadores é feita através do \textbf{botão salvar}, a extensão do arquivo gerado é o .mks. Essa extensão de arquivo pode ser aberta por processadores de texto como bloco de notas. O arquivo possui as coordenadas $X$, $Y$ e $Z$ seguido o código $RGB$, tamanho de marcador e a identificação. Posteriormente, esse arquivo pode ser importado através do \textbf{botão Carregar}.
	152	+
	153	+Caso o usuário desejar excluir apenas um marcador basta \textbf{selecionar} o item desejado na lista e clicar no \textbf{botão Remover}, também existe a opção de excluir todos os marcadores criados, \textbf{Deletar todos marcadores}. Além disso, pode-se ocultar/mostrar a exibição dos marcadores no volume pelo \textbf{botão ocultar/mostrar}.
	154	+
	155	+\section{Caixas de seleção, trigger externo}
	156	+
	157	+Outra maneira para criação de marcadores é a monitoração externa de trigger. Para ativa-la basta selecionar a caixa de seleção \textbf{Trigger externo}. Essa função foi desenvolvida para comunicar dispositivos EMT e criar automaticamente o marcador em posições onde os pulsos foram aplicados. No entanto, outras aplicações são possíveis de acordo com a necessidade do usuário.
	158	+A comunicação com o dispositivo externo é feita através da porta serial COM1, e basta enviar qualquer sinal do tipo RS-232 em uma velocidade \textit{baud rate} de 9600 no pino de recepção que será criado um marcador na atual posição da cruz.
	159	+
	160	+\section{Câmera do volume}
	161	+
	162	+O posicionamento da câmera do volume é atualizado automaticamente, tanto pela posição da cruz vermelha das fatias quanto pela posição da sonda durante a navegação. O usuário pode desabilitar a atualização automática e atualizar a câmera manualmente. O posicionamento será alterado caso o usuário o fizer na janela de volume. Para isso, basta desmarcar a caixa de seleção \textbf{Câmera do volume}.
...	...
...	...	@@ -15,6 +15,7 @@
15	15	\usepackage{wallpaper}
16	16	\usepackage{subfig}
17	17	\usepackage{float}
	18	+\usepackage{esvect}
18	19
19	20
20	21	\hypersetup{
...	...	@@ -50,6 +51,7 @@
50	51	\include{cap_visual_vol}
51	52	\include{cap_export}
52	53	\include{cap_cust}
	54	+\include{cap_nav}
53	55	\include{autores}
54	56	\end{document}
55	57
...	...